MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_011529	GTC	2	6	952683	952688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224180
17002	NC_011529	ACTC	2	8	952702	952709	25 %	25 %	0 %	50 %	212224180
17003	NC_011529	TCG	2	6	952786	952791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224180
17004	NC_011529	ATC	2	6	952808	952813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224180
17005	NC_011529	ATG	2	6	952830	952835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224180
17006	NC_011529	CAA	2	6	952873	952878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224180
17007	NC_011529	CTG	2	6	952980	952985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224180
17008	NC_011529	GAT	2	6	953034	953039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224180
17009	NC_011529	CTGG	2	8	953040	953047	0 %	25 %	50 %	25 %	212224180
17010	NC_011529	CCA	2	6	953115	953120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224180
17011	NC_011529	TTC	2	6	953130	953135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224180
17012	NC_011529	GCT	2	6	953141	953146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224180
17013	NC_011529	ATT	2	6	953244	953249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224180
17014	NC_011529	AAGG	2	8	953264	953271	50 %	0 %	50 %	0 %	212224180
17015	NC_011529	GTTT	2	8	953307	953314	0 %	75 %	25 %	0 %	212224180
17016	NC_011529	TAT	2	6	953333	953338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224180
17017	NC_011529	ATT	2	6	953358	953363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224180
17018	NC_011529	CAG	2	6	953383	953388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224180
17019	NC_011529	GCT	2	6	953616	953621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224181
17020	NC_011529	TTG	2	6	953630	953635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224181
17021	NC_011529	GAA	2	6	953826	953831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224181
17022	NC_011529	TCC	2	6	953837	953842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224181
17023	NC_011529	GAG	2	6	953968	953973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224181
17024	NC_011529	AGG	2	6	954029	954034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224181
17025	NC_011529	GAG	2	6	954040	954045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224181
17026	NC_011529	GA	3	6	954091	954096	50 %	0 %	50 %	0 %	212224181
17027	NC_011529	GAC	2	6	954130	954135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224181
17028	NC_011529	GCC	2	6	954163	954168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224181
17029	NC_011529	AGG	3	9	954218	954226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224181
17030	NC_011529	TGGA	2	8	954412	954419	25 %	25 %	50 %	0 %	212224181
17031	NC_011529	AAG	2	6	954430	954435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224181
17032	NC_011529	TCC	2	6	954461	954466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224181
17033	NC_011529	GGA	2	6	954472	954477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224181
17034	NC_011529	CAA	2	6	954501	954506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224181
17035	NC_011529	GGAC	2	8	954573	954580	25 %	0 %	50 %	25 %	212224181
17036	NC_011529	GCA	2	6	954914	954919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224182
17037	NC_011529	GGA	2	6	954958	954963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224182
17038	NC_011529	ACT	2	6	954984	954989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224182
17039	NC_011529	G	6	6	955092	955097	0 %	0 %	100 %	0 %	212224182
17040	NC_011529	TTC	2	6	955281	955286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224183
17041	NC_011529	TGCC	2	8	955300	955307	0 %	25 %	25 %	50 %	212224183
17042	NC_011529	GCA	2	6	955319	955324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224183
17043	NC_011529	CAC	2	6	955330	955335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224183
17044	NC_011529	TAC	2	6	955376	955381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224183
17045	NC_011529	GCAAT	2	10	955398	955407	40 %	20 %	20 %	20 %	212224183
17046	NC_011529	TAT	2	6	955433	955438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224183
17047	NC_011529	AGTC	2	8	955446	955453	25 %	25 %	25 %	25 %	212224183
17048	NC_011529	GA	3	6	955556	955561	50 %	0 %	50 %	0 %	212224183
17049	NC_011529	CAA	2	6	955660	955665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224183
17050	NC_011529	TGAATG	2	12	955827	955838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224183
17051	NC_011529	CCT	2	6	955843	955848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224183
17052	NC_011529	ATC	2	6	955889	955894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224183
17053	NC_011529	AGA	2	6	956208	956213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224183
17054	NC_011529	GTC	2	6	956222	956227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224183
17055	NC_011529	TCATT	2	10	956268	956277	20 %	60 %	0 %	20 %	212224183
17056	NC_011529	TGTT	2	8	956374	956381	0 %	75 %	25 %	0 %	212224184
17057	NC_011529	CAT	2	6	956501	956506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224184
17058	NC_011529	GAT	2	6	956534	956539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224184
17059	NC_011529	CAGG	2	8	956579	956586	25 %	0 %	50 %	25 %	212224184
17060	NC_011529	TTC	3	9	956643	956651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224184
17061	NC_011529	CT	4	8	956676	956683	0 %	50 %	0 %	50 %	212224184
17062	NC_011529	TTAC	2	8	956689	956696	25 %	50 %	0 %	25 %	212224184
17063	NC_011529	T	6	6	956706	956711	0 %	100 %	0 %	0 %	212224184
17064	NC_011529	AGC	2	6	956763	956768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224184
17065	NC_011529	CCTT	2	8	956860	956867	0 %	50 %	0 %	50 %	212224184
17066	NC_011529	TCC	2	6	956924	956929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224184
17067	NC_011529	TGG	2	6	957040	957045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224184
17068	NC_011529	TGA	2	6	957052	957057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224184
17069	NC_011529	AG	3	6	957059	957064	50 %	0 %	50 %	0 %	212224184
17070	NC_011529	GAG	2	6	957079	957084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224184
17071	NC_011529	ACT	2	6	957109	957114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224185
17072	NC_011529	TC	3	6	957122	957127	0 %	50 %	0 %	50 %	212224185
17073	NC_011529	GGC	2	6	957136	957141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224185
17074	NC_011529	TCAA	2	8	957146	957153	50 %	25 %	0 %	25 %	212224185
