MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_011529	CA	3	6	583051	583056	50 %	0 %	0 %	50 %	212223773
10502	NC_011529	GGTCAA	2	12	583057	583068	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212223773
10503	NC_011529	GGC	2	6	583086	583091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223773
10504	NC_011529	CGAC	2	8	583134	583141	25 %	0 %	25 %	50 %	212223773
10505	NC_011529	ACC	2	6	583208	583213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223773
10506	NC_011529	CCGC	2	8	583337	583344	0 %	0 %	25 %	75 %	212223773
10507	NC_011529	GCA	2	6	583351	583356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223773
10508	NC_011529	GCT	2	6	583361	583366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223773
10509	NC_011529	CAG	2	6	583368	583373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223773
10510	NC_011529	C	6	6	583414	583419	0 %	0 %	0 %	100 %	212223773
10511	NC_011529	TGAG	2	8	583525	583532	25 %	25 %	50 %	0 %	212223773
10512	NC_011529	AAAT	2	8	583596	583603	75 %	25 %	0 %	0 %	212223774
10513	NC_011529	GCT	2	6	583697	583702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223774
10514	NC_011529	GTT	2	6	583746	583751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223774
10515	NC_011529	TCA	2	6	583759	583764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223774
10516	NC_011529	TA	3	6	583844	583849	50 %	50 %	0 %	0 %	212223774
10517	NC_011529	AAC	2	6	583858	583863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223774
10518	NC_011529	CAA	2	6	583886	583891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223774
10519	NC_011529	CAC	2	6	583944	583949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223774
10520	NC_011529	GAA	3	9	584183	584191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223774
10521	NC_011529	TAGA	2	8	584267	584274	50 %	25 %	25 %	0 %	212223774
10522	NC_011529	CTT	3	9	584381	584389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223774
10523	NC_011529	ATGG	2	8	584406	584413	25 %	25 %	50 %	0 %	212223774
10524	NC_011529	TCT	2	6	584419	584424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223774
10525	NC_011529	ATC	2	6	584445	584450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223774
10526	NC_011529	AAAGGA	2	12	584461	584472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223774
10527	NC_011529	TGT	2	6	584493	584498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223774
10528	NC_011529	TC	3	6	584557	584562	0 %	50 %	0 %	50 %	212223774
10529	NC_011529	TCC	2	6	584571	584576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223774
10530	NC_011529	CATT	2	8	584765	584772	25 %	50 %	0 %	25 %	212223775
10531	NC_011529	TCG	2	6	584815	584820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223775
10532	NC_011529	TGGC	2	8	584856	584863	0 %	25 %	50 %	25 %	212223775
10533	NC_011529	GCCC	2	8	584903	584910	0 %	0 %	25 %	75 %	212223775
10534	NC_011529	GTA	2	6	584936	584941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223775
10535	NC_011529	TCG	2	6	584998	585003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223775
10536	NC_011529	ACG	2	6	585084	585089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223775
10537	NC_011529	CGG	2	6	585122	585127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223775
10538	NC_011529	ACC	2	6	585140	585145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223775
10539	NC_011529	CCT	2	6	585154	585159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223775
10540	NC_011529	GAA	3	9	585170	585178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223775
10541	NC_011529	CAT	2	6	585230	585235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223775
10542	NC_011529	GTC	2	6	585254	585259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223775
10543	NC_011529	CTTC	2	8	585352	585359	0 %	50 %	0 %	50 %	212223775
10544	NC_011529	CGA	2	6	585364	585369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223775
10545	NC_011529	TCA	2	6	585372	585377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223775
10546	NC_011529	CTT	2	6	585410	585415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223775
10547	NC_011529	CCT	2	6	585421	585426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223775
10548	NC_011529	ATT	2	6	585492	585497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223775
10549	NC_011529	GAG	2	6	585524	585529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223775
10550	NC_011529	GCC	2	6	585533	585538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223775
10551	NC_011529	GCTCCG	2	12	585622	585633	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	212223775
10552	NC_011529	GTA	2	6	585668	585673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223775
10553	NC_011529	CCT	2	6	585721	585726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223775
10554	NC_011529	CT	3	6	585781	585786	0 %	50 %	0 %	50 %	212223775
10555	NC_011529	CCT	2	6	585918	585923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223776
10556	NC_011529	GGC	2	6	585971	585976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223776
10557	NC_011529	AGA	2	6	586002	586007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223776
10558	NC_011529	CCTCA	2	10	586090	586099	20 %	20 %	0 %	60 %	212223776
10559	NC_011529	CCA	2	6	586153	586158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223776
10560	NC_011529	G	6	6	586247	586252	0 %	0 %	100 %	0 %	212223776
10561	NC_011529	CTT	2	6	586276	586281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223776
10562	NC_011529	CCG	2	6	586292	586297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223776
10563	NC_011529	AGT	2	6	586302	586307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223776
10564	NC_011529	GGC	2	6	586309	586314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223776
10565	NC_011529	TGG	3	9	586350	586358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223776
10566	NC_011529	AGTAT	2	10	586359	586368	40 %	40 %	20 %	0 %	212223776
