MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_011529	TGT	2	6	389270	389275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223563
7002	NC_011529	CCAGT	2	10	389284	389293	20 %	20 %	20 %	40 %	212223563
7003	NC_011529	TTC	2	6	389306	389311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223563
7004	NC_011529	ATC	2	6	389355	389360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223563
7005	NC_011529	GAG	2	6	389391	389396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223563
7006	NC_011529	TC	3	6	389426	389431	0 %	50 %	0 %	50 %	212223563
7007	NC_011529	TC	5	10	389494	389503	0 %	50 %	0 %	50 %	212223563
7008	NC_011529	AGG	2	6	389513	389518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223563
7009	NC_011529	ACG	2	6	389550	389555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223563
7010	NC_011529	TCC	2	6	389641	389646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223563
7011	NC_011529	CTC	2	6	389731	389736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223563
7012	NC_011529	TGATG	2	10	389863	389872	20 %	40 %	40 %	0 %	212223563
7013	NC_011529	TGA	2	6	389959	389964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223563
7014	NC_011529	A	6	6	390041	390046	100 %	0 %	0 %	0 %	212223563
7015	NC_011529	GCT	2	6	390127	390132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223564
7016	NC_011529	CAA	2	6	390213	390218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223564
7017	NC_011529	GAT	2	6	390229	390234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223564
7018	NC_011529	TAAGGC	2	12	390300	390311	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212223564
7019	NC_011529	ACG	2	6	390353	390358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223564
7020	NC_011529	CGG	2	6	390372	390377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223564
7021	NC_011529	TGT	2	6	390405	390410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223564
7022	NC_011529	GA	3	6	390425	390430	50 %	0 %	50 %	0 %	212223564
7023	NC_011529	TCA	2	6	390446	390451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223564
7024	NC_011529	TGC	2	6	390514	390519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223564
7025	NC_011529	CAT	2	6	390571	390576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223564
7026	NC_011529	TAT	2	6	390628	390633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223564
7027	NC_011529	CAG	2	6	390691	390696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223564
7028	NC_011529	CCG	2	6	390701	390706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223564
7029	NC_011529	TGT	2	6	390726	390731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223564
7030	NC_011529	GAG	2	6	390769	390774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223564
7031	NC_011529	ACG	2	6	390830	390835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223564
7032	NC_011529	GTA	2	6	390841	390846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223564
7033	NC_011529	GCTAGG	2	12	390857	390868	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212223564
7034	NC_011529	CGA	2	6	390918	390923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223564
7035	NC_011529	AGG	2	6	391057	391062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223565
7036	NC_011529	GGA	2	6	391163	391168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223565
7037	NC_011529	CTC	2	6	391189	391194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223565
7038	NC_011529	CCT	2	6	391254	391259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223565
7039	NC_011529	CGC	2	6	391299	391304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223565
7040	NC_011529	CCT	2	6	391389	391394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223565
7041	NC_011529	GAG	2	6	391414	391419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223565
7042	NC_011529	TCG	2	6	391440	391445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223565
7043	NC_011529	TTC	2	6	391466	391471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223565
7044	NC_011529	GAG	2	6	391477	391482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223565
7045	NC_011529	GCTCC	2	10	391538	391547	0 %	20 %	20 %	60 %	212223565
7046	NC_011529	TTC	2	6	391566	391571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223565
7047	NC_011529	TAT	2	6	391588	391593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223565
7048	NC_011529	ATC	2	6	391597	391602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223565
7049	NC_011529	TCAC	2	8	391760	391767	25 %	25 %	0 %	50 %	212223565
7050	NC_011529	GTCT	2	8	391822	391829	0 %	50 %	25 %	25 %	212223565
7051	NC_011529	CCA	2	6	391854	391859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223565
7052	NC_011529	TCA	2	6	391865	391870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223565
7053	NC_011529	CAT	2	6	391890	391895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223565
7054	NC_011529	GAT	2	6	391945	391950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223565
7055	NC_011529	CAG	2	6	392211	392216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223566
7056	NC_011529	CAT	2	6	392376	392381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223566
7057	NC_011529	CTA	2	6	392478	392483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223566
7058	NC_011529	TGC	2	6	392576	392581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223566
7059	NC_011529	GAT	2	6	392653	392658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223566
7060	NC_011529	AGT	2	6	392673	392678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223566
7061	NC_011529	TCA	2	6	392782	392787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223567
7062	NC_011529	TTC	2	6	392810	392815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223567
7063	NC_011529	TC	3	6	392887	392892	0 %	50 %	0 %	50 %	212223567
7064	NC_011529	TCCGCC	2	12	392900	392911	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	212223567
7065	NC_011529	CCT	2	6	392962	392967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223567
7066	NC_011529	TAT	2	6	393098	393103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223567
7067	NC_011529	GGC	2	6	393132	393137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223567