17075	NC_011529	TCT	2	6	957225	957230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224185
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17077	NC_011529	AGG	2	6	957268	957273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224185
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17079	NC_011529	T	6	6	957300	957305	0 %	100 %	0 %	0 %	212224185
17080	NC_011529	CCT	2	6	957421	957426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224185
17081	NC_011529	GA	3	6	957430	957435	50 %	0 %	50 %	0 %	212224185
17082	NC_011529	C	6	6	957443	957448	0 %	0 %	0 %	100 %	212224185
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17085	NC_011529	AACC	2	8	957615	957622	50 %	0 %	0 %	50 %	212224186
17086	NC_011529	AGC	2	6	957669	957674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224186
17087	NC_011529	CCA	2	6	957772	957777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224186
17088	NC_011529	GAC	2	6	957841	957846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224186
17089	NC_011529	AGG	2	6	957889	957894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224186
17090	NC_011529	CTC	2	6	957906	957911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224186
17091	NC_011529	CGA	2	6	957975	957980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224186
17092	NC_011529	CAT	2	6	958017	958022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224186
17093	NC_011529	GAA	2	6	958045	958050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224186
17094	NC_011529	A	6	6	958049	958054	100 %	0 %	0 %	0 %	212224186
17095	NC_011529	GTG	2	6	958096	958101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224186
17096	NC_011529	GA	3	6	958154	958159	50 %	0 %	50 %	0 %	212224186
17097	NC_011529	CGG	2	6	958174	958179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224186
17098	NC_011529	CTA	2	6	958182	958187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224186
17099	NC_011529	AGG	2	6	958432	958437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224187
17100	NC_011529	TAA	2	6	958449	958454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224187
17101	NC_011529	GAG	2	6	958472	958477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224187
17102	NC_011529	AGA	2	6	958519	958524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224187
17103	NC_011529	AGTTCG	2	12	958566	958577	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212224187
17104	NC_011529	TCAT	2	8	958655	958662	25 %	50 %	0 %	25 %	212224187
17105	NC_011529	CTG	2	6	958679	958684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224187
17106	NC_011529	AAG	2	6	958727	958732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224187
17107	NC_011529	CCA	2	6	958786	958791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224187
17108	NC_011529	GAG	2	6	958897	958902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224187
17109	NC_011529	AAT	2	6	958912	958917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224187
17110	NC_011529	TAG	2	6	958933	958938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224187
17111	NC_011529	GGA	2	6	958958	958963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224187
17112	NC_011529	AT	3	6	959077	959082	50 %	50 %	0 %	0 %	212224187
17113	NC_011529	GAG	2	6	959093	959098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224187
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17117	NC_011529	TCC	2	6	959254	959259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224188
17118	NC_011529	ATTC	2	8	959260	959267	25 %	50 %	0 %	25 %	212224188
17119	NC_011529	AGA	2	6	959269	959274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224188
17120	NC_011529	AGG	2	6	959301	959306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224188
17121	NC_011529	AGA	2	6	959368	959373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224188
17122	NC_011529	TTC	2	6	959438	959443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224188
17123	NC_011529	TCC	2	6	959447	959452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224188
17124	NC_011529	CCA	2	6	959531	959536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224189
17125	NC_011529	AGGA	2	8	959775	959782	50 %	0 %	50 %	0 %	212224189
17126	NC_011529	GAA	3	9	959891	959899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224189
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17129	NC_011529	CTACCT	2	12	960047	960058	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	212224189
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17137	NC_011529	CGT	2	6	960356	960361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224189
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17149	NC_011529	AGGAC	2	10	961061	961070	40 %	0 %	40 %	20 %	212224189
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17185	NC_011529	CGT	3	9	963495	963503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224191
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17208	NC_011529	GCGTT	2	10	964760	964769	0 %	40 %	40 %	20 %	212224192
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17225	NC_011529	AAGT	2	8	966326	966333	50 %	25 %	25 %	0 %	212224193
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17228	NC_011529	CCA	2	6	966454	966459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224193
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17230	NC_011529	TTGAGC	2	12	966711	966722	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212224194
17231	NC_011529	CGC	2	6	966779	966784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224194
17232	NC_011529	C	6	6	966835	966840	0 %	0 %	0 %	100 %	212224194
17233	NC_011529	CTT	2	6	966896	966901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224194
17234	NC_011529	CG	3	6	966922	966927	0 %	0 %	50 %	50 %	212224194
17235	NC_011529	CT	3	6	966978	966983	0 %	50 %	0 %	50 %	212224194
17236	NC_011529	AT	3	6	967043	967048	50 %	50 %	0 %	0 %	212224194
17237	NC_011529	CCT	2	6	967186	967191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224194
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17480	NC_011529	AAAAG	2	10	981277	981286	80 %	0 %	20 %	0 %	212224214
17481	NC_011529	TTC	2	6	981297	981302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224214
17482	NC_011529	GA	3	6	981342	981347	50 %	0 %	50 %	0 %	212224214
17483	NC_011529	TGGT	2	8	981387	981394	0 %	50 %	50 %	0 %	212224214
17484	NC_011529	CGT	2	6	981430	981435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224214
17485	NC_011529	TGG	2	6	981490	981495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224214
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