MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_011529	CCA	2	6	752260	752265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223958
13502	NC_011529	CCCA	2	8	752291	752298	25 %	0 %	0 %	75 %	212223958
13503	NC_011529	CCA	2	6	752386	752391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223958
13504	NC_011529	TGG	2	6	752448	752453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223958
13505	NC_011529	CAA	2	6	752557	752562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223958
13506	NC_011529	ACA	2	6	752585	752590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223958
13507	NC_011529	T	7	7	752624	752630	0 %	100 %	0 %	0 %	212223958
13508	NC_011529	AGG	2	6	752648	752653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223958
13509	NC_011529	CAA	2	6	752679	752684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223958
13510	NC_011529	AGA	2	6	752713	752718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223958
13511	NC_011529	CCT	2	6	752720	752725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223958
13512	NC_011529	AAG	2	6	752785	752790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223958
13513	NC_011529	TCC	2	6	752851	752856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223959
13514	NC_011529	CCT	2	6	752860	752865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223959
13515	NC_011529	GCA	2	6	752877	752882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223959
13516	NC_011529	A	6	6	752882	752887	100 %	0 %	0 %	0 %	212223959
13517	NC_011529	GGT	2	6	753043	753048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223959
13518	NC_011529	AAG	3	9	753071	753079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223959
13519	NC_011529	CCT	2	6	753136	753141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223960
13520	NC_011529	TC	3	6	753180	753185	0 %	50 %	0 %	50 %	212223960
13521	NC_011529	CTC	2	6	753294	753299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223960
13522	NC_011529	GTA	2	6	753312	753317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223960
13523	NC_011529	GTGG	2	8	753325	753332	0 %	25 %	75 %	0 %	212223960
13524	NC_011529	ATT	2	6	753394	753399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223960
13525	NC_011529	TCCTTT	2	12	753439	753450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223960
13526	NC_011529	AGT	2	6	753473	753478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223960
13527	NC_011529	CTT	2	6	753493	753498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223960
13528	NC_011529	TGA	2	6	753611	753616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223960
13529	NC_011529	ACT	2	6	753654	753659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223960
13530	NC_011529	CAG	2	6	753981	753986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223961
13531	NC_011529	AAG	2	6	754064	754069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223961
13532	NC_011529	AGTTG	2	10	754155	754164	20 %	40 %	40 %	0 %	212223961
13533	NC_011529	ATC	2	6	754219	754224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223961
13534	NC_011529	GCG	2	6	754280	754285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223961
13535	NC_011529	CAA	2	6	754299	754304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223961
13536	NC_011529	AGG	2	6	754370	754375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223961
13537	NC_011529	ATG	2	6	754452	754457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223962
13538	NC_011529	TACAC	2	10	754470	754479	40 %	20 %	0 %	40 %	212223962
13539	NC_011529	TCA	2	6	754480	754485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223962
13540	NC_011529	CAG	2	6	754496	754501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223962
13541	NC_011529	GATAGC	2	12	754520	754531	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212223962
13542	NC_011529	CCT	2	6	754616	754621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223962
13543	NC_011529	CT	3	6	754632	754637	0 %	50 %	0 %	50 %	212223962
13544	NC_011529	AAG	2	6	754710	754715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223962
13545	NC_011529	TGG	2	6	754792	754797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223962
13546	NC_011529	AGAA	2	8	754962	754969	75 %	0 %	25 %	0 %	212223962
13547	NC_011529	CTG	2	6	755106	755111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223962
13548	NC_011529	CTG	2	6	755118	755123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223962
13549	NC_011529	GGGA	2	8	755135	755142	25 %	0 %	75 %	0 %	212223962
13550	NC_011529	TAG	2	6	755149	755154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223962
13551	NC_011529	AG	3	6	755153	755158	50 %	0 %	50 %	0 %	212223962
13552	NC_011529	GA	3	6	755226	755231	50 %	0 %	50 %	0 %	212223962
13553	NC_011529	TGA	2	6	755275	755280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223962
13554	NC_011529	TGG	2	6	755350	755355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223963
13555	NC_011529	CA	3	6	755383	755388	50 %	0 %	0 %	50 %	212223963
13556	NC_011529	CA	3	6	755392	755397	50 %	0 %	0 %	50 %	212223963
13557	NC_011529	GAT	2	6	755524	755529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223963
13558	NC_011529	TA	3	6	755547	755552	50 %	50 %	0 %	0 %	212223963
13559	NC_011529	TC	3	6	755620	755625	0 %	50 %	0 %	50 %	212223963
13560	NC_011529	TA	3	6	755697	755702	50 %	50 %	0 %	0 %	212223963
13561	NC_011529	TTCA	2	8	755737	755744	25 %	50 %	0 %	25 %	212223963
13562	NC_011529	GTA	2	6	755906	755911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223963
13563	NC_011529	ACC	2	6	755915	755920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223963
13564	NC_011529	AGG	2	6	755969	755974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223963
13565	NC_011529	TCA	2	6	756051	756056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223963
13566	NC_011529	GA	3	6	756115	756120	50 %	0 %	50 %	0 %	212223963
13567	NC_011529	GCG	2	6	756201	756206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223963
13568	NC_011529	AAC	2	6	756221	756226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223963
