MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011529	TCT	2	6	611208	611213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223803
11002	NC_011529	TTC	2	6	611221	611226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223803
11003	NC_011529	TCC	2	6	611237	611242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223803
11004	NC_011529	ATC	2	6	611590	611595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223804
11005	NC_011529	GGA	2	6	611632	611637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223804
11006	NC_011529	GCC	2	6	611665	611670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223804
11007	NC_011529	ATG	2	6	611706	611711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223805
11008	NC_011529	AGG	2	6	611824	611829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223805
11009	NC_011529	GA	3	6	611921	611926	50 %	0 %	50 %	0 %	212223805
11010	NC_011529	TGT	3	9	611951	611959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223805
11011	NC_011529	CGT	2	6	611963	611968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223805
11012	NC_011529	AGAC	2	8	612055	612062	50 %	0 %	25 %	25 %	212223805
11013	NC_011529	AG	3	6	612073	612078	50 %	0 %	50 %	0 %	212223805
11014	NC_011529	GGA	2	6	612104	612109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223805
11015	NC_011529	AGG	2	6	612145	612150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223805
11016	NC_011529	GAG	2	6	612162	612167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223805
11017	NC_011529	AAGGA	2	10	612171	612180	60 %	0 %	40 %	0 %	212223805
11018	NC_011529	CTC	2	6	612330	612335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223805
11019	NC_011529	GAC	2	6	612342	612347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223805
11020	NC_011529	TAA	2	6	612352	612357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223805
11021	NC_011529	CGA	2	6	612392	612397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223805
11022	NC_011529	GC	3	6	612437	612442	0 %	0 %	50 %	50 %	212223805
11023	NC_011529	ATA	2	6	612453	612458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223805
11024	NC_011529	GCCA	2	8	612459	612466	25 %	0 %	25 %	50 %	212223805
11025	NC_011529	GA	3	6	612526	612531	50 %	0 %	50 %	0 %	212223805
11026	NC_011529	C	6	6	612691	612696	0 %	0 %	0 %	100 %	212223805
11027	NC_011529	TAGC	2	8	612700	612707	25 %	25 %	25 %	25 %	212223805
11028	NC_011529	TCC	2	6	612712	612717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223805
11029	NC_011529	GTT	2	6	612726	612731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223805
11030	NC_011529	CTT	2	6	612767	612772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223805
11031	NC_011529	TCC	2	6	612784	612789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223805
11032	NC_011529	GCC	2	6	612837	612842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223805
11033	NC_011529	GA	3	6	612852	612857	50 %	0 %	50 %	0 %	212223805
11034	NC_011529	CCA	2	6	612940	612945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223805
11035	NC_011529	CTT	2	6	613046	613051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223805
11036	NC_011529	CTC	2	6	613101	613106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223805
11037	NC_011529	CTC	2	6	613110	613115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223805
11038	NC_011529	TCA	2	6	613126	613131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223805
11039	NC_011529	GAA	2	6	613152	613157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223805
11040	NC_011529	TCA	2	6	613165	613170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223805
11041	NC_011529	GAG	2	6	613229	613234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223805
11042	NC_011529	AAG	2	6	613248	613253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223805
11043	NC_011529	ATA	2	6	613263	613268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223805
11044	NC_011529	CAG	2	6	613298	613303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223805
11045	NC_011529	GAG	2	6	613473	613478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223805
11046	NC_011529	AGCG	2	8	613484	613491	25 %	0 %	50 %	25 %	212223805
11047	NC_011529	GGC	2	6	613595	613600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223805
11048	NC_011529	T	6	6	613609	613614	0 %	100 %	0 %	0 %	212223805
11049	NC_011529	TAG	2	6	613636	613641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223805
11050	NC_011529	AAT	2	6	613643	613648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223805
11051	NC_011529	AAGG	2	8	613720	613727	50 %	0 %	50 %	0 %	212223806
11052	NC_011529	GAA	2	6	613771	613776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223806
11053	NC_011529	TGG	2	6	614055	614060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223807
11054	NC_011529	TCA	2	6	614086	614091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223807
11055	NC_011529	CGA	2	6	614175	614180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223807
11056	NC_011529	GTT	2	6	614182	614187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223807
11057	NC_011529	AG	3	6	614218	614223	50 %	0 %	50 %	0 %	212223807
11058	NC_011529	CGA	2	6	614229	614234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223807
11059	NC_011529	GGT	2	6	614296	614301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223807
11060	NC_011529	AGAA	2	8	614401	614408	75 %	0 %	25 %	0 %	212223807
11061	NC_011529	TCA	2	6	614417	614422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223807
11062	NC_011529	GAA	2	6	614479	614484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223807
11063	NC_011529	TCG	2	6	614534	614539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223807
11064	NC_011529	AGG	2	6	614594	614599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223807
11065	NC_011529	GAAG	2	8	614610	614617	50 %	0 %	50 %	0 %	212223807
11066	NC_011529	TTC	2	6	614618	614623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223807
11067	NC_011529	CCA	2	6	614655	614660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223807
11068	NC_011529	ACT	2	6	614675	614680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223807
11069	NC_011529	GAT	2	6	614701	614706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223807
11070	NC_011529	CCA	2	6	614718	614723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223807
