MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011529	CGG	2	6	77049	77054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223241
1502	NC_011529	TGG	2	6	77069	77074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223241
1503	NC_011529	GGGA	2	8	77086	77093	25 %	0 %	75 %	0 %	212223241
1504	NC_011529	GAG	2	6	77122	77127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223241
1505	NC_011529	GA	3	6	77185	77190	50 %	0 %	50 %	0 %	212223241
1506	NC_011529	TTA	2	6	77204	77209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223241
1507	NC_011529	AAC	2	6	77257	77262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223241
1508	NC_011529	AGAGC	2	10	77292	77301	40 %	0 %	40 %	20 %	212223241
1509	NC_011529	CCT	2	6	77444	77449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223241
1510	NC_011529	GGC	2	6	77463	77468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223241
1511	NC_011529	TC	3	6	77478	77483	0 %	50 %	0 %	50 %	212223241
1512	NC_011529	GAA	2	6	77508	77513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223241
1513	NC_011529	GTC	2	6	77605	77610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223241
1514	NC_011529	GAG	2	6	77805	77810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223242
1515	NC_011529	AAG	2	6	77986	77991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223242
1516	NC_011529	GCG	2	6	78044	78049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223242
1517	NC_011529	TTC	2	6	78050	78055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223242
1518	NC_011529	GA	3	6	78067	78072	50 %	0 %	50 %	0 %	212223242
1519	NC_011529	GGT	2	6	78081	78086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223242
1520	NC_011529	GCT	2	6	78093	78098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223242
1521	NC_011529	GGA	2	6	78150	78155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223242
1522	NC_011529	GCC	2	6	78204	78209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223242
1523	NC_011529	GAG	2	6	78213	78218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223242
1524	NC_011529	TAC	2	6	78253	78258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223242
1525	NC_011529	CCA	2	6	78339	78344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223242
1526	NC_011529	GCCTT	2	10	78350	78359	0 %	40 %	20 %	40 %	212223242
1527	NC_011529	AGG	2	6	78413	78418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223242
1528	NC_011529	TTG	2	6	78446	78451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223242
1529	NC_011529	AGG	2	6	78470	78475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223242
1530	NC_011529	GCG	2	6	78568	78573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223242
1531	NC_011529	AAG	2	6	78631	78636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223242
1532	NC_011529	TGA	2	6	78653	78658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223242
1533	NC_011529	TCG	2	6	78674	78679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223242
1534	NC_011529	CCA	2	6	78692	78697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223242
1535	NC_011529	AGA	2	6	78719	78724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223242
1536	NC_011529	AAG	2	6	79053	79058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223243
1537	NC_011529	TCT	2	6	79069	79074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223243
1538	NC_011529	CTG	2	6	79083	79088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223243
1539	NC_011529	ATTG	2	8	79100	79107	25 %	50 %	25 %	0 %	212223243
1540	NC_011529	CAC	2	6	79111	79116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223243
1541	NC_011529	CAA	2	6	79136	79141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223243
1542	NC_011529	ATG	2	6	79180	79185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223243
1543	NC_011529	CCTGCC	2	12	79258	79269	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	212223243
1544	NC_011529	ACC	2	6	79299	79304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223243
1545	NC_011529	GGT	2	6	79319	79324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223243
1546	NC_011529	GTT	3	9	79358	79366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223243
1547	NC_011529	ATGT	2	8	79407	79414	25 %	50 %	25 %	0 %	212223243
1548	NC_011529	GAG	2	6	79433	79438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223243
1549	NC_011529	TTA	2	6	79456	79461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223243
1550	NC_011529	AAT	2	6	79466	79471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223243
1551	NC_011529	CAA	2	6	79498	79503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223243
1552	NC_011529	TTC	2	6	79557	79562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223243
1553	NC_011529	TTG	2	6	79597	79602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223243
1554	NC_011529	TGAA	2	8	79612	79619	50 %	25 %	25 %	0 %	212223243
1555	NC_011529	GAA	2	6	79625	79630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223243
1556	NC_011529	TAG	2	6	79720	79725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223243
1557	NC_011529	ATA	2	6	79740	79745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223243
1558	NC_011529	GAT	2	6	79749	79754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223243
1559	NC_011529	TCT	2	6	79804	79809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223243
1560	NC_011529	GAA	2	6	79812	79817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223243
1561	NC_011529	TG	3	6	79820	79825	0 %	50 %	50 %	0 %	212223243
1562	NC_011529	GGT	2	6	79853	79858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223243