7068	NC_011529	TCT	2	6	393153	393158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223567
7069	NC_011529	CTT	2	6	393194	393199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223567
7070	NC_011529	TCC	2	6	393202	393207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223567
7071	NC_011529	AGC	2	6	393268	393273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223567
7072	NC_011529	TTC	2	6	393334	393339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223567
7073	NC_011529	CCT	2	6	393370	393375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223567
7074	NC_011529	CT	3	6	393410	393415	0 %	50 %	0 %	50 %	212223567
7075	NC_011529	AGGT	2	8	393459	393466	25 %	25 %	50 %	0 %	212223567
7076	NC_011529	CGG	2	6	393508	393513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223567
7077	NC_011529	TGT	2	6	393568	393573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223567
7078	NC_011529	TGGGC	2	10	393609	393618	0 %	20 %	60 %	20 %	212223567
7079	NC_011529	CAG	2	6	393658	393663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223567
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7081	NC_011529	TC	3	6	393827	393832	0 %	50 %	0 %	50 %	212223567
7082	NC_011529	CTC	3	9	393872	393880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223567
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7084	NC_011529	CT	3	6	394119	394124	0 %	50 %	0 %	50 %	212223568
7085	NC_011529	ATC	2	6	394213	394218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223568
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7087	NC_011529	AAG	2	6	394330	394335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223568
7088	NC_011529	CGA	2	6	394410	394415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223568
7089	NC_011529	TCT	2	6	394427	394432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223568
7090	NC_011529	GAAG	2	8	394467	394474	50 %	0 %	50 %	0 %	212223568
7091	NC_011529	AAGAT	2	10	394490	394499	60 %	20 %	20 %	0 %	212223568
7092	NC_011529	TCAAGG	2	12	394508	394519	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212223568
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7094	NC_011529	ATG	2	6	394543	394548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223568
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7096	NC_011529	CTGG	2	8	394647	394654	0 %	25 %	50 %	25 %	212223569
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7099	NC_011529	TCT	2	6	394717	394722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223569
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7101	NC_011529	CCT	2	6	394799	394804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223569
7102	NC_011529	C	6	6	394810	394815	0 %	0 %	0 %	100 %	212223569
7103	NC_011529	GGAAG	2	10	394962	394971	40 %	0 %	60 %	0 %	212223569
7104	NC_011529	GCC	2	6	394992	394997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223569
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7107	NC_011529	GAAAA	2	10	395037	395046	80 %	0 %	20 %	0 %	212223569
7108	NC_011529	GCT	2	6	395048	395053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223569
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7110	NC_011529	CGC	2	6	395069	395074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223569
7111	NC_011529	TA	3	6	395132	395137	50 %	50 %	0 %	0 %	212223569
7112	NC_011529	TTTC	2	8	395172	395179	0 %	75 %	0 %	25 %	212223569
7113	NC_011529	TCG	2	6	395185	395190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223569
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7118	NC_011529	GGT	2	6	395571	395576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223569
7119	NC_011529	TCCC	2	8	395648	395655	0 %	25 %	0 %	75 %	212223569
7120	NC_011529	CATC	2	8	395664	395671	25 %	25 %	0 %	50 %	212223569
7121	NC_011529	GGC	2	6	395693	395698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223569
7122	NC_011529	CTT	2	6	395699	395704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223569
7123	NC_011529	ATC	2	6	395736	395741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223569
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7125	NC_011529	TTG	2	6	395812	395817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223569
7126	NC_011529	ATC	2	6	395837	395842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223569
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7129	NC_011529	TCCG	2	8	395916	395923	0 %	25 %	25 %	50 %	212223569
7130	NC_011529	CATC	2	8	395935	395942	25 %	25 %	0 %	50 %	212223569
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7234	NC_011529	CCAGCT	2	12	401264	401275	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212223574
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7236	NC_011529	CGA	2	6	401424	401429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223575
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7240	NC_011529	TCA	2	6	401589	401594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223575
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7243	NC_011529	CT	3	6	401726	401731	0 %	50 %	0 %	50 %	212223575
7244	NC_011529	CT	3	6	401790	401795	0 %	50 %	0 %	50 %	212223575
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7364	NC_011529	CTCC	2	8	407930	407937	0 %	25 %	0 %	75 %	212223582
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7484	NC_011529	CGG	2	6	414249	414254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223589
7485	NC_011529	GAG	2	6	414278	414283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223589
7486	NC_011529	GA	3	6	414289	414294	50 %	0 %	50 %	0 %	212223589
7487	NC_011529	AT	3	6	414321	414326	50 %	50 %	0 %	0 %	212223589
7488	NC_011529	ATC	2	6	414329	414334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223589
7489	NC_011529	GAA	2	6	414373	414378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223589
7490	NC_011529	GCC	2	6	414380	414385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223589
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7492	NC_011529	GGA	2	6	414484	414489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223589
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7499	NC_011529	AGGTA	2	10	414954	414963	40 %	20 %	40 %	0 %	212223590
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