MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011529	GGTT	2	8	783942	783949	0 %	50 %	50 %	0 %	212223995
14002	NC_011529	TAT	2	6	783967	783972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223995
14003	NC_011529	TAT	2	6	783979	783984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223995
14004	NC_011529	GGC	2	6	783985	783990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223995
14005	NC_011529	CT	3	6	784000	784005	0 %	50 %	0 %	50 %	212223995
14006	NC_011529	GAC	2	6	784473	784478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223996
14007	NC_011529	GGC	2	6	784550	784555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223996
14008	NC_011529	TCT	2	6	784595	784600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223996
14009	NC_011529	CCTT	2	8	784675	784682	0 %	50 %	0 %	50 %	212223996
14010	NC_011529	GTA	2	6	784695	784700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223996
14011	NC_011529	AAC	2	6	784764	784769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223996
14012	NC_011529	GAA	2	6	785087	785092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223997
14013	NC_011529	GCTGA	2	10	785115	785124	20 %	20 %	40 %	20 %	212223997
14014	NC_011529	CCT	2	6	785141	785146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223997
14015	NC_011529	GGA	2	6	785164	785169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223997
14016	NC_011529	A	6	6	785184	785189	100 %	0 %	0 %	0 %	212223997
14017	NC_011529	ACG	2	6	785290	785295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223997
14018	NC_011529	CGG	2	6	785342	785347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223997
14019	NC_011529	GCT	2	6	785354	785359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223997
14020	NC_011529	GTTCT	2	10	785412	785421	0 %	60 %	20 %	20 %	212223997
14021	NC_011529	GAC	2	6	785430	785435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223997
14022	NC_011529	GAG	2	6	785472	785477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223997
14023	NC_011529	GGT	2	6	785885	785890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223998
14024	NC_011529	TGAA	2	8	785914	785921	50 %	25 %	25 %	0 %	212223998
14025	NC_011529	CCT	2	6	785933	785938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223998
14026	NC_011529	CG	3	6	785951	785956	0 %	0 %	50 %	50 %	212223998
14027	NC_011529	GCG	2	6	786010	786015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223998
14028	NC_011529	ATG	2	6	786079	786084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223998
14029	NC_011529	TTC	2	6	786115	786120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223998
14030	NC_011529	TC	3	6	786207	786212	0 %	50 %	0 %	50 %	212223998
14031	NC_011529	GCTC	2	8	786284	786291	0 %	25 %	25 %	50 %	212223998
14032	NC_011529	AG	3	6	786304	786309	50 %	0 %	50 %	0 %	212223998
14033	NC_011529	GGT	2	6	786320	786325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223998
14034	NC_011529	GCC	2	6	786336	786341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223998
14035	NC_011529	AGG	2	6	786394	786399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223998
14036	NC_011529	CTT	2	6	786488	786493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223998
14037	NC_011529	GAT	2	6	786507	786512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223998
14038	NC_011529	TGG	2	6	786550	786555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223998
14039	NC_011529	TAC	2	6	786585	786590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223998
14040	NC_011529	GAG	2	6	786603	786608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223998
14041	NC_011529	CTT	2	6	786636	786641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223998
14042	NC_011529	CTC	2	6	786675	786680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223998
14043	NC_011529	GAG	2	6	786756	786761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223998
14044	NC_011529	GTG	2	6	786815	786820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223998
14045	NC_011529	CTT	2	6	786980	786985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223999
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14050	NC_011529	TCG	2	6	787155	787160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223999
14051	NC_011529	TG	3	6	787168	787173	0 %	50 %	50 %	0 %	212223999
14052	NC_011529	CTC	2	6	787193	787198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223999
14053	NC_011529	TGAG	2	8	787207	787214	25 %	25 %	50 %	0 %	212223999
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14055	NC_011529	CCG	2	6	787287	787292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223999
14056	NC_011529	CG	3	6	787514	787519	0 %	0 %	50 %	50 %	212223999
14057	NC_011529	TTG	3	9	787521	787529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223999
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14059	NC_011529	GTG	2	6	787563	787568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223999
14060	NC_011529	CGT	2	6	787612	787617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223999
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14063	NC_011529	CCGG	2	8	787839	787846	0 %	0 %	50 %	50 %	212223999
14064	NC_011529	TCC	2	6	787899	787904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223999
14065	NC_011529	TCT	2	6	787927	787932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223999
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14070	NC_011529	TCC	2	6	788313	788318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223999
