MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011529	TGTT	2	8	723116	723123	0 %	75 %	25 %	0 %	212223924
13002	NC_011529	CTC	2	6	723169	723174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223924
13003	NC_011529	AAC	2	6	723220	723225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223924
13004	NC_011529	AC	3	6	723278	723283	50 %	0 %	0 %	50 %	212223924
13005	NC_011529	CCA	2	6	723323	723328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223924
13006	NC_011529	TGG	2	6	723331	723336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223924
13007	NC_011529	CCT	2	6	723363	723368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223924
13008	NC_011529	GGT	2	6	723394	723399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223924
13009	NC_011529	CTT	2	6	723432	723437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223924
13010	NC_011529	GAGC	2	8	723456	723463	25 %	0 %	50 %	25 %	212223924
13011	NC_011529	GCA	2	6	723504	723509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223924
13012	NC_011529	TGG	2	6	723543	723548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223924
13013	NC_011529	AAC	2	6	723574	723579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223924
13014	NC_011529	CGT	2	6	723639	723644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223924
13015	NC_011529	TGA	2	6	723680	723685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223924
13016	NC_011529	CAGGG	2	10	723715	723724	20 %	0 %	60 %	20 %	212223924
13017	NC_011529	CGG	2	6	723888	723893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223924
13018	NC_011529	CCG	2	6	723980	723985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223924
13019	NC_011529	TCA	2	6	724094	724099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223924
13020	NC_011529	ACC	2	6	724133	724138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223924
13021	NC_011529	TGA	2	6	724166	724171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223924
13022	NC_011529	TGA	2	6	724281	724286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223924
13023	NC_011529	AGC	2	6	724314	724319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223924
13024	NC_011529	CAGG	2	8	724323	724330	25 %	0 %	50 %	25 %	212223924
13025	NC_011529	CTA	2	6	724368	724373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223924
13026	NC_011529	CA	3	6	724424	724429	50 %	0 %	0 %	50 %	212223924
13027	NC_011529	CAT	2	6	724434	724439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223924
13028	NC_011529	AGG	2	6	724457	724462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223924
13029	NC_011529	AGG	2	6	724475	724480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223924
13030	NC_011529	AAC	2	6	724483	724488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223924
13031	NC_011529	AAG	2	6	724552	724557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223924
13032	NC_011529	AAG	2	6	724585	724590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223924
13033	NC_011529	AAG	2	6	724615	724620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223924
13034	NC_011529	TCC	2	6	724663	724668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223925
13035	NC_011529	CCT	2	6	724681	724686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223925
13036	NC_011529	T	6	6	724723	724728	0 %	100 %	0 %	0 %	212223925
13037	NC_011529	AGA	2	6	724735	724740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223925
13038	NC_011529	CTT	2	6	724767	724772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223925
13039	NC_011529	TGG	2	6	724789	724794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223925
13040	NC_011529	GTA	2	6	724806	724811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223925
13041	NC_011529	GTATG	2	10	724821	724830	20 %	40 %	40 %	0 %	212223925
13042	NC_011529	GGC	2	6	725071	725076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223926
13043	NC_011529	T	6	6	725101	725106	0 %	100 %	0 %	0 %	212223926
13044	NC_011529	AAG	2	6	725129	725134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223926
13045	NC_011529	AGG	2	6	725142	725147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223926
13046	NC_011529	A	6	6	725149	725154	100 %	0 %	0 %	0 %	212223926
13047	NC_011529	TTC	2	6	725192	725197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223926
13048	NC_011529	CGA	2	6	725253	725258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223926
13049	NC_011529	GAA	3	9	725278	725286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223926
13050	NC_011529	CTC	2	6	725294	725299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223926
13051	NC_011529	CCG	2	6	725327	725332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223926
13052	NC_011529	CTCG	2	8	725500	725507	0 %	25 %	25 %	50 %	212223926
13053	NC_011529	GTC	2	6	725671	725676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223926
13054	NC_011529	CT	3	6	725729	725734	0 %	50 %	0 %	50 %	212223927
13055	NC_011529	GTC	2	6	725758	725763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223927
13056	NC_011529	CAT	2	6	725811	725816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223927
13057	NC_011529	GCC	2	6	725997	726002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223928
13058	NC_011529	C	6	6	726001	726006	0 %	0 %	0 %	100 %	212223928
13059	NC_011529	GCGG	2	8	726007	726014	0 %	0 %	75 %	25 %	212223928
13060	NC_011529	CCT	2	6	726119	726124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223928
13061	NC_011529	GAG	2	6	726141	726146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223928
13062	NC_011529	TCCT	2	8	726229	726236	0 %	50 %	0 %	50 %	212223928
13063	NC_011529	TTTC	2	8	726328	726335	0 %	75 %	0 %	25 %	212223929
13064	NC_011529	TGTA	2	8	726354	726361	25 %	50 %	25 %	0 %	212223929
13065	NC_011529	GAG	2	6	726365	726370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223929
13066	NC_011529	CTT	2	6	726437	726442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223929