11071	NC_011529	CTA	2	6	614757	614762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223807
11072	NC_011529	AAG	2	6	614771	614776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223807
11073	NC_011529	CGA	2	6	614823	614828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223807
11074	NC_011529	CGT	2	6	614988	614993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223807
11075	NC_011529	TCC	2	6	615008	615013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223807
11076	NC_011529	CGT	2	6	615027	615032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223807
11077	NC_011529	GAG	2	6	615103	615108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223807
11078	NC_011529	CCAA	2	8	615139	615146	50 %	0 %	0 %	50 %	212223807
11079	NC_011529	TTC	2	6	615424	615429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223808
11080	NC_011529	GAG	2	6	615455	615460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223808
11081	NC_011529	CAG	2	6	615541	615546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223808
11082	NC_011529	CTG	2	6	615558	615563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223808
11083	NC_011529	CGG	2	6	615572	615577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223808
11084	NC_011529	CGC	2	6	615623	615628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223808
11085	NC_011529	TCC	2	6	615634	615639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223808
11086	NC_011529	ACG	2	6	615651	615656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223808
11087	NC_011529	ATC	2	6	615747	615752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223808
11088	NC_011529	TGG	2	6	615753	615758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223808
11089	NC_011529	CCCT	2	8	615816	615823	0 %	25 %	0 %	75 %	212223808
11090	NC_011529	GTTCTG	2	12	615872	615883	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	212223808
11091	NC_011529	AAG	2	6	615888	615893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223808
11092	NC_011529	TGT	2	6	616021	616026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223808
11093	NC_011529	TCT	2	6	616063	616068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223808
11094	NC_011529	ACA	2	6	616101	616106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223808
11095	NC_011529	TTC	2	6	616126	616131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223808
11096	NC_011529	ATCG	2	8	616187	616194	25 %	25 %	25 %	25 %	212223808
11097	NC_011529	GTG	2	6	616363	616368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223809
11098	NC_011529	ATG	2	6	616414	616419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223809
11099	NC_011529	TGA	2	6	616877	616882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223810
11100	NC_011529	TCC	2	6	616897	616902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223810
11101	NC_011529	AGG	2	6	616912	616917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223810
11102	NC_011529	CAT	2	6	617009	617014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223810
11103	NC_011529	TAT	2	6	617093	617098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223810
11104	NC_011529	AGA	2	6	617099	617104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223810
11105	NC_011529	ATTA	2	8	617121	617128	50 %	50 %	0 %	0 %	212223810
11106	NC_011529	GAA	2	6	617211	617216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223810
11107	NC_011529	TC	3	6	617406	617411	0 %	50 %	0 %	50 %	212223811
11108	NC_011529	TCA	2	6	617422	617427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223811
11109	NC_011529	CTTAGG	2	12	617478	617489	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212223811
11110	NC_011529	AACC	2	8	617495	617502	50 %	0 %	0 %	50 %	212223811
11111	NC_011529	GAG	2	6	617553	617558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223811
11112	NC_011529	CGA	2	6	617561	617566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223811
11113	NC_011529	GAAGTT	2	12	617571	617582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223811
11114	NC_011529	A	6	6	617593	617598	100 %	0 %	0 %	0 %	212223811
11115	NC_011529	GAT	2	6	617673	617678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223811
11116	NC_011529	TGAGC	2	10	617687	617696	20 %	20 %	40 %	20 %	212223811
11117	NC_011529	CTC	2	6	617835	617840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223811
11118	NC_011529	CG	3	6	617989	617994	0 %	0 %	50 %	50 %	212223812
11119	NC_011529	GCG	2	6	618107	618112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223812
11120	NC_011529	TACA	2	8	618117	618124	50 %	25 %	0 %	25 %	212223812
11121	NC_011529	TAC	2	6	618130	618135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223812
11122	NC_011529	GT	3	6	618184	618189	0 %	50 %	50 %	0 %	212223812
11123	NC_011529	CAA	2	6	618201	618206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223812
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11143	NC_011529	GTA	2	6	619440	619445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223814
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11229	NC_011529	TTC	2	6	624338	624343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223820
11230	NC_011529	CGT	2	6	624367	624372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223820
11231	NC_011529	GAG	2	6	624400	624405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223820
11232	NC_011529	GCG	2	6	624564	624569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223820
11233	NC_011529	CCACT	2	10	624588	624597	20 %	20 %	0 %	60 %	212223820
11234	NC_011529	AGCG	2	8	624622	624629	25 %	0 %	50 %	25 %	212223820
11235	NC_011529	CT	3	6	624639	624644	0 %	50 %	0 %	50 %	212223820
11236	NC_011529	ACG	2	6	624645	624650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223820
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11359	NC_011529	CCAG	2	8	632106	632113	25 %	0 %	25 %	50 %	212223825
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11479	NC_011529	GA	3	6	639383	639388	50 %	0 %	50 %	0 %	212223835
11480	NC_011529	TGT	2	6	639411	639416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223835
11481	NC_011529	GAA	2	6	639437	639442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223835
11482	NC_011529	GAT	2	6	639486	639491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223835
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