MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_011529	GAA	2	6	445548	445553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223631
8002	NC_011529	CTT	2	6	445579	445584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223631
8003	NC_011529	ACG	2	6	445609	445614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223631
8004	NC_011529	ACG	2	6	445786	445791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223631
8005	NC_011529	CGT	2	6	445845	445850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223631
8006	NC_011529	CGG	2	6	445935	445940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223631
8007	NC_011529	CT	3	6	445952	445957	0 %	50 %	0 %	50 %	212223631
8008	NC_011529	AC	3	6	446021	446026	50 %	0 %	0 %	50 %	212223631
8009	NC_011529	AAT	2	6	446154	446159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223631
8010	NC_011529	TAG	2	6	446210	446215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223632
8011	NC_011529	CTC	2	6	446248	446253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223632
8012	NC_011529	TAT	2	6	446272	446277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223632
8013	NC_011529	AGC	2	6	446297	446302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223632
8014	NC_011529	TGC	2	6	446307	446312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223632
8015	NC_011529	TAT	2	6	446320	446325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223632
8016	NC_011529	CCA	2	6	446341	446346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223632
8017	NC_011529	TCT	2	6	446361	446366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223632
8018	NC_011529	ATG	2	6	446456	446461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223632
8019	NC_011529	TCAT	2	8	446501	446508	25 %	50 %	0 %	25 %	212223632
8020	NC_011529	GCC	2	6	446509	446514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223632
8021	NC_011529	TAC	2	6	446560	446565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223632
8022	NC_011529	TCA	2	6	446615	446620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223632
8023	NC_011529	CGC	2	6	446725	446730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223632
8024	NC_011529	TTCT	2	8	446878	446885	0 %	75 %	0 %	25 %	212223633
8025	NC_011529	TCT	2	6	446888	446893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223633
8026	NC_011529	CTTC	2	8	446904	446911	0 %	50 %	0 %	50 %	212223633
8027	NC_011529	GCT	2	6	446954	446959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223633
8028	NC_011529	CGG	2	6	446998	447003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223633
8029	NC_011529	TC	3	6	447047	447052	0 %	50 %	0 %	50 %	212223633
8030	NC_011529	GTA	2	6	447055	447060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223633
8031	NC_011529	CCT	2	6	447066	447071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223633
8032	NC_011529	TTG	2	6	447080	447085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223633
8033	NC_011529	TCT	2	6	447093	447098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223633
8034	NC_011529	TGGA	2	8	447151	447158	25 %	25 %	50 %	0 %	212223633
8035	NC_011529	AGCTCC	2	12	447176	447187	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212223633
8036	NC_011529	GGT	2	6	447202	447207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223633
8037	NC_011529	AC	3	6	447392	447397	50 %	0 %	0 %	50 %	212223633
8038	NC_011529	TTC	2	6	447398	447403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223633
8039	NC_011529	CTT	2	6	447478	447483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223633
8040	NC_011529	TGA	2	6	447513	447518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223633
8041	NC_011529	ATG	2	6	447519	447524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223633
8042	NC_011529	CTT	2	6	447526	447531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223633
8043	NC_011529	TCA	2	6	447576	447581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223634
8044	NC_011529	TGG	2	6	447594	447599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223634
8045	NC_011529	TCA	2	6	447614	447619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223634
8046	NC_011529	CCAA	2	8	447649	447656	50 %	0 %	0 %	50 %	212223634
8047	NC_011529	GCT	2	6	447659	447664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223634
8048	NC_011529	GAC	2	6	447738	447743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223634
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8050	NC_011529	GAG	2	6	447873	447878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223634
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8052	NC_011529	CTC	2	6	448006	448011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223634
8053	NC_011529	CGT	2	6	448013	448018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223634
8054	NC_011529	CTT	2	6	448074	448079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223634
8055	NC_011529	CCT	2	6	448104	448109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223634
8056	NC_011529	CCT	2	6	448218	448223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223634
8057	NC_011529	CCG	2	6	448228	448233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223634
8058	NC_011529	GCA	2	6	448306	448311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223634
8059	NC_011529	GTT	2	6	448402	448407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223634
8060	NC_011529	CT	3	6	448423	448428	0 %	50 %	0 %	50 %	212223634
8061	NC_011529	TCA	2	6	448450	448455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223634
8062	NC_011529	AGG	2	6	448510	448515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223634
8063	NC_011529	GGA	2	6	448571	448576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223634
8064	NC_011529	AAC	2	6	448669	448674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223634
8065	NC_011529	ATCC	2	8	448704	448711	25 %	25 %	0 %	50 %	212223634
8066	NC_011529	TC	3	6	448717	448722	0 %	50 %	0 %	50 %	212223634
8067	NC_011529	AGC	2	6	448805	448810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223635
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8069	NC_011529	TCG	2	6	448880	448885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223635
8070	NC_011529	TCT	2	6	448905	448910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223635
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8072	NC_011529	GATA	2	8	449073	449080	50 %	25 %	25 %	0 %	212223635
8073	NC_011529	AGCTCA	2	12	449081	449092	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212223635
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8085	NC_011529	GCAT	2	8	449504	449511	25 %	25 %	25 %	25 %	212223636
8086	NC_011529	GAC	2	6	449520	449525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223636
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8092	NC_011529	CCA	2	6	449870	449875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223636
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8119	NC_011529	CCT	2	6	450990	450995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223638
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8121	NC_011529	TCC	2	6	451014	451019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223638
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8364	NC_011529	GAC	2	6	464397	464402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223653
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8484	NC_011529	CTT	2	6	471024	471029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223660
8485	NC_011529	TTC	2	6	471051	471056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223660
8486	NC_011529	CT	3	6	471060	471065	0 %	50 %	0 %	50 %	212223660
8487	NC_011529	CT	3	6	471071	471076	0 %	50 %	0 %	50 %	212223660
8488	NC_011529	ATCT	2	8	471126	471133	25 %	50 %	0 %	25 %	212223660
8489	NC_011529	GGGA	2	8	471184	471191	25 %	0 %	75 %	0 %	212223660
8490	NC_011529	T	6	6	471359	471364	0 %	100 %	0 %	0 %	212223660
8491	NC_011529	TCG	2	6	471428	471433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223661
8492	NC_011529	TGACCC	2	12	471438	471449	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212223661
8493	NC_011529	TAT	2	6	471505	471510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223661
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8498	NC_011529	TCG	2	6	471836	471841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223662
8499	NC_011529	TGG	2	6	471894	471899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223662
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