MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_011529	CTA	2	6	530590	530595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223725
9503	NC_011529	TCA	2	6	530596	530601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223725
9504	NC_011529	GAT	2	6	530639	530644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223725
9505	NC_011529	GAA	2	6	530772	530777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223725
9506	NC_011529	GAC	2	6	530802	530807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223725
9507	NC_011529	ACG	2	6	530815	530820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223725
9508	NC_011529	GAG	2	6	530829	530834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223725
9509	NC_011529	GAC	2	6	530844	530849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223725
9510	NC_011529	ATG	2	6	530872	530877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223725
9511	NC_011529	CGA	2	6	530888	530893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223725
9512	NC_011529	ATG	2	6	530902	530907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223725
9513	NC_011529	AGT	2	6	530922	530927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223725
9514	NC_011529	CGA	2	6	530930	530935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223725
9515	NC_011529	TGA	3	9	530957	530965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223725
9516	NC_011529	GAC	2	6	530970	530975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223725
9517	NC_011529	GCG	2	6	531057	531062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223726
9518	NC_011529	TCG	2	6	531094	531099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223726
9519	NC_011529	CTT	2	6	531210	531215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223726
9520	NC_011529	TGA	2	6	531245	531250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223726
9521	NC_011529	AAAT	2	8	531274	531281	75 %	25 %	0 %	0 %	212223726
9522	NC_011529	CTA	2	6	531332	531337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223726
9523	NC_011529	CTGAC	2	10	531343	531352	20 %	20 %	20 %	40 %	212223726
9524	NC_011529	TTG	2	6	531433	531438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223726
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9526	NC_011529	CGA	2	6	531670	531675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223726
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9528	NC_011529	CAG	2	6	531764	531769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223726
9529	NC_011529	GGA	2	6	531770	531775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223726
9530	NC_011529	AGGCA	2	10	531856	531865	40 %	0 %	40 %	20 %	212223726
9531	NC_011529	AAG	3	9	531957	531965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223726
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9533	NC_011529	CGT	2	6	532065	532070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223727
9534	NC_011529	GAG	2	6	532078	532083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223727
9535	NC_011529	CT	3	6	532094	532099	0 %	50 %	0 %	50 %	212223727
9536	NC_011529	CTT	2	6	532111	532116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223727
9537	NC_011529	ACG	2	6	532139	532144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223727
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9539	NC_011529	GTC	2	6	532159	532164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223727
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9542	NC_011529	CGA	2	6	532191	532196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223727
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9544	NC_011529	CCT	2	6	532338	532343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223727
9545	NC_011529	TCT	2	6	532347	532352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223727
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9549	NC_011529	GTA	2	6	532471	532476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223727
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9554	NC_011529	CTG	2	6	532599	532604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223727
9555	NC_011529	TCT	2	6	532659	532664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223727
9556	NC_011529	GAG	2	6	532690	532695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223727
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9612	NC_011529	GCC	2	6	535784	535789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223730
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9618	NC_011529	CT	3	6	535867	535872	0 %	50 %	0 %	50 %	212223731
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9621	NC_011529	TCC	2	6	536019	536024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223731
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9981	NC_011529	ACC	2	6	555140	555145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223751
9982	NC_011529	GAG	2	6	555149	555154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223751
9983	NC_011529	AGC	2	6	555249	555254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223751
9984	NC_011529	AAG	2	6	555275	555280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223751
9985	NC_011529	CCCG	2	8	555295	555302	0 %	0 %	25 %	75 %	212223751
9986	NC_011529	TCA	2	6	555333	555338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223751
9987	NC_011529	AGG	2	6	555362	555367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223751
9988	NC_011529	GCG	2	6	555453	555458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223751
9989	NC_011529	ACC	2	6	555480	555485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223751
9990	NC_011529	GAGGTC	2	12	555512	555523	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212223751
9991	NC_011529	GGA	2	6	555595	555600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223751
9992	NC_011529	TCA	2	6	555603	555608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223751
9993	NC_011529	CAAGC	2	10	555736	555745	40 %	0 %	20 %	40 %	212223751
9994	NC_011529	CGA	2	6	555748	555753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223751
9995	NC_011529	AGG	2	6	555774	555779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223751
9996	NC_011529	CTG	2	6	555846	555851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223751
9997	NC_011529	ACC	2	6	555857	555862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223751
9998	NC_011529	GAG	2	6	555893	555898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223751
9999	NC_011529	AAG	2	6	555899	555904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223751
10000	NC_011529	GAG	2	6	555923	555928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223751

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