1563	NC_011529	GAA	2	6	79873	79878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223244
1564	NC_011529	T	6	6	79898	79903	0 %	100 %	0 %	0 %	212223244
1565	NC_011529	CTT	2	6	79966	79971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223244
1566	NC_011529	CAG	2	6	80036	80041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223244
1567	NC_011529	AG	4	8	80040	80047	50 %	0 %	50 %	0 %	212223244
1568	NC_011529	GA	3	6	80243	80248	50 %	0 %	50 %	0 %	212223244
1569	NC_011529	GTC	2	6	80270	80275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223244
1570	NC_011529	CTC	2	6	80315	80320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223244
1571	NC_011529	CTC	2	6	80338	80343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223244
1572	NC_011529	TTTTG	2	10	80386	80395	0 %	80 %	20 %	0 %	212223244
1573	NC_011529	ATG	2	6	80414	80419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223244
1574	NC_011529	ACA	2	6	80514	80519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223244
1575	NC_011529	GAA	2	6	80614	80619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223244
1576	NC_011529	TGA	2	6	80688	80693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223244
1577	NC_011529	ACG	2	6	80768	80773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223244
1578	NC_011529	TCC	2	6	80778	80783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223244
1579	NC_011529	GGT	2	6	80802	80807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223244
1580	NC_011529	TGG	2	6	80824	80829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223244
1581	NC_011529	CTA	2	6	81385	81390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223245
1582	NC_011529	AGG	2	6	81465	81470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223245
1583	NC_011529	GGA	2	6	81521	81526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223245
1584	NC_011529	GAG	2	6	81567	81572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223245
1585	NC_011529	GGA	2	6	81593	81598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223245
1586	NC_011529	AAG	2	6	81599	81604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223245
1587	NC_011529	ATA	2	6	81672	81677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223245
1588	NC_011529	GTT	2	6	81935	81940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223246
1589	NC_011529	ATT	2	6	82000	82005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223246
1590	NC_011529	AAT	2	6	82117	82122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223246
1591	NC_011529	A	6	6	82169	82174	100 %	0 %	0 %	0 %	212223246
1592	NC_011529	GAG	2	6	82192	82197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223246
1593	NC_011529	ACT	3	9	82529	82537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223247
1594	NC_011529	TCT	2	6	82625	82630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223247
1595	NC_011529	GGAAC	2	10	82651	82660	40 %	0 %	40 %	20 %	212223247
1596	NC_011529	AG	3	6	82668	82673	50 %	0 %	50 %	0 %	212223247
1597	NC_011529	TTG	2	6	82751	82756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223247
1598	NC_011529	CGT	2	6	82761	82766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223247
1599	NC_011529	CAA	2	6	82821	82826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223247
1600	NC_011529	ATC	2	6	82894	82899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223247
1601	NC_011529	C	6	6	82905	82910	0 %	0 %	0 %	100 %	212223247
1602	NC_011529	GGAAA	2	10	82921	82930	60 %	0 %	40 %	0 %	212223247
1603	NC_011529	CCT	2	6	82980	82985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223247
1604	NC_011529	AT	3	6	83019	83024	50 %	50 %	0 %	0 %	212223247
1605	NC_011529	GGA	2	6	83037	83042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223247
1606	NC_011529	GA	3	6	83058	83063	50 %	0 %	50 %	0 %	212223247
1607	NC_011529	AGC	2	6	83279	83284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223248
1608	NC_011529	CGA	2	6	83388	83393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223248
1609	NC_011529	AAG	2	6	83401	83406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223248
1610	NC_011529	GAG	2	6	83410	83415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223248
1611	NC_011529	AAG	2	6	83662	83667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223248
1612	NC_011529	GAA	2	6	83704	83709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223249
1613	NC_011529	AG	3	6	83753	83758	50 %	0 %	50 %	0 %	212223249
1614	NC_011529	GAA	2	6	83770	83775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223249
1615	NC_011529	CAAGAA	2	12	83785	83796	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	212223249
1616	NC_011529	CCT	2	6	83851	83856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223249
1617	NC_011529	GCG	2	6	83858	83863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223249
1618	NC_011529	CTC	2	6	83897	83902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223249
1619	NC_011529	CTT	2	6	83924	83929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223249
1620	NC_011529	TC	3	6	83956	83961	0 %	50 %	0 %	50 %	212223249
1621	NC_011529	AAG	2	6	84011	84016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223249
1622	NC_011529	CAGG	2	8	84034	84041	25 %	0 %	50 %	25 %	212223249
1623	NC_011529	AGG	3	9	84117	84125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223249
1624	NC_011529	GA	3	6	84179	84184	50 %	0 %	50 %	0 %	212223249
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1626	NC_011529	GTT	2	6	84238	84243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223250
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