13067	NC_011529	GTC	2	6	726512	726517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223929
13068	NC_011529	CT	4	8	726518	726525	0 %	50 %	0 %	50 %	212223929
13069	NC_011529	TCC	2	6	726645	726650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223929
13070	NC_011529	GAT	2	6	726752	726757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223929
13071	NC_011529	GTT	2	6	726761	726766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223929
13072	NC_011529	GAC	2	6	726803	726808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223929
13073	NC_011529	TTC	2	6	726843	726848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223929
13074	NC_011529	GAG	2	6	726903	726908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223929
13075	NC_011529	GGT	2	6	726969	726974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223929
13076	NC_011529	AGA	2	6	727142	727147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223930
13077	NC_011529	CGT	2	6	727223	727228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223930
13078	NC_011529	GGA	2	6	727340	727345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223930
13079	NC_011529	GAG	2	6	727350	727355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223930
13080	NC_011529	GA	3	6	727359	727364	50 %	0 %	50 %	0 %	212223930
13081	NC_011529	GAG	2	6	727392	727397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223930
13082	NC_011529	AG	3	6	727413	727418	50 %	0 %	50 %	0 %	212223930
13083	NC_011529	GGA	2	6	727445	727450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223930
13084	NC_011529	CA	3	6	727464	727469	50 %	0 %	0 %	50 %	212223930
13085	NC_011529	TC	3	6	727470	727475	0 %	50 %	0 %	50 %	212223930
13086	NC_011529	GGA	2	6	727487	727492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223930
13087	NC_011529	TCC	2	6	727551	727556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223931
13088	NC_011529	AAGG	2	8	727585	727592	50 %	0 %	50 %	0 %	212223931
13089	NC_011529	TCC	2	6	727598	727603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223931
13090	NC_011529	CTC	2	6	727678	727683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223931
13091	NC_011529	GTA	2	6	727690	727695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223931
13092	NC_011529	ATG	2	6	727724	727729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223931
13093	NC_011529	GCTCG	2	10	727783	727792	0 %	20 %	40 %	40 %	212223931
13094	NC_011529	CGG	2	6	727903	727908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223931
13095	NC_011529	CGG	2	6	727912	727917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223931
13096	NC_011529	TTCT	2	8	727946	727953	0 %	75 %	0 %	25 %	212223931
13097	NC_011529	GAG	2	6	727966	727971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223931
13098	NC_011529	AGG	2	6	727997	728002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223931
13099	NC_011529	TGA	3	9	728073	728081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223931
13100	NC_011529	TCC	3	9	730266	730274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223932
13101	NC_011529	CCCT	2	8	730394	730401	0 %	25 %	0 %	75 %	212223932
13102	NC_011529	TCA	2	6	730439	730444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223932
13103	NC_011529	GGT	2	6	730552	730557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223932
13104	NC_011529	TCC	2	6	730639	730644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223932
13105	NC_011529	TCG	2	6	730647	730652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223932
13106	NC_011529	TGA	2	6	730701	730706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223932
13107	NC_011529	TACT	2	8	730763	730770	25 %	50 %	0 %	25 %	212223932
13108	NC_011529	CTT	2	6	730813	730818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223932
13109	NC_011529	GTA	2	6	730861	730866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223932
13110	NC_011529	CCT	2	6	730953	730958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223932
13111	NC_011529	ACG	2	6	730985	730990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223932
13112	NC_011529	AGC	2	6	731000	731005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223932
13113	NC_011529	CTT	2	6	731016	731021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223932
13114	NC_011529	TC	3	6	731029	731034	0 %	50 %	0 %	50 %	212223932
13115	NC_011529	TTC	2	6	731060	731065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223932
13116	NC_011529	CCA	2	6	731079	731084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223932
13117	NC_011529	CCTT	2	8	731095	731102	0 %	50 %	0 %	50 %	212223932
13118	NC_011529	ACG	2	6	731180	731185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223932
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13120	NC_011529	GAA	2	6	731266	731271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223932
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13481	NC_011529	GAA	2	6	751340	751345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223956
13482	NC_011529	CT	4	8	751348	751355	0 %	50 %	0 %	50 %	212223956
13483	NC_011529	CTT	2	6	751454	751459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223956
13484	NC_011529	ACCGGC	2	12	751527	751538	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	212223956
13485	NC_011529	GGC	2	6	751563	751568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223956
13486	NC_011529	GGA	2	6	751591	751596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223956
13487	NC_011529	GGT	2	6	751640	751645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223956
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13493	NC_011529	CTCG	2	8	751961	751968	0 %	25 %	25 %	50 %	212223957
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13499	NC_011529	GCC	2	6	752092	752097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223957
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