MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_011529	AG	3	6	1094181	1094186	50 %	0 %	50 %	0 %	212224347
19502	NC_011529	GACGTT	2	12	1094208	1094219	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212224347
19503	NC_011529	TGT	2	6	1094228	1094233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224347
19504	NC_011529	GAG	2	6	1094241	1094246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224347
19505	NC_011529	GGA	2	6	1094306	1094311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224347
19506	NC_011529	CGC	2	6	1094321	1094326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224347
19507	NC_011529	ATC	2	6	1094481	1094486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224347
19508	NC_011529	ACT	2	6	1094494	1094499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224347
19509	NC_011529	AGG	2	6	1094617	1094622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224347
19510	NC_011529	CAG	2	6	1094649	1094654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224347
19511	NC_011529	AGA	2	6	1094659	1094664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224347
19512	NC_011529	GA	3	6	1094817	1094822	50 %	0 %	50 %	0 %	212224347
19513	NC_011529	CTT	2	6	1094868	1094873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224347
19514	NC_011529	CAA	2	6	1094930	1094935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224347
19515	NC_011529	AGG	2	6	1094977	1094982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224347
19516	NC_011529	GA	3	6	1095159	1095164	50 %	0 %	50 %	0 %	212224347
19517	NC_011529	ATA	2	6	1095177	1095182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224347
19518	NC_011529	GAC	2	6	1095189	1095194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224347
19519	NC_011529	CGA	2	6	1095278	1095283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224347
19520	NC_011529	CGT	2	6	1095368	1095373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224347
19521	NC_011529	CGT	2	6	1095380	1095385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224347
19522	NC_011529	GCA	2	6	1095433	1095438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224347
19523	NC_011529	CAT	2	6	1095470	1095475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224347
19524	NC_011529	ACA	2	6	1095526	1095531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224347
19525	NC_011529	CGA	2	6	1095719	1095724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224347
19526	NC_011529	AAG	2	6	1095735	1095740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224347
19527	NC_011529	TCA	2	6	1095748	1095753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224347
19528	NC_011529	CGT	2	6	1095821	1095826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224347
19529	NC_011529	ATC	2	6	1095831	1095836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224347
19530	NC_011529	GCT	2	6	1095848	1095853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224347
19531	NC_011529	GGT	3	9	1095855	1095863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224347
19532	NC_011529	CGA	2	6	1095906	1095911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224348
19533	NC_011529	GCA	2	6	1095961	1095966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224348
19534	NC_011529	TACA	2	8	1096081	1096088	50 %	25 %	0 %	25 %	212224348
19535	NC_011529	ATG	2	6	1096162	1096167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224348
19536	NC_011529	CAC	2	6	1096185	1096190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224348
19537	NC_011529	CCT	2	6	1096324	1096329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224348
19538	NC_011529	GAA	2	6	1096461	1096466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224348
19539	NC_011529	TCG	2	6	1096693	1096698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224349
19540	NC_011529	GAA	2	6	1096751	1096756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224349
19541	NC_011529	GCT	2	6	1096778	1096783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224349
19542	NC_011529	TGA	2	6	1096802	1096807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224349
19543	NC_011529	GAC	2	6	1096815	1096820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224349
19544	NC_011529	GAA	2	6	1096896	1096901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224349
19545	NC_011529	ACG	2	6	1096942	1096947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224349
19546	NC_011529	GA	4	8	1096950	1096957	50 %	0 %	50 %	0 %	212224349
19547	NC_011529	CCAGA	2	10	1096963	1096972	40 %	0 %	20 %	40 %	212224349
19548	NC_011529	TTA	2	6	1096993	1096998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224349
19549	NC_011529	CCA	2	6	1097059	1097064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224349
19550	NC_011529	AAG	2	6	1097268	1097273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224350
19551	NC_011529	ATA	2	6	1097280	1097285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224350
19552	NC_011529	AGGT	2	8	1097341	1097348	25 %	25 %	50 %	0 %	212224350
19553	NC_011529	AGC	2	6	1097375	1097380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224350
19554	NC_011529	CTC	2	6	1097433	1097438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224350
19555	NC_011529	AAG	2	6	1097568	1097573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224350
19556	NC_011529	CTA	2	6	1097708	1097713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224350
19557	NC_011529	AAG	2	6	1097761	1097766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224351
19558	NC_011529	TCG	2	6	1097780	1097785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224351
19559	NC_011529	CAG	2	6	1097807	1097812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224351
19560	NC_011529	ATG	2	6	1097824	1097829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224351
19561	NC_011529	AGA	2	6	1097862	1097867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224351
