MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_011529	CTT	2	6	925016	925021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224149
16502	NC_011529	CACCTC	2	12	925037	925048	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	212224149
16503	NC_011529	G	6	6	925156	925161	0 %	0 %	100 %	0 %	212224149
16504	NC_011529	TAG	2	6	925327	925332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224150
16505	NC_011529	CTT	2	6	925346	925351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224150
16506	NC_011529	CAAC	2	8	925381	925388	50 %	0 %	0 %	50 %	212224150
16507	NC_011529	GAG	2	6	925524	925529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224150
16508	NC_011529	TGA	2	6	925535	925540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224150
16509	NC_011529	CGTT	2	8	925573	925580	0 %	50 %	25 %	25 %	212224150
16510	NC_011529	AAG	2	6	925605	925610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224150
16511	NC_011529	ATC	3	9	925626	925634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224150
16512	NC_011529	GGT	2	6	925638	925643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224150
16513	NC_011529	AGGA	2	8	925660	925667	50 %	0 %	50 %	0 %	212224150
16514	NC_011529	AAG	2	6	925668	925673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224150
16515	NC_011529	AG	3	6	925701	925706	50 %	0 %	50 %	0 %	212224150
16516	NC_011529	ATC	2	6	925719	925724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224150
16517	NC_011529	CCTG	2	8	925778	925785	0 %	25 %	25 %	50 %	212224150
16518	NC_011529	CATAGG	2	12	925883	925894	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212224150
16519	NC_011529	CAA	2	6	925913	925918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224150
16520	NC_011529	TCGACG	2	12	925921	925932	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212224150
16521	NC_011529	ACG	2	6	925960	925965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224150
16522	NC_011529	CGT	2	6	925976	925981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224150
16523	NC_011529	GGAA	2	8	926010	926017	50 %	0 %	50 %	0 %	212224150
16524	NC_011529	GCC	2	6	926028	926033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224150
16525	NC_011529	AGG	2	6	926034	926039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224150
16526	NC_011529	GAA	2	6	926077	926082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224150
16527	NC_011529	GCT	2	6	926100	926105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224150
16528	NC_011529	ACG	2	6	926146	926151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224150
16529	NC_011529	ATC	2	6	926265	926270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224150
16530	NC_011529	GCGA	2	8	926298	926305	25 %	0 %	50 %	25 %	212224150
16531	NC_011529	GAA	2	6	926346	926351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224150
16532	NC_011529	CGC	2	6	926380	926385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224150
16533	NC_011529	CTC	2	6	926517	926522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224150
16534	NC_011529	GAG	3	9	926523	926531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224150
16535	NC_011529	AGA	3	9	926560	926568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224150
16536	NC_011529	CGTTGC	2	12	926582	926593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224150
16537	NC_011529	AAG	2	6	926604	926609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224150
16538	NC_011529	TAC	2	6	926616	926621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224150
16539	NC_011529	GA	3	6	926667	926672	50 %	0 %	50 %	0 %	212224150
16540	NC_011529	GAG	2	6	926717	926722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224150
16541	NC_011529	GGA	2	6	926874	926879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224151
16542	NC_011529	GAG	2	6	926920	926925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224151
16543	NC_011529	GTT	2	6	926989	926994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224151
16544	NC_011529	GAG	2	6	927016	927021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224151
16545	NC_011529	ATC	2	6	927040	927045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224151
16546	NC_011529	ATC	2	6	927127	927132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224151
16547	NC_011529	TCG	2	6	927194	927199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224151
16548	NC_011529	GC	3	6	927298	927303	0 %	0 %	50 %	50 %	212224151
16549	NC_011529	GAA	2	6	927307	927312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224151
16550	NC_011529	CCT	3	9	927339	927347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224151
16551	NC_011529	CAGC	2	8	927354	927361	25 %	0 %	25 %	50 %	212224151
16552	NC_011529	TCG	2	6	927362	927367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224151
16553	NC_011529	AGA	2	6	927479	927484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224151
16554	NC_011529	TTTC	2	8	927529	927536	0 %	75 %	0 %	25 %	212224152
16555	NC_011529	CCT	2	6	927565	927570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224152
16556	NC_011529	AT	3	6	927631	927636	50 %	50 %	0 %	0 %	212224152
16557	NC_011529	A	6	6	927662	927667	100 %	0 %	0 %	0 %	212224152
16558	NC_011529	CAG	2	6	927749	927754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224152
16559	NC_011529	ACT	2	6	927771	927776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224152
16560	NC_011529	ATA	2	6	927794	927799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224152
16561	NC_011529	AGGT	2	8	927828	927835	25 %	25 %	50 %	0 %	212224152
16562	NC_011529	TGTCTA	2	12	928065	928076	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212224153
16563	NC_011529	TCT	2	6	928125	928130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224153
16564	NC_011529	GAC	2	6	928144	928149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224153
16565	NC_011529	GCT	2	6	928263	928268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224153
16566	NC_011529	GTC	2	6	928312	928317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224153
16567	NC_011529	CTT	2	6	928351	928356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224153
16568	NC_011529	CTT	2	6	928359	928364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224153
16569	NC_011529	CGA	2	6	928365	928370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224153
