MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_011529	CCTG	2	8	501136	501143	0 %	25 %	25 %	50 %	212223694
9002	NC_011529	AAC	2	6	501227	501232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223694
9003	NC_011529	TCGTTC	2	12	501255	501266	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	212223694
9004	NC_011529	TCCT	2	8	501284	501291	0 %	50 %	0 %	50 %	212223694
9005	NC_011529	G	6	6	501352	501357	0 %	0 %	100 %	0 %	212223694
9006	NC_011529	TAT	2	6	501362	501367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223694
9007	NC_011529	ATG	2	6	501459	501464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223694
9008	NC_011529	TGA	2	6	501469	501474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223694
9009	NC_011529	GCC	3	9	501479	501487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223694
9010	NC_011529	GTT	2	6	501503	501508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223694
9011	NC_011529	AGA	2	6	501520	501525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223694
9012	NC_011529	CCG	2	6	501550	501555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223694
9013	NC_011529	CCTG	2	8	501573	501580	0 %	25 %	25 %	50 %	212223694
9014	NC_011529	GCG	2	6	501600	501605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223694
9015	NC_011529	TCT	2	6	501609	501614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223694
9016	NC_011529	TTA	2	6	501615	501620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223694
9017	NC_011529	ACA	2	6	501681	501686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223694
9018	NC_011529	GCC	2	6	501797	501802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223694
9019	NC_011529	CGG	2	6	501827	501832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223694
9020	NC_011529	TAG	2	6	501882	501887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223694
9021	NC_011529	TCT	2	6	501891	501896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223694
9022	NC_011529	TCTG	2	8	501953	501960	0 %	50 %	25 %	25 %	212223694
9023	NC_011529	TAG	2	6	501984	501989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223694
9024	NC_011529	GGT	2	6	502079	502084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223694
9025	NC_011529	GTG	2	6	502101	502106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223694
9026	NC_011529	GCCG	2	8	502130	502137	0 %	0 %	50 %	50 %	212223694
9027	NC_011529	TCA	2	6	502304	502309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223695
9028	NC_011529	AAG	2	6	502335	502340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223695
9029	NC_011529	GTTGTG	2	12	502393	502404	0 %	50 %	50 %	0 %	212223695
9030	NC_011529	GCG	2	6	502406	502411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223695
9031	NC_011529	TCG	3	9	502424	502432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223695
9032	NC_011529	GTC	2	6	502450	502455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223695
9033	NC_011529	GTGGTC	2	12	502489	502500	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	212223695
9034	NC_011529	GCT	2	6	502507	502512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223695
9035	NC_011529	TGA	2	6	502799	502804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223695
9036	NC_011529	CTCC	2	8	502814	502821	0 %	25 %	0 %	75 %	212223695
9037	NC_011529	TTGA	2	8	502926	502933	25 %	50 %	25 %	0 %	212223695
9038	NC_011529	GAG	2	6	503064	503069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223695
9039	NC_011529	TTG	2	6	503071	503076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223695
9040	NC_011529	TCCC	2	8	503138	503145	0 %	25 %	0 %	75 %	212223695
9041	NC_011529	TTC	2	6	503175	503180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223695
9042	NC_011529	TTC	2	6	503190	503195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223695
9043	NC_011529	TAACC	2	10	503254	503263	40 %	20 %	0 %	40 %	212223695
9044	NC_011529	CAA	2	6	503348	503353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223695
9045	NC_011529	TTG	2	6	503432	503437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223695
9046	NC_011529	GAATCA	2	12	503468	503479	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212223695
9047	NC_011529	ACT	2	6	503597	503602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223696
9048	NC_011529	CT	3	6	503601	503606	0 %	50 %	0 %	50 %	212223696
9049	NC_011529	CT	3	6	503661	503666	0 %	50 %	0 %	50 %	212223696
9050	NC_011529	CTC	2	6	503691	503696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223696
9051	NC_011529	GAG	2	6	503697	503702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223696
9052	NC_011529	CTC	2	6	503751	503756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223696
9053	NC_011529	CAA	2	6	503837	503842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223696
9054	NC_011529	TTG	2	6	503845	503850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223696
9055	NC_011529	TGT	2	6	503876	503881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223696
9056	NC_011529	AAG	2	6	503988	503993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223696
9057	NC_011529	GAA	2	6	503999	504004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223696
9058	NC_011529	TTC	2	6	504093	504098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223696
9059	NC_011529	TAT	2	6	504159	504164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223696
9060	NC_011529	CAC	2	6	504165	504170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223696
9061	NC_011529	TCT	2	6	504514	504519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223697
9062	NC_011529	TAT	2	6	504563	504568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223697
9063	NC_011529	GAA	2	6	504629	504634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223697
9064	NC_011529	GGC	2	6	504662	504667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223697
9065	NC_011529	AGAA	2	8	504779	504786	75 %	0 %	25 %	0 %	212223697
9066	NC_011529	CTC	2	6	504884	504889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223697
9067	NC_011529	GAC	2	6	504905	504910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223697
9068	NC_011529	CAA	2	6	504922	504927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223697
9069	NC_011529	CGA	2	6	504940	504945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223697
9070	NC_011529	TCTT	2	8	504961	504968	0 %	75 %	0 %	25 %	212223697
9071	NC_011529	GAAGTA	2	12	505061	505072	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212223697
9072	NC_011529	CCA	2	6	505111	505116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223697
9073	NC_011529	TGA	2	6	505162	505167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223697
