MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011529	AGA	2	6	362069	362074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223537
6502	NC_011529	TCG	2	6	362098	362103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223537
6503	NC_011529	GGA	2	6	362121	362126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223537
6504	NC_011529	ACA	2	6	362186	362191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223537
6505	NC_011529	ACAA	2	8	362239	362246	75 %	0 %	0 %	25 %	212223537
6506	NC_011529	GA	3	6	362291	362296	50 %	0 %	50 %	0 %	212223537
6507	NC_011529	GAA	2	6	362332	362337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223537
6508	NC_011529	GAG	2	6	362404	362409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223537
6509	NC_011529	GAT	2	6	362421	362426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223537
6510	NC_011529	ACG	3	9	362700	362708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223538
6511	NC_011529	GAC	2	6	362786	362791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223538
6512	NC_011529	GAC	2	6	362846	362851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223538
6513	NC_011529	GCC	2	6	362915	362920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223538
6514	NC_011529	AGG	2	6	362925	362930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223538
6515	NC_011529	TC	3	6	362963	362968	0 %	50 %	0 %	50 %	212223538
6516	NC_011529	GCT	2	6	362983	362988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223538
6517	NC_011529	GAG	2	6	363203	363208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223538
6518	NC_011529	CGA	2	6	363226	363231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223538
6519	NC_011529	CTC	2	6	363248	363253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223538
6520	NC_011529	CGCTC	2	10	363258	363267	0 %	20 %	20 %	60 %	212223538
6521	NC_011529	TCG	2	6	363324	363329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223538
6522	NC_011529	CAT	2	6	363335	363340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223538
6523	NC_011529	CCG	2	6	363411	363416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223538
6524	NC_011529	GTA	2	6	363425	363430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223538
6525	NC_011529	AG	3	6	363453	363458	50 %	0 %	50 %	0 %	212223538
6526	NC_011529	GAA	2	6	363544	363549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223538
6527	NC_011529	CTTC	2	8	363553	363560	0 %	50 %	0 %	50 %	212223538
6528	NC_011529	TC	3	6	363584	363589	0 %	50 %	0 %	50 %	212223538
6529	NC_011529	GAC	2	6	363713	363718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223538
6530	NC_011529	GAT	2	6	363737	363742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223538
6531	NC_011529	GTG	2	6	363828	363833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223539
6532	NC_011529	AT	3	6	363903	363908	50 %	50 %	0 %	0 %	212223539
6533	NC_011529	ACT	2	6	363911	363916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223539
6534	NC_011529	AAAG	2	8	364136	364143	75 %	0 %	25 %	0 %	212223539
6535	NC_011529	TC	3	6	364166	364171	0 %	50 %	0 %	50 %	212223539
6536	NC_011529	ACA	2	6	364327	364332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223539
6537	NC_011529	GAA	2	6	364338	364343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223539
6538	NC_011529	GAT	2	6	364361	364366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223539
6539	NC_011529	CTC	2	6	364374	364379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223539
6540	NC_011529	TC	3	6	364505	364510	0 %	50 %	0 %	50 %	212223539
6541	NC_011529	G	6	6	364534	364539	0 %	0 %	100 %	0 %	212223539
6542	NC_011529	AAC	2	6	364710	364715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223539
6543	NC_011529	AGG	2	6	364791	364796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223539
6544	NC_011529	GAAG	2	8	364832	364839	50 %	0 %	50 %	0 %	212223539
6545	NC_011529	AAGG	2	8	364902	364909	50 %	0 %	50 %	0 %	212223539
6546	NC_011529	AGG	2	6	364942	364947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223539
6547	NC_011529	GGT	2	6	364989	364994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223539
6548	NC_011529	AAG	2	6	365043	365048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223539
6549	NC_011529	GAC	2	6	365079	365084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223539
6550	NC_011529	GA	3	6	365112	365117	50 %	0 %	50 %	0 %	212223539
6551	NC_011529	TAT	2	6	365148	365153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223539
6552	NC_011529	AAG	3	9	365178	365186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223539
6553	NC_011529	AAT	2	6	365194	365199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223539
6554	NC_011529	TCT	2	6	365366	365371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223540
6555	NC_011529	CTT	2	6	365375	365380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223540
6556	NC_011529	TTC	2	6	365426	365431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223540
6557	NC_011529	GTA	2	6	365475	365480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223540
6558	NC_011529	TGA	2	6	365492	365497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223540
6559	NC_011529	TC	3	6	365515	365520	0 %	50 %	0 %	50 %	212223540
6560	NC_011529	TCA	2	6	365608	365613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223540
6561	NC_011529	TCC	2	6	365677	365682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223540
6562	NC_011529	GAA	2	6	365787	365792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223540
