MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_011529	ATA	2	6	1067329	1067334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224316
19002	NC_011529	CGA	2	6	1067349	1067354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224316
19003	NC_011529	CGT	2	6	1067379	1067384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224316
19004	NC_011529	A	6	6	1067431	1067436	100 %	0 %	0 %	0 %	212224316
19005	NC_011529	AAT	2	6	1067466	1067471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224316
19006	NC_011529	GAT	2	6	1067503	1067508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224316
19007	NC_011529	GAA	2	6	1067527	1067532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224316
19008	NC_011529	TCG	2	6	1067561	1067566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224316
19009	NC_011529	AAG	2	6	1067585	1067590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224316
19010	NC_011529	GCT	2	6	1067647	1067652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224316
19011	NC_011529	AGGA	2	8	1067695	1067702	50 %	0 %	50 %	0 %	212224316
19012	NC_011529	ATA	2	6	1067725	1067730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224316
19013	NC_011529	TCG	2	6	1067873	1067878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224317
19014	NC_011529	CTT	2	6	1067907	1067912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224317
19015	NC_011529	GCC	2	6	1067935	1067940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224317
19016	NC_011529	TC	3	6	1067959	1067964	0 %	50 %	0 %	50 %	212224317
19017	NC_011529	TTG	2	6	1068092	1068097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224317
19018	NC_011529	GGA	2	6	1068101	1068106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224317
19019	NC_011529	CTC	2	6	1068217	1068222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224317
19020	NC_011529	TCG	2	6	1068272	1068277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224317
19021	NC_011529	CGA	2	6	1068452	1068457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224318
19022	NC_011529	GAC	2	6	1068474	1068479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224318
19023	NC_011529	CCT	2	6	1068599	1068604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224318
19024	NC_011529	GTA	2	6	1068660	1068665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224318
19025	NC_011529	TCG	2	6	1068814	1068819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224318
19026	NC_011529	AG	3	6	1068968	1068973	50 %	0 %	50 %	0 %	212224318
19027	NC_011529	C	6	6	1068995	1069000	0 %	0 %	0 %	100 %	212224318
19028	NC_011529	ACG	2	6	1069009	1069014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224318
19029	NC_011529	TGG	2	6	1069063	1069068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224318
19030	NC_011529	CCT	2	6	1069082	1069087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224318
19031	NC_011529	CGA	2	6	1069103	1069108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224318
19032	NC_011529	GAA	2	6	1069113	1069118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224318
19033	NC_011529	ACC	2	6	1069138	1069143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224319
19034	NC_011529	G	6	6	1069288	1069293	0 %	0 %	100 %	0 %	212224319
19035	NC_011529	CTC	2	6	1069314	1069319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224319
19036	NC_011529	GAAG	2	8	1069421	1069428	50 %	0 %	50 %	0 %	212224319
19037	NC_011529	GAG	2	6	1069431	1069436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224319
19038	NC_011529	GGA	2	6	1069467	1069472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224319
19039	NC_011529	CCG	2	6	1069501	1069506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224319
19040	NC_011529	GAAGGA	2	12	1069518	1069529	50 %	0 %	50 %	0 %	212224319
19041	NC_011529	T	7	7	1069581	1069587	0 %	100 %	0 %	0 %	212224320
19042	NC_011529	CTC	2	6	1069604	1069609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224320
19043	NC_011529	GAAG	2	8	1069683	1069690	50 %	0 %	50 %	0 %	212224320
19044	NC_011529	ATC	2	6	1069849	1069854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224320
19045	NC_011529	CTC	2	6	1069894	1069899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224320
19046	NC_011529	TCG	2	6	1070018	1070023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224320
19047	NC_011529	TCT	2	6	1070041	1070046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224320
19048	NC_011529	TGT	2	6	1070199	1070204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224321
19049	NC_011529	TCA	2	6	1070237	1070242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224321
19050	NC_011529	TCT	2	6	1070250	1070255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224321
19051	NC_011529	CTC	2	6	1070263	1070268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224321
19052	NC_011529	AAC	2	6	1070311	1070316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224321
19053	NC_011529	GTT	2	6	1070329	1070334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224321
19054	NC_011529	TTCTC	2	10	1070397	1070406	0 %	60 %	0 %	40 %	212224321
