MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011529	AGG	2	6	555933	555938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223751
10002	NC_011529	AGA	2	6	555955	555960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223751
10003	NC_011529	GAG	2	6	555968	555973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223751
10004	NC_011529	GAA	3	9	555979	555987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223751
10005	NC_011529	CCA	2	6	555990	555995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223751
10006	NC_011529	ACC	2	6	556007	556012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223751
10007	NC_011529	AAG	2	6	556034	556039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223751
10008	NC_011529	AGA	2	6	556056	556061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223751
10009	NC_011529	AGCC	2	8	556068	556075	25 %	0 %	25 %	50 %	212223751
10010	NC_011529	GAG	2	6	556085	556090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223751
10011	NC_011529	AAG	2	6	556091	556096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223751
10012	NC_011529	GGC	2	6	556241	556246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223752
10013	NC_011529	CGT	2	6	556265	556270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223752
10014	NC_011529	ACT	2	6	556423	556428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223752
10015	NC_011529	GAA	2	6	556544	556549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223752
10016	NC_011529	AATG	2	8	556551	556558	50 %	25 %	25 %	0 %	212223752
10017	NC_011529	CTTC	2	8	556682	556689	0 %	50 %	0 %	50 %	212223752
10018	NC_011529	TCC	2	6	556699	556704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223752
10019	NC_011529	ATG	2	6	556859	556864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223753
10020	NC_011529	CTT	2	6	556921	556926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223753
10021	NC_011529	TTCGTC	2	12	556961	556972	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	212223753
10022	NC_011529	AAG	2	6	557012	557017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223753
10023	NC_011529	GTC	2	6	557087	557092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223753
10024	NC_011529	CTT	2	6	557212	557217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223753
10025	NC_011529	CTT	2	6	557264	557269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223753
10026	NC_011529	TTC	2	6	557296	557301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223753
10027	NC_011529	CCT	2	6	557341	557346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223753
10028	NC_011529	CAG	2	6	557355	557360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223753
10029	NC_011529	TCT	2	6	557367	557372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223753
10030	NC_011529	GGCA	2	8	557444	557451	25 %	0 %	50 %	25 %	212223753
10031	NC_011529	AT	3	6	557462	557467	50 %	50 %	0 %	0 %	212223753
10032	NC_011529	CTG	2	6	557483	557488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223753
10033	NC_011529	CGA	2	6	557564	557569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223754
10034	NC_011529	GAG	3	9	557721	557729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223754
10035	NC_011529	GAG	2	6	557745	557750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223754
10036	NC_011529	AG	3	6	557784	557789	50 %	0 %	50 %	0 %	212223754
10037	NC_011529	AAGG	2	8	557911	557918	50 %	0 %	50 %	0 %	212223754
10038	NC_011529	TCC	2	6	557998	558003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223754
10039	NC_011529	CGC	2	6	558015	558020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223754
10040	NC_011529	CAG	2	6	558036	558041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223754
10041	NC_011529	GTC	2	6	558043	558048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223754
10042	NC_011529	CAG	2	6	558162	558167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223754
10043	NC_011529	GCTC	2	8	558203	558210	0 %	25 %	25 %	50 %	212223754
10044	NC_011529	GAAG	2	8	558320	558327	50 %	0 %	50 %	0 %	212223754
10045	NC_011529	AGA	2	6	558365	558370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223754
10046	NC_011529	GAA	2	6	558423	558428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223754
10047	NC_011529	CTA	2	6	558461	558466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223754
10048	NC_011529	TTTC	2	8	558608	558615	0 %	75 %	0 %	25 %	212223754
10049	NC_011529	AGG	2	6	558643	558648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223754
10050	NC_011529	TTC	2	6	558662	558667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223754
10051	NC_011529	CTC	2	6	558684	558689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223754