16570	NC_011529	TGG	2	6	928383	928388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224153
16571	NC_011529	AGTC	2	8	928404	928411	25 %	25 %	25 %	25 %	212224153
16572	NC_011529	GCC	2	6	928514	928519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224153
16573	NC_011529	CTG	2	6	928634	928639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224153
16574	NC_011529	GAA	2	6	929229	929234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224154
16575	NC_011529	ATTTTT	2	12	929263	929274	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	212224154
16576	NC_011529	TTTA	2	8	929283	929290	25 %	75 %	0 %	0 %	212224154
16577	NC_011529	CCT	2	6	929314	929319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224154
16578	NC_011529	ATA	2	6	929387	929392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224154
16579	NC_011529	GA	3	6	929435	929440	50 %	0 %	50 %	0 %	212224154
16580	NC_011529	TTCA	2	8	929449	929456	25 %	50 %	0 %	25 %	212224154
16581	NC_011529	GGAA	2	8	929574	929581	50 %	0 %	50 %	0 %	212224154
16582	NC_011529	ATT	2	6	929582	929587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224154
16583	NC_011529	TAC	2	6	929620	929625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224154
16584	NC_011529	CAT	2	6	929673	929678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224154
16585	NC_011529	GGAA	2	8	929681	929688	50 %	0 %	50 %	0 %	212224154
16586	NC_011529	AGG	2	6	929806	929811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224154
16587	NC_011529	CA	3	6	929822	929827	50 %	0 %	0 %	50 %	212224154
16588	NC_011529	CTA	2	6	929865	929870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224154
16589	NC_011529	GAG	2	6	929920	929925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224154
16590	NC_011529	CTG	2	6	929977	929982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224154
16591	NC_011529	TAC	2	6	930016	930021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224154
16592	NC_011529	ACG	2	6	930026	930031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224154
16593	NC_011529	A	7	7	930044	930050	100 %	0 %	0 %	0 %	212224154
16594	NC_011529	GCAG	2	8	930070	930077	25 %	0 %	50 %	25 %	212224154
16595	NC_011529	GA	3	6	930115	930120	50 %	0 %	50 %	0 %	212224154
16596	NC_011529	ACA	2	6	930163	930168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224154
16597	NC_011529	GTG	2	6	930201	930206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224154
16598	NC_011529	CCT	2	6	930310	930315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224155
16599	NC_011529	TCT	2	6	930334	930339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224155
16600	NC_011529	CAC	2	6	930362	930367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224155
16601	NC_011529	TCC	2	6	930453	930458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224155
16602	NC_011529	TTA	2	6	930508	930513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224155
16603	NC_011529	CAG	2	6	930515	930520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224155
16604	NC_011529	TACT	2	8	930735	930742	25 %	50 %	0 %	25 %	212224155
16605	NC_011529	CTT	2	6	930776	930781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224155
16606	NC_011529	CAC	2	6	931058	931063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224156
16607	NC_011529	AAC	2	6	931070	931075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224156
16608	NC_011529	CGAG	2	8	931116	931123	25 %	0 %	50 %	25 %	212224156
16609	NC_011529	AGA	2	6	931165	931170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224156
16610	NC_011529	CAA	2	6	931216	931221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224156
16611	NC_011529	AG	3	6	931256	931261	50 %	0 %	50 %	0 %	212224156
16612	NC_011529	CGAG	2	8	931279	931286	25 %	0 %	50 %	25 %	212224156
16613	NC_011529	AGT	3	9	931330	931338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224156
16614	NC_011529	TGAA	2	8	931384	931391	50 %	25 %	25 %	0 %	212224156
16615	NC_011529	AGG	3	9	931446	931454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224156
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16617	NC_011529	CTC	2	6	931553	931558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224157
16618	NC_011529	TTA	2	6	931570	931575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224157
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16620	NC_011529	TCC	2	6	931662	931667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224157
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16982	NC_011529	CCA	2	6	951189	951194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224178
16983	NC_011529	TCA	2	6	951232	951237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224178
16984	NC_011529	CAG	2	6	951241	951246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224178
16985	NC_011529	GGT	2	6	951281	951286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224178
16986	NC_011529	AAT	2	6	951323	951328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224178
16987	NC_011529	GA	3	6	951362	951367	50 %	0 %	50 %	0 %	212224178
16988	NC_011529	GTG	2	6	951391	951396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224178
16989	NC_011529	TCA	2	6	951435	951440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224179
16990	NC_011529	AT	3	6	951587	951592	50 %	50 %	0 %	0 %	212224179
16991	NC_011529	AGT	2	6	951757	951762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224179
16992	NC_011529	GAT	2	6	951773	951778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224179
16993	NC_011529	ATGT	2	8	951785	951792	25 %	50 %	25 %	0 %	212224179
16994	NC_011529	TTCGCA	2	12	951936	951947	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212224180
16995	NC_011529	TGGCT	2	10	952016	952025	0 %	40 %	40 %	20 %	212224180
16996	NC_011529	TTAG	2	8	952026	952033	25 %	50 %	25 %	0 %	212224180
16997	NC_011529	GGA	2	6	952092	952097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224180
16998	NC_011529	TAT	2	6	952233	952238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224180
16999	NC_011529	GCCTTG	2	12	952563	952574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224180
17000	NC_011529	CAG	2	6	952642	952647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224180

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