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14072	NC_011529	GCC	2	6	788435	788440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224000
14073	NC_011529	TGA	2	6	788447	788452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224000
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14077	NC_011529	TCG	2	6	788593	788598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224000
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14080	NC_011529	CCG	2	6	788659	788664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224000
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14085	NC_011529	CTC	2	6	789005	789010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224000
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14100	NC_011529	CT	4	8	789900	789907	0 %	50 %	0 %	50 %	212224002
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14103	NC_011529	CTG	2	6	790196	790201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224002
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14105	NC_011529	TAT	2	6	790342	790347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224002
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14107	NC_011529	TCT	2	6	790461	790466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224002
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14110	NC_011529	CTT	2	6	790665	790670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224002
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14120	NC_011529	ATC	2	6	790986	790991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224003
14121	NC_011529	GTC	2	6	791024	791029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224003
14122	NC_011529	TCA	2	6	791097	791102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224003
14123	NC_011529	G	6	6	791123	791128	0 %	0 %	100 %	0 %	212224003
14124	NC_011529	CA	3	6	791149	791154	50 %	0 %	0 %	50 %	212224003
14125	NC_011529	TCC	2	6	791217	791222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224003
14126	NC_011529	CTC	2	6	791223	791228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224003
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14128	NC_011529	AGC	2	6	791336	791341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224003
14129	NC_011529	GGA	2	6	791346	791351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224003
14130	NC_011529	TTG	2	6	791499	791504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224003
14131	NC_011529	TTA	2	6	791524	791529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224003
14132	NC_011529	TGT	2	6	791545	791550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224003
14133	NC_011529	CAT	2	6	791674	791679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224003
14134	NC_011529	TA	4	8	791686	791693	50 %	50 %	0 %	0 %	212224003
14135	NC_011529	TAT	2	6	791738	791743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224003
14136	NC_011529	GGA	2	6	791764	791769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224003
14137	NC_011529	CTTT	2	8	791831	791838	0 %	75 %	0 %	25 %	212224003
14138	NC_011529	CCAT	2	8	791841	791848	25 %	25 %	0 %	50 %	212224003
14139	NC_011529	CCA	2	6	791890	791895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224003
14140	NC_011529	TTC	2	6	792035	792040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224004
14141	NC_011529	AGG	2	6	792056	792061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224004
14142	NC_011529	CTT	2	6	792113	792118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224004
14143	NC_011529	GCT	2	6	792122	792127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224004
14144	NC_011529	ACA	2	6	792147	792152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224004
14145	NC_011529	TGA	2	6	792178	792183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224004
14146	NC_011529	TCG	2	6	792255	792260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224004
14147	NC_011529	CGG	2	6	792264	792269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224004
14148	NC_011529	GAG	2	6	792392	792397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224004
14149	NC_011529	ATT	2	6	792461	792466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224004
14150	NC_011529	GCC	2	6	792493	792498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224004
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14152	NC_011529	CTC	2	6	792735	792740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224005
14153	NC_011529	CAA	2	6	792841	792846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224005
14154	NC_011529	GAA	2	6	792855	792860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224005
14155	NC_011529	GTGG	2	8	792973	792980	0 %	25 %	75 %	0 %	212224006
14156	NC_011529	TTC	2	6	793044	793049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224006
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14158	NC_011529	TGA	2	6	793214	793219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224006
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14161	NC_011529	TAC	2	6	793624	793629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224007
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14184	NC_011529	AG	3	6	795036	795041	50 %	0 %	50 %	0 %	212224009
14185	NC_011529	GAA	2	6	795055	795060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224009
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14210	NC_011529	GGAGG	2	10	796250	796259	20 %	0 %	80 %	0 %	212224009
14211	NC_011529	CAT	2	6	796270	796275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224009