9074	NC_011529	TTA	2	6	505252	505257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223697
9075	NC_011529	TCG	2	6	505261	505266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223697
9076	NC_011529	GCC	2	6	505269	505274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223697
9077	NC_011529	ATG	2	6	505561	505566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223698
9078	NC_011529	TCA	2	6	505589	505594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223698
9079	NC_011529	CTC	2	6	505612	505617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223698
9080	NC_011529	GAA	2	6	505716	505721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223698
9081	NC_011529	AGT	2	6	505724	505729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223698
9082	NC_011529	AGT	2	6	505785	505790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223698
9083	NC_011529	AGC	2	6	505864	505869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223698
9084	NC_011529	TTC	2	6	506002	506007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223698
9085	NC_011529	TTG	2	6	506029	506034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223698
9086	NC_011529	TCC	2	6	506041	506046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223698
9087	NC_011529	GTCA	2	8	506052	506059	25 %	25 %	25 %	25 %	212223698
9088	NC_011529	CGC	2	6	506165	506170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223698
9089	NC_011529	GCC	2	6	506173	506178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223698
9090	NC_011529	TA	3	6	506334	506339	50 %	50 %	0 %	0 %	212223699
9091	NC_011529	CT	3	6	506341	506346	0 %	50 %	0 %	50 %	212223699
9092	NC_011529	T	6	6	506387	506392	0 %	100 %	0 %	0 %	212223699
9093	NC_011529	TCA	2	6	506422	506427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223699
9094	NC_011529	GGA	2	6	506446	506451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223699
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9096	NC_011529	TTA	2	6	506710	506715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223699
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9098	NC_011529	C	6	6	506875	506880	0 %	0 %	0 %	100 %	212223699
9099	NC_011529	GA	3	6	506897	506902	50 %	0 %	50 %	0 %	212223699
9100	NC_011529	TCC	2	6	506967	506972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223699
9101	NC_011529	GGT	2	6	507274	507279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223700
9102	NC_011529	GTCTG	2	10	507283	507292	0 %	40 %	40 %	20 %	212223700
9103	NC_011529	TGG	3	9	507313	507321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223700
9104	NC_011529	ATA	2	6	507323	507328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223700
9105	NC_011529	GAAG	2	8	507499	507506	50 %	0 %	50 %	0 %	212223700
9106	NC_011529	ATC	2	6	507527	507532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223700
9107	NC_011529	ACAT	2	8	507608	507615	50 %	25 %	0 %	25 %	212223700
9108	NC_011529	T	6	6	507684	507689	0 %	100 %	0 %	0 %	212223700
9109	NC_011529	TGGA	2	8	507693	507700	25 %	25 %	50 %	0 %	212223700
9110	NC_011529	GCA	2	6	507726	507731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223700
9111	NC_011529	ACGG	2	8	507771	507778	25 %	0 %	50 %	25 %	212223700
9112	NC_011529	GGA	2	6	507805	507810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223700
9113	NC_011529	TTA	2	6	507915	507920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223700
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9115	NC_011529	TCT	2	6	508222	508227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223701
9116	NC_011529	TCC	2	6	508259	508264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223701
9117	NC_011529	GT	3	6	508377	508382	0 %	50 %	50 %	0 %	212223701
9118	NC_011529	CTTC	2	8	508444	508451	0 %	50 %	0 %	50 %	212223701
9119	NC_011529	TTC	3	9	508449	508457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223701
9120	NC_011529	GAG	2	6	508499	508504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223701
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9122	NC_011529	GAG	2	6	508523	508528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223701
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9243	NC_011529	GAC	2	6	515206	515211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223708
9244	NC_011529	TCA	2	6	515246	515251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223708
9245	NC_011529	CCT	2	6	515325	515330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223708
9246	NC_011529	AAG	2	6	515458	515463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223708
9247	NC_011529	TGA	2	6	515520	515525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223708
9248	NC_011529	AGA	2	6	515540	515545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223708
9249	NC_011529	TCT	2	6	515570	515575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223708
9250	NC_011529	CCT	2	6	515670	515675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223709
9251	NC_011529	GCT	2	6	515715	515720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223709
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9259	NC_011529	GAT	2	6	515977	515982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223710
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9264	NC_011529	ATC	2	6	516227	516232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223710
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9273	NC_011529	TCT	2	6	516597	516602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223711
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9282	NC_011529	ATAC	2	8	517367	517374	50 %	25 %	0 %	25 %	212223711
9283	NC_011529	ACAT	2	8	517417	517424	50 %	25 %	0 %	25 %	212223712
9284	NC_011529	A	7	7	517442	517448	100 %	0 %	0 %	0 %	212223712
9285	NC_011529	CA	3	6	517505	517510	50 %	0 %	0 %	50 %	212223712
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9363	NC_011529	CTC	2	6	521958	521963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223716
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9365	NC_011529	GAC	2	6	522027	522032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223716
9366	NC_011529	GTC	2	6	522072	522077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223716
9367	NC_011529	GTC	2	6	522127	522132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223716
9368	NC_011529	CAT	2	6	522246	522251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223716
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9401	NC_011529	CGGAG	2	10	524435	524444	20 %	0 %	60 %	20 %	212223718
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9482	NC_011529	GAAG	2	8	529317	529324	50 %	0 %	50 %	0 %	212223724
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