MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_011529	CT	3	6	982465	982470	0 %	50 %	0 %	50 %	212224216
17503	NC_011529	CGA	2	6	982541	982546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224216
17504	NC_011529	ATT	2	6	982548	982553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224216
17505	NC_011529	TCC	2	6	982585	982590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224216
17506	NC_011529	GGA	2	6	982592	982597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224216
17507	NC_011529	TGG	2	6	982648	982653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224216
17508	NC_011529	CA	3	6	982731	982736	50 %	0 %	0 %	50 %	212224216
17509	NC_011529	GCG	2	6	982741	982746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224216
17510	NC_011529	TCC	2	6	982792	982797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224216
17511	NC_011529	GTT	2	6	982905	982910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224216
17512	NC_011529	GAA	2	6	982964	982969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224216
17513	NC_011529	AGA	2	6	983039	983044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224216
17514	NC_011529	GAG	2	6	983072	983077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224216
17515	NC_011529	CCG	2	6	983092	983097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224216
17516	NC_011529	CTT	2	6	983100	983105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224216
17517	NC_011529	TCA	2	6	983110	983115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224216
17518	NC_011529	GAA	2	6	983160	983165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224216
17519	NC_011529	TACT	2	8	983414	983421	25 %	50 %	0 %	25 %	212224217
17520	NC_011529	TGA	2	6	983426	983431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224217
17521	NC_011529	TAG	2	6	983525	983530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224217
17522	NC_011529	GA	3	6	983608	983613	50 %	0 %	50 %	0 %	212224217
17523	NC_011529	CATA	2	8	983615	983622	50 %	25 %	0 %	25 %	212224217
17524	NC_011529	AGA	2	6	983627	983632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224217
17525	NC_011529	A	6	6	983677	983682	100 %	0 %	0 %	0 %	212224217
17526	NC_011529	ACA	2	6	983723	983728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224217
17527	NC_011529	CAC	2	6	983763	983768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224217
17528	NC_011529	AAC	2	6	983890	983895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224217
17529	NC_011529	CGG	2	6	984010	984015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224217
17530	NC_011529	GAATG	2	10	984096	984105	40 %	20 %	40 %	0 %	212224217
17531	NC_011529	CTC	2	6	984129	984134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224217
17532	NC_011529	CCTT	2	8	984158	984165	0 %	50 %	0 %	50 %	212224218
17533	NC_011529	CTT	2	6	984177	984182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224218
17534	NC_011529	CTC	3	9	984210	984218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224218
17535	NC_011529	GAG	2	6	984258	984263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224218
17536	NC_011529	CTT	2	6	984339	984344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224218
17537	NC_011529	CTC	2	6	984349	984354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224218
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17539	NC_011529	TCCTC	2	10	984371	984380	0 %	40 %	0 %	60 %	212224218
17540	NC_011529	CTT	2	6	984561	984566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224218
17541	NC_011529	CAC	2	6	984657	984662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224218
17542	NC_011529	ACCTCG	2	12	984688	984699	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212224218
17543	NC_011529	CGC	2	6	984728	984733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224218
17544	NC_011529	CTG	2	6	984745	984750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224218
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17549	NC_011529	TCC	2	6	984970	984975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224218
17550	NC_011529	TTCC	2	8	985038	985045	0 %	50 %	0 %	50 %	212224218
17551	NC_011529	AGT	2	6	985058	985063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224218
17552	NC_011529	TCG	2	6	985069	985074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224218
17553	NC_011529	CG	3	6	985073	985078	0 %	0 %	50 %	50 %	212224218
17554	NC_011529	GTCC	2	8	985126	985133	0 %	25 %	25 %	50 %	212224218
17555	NC_011529	AGA	2	6	985175	985180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224218
17556	NC_011529	CTG	2	6	985281	985286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224218
17557	NC_011529	CTG	2	6	985315	985320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224218
17558	NC_011529	CTC	2	6	985365	985370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224218
17559	NC_011529	TCT	2	6	985376	985381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224218
17560	NC_011529	GGT	2	6	985478	985483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224218
17561	NC_011529	AT	3	6	985515	985520	50 %	50 %	0 %	0 %	212224218
17562	NC_011529	CT	3	6	985551	985556	0 %	50 %	0 %	50 %	212224218
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17564	NC_011529	GATT	2	8	985718	985725	25 %	50 %	25 %	0 %	212224218
17565	NC_011529	CTTC	2	8	985745	985752	0 %	50 %	0 %	50 %	212224218
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17585	NC_011529	TCG	2	6	986837	986842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224219
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17588	NC_011529	GA	3	6	987046	987051	50 %	0 %	50 %	0 %	212224220
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17602	NC_011529	CGA	2	6	987730	987735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224221
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17607	NC_011529	CCA	2	6	988038	988043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224221
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17611	NC_011529	CGA	2	6	988258	988263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224221
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17617	NC_011529	TC	3	6	988556	988561	0 %	50 %	0 %	50 %	212224221
17618	NC_011529	CTC	2	6	988610	988615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224221
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17975	NC_011529	CCT	2	6	1011929	1011934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224240
17976	NC_011529	CTT	2	6	1011968	1011973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224240
17977	NC_011529	GAG	2	6	1012013	1012018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224240
17978	NC_011529	CGA	2	6	1012024	1012029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224240
17979	NC_011529	TAT	2	6	1012103	1012108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224240
17980	NC_011529	CTC	2	6	1012160	1012165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224240
17981	NC_011529	CAC	2	6	1012204	1012209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224240
17982	NC_011529	CGC	2	6	1012306	1012311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224240
17983	NC_011529	GAA	2	6	1012387	1012392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224240
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17986	NC_011529	AGCCT	2	10	1012489	1012498	20 %	20 %	20 %	40 %	212224240
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17991	NC_011529	GA	3	6	1012837	1012842	50 %	0 %	50 %	0 %	212224240
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18000	NC_011529	CTT	3	9	1013159	1013167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224241

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