19562	NC_011529	AGT	2	6	1097880	1097885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224351
19563	NC_011529	AAG	2	6	1097900	1097905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224351
19564	NC_011529	TTC	2	6	1097950	1097955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224351
19565	NC_011529	GGA	2	6	1098081	1098086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224351
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19568	NC_011529	GGT	2	6	1098285	1098290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224351
19569	NC_011529	TAC	2	6	1098310	1098315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224351
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19572	NC_011529	TAC	2	6	1098515	1098520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224351
19573	NC_011529	GAG	2	6	1098634	1098639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224351
19574	NC_011529	ATG	2	6	1098668	1098673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224351
19575	NC_011529	AAT	2	6	1098738	1098743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224351
19576	NC_011529	CAATT	2	10	1098768	1098777	40 %	40 %	0 %	20 %	212224351
19577	NC_011529	TGAG	2	8	1098830	1098837	25 %	25 %	50 %	0 %	212224351
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19580	NC_011529	GC	3	6	1099110	1099115	0 %	0 %	50 %	50 %	212224351
19581	NC_011529	CAG	2	6	1099180	1099185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224351
19582	NC_011529	CAG	2	6	1099207	1099212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224351
19583	NC_011529	AG	3	6	1099266	1099271	50 %	0 %	50 %	0 %	212224351
19584	NC_011529	AG	3	6	1099336	1099341	50 %	0 %	50 %	0 %	212224351
19585	NC_011529	GA	3	6	1099389	1099394	50 %	0 %	50 %	0 %	212224351
19586	NC_011529	GAA	2	6	1099441	1099446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224351
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19588	NC_011529	ACA	2	6	1099601	1099606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224351
19589	NC_011529	GA	3	6	1099685	1099690	50 %	0 %	50 %	0 %	212224351
19590	NC_011529	ACC	2	6	1099711	1099716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224351
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19595	NC_011529	ACT	2	6	1099858	1099863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224351
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19597	NC_011529	GC	3	6	1099926	1099931	0 %	0 %	50 %	50 %	212224351
19598	NC_011529	GAA	2	6	1099944	1099949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224351
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19602	NC_011529	AAG	2	6	1100166	1100171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224352
19603	NC_011529	GAA	2	6	1100210	1100215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224352
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19605	NC_011529	CAGG	2	8	1100284	1100291	25 %	0 %	50 %	25 %	212224352
19606	NC_011529	AGGA	2	8	1100336	1100343	50 %	0 %	50 %	0 %	212224352
19607	NC_011529	AT	3	6	1100389	1100394	50 %	50 %	0 %	0 %	212224352
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19610	NC_011529	AG	3	6	1100484	1100489	50 %	0 %	50 %	0 %	212224352
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19612	NC_011529	GGAA	2	8	1100565	1100572	50 %	0 %	50 %	0 %	212224352
19613	NC_011529	TCC	2	6	1100584	1100589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224352
19614	NC_011529	GGA	2	6	1100590	1100595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224352
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19616	NC_011529	CCG	2	6	1100676	1100681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224352
19617	NC_011529	GAG	2	6	1100759	1100764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224352
19618	NC_011529	TGGCAG	2	12	1100804	1100815	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212224353
19619	NC_011529	CAG	2	6	1100858	1100863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224353
19620	NC_011529	GA	3	6	1100874	1100879	50 %	0 %	50 %	0 %	212224353
19621	NC_011529	GA	3	6	1100933	1100938	50 %	0 %	50 %	0 %	212224353
19622	NC_011529	TTG	2	6	1100939	1100944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224353
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19627	NC_011529	CA	3	6	1101136	1101141	50 %	0 %	0 %	50 %	212224353
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19631	NC_011529	TCA	2	6	1101515	1101520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224353
19632	NC_011529	AG	3	6	1101562	1101567	50 %	0 %	50 %	0 %	212224353
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19636	NC_011529	CGA	2	6	1101892	1101897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224354
19637	NC_011529	GGCCG	2	10	1101902	1101911	0 %	0 %	60 %	40 %	212224354
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19643	NC_011529	CGT	2	6	1102402	1102407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224354
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19652	NC_011529	TA	3	6	1102917	1102922	50 %	50 %	0 %	0 %	212224354
19653	NC_011529	CTGT	2	8	1102949	1102956	0 %	50 %	25 %	25 %	212224354
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19848	NC_011529	TTC	2	6	1114327	1114332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224368
19849	NC_011529	TCC	2	6	1114351	1114356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224368
19850	NC_011529	CAT	2	6	1114511	1114516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224368
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19854	NC_011529	GTA	2	6	1114832	1114837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224369
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19859	NC_011529	TGA	2	6	1115071	1115076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224369
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19958	NC_011529	CA	3	6	1121132	1121137	50 %	0 %	0 %	50 %	212224377
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