10052	NC_011529	TCT	2	6	558707	558712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223754
10053	NC_011529	CGG	2	6	558813	558818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223754
10054	NC_011529	CTC	2	6	558855	558860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223754
10055	NC_011529	CGA	2	6	558866	558871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223754
10056	NC_011529	CTGG	2	8	559017	559024	0 %	25 %	50 %	25 %	212223754
10057	NC_011529	TC	3	6	559081	559086	0 %	50 %	0 %	50 %	212223754
10058	NC_011529	CCT	2	6	559148	559153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223754
10059	NC_011529	GTC	2	6	559212	559217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223754
10060	NC_011529	CCTTTA	2	12	559259	559270	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	212223754
10061	NC_011529	TCCT	2	8	559335	559342	0 %	50 %	0 %	50 %	212223754
10062	NC_011529	GAA	2	6	559415	559420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223754
10063	NC_011529	TCA	2	6	559421	559426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223754
10064	NC_011529	TCA	2	6	559939	559944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223755
10065	NC_011529	AAC	3	9	560141	560149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223755
10066	NC_011529	AGT	2	6	560289	560294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223755
10067	NC_011529	CAA	2	6	560323	560328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223755
10068	NC_011529	TAGG	2	8	560500	560507	25 %	25 %	50 %	0 %	212223756
10069	NC_011529	TGT	2	6	560511	560516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223756
10070	NC_011529	CTC	2	6	560569	560574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223756
10071	NC_011529	TAG	2	6	560589	560594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223756
10072	NC_011529	GTT	2	6	560596	560601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223756
10073	NC_011529	GCC	2	6	560651	560656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223756
10074	NC_011529	CTT	2	6	560802	560807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223756
10075	NC_011529	ATC	2	6	560813	560818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223756
10076	NC_011529	TTA	2	6	560976	560981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223756
10077	NC_011529	CTCC	2	8	561055	561062	0 %	25 %	0 %	75 %	212223756
10078	NC_011529	CGT	2	6	561066	561071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223756
10079	NC_011529	CGT	2	6	561073	561078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223756
10080	NC_011529	CTC	2	6	561331	561336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223756
10081	NC_011529	TC	3	6	561390	561395	0 %	50 %	0 %	50 %	212223756
10082	NC_011529	AAG	2	6	561416	561421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223756
10083	NC_011529	CAGA	2	8	561454	561461	50 %	0 %	25 %	25 %	212223756
10084	NC_011529	CTG	2	6	561513	561518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223756
10085	NC_011529	CTCC	2	8	561541	561548	0 %	25 %	0 %	75 %	212223756
10086	NC_011529	CCT	2	6	561589	561594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223756
10087	NC_011529	CCT	2	6	561626	561631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223757
10088	NC_011529	CTAG	2	8	561649	561656	25 %	25 %	25 %	25 %	212223757
10089	NC_011529	ATCT	2	8	561660	561667	25 %	50 %	0 %	25 %	212223757
10090	NC_011529	TCA	2	6	561679	561684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223757
10091	NC_011529	TTC	2	6	561712	561717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223757
10092	NC_011529	G	6	6	561828	561833	0 %	0 %	100 %	0 %	212223757
10093	NC_011529	CCAT	2	8	561845	561852	25 %	25 %	0 %	50 %	212223757
10094	NC_011529	TTC	2	6	562002	562007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223757
10095	NC_011529	CAGG	2	8	562053	562060	25 %	0 %	50 %	25 %	212223757
10096	NC_011529	CAG	2	6	562124	562129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223757
10097	NC_011529	AAT	2	6	562155	562160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223757
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10099	NC_011529	GATT	2	8	562222	562229	25 %	50 %	25 %	0 %	212223758
10100	NC_011529	CTT	2	6	562257	562262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223758
10101	NC_011529	AGA	2	6	562317	562322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223758
10102	NC_011529	TTC	2	6	562362	562367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223758
10103	NC_011529	TCAA	2	8	562373	562380	50 %	25 %	0 %	25 %	212223758
10104	NC_011529	ATT	2	6	562490	562495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223758