13569	NC_011529	CTGGT	2	10	756264	756273	0 %	40 %	40 %	20 %	212223963
13570	NC_011529	AAT	2	6	756278	756283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223963
13571	NC_011529	AG	3	6	756328	756333	50 %	0 %	50 %	0 %	212223963
13572	NC_011529	AGT	2	6	756394	756399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223963
13573	NC_011529	CCA	2	6	756472	756477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223963
13574	NC_011529	AG	3	6	756486	756491	50 %	0 %	50 %	0 %	212223963
13575	NC_011529	ACGC	2	8	757109	757116	25 %	0 %	25 %	50 %	212223964
13576	NC_011529	GCCC	2	8	757135	757142	0 %	0 %	25 %	75 %	212223964
13577	NC_011529	ACC	3	9	757155	757163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223964
13578	NC_011529	GCCCT	2	10	757176	757185	0 %	20 %	20 %	60 %	212223964
13579	NC_011529	AG	3	6	757234	757239	50 %	0 %	50 %	0 %	212223964
13580	NC_011529	ATG	2	6	757832	757837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223965
13581	NC_011529	AGC	2	6	757868	757873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223965
13582	NC_011529	CTG	2	6	757876	757881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223965
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13584	NC_011529	TGA	2	6	758073	758078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223965
13585	NC_011529	TAT	2	6	758089	758094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223965
13586	NC_011529	TCG	2	6	758102	758107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223965
13587	NC_011529	CT	3	6	758140	758145	0 %	50 %	0 %	50 %	212223965
13588	NC_011529	CTTT	2	8	758208	758215	0 %	75 %	0 %	25 %	212223965
13589	NC_011529	TGA	2	6	758265	758270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223965
13590	NC_011529	CTT	2	6	758645	758650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223966
13591	NC_011529	TCA	2	6	758679	758684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223966
13592	NC_011529	TCTT	2	8	758769	758776	0 %	75 %	0 %	25 %	212223966
13593	NC_011529	GAG	2	6	758783	758788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223966
13594	NC_011529	GTT	2	6	758873	758878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223966
13595	NC_011529	CCT	2	6	758891	758896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223966
13596	NC_011529	AGG	2	6	758898	758903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223966
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13598	NC_011529	GTC	2	6	759062	759067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223966
13599	NC_011529	ATC	2	6	759090	759095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223966
13600	NC_011529	CTCA	2	8	759164	759171	25 %	25 %	0 %	50 %	212223967
13601	NC_011529	CCT	2	6	759176	759181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223967
13602	NC_011529	TCC	3	9	759210	759218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223967
13603	NC_011529	CGT	2	6	759266	759271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223967
13604	NC_011529	TTA	2	6	759316	759321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223967
13605	NC_011529	TC	3	6	759418	759423	0 %	50 %	0 %	50 %	212223967
13606	NC_011529	CCTCAT	2	12	759499	759510	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	212223967
13607	NC_011529	GAG	2	6	759521	759526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223967
13608	NC_011529	CAT	2	6	759539	759544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223967
13609	NC_011529	TCA	2	6	759564	759569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223968
13610	NC_011529	ACA	2	6	759707	759712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223968
13611	NC_011529	ACCAC	2	10	759801	759810	40 %	0 %	0 %	60 %	212223968
13612	NC_011529	T	6	6	759962	759967	0 %	100 %	0 %	0 %	212223968
13613	NC_011529	GTC	2	6	759988	759993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223968
13614	NC_011529	TCCT	2	8	760127	760134	0 %	50 %	0 %	50 %	212223968
13615	NC_011529	CTC	2	6	760156	760161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223968
13616	NC_011529	CTT	2	6	760171	760176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223968
13617	NC_011529	CT	3	6	760214	760219	0 %	50 %	0 %	50 %	212223968
13618	NC_011529	GA	4	8	760434	760441	50 %	0 %	50 %	0 %	212223969
13619	NC_011529	C	6	6	760460	760465	0 %	0 %	0 %	100 %	212223969
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13621	NC_011529	TAT	2	6	760495	760500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223969
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13980	NC_011529	GGGA	2	8	782897	782904	25 %	0 %	75 %	0 %	212223994
13981	NC_011529	CACATC	2	12	782918	782929	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	212223994
13982	NC_011529	TCG	2	6	782976	782981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223994
13983	NC_011529	CCA	2	6	783073	783078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223994
13984	NC_011529	CAA	2	6	783214	783219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223995
13985	NC_011529	TCCT	2	8	783224	783231	0 %	50 %	0 %	50 %	212223995
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13988	NC_011529	TCG	2	6	783306	783311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223995
13989	NC_011529	TTCC	2	8	783423	783430	0 %	50 %	0 %	50 %	212223995
13990	NC_011529	TGCCA	2	10	783469	783478	20 %	20 %	20 %	40 %	212223995
13991	NC_011529	CGA	2	6	783483	783488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223995
13992	NC_011529	GTA	2	6	783508	783513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223995
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13995	NC_011529	CT	3	6	783731	783736	0 %	50 %	0 %	50 %	212223995
13996	NC_011529	TTC	2	6	783752	783757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223995
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13998	NC_011529	ATA	2	6	783881	783886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223995
13999	NC_011529	CAG	2	6	783892	783897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223995
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