19055	NC_011529	TC	3	6	1070435	1070440	0 %	50 %	0 %	50 %	212224321
19056	NC_011529	GA	3	6	1070552	1070557	50 %	0 %	50 %	0 %	212224322
19057	NC_011529	TGCTCG	2	12	1070609	1070620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224322
19058	NC_011529	GGC	2	6	1070628	1070633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224322
19059	NC_011529	GAA	2	6	1070655	1070660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224322
19060	NC_011529	CGA	2	6	1070811	1070816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224323
19061	NC_011529	TAC	2	6	1070854	1070859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224323
19062	NC_011529	TTC	2	6	1070872	1070877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224323
19063	NC_011529	TTC	2	6	1070920	1070925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224323
19064	NC_011529	CTG	2	6	1071010	1071015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224323
19065	NC_011529	CTC	2	6	1071088	1071093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224323
19066	NC_011529	CAT	2	6	1071099	1071104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224323
19067	NC_011529	CT	3	6	1071132	1071137	0 %	50 %	0 %	50 %	212224323
19068	NC_011529	GGC	2	6	1071283	1071288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224323
19069	NC_011529	TGG	2	6	1071295	1071300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224323
19070	NC_011529	TCA	2	6	1071314	1071319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224323
19071	NC_011529	CAC	2	6	1071432	1071437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224323
19072	NC_011529	GGA	2	6	1071498	1071503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224323
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19074	NC_011529	GAA	2	6	1071690	1071695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224323
19075	NC_011529	GAG	2	6	1071706	1071711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224323
19076	NC_011529	TTG	2	6	1071722	1071727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224323
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19082	NC_011529	TAA	2	6	1072280	1072285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224324
19083	NC_011529	TCC	2	6	1072349	1072354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224324
19084	NC_011529	GCT	2	6	1072374	1072379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224324
19085	NC_011529	ATT	2	6	1072398	1072403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224324
19086	NC_011529	CCAT	2	8	1072435	1072442	25 %	25 %	0 %	50 %	212224324
19087	NC_011529	CAAAG	2	10	1072495	1072504	60 %	0 %	20 %	20 %	212224324
19088	NC_011529	GAA	2	6	1072545	1072550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224324
19089	NC_011529	CTT	2	6	1072590	1072595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224324
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19092	NC_011529	CAG	2	6	1072900	1072905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224325
19093	NC_011529	GAT	2	6	1072961	1072966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224325
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19096	NC_011529	CCG	2	6	1073190	1073195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224325
19097	NC_011529	GAA	2	6	1073242	1073247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224325
19098	NC_011529	GCCT	2	8	1073277	1073284	0 %	25 %	25 %	50 %	212224325
19099	NC_011529	TCC	2	6	1073355	1073360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224325
19100	NC_011529	CTTGG	2	10	1073427	1073436	0 %	40 %	40 %	20 %	212224326
19101	NC_011529	CAAG	2	8	1073440	1073447	50 %	0 %	25 %	25 %	212224326
19102	NC_011529	ATG	2	6	1073452	1073457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224326
19103	NC_011529	AGT	2	6	1073544	1073549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224326
19104	NC_011529	CGT	2	6	1073568	1073573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224326
19105	NC_011529	GGAA	2	8	1073607	1073614	50 %	0 %	50 %	0 %	212224326
19106	NC_011529	AGG	2	6	1073791	1073796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224326
19107	NC_011529	G	6	6	1073801	1073806	0 %	0 %	100 %	0 %	212224326
19108	NC_011529	AGA	2	6	1073826	1073831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224326
19109	NC_011529	CAT	2	6	1073837	1073842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224326
19110	NC_011529	TA	3	6	1073944	1073949	50 %	50 %	0 %	0 %	212224326
19111	NC_011529	GCTCA	2	10	1073973	1073982	20 %	20 %	20 %	40 %	212224326
19112	NC_011529	TTC	2	6	1074183	1074188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224326
19113	NC_011529	GA	3	6	1074241	1074246	50 %	0 %	50 %	0 %	212224326
19114	NC_011529	GCC	2	6	1074303	1074308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224326
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19116	NC_011529	AAAG	2	8	1074381	1074388	75 %	0 %	25 %	0 %	212224326
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19231	NC_011529	TAA	2	6	1080134	1080139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224331