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14220	NC_011529	GGC	2	6	796876	796881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224010
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14223	NC_011529	AAG	2	6	797125	797130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224010
14224	NC_011529	CAA	2	6	797187	797192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224010
14225	NC_011529	AG	3	6	797215	797220	50 %	0 %	50 %	0 %	212224010
14226	NC_011529	TGGA	2	8	797230	797237	25 %	25 %	50 %	0 %	212224010
14227	NC_011529	GC	3	6	797274	797279	0 %	0 %	50 %	50 %	212224010
14228	NC_011529	CCGCTC	2	12	797293	797304	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	212224010
14229	NC_011529	CGC	2	6	797372	797377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224010
14230	NC_011529	GAG	2	6	797401	797406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224010
14231	NC_011529	A	6	6	797409	797414	100 %	0 %	0 %	0 %	212224010
14232	NC_011529	AGG	2	6	797431	797436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224010
14233	NC_011529	TTTTG	2	10	797473	797482	0 %	80 %	20 %	0 %	212224011
14234	NC_011529	GAG	2	6	797498	797503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224011
14235	NC_011529	GGA	2	6	797526	797531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224011
14236	NC_011529	TTC	2	6	797535	797540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224011
14237	NC_011529	GAG	2	6	797618	797623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224011
14238	NC_011529	CGT	2	6	797629	797634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224011
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14240	NC_011529	A	6	6	797668	797673	100 %	0 %	0 %	0 %	212224011
14241	NC_011529	AG	3	6	797765	797770	50 %	0 %	50 %	0 %	212224011
14242	NC_011529	ATA	2	6	797801	797806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224011
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14244	NC_011529	TGA	2	6	797996	798001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224012
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14348	NC_011529	TCA	3	9	803752	803760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224021
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14350	NC_011529	AT	3	6	803905	803910	50 %	50 %	0 %	0 %	212224021
14351	NC_011529	TCCA	2	8	803967	803974	25 %	25 %	0 %	50 %	212224022
14352	NC_011529	AGC	2	6	804012	804017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224022
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14354	NC_011529	GCC	2	6	804090	804095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224022
14355	NC_011529	T	7	7	804165	804171	0 %	100 %	0 %	0 %	212224022
14356	NC_011529	CGA	2	6	804247	804252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224022
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14358	NC_011529	CTT	2	6	804312	804317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224022
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14360	NC_011529	TCT	2	6	804370	804375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224022
14361	NC_011529	CCAAAG	2	12	804382	804393	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	212224022
14362	NC_011529	CGA	2	6	804665	804670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224023
14363	NC_011529	GAAG	2	8	804683	804690	50 %	0 %	50 %	0 %	212224023
14364	NC_011529	ATA	2	6	804699	804704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224023
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14392	NC_011529	GTC	2	6	805870	805875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224025
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14401	NC_011529	TCT	2	6	806445	806450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224026
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14467	NC_011529	GA	3	6	809652	809657	50 %	0 %	50 %	0 %	212224029
14468	NC_011529	AGA	2	6	809721	809726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224029
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14477	NC_011529	GA	4	8	810214	810221	50 %	0 %	50 %	0 %	212224030
14478	NC_011529	GGA	2	6	810313	810318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224031
14479	NC_011529	ACG	2	6	810443	810448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224031
14480	NC_011529	GAGTG	2	10	810493	810502	20 %	20 %	60 %	0 %	212224031
14481	NC_011529	CGC	2	6	810569	810574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224031
14482	NC_011529	A	6	6	810601	810606	100 %	0 %	0 %	0 %	212224031
14483	NC_011529	CTA	2	6	810663	810668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224031
14484	NC_011529	CAGC	2	8	810673	810680	25 %	0 %	25 %	50 %	212224031
14485	NC_011529	GTC	2	6	810733	810738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224031
14486	NC_011529	CAG	2	6	810746	810751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224031
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14489	NC_011529	AGCA	2	8	810946	810953	50 %	0 %	25 %	25 %	212224032
14490	NC_011529	CGT	2	6	810982	810987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224032
14491	NC_011529	ATA	2	6	811043	811048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224032
14492	NC_011529	GAG	2	6	811256	811261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224032
14493	NC_011529	GAG	2	6	811388	811393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224032
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