10567	NC_011529	GTC	2	6	586381	586386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223776
10568	NC_011529	TCG	2	6	586469	586474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223776
10569	NC_011529	AAG	2	6	586481	586486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223776
10570	NC_011529	GGC	2	6	586488	586493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223776
10571	NC_011529	GA	3	6	586505	586510	50 %	0 %	50 %	0 %	212223776
10572	NC_011529	GAG	2	6	586564	586569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223776
10573	NC_011529	CTTG	2	8	586582	586589	0 %	50 %	25 %	25 %	212223776
10574	NC_011529	GAT	2	6	586693	586698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223776
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10576	NC_011529	GAA	2	6	586884	586889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223777
10577	NC_011529	GAG	2	6	586906	586911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223777
10578	NC_011529	AAG	2	6	586963	586968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223777
10579	NC_011529	CGA	2	6	586989	586994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223777
10580	NC_011529	GCA	2	6	587002	587007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223777
10581	NC_011529	GTTT	2	8	587201	587208	0 %	75 %	25 %	0 %	212223777
10582	NC_011529	GAG	2	6	587239	587244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223777
10583	NC_011529	GAA	2	6	587248	587253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223777
10584	NC_011529	GAG	2	6	587283	587288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223778
10585	NC_011529	AAT	2	6	587408	587413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223778
10586	NC_011529	CT	3	6	587488	587493	0 %	50 %	0 %	50 %	212223778
10587	NC_011529	TTC	2	6	587502	587507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223778
10588	NC_011529	CTGTTC	2	12	587517	587528	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	212223778
10589	NC_011529	TCG	2	6	587635	587640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223778
10590	NC_011529	GGT	2	6	587674	587679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223778
10591	NC_011529	A	7	7	587689	587695	100 %	0 %	0 %	0 %	212223778
10592	NC_011529	CGG	2	6	587708	587713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223778
10593	NC_011529	TGG	2	6	587767	587772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223778
10594	NC_011529	AAG	2	6	587775	587780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223778
10595	NC_011529	TTC	2	6	587851	587856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223778
10596	NC_011529	CTC	2	6	587943	587948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223778
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10598	NC_011529	C	6	6	588070	588075	0 %	0 %	0 %	100 %	212223778
10599	NC_011529	GGTC	2	8	588092	588099	0 %	25 %	50 %	25 %	212223778
10600	NC_011529	CGT	2	6	588122	588127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223778
10601	NC_011529	GACG	2	8	588212	588219	25 %	0 %	50 %	25 %	212223778
10602	NC_011529	GAC	2	6	588360	588365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223778
10603	NC_011529	CAT	2	6	588473	588478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223778
10604	NC_011529	AGC	2	6	588524	588529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223778
10605	NC_011529	AAAT	2	8	588728	588735	75 %	25 %	0 %	0 %	212223779
10606	NC_011529	CCT	2	6	588855	588860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223779
10607	NC_011529	AAG	2	6	588862	588867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223779
10608	NC_011529	CGG	2	6	589091	589096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223779
10609	NC_011529	CT	3	6	589108	589113	0 %	50 %	0 %	50 %	212223779
10610	NC_011529	GTT	2	6	589198	589203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223779
10611	NC_011529	ACG	2	6	589208	589213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223779
10612	NC_011529	GAT	2	6	589348	589353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223779
10613	NC_011529	AT	3	6	589352	589357	50 %	50 %	0 %	0 %	212223779
10614	NC_011529	GAG	2	6	589502	589507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223780
10615	NC_011529	A	6	6	589597	589602	100 %	0 %	0 %	0 %	212223780
10616	NC_011529	GAG	2	6	589794	589799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223781
10617	NC_011529	GTG	2	6	590197	590202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223782
10618	NC_011529	ATG	2	6	590205	590210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223782
10619	NC_011529	CAT	2	6	590231	590236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223782
10620	NC_011529	CT	3	6	590240	590245	0 %	50 %	0 %	50 %	212223782
10621	NC_011529	TAT	2	6	590246	590251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223782
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10624	NC_011529	TGG	2	6	590302	590307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223782
10625	NC_011529	GTC	2	6	590391	590396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223782
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10643	NC_011529	TCCC	2	8	591347	591354	0 %	25 %	0 %	75 %	212223783
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10647	NC_011529	TGG	2	6	591514	591519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223783
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10651	NC_011529	GCT	2	6	591725	591730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223783
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10658	NC_011529	AGC	2	6	592232	592237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223784
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10663	NC_011529	GTC	2	6	592700	592705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223784
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