19232	NC_011529	GAC	2	6	1080170	1080175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224331
19233	NC_011529	ACA	2	6	1080197	1080202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224331
19234	NC_011529	GGC	2	6	1080334	1080339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224331
19235	NC_011529	GGC	2	6	1080385	1080390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224331
19236	NC_011529	A	6	6	1080395	1080400	100 %	0 %	0 %	0 %	212224331
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19238	NC_011529	CGGC	2	8	1080623	1080630	0 %	0 %	50 %	50 %	212224332
19239	NC_011529	CT	3	6	1080737	1080742	0 %	50 %	0 %	50 %	212224332
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19242	NC_011529	CTC	3	9	1080849	1080857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224332
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19247	NC_011529	CAA	2	6	1081013	1081018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224332
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19253	NC_011529	CTG	2	6	1081196	1081201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224332
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19332	NC_011529	ACAGTA	2	12	1085175	1085186	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212224337
19333	NC_011529	GTT	2	6	1085187	1085192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224337
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19344	NC_011529	GTG	2	6	1085718	1085723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224338
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19346	NC_011529	TTG	2	6	1085880	1085885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224338
19347	NC_011529	ACA	2	6	1086009	1086014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224338
19348	NC_011529	ACTC	2	8	1086073	1086080	25 %	25 %	0 %	50 %	212224338
19349	NC_011529	CTGC	2	8	1086120	1086127	0 %	25 %	25 %	50 %	212224338
19350	NC_011529	GCT	2	6	1086151	1086156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224338
19351	NC_011529	GTT	2	6	1086179	1086184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224338
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19353	NC_011529	CTG	2	6	1086263	1086268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224338
19354	NC_011529	GCA	3	9	1086297	1086305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224338
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19357	NC_011529	CTC	2	6	1086626	1086631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224339
19358	NC_011529	GCTG	2	8	1086632	1086639	0 %	25 %	50 %	25 %	212224339
19359	NC_011529	TTG	2	6	1086716	1086721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224339
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19362	NC_011529	GC	3	6	1086818	1086823	0 %	0 %	50 %	50 %	212224339
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19377	NC_011529	AG	3	6	1087691	1087696	50 %	0 %	50 %	0 %	212224340
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19434	NC_011529	ATG	2	6	1091237	1091242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224344
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19438	NC_011529	ACAA	2	8	1091405	1091412	75 %	0 %	0 %	25 %	212224344
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19445	NC_011529	AG	3	6	1091678	1091683	50 %	0 %	50 %	0 %	212224344
19446	NC_011529	GAG	2	6	1091780	1091785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224344
19447	NC_011529	CAG	2	6	1091828	1091833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224344
19448	NC_011529	AGG	2	6	1091919	1091924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224344
19449	NC_011529	TCG	2	6	1092033	1092038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224344
19450	NC_011529	AT	3	6	1092044	1092049	50 %	50 %	0 %	0 %	212224344
19451	NC_011529	TGC	2	6	1092118	1092123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224345
19452	NC_011529	GAA	2	6	1092125	1092130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224345
19453	NC_011529	CCA	2	6	1092149	1092154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224345
19454	NC_011529	AGG	2	6	1092181	1092186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224345
19455	NC_011529	ATGG	2	8	1092249	1092256	25 %	25 %	50 %	0 %	212224345
19456	NC_011529	A	6	6	1092278	1092283	100 %	0 %	0 %	0 %	212224345
19457	NC_011529	CCG	2	6	1092316	1092321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224345
19458	NC_011529	AGGA	2	8	1092328	1092335	50 %	0 %	50 %	0 %	212224345
19459	NC_011529	AGGC	2	8	1092355	1092362	25 %	0 %	50 %	25 %	212224345
19460	NC_011529	AAAT	2	8	1092412	1092419	75 %	25 %	0 %	0 %	212224345
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19462	NC_011529	GAT	2	6	1092494	1092499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224346
19463	NC_011529	CTG	2	6	1092559	1092564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224346
19464	NC_011529	TAA	2	6	1092675	1092680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224346
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