10105	NC_011529	CAT	2	6	562503	562508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223758
10106	NC_011529	CCG	2	6	562529	562534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223758
10107	NC_011529	CTC	2	6	562540	562545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223758
10108	NC_011529	GAGAA	2	10	562719	562728	60 %	0 %	40 %	0 %	212223758
10109	NC_011529	TA	3	6	562798	562803	50 %	50 %	0 %	0 %	212223758
10110	NC_011529	TGA	2	6	562806	562811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223758
10111	NC_011529	CT	3	6	562872	562877	0 %	50 %	0 %	50 %	212223758
10112	NC_011529	AGTG	2	8	562907	562914	25 %	25 %	50 %	0 %	212223758
10113	NC_011529	ATT	2	6	562958	562963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223758
10114	NC_011529	TGG	2	6	562975	562980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223758
10115	NC_011529	TACA	2	8	563014	563021	50 %	25 %	0 %	25 %	212223758
10116	NC_011529	GTGTC	2	10	563036	563045	0 %	40 %	40 %	20 %	212223758
10117	NC_011529	CTT	2	6	563218	563223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223758
10118	NC_011529	CAT	2	6	563233	563238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223758
10119	NC_011529	TGGA	2	8	563357	563364	25 %	25 %	50 %	0 %	212223759
10120	NC_011529	CGA	2	6	563443	563448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223759
10121	NC_011529	TAC	2	6	563471	563476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223759
10122	NC_011529	CAT	2	6	563518	563523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223759
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10125	NC_011529	CGA	2	6	563614	563619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223759
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10128	NC_011529	CGA	2	6	563692	563697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223759
10129	NC_011529	CGA	2	6	563740	563745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223759
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10133	NC_011529	GAAG	2	8	564100	564107	50 %	0 %	50 %	0 %	212223759
10134	NC_011529	GAG	2	6	564152	564157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223759
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10136	NC_011529	AAG	2	6	564335	564340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223759
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10146	NC_011529	CGA	2	6	564700	564705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223759
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10149	NC_011529	CGA	2	6	564913	564918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223759
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10208	NC_011529	TC	3	6	567880	567885	0 %	50 %	0 %	50 %	212223761
10209	NC_011529	AT	3	6	568181	568186	50 %	50 %	0 %	0 %	212223761
10210	NC_011529	CCCT	2	8	568190	568197	0 %	25 %	0 %	75 %	212223761
10211	NC_011529	GA	3	6	568233	568238	50 %	0 %	50 %	0 %	212223761
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10218	NC_011529	C	6	6	568660	568665	0 %	0 %	0 %	100 %	212223761
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10228	NC_011529	CT	3	6	569266	569271	0 %	50 %	0 %	50 %	212223761
10229	NC_011529	CGT	2	6	569303	569308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223761
10230	NC_011529	AAATC	2	10	569377	569386	60 %	20 %	0 %	20 %	212223761
10231	NC_011529	CGA	2	6	569389	569394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223761
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10234	NC_011529	GAT	2	6	569630	569635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223761
10235	NC_011529	GGT	2	6	569724	569729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223761
10236	NC_011529	GTT	2	6	569870	569875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223761
10237	NC_011529	GCG	2	6	569887	569892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223761
10238	NC_011529	ATC	2	6	569915	569920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223761
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10481	NC_011529	AG	3	6	582190	582195	50 %	0 %	50 %	0 %	212223772
10482	NC_011529	GATA	2	8	582249	582256	50 %	25 %	25 %	0 %	212223772
10483	NC_011529	T	6	6	582322	582327	0 %	100 %	0 %	0 %	212223772
10484	NC_011529	TGG	2	6	582386	582391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223772
10485	NC_011529	GAG	2	6	582400	582405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223772
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10487	NC_011529	GTGA	2	8	582539	582546	25 %	25 %	50 %	0 %	212223772
10488	NC_011529	TCA	2	6	582615	582620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223773
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