6563	NC_011529	TAT	2	6	365853	365858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223540
6564	NC_011529	CGT	2	6	365942	365947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223540
6565	NC_011529	ATG	2	6	365971	365976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223540
6566	NC_011529	GCC	2	6	366372	366377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223541
6567	NC_011529	ATT	2	6	366429	366434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223541
6568	NC_011529	GAT	2	6	366455	366460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223541
6569	NC_011529	TGT	2	6	366487	366492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223541
6570	NC_011529	GGT	2	6	366526	366531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223541
6571	NC_011529	CTC	2	6	366683	366688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223541
6572	NC_011529	CGG	2	6	366791	366796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223541
6573	NC_011529	ATG	2	6	366797	366802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223541
6574	NC_011529	CTC	2	6	366809	366814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223541
6575	NC_011529	CCT	2	6	366889	366894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223541
6576	NC_011529	CCCTG	2	10	366955	366964	0 %	20 %	20 %	60 %	212223541
6577	NC_011529	CTC	2	6	366980	366985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223541
6578	NC_011529	GAG	2	6	367124	367129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223541
6579	NC_011529	TCG	2	6	367143	367148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223541
6580	NC_011529	CCT	2	6	367169	367174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223541
6581	NC_011529	CGC	2	6	367270	367275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223541
6582	NC_011529	ACA	2	6	367293	367298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223541
6583	NC_011529	CCAG	2	8	367331	367338	25 %	0 %	25 %	50 %	212223541
6584	NC_011529	CGA	2	6	367345	367350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223541
6585	NC_011529	GTC	2	6	367368	367373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223541
6586	NC_011529	ATA	2	6	367398	367403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223541
6587	NC_011529	CGA	2	6	367435	367440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223541
6588	NC_011529	TTC	2	6	367511	367516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223541
6589	NC_011529	GAAC	2	8	367546	367553	50 %	0 %	25 %	25 %	212223541
6590	NC_011529	TCT	2	6	367561	367566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223541
6591	NC_011529	GCG	2	6	367569	367574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223541
6592	NC_011529	TAA	2	6	367578	367583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223541
6593	NC_011529	GGC	2	6	367587	367592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223541
6594	NC_011529	GTCGAA	2	12	367601	367612	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212223541
6595	NC_011529	ATC	2	6	367677	367682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223541
6596	NC_011529	TCG	2	6	367698	367703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223541
6597	NC_011529	TCA	2	6	367761	367766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223541
6598	NC_011529	ACG	2	6	367776	367781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223541
6599	NC_011529	TCC	2	6	367923	367928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223541
6600	NC_011529	CGT	2	6	367933	367938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223541
6601	NC_011529	CGA	2	6	367999	368004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223541
6602	NC_011529	CT	3	6	368007	368012	0 %	50 %	0 %	50 %	212223541
6603	NC_011529	ACCAG	2	10	368060	368069	40 %	0 %	20 %	40 %	212223542
6604	NC_011529	CT	3	6	368076	368081	0 %	50 %	0 %	50 %	212223542
6605	NC_011529	GTC	2	6	368118	368123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223542
6606	NC_011529	CAATTC	2	12	368153	368164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223542
6607	NC_011529	CT	3	6	368211	368216	0 %	50 %	0 %	50 %	212223542
6608	NC_011529	GCC	2	6	368229	368234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223542
6609	NC_011529	GCTCG	2	10	368280	368289	0 %	20 %	40 %	40 %	212223542
6610	NC_011529	ATA	2	6	368298	368303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223542
6611	NC_011529	ACCA	2	8	368394	368401	50 %	0 %	0 %	50 %	212223542
6612	NC_011529	CTGC	2	8	368514	368521	0 %	25 %	25 %	50 %	212223542
6613	NC_011529	CT	3	6	368564	368569	0 %	50 %	0 %	50 %	212223542
6614	NC_011529	CT	3	6	368612	368617	0 %	50 %	0 %	50 %	212223542
6615	NC_011529	CGA	2	6	368639	368644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223542
6616	NC_011529	GTAG	2	8	368657	368664	25 %	25 %	50 %	0 %	212223542
6617	NC_011529	AG	3	6	368732	368737	50 %	0 %	50 %	0 %	212223542
6618	NC_011529	GCT	2	6	368843	368848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223542
6619	NC_011529	TCC	2	6	368956	368961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223542
6620	NC_011529	CTC	2	6	368988	368993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223542
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6622	NC_011529	CTTC	2	8	369048	369055	0 %	50 %	0 %	50 %	212223542
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6987	NC_011529	CTTC	2	8	388603	388610	0 %	50 %	0 %	50 %	212223562
6988	NC_011529	TC	3	6	388632	388637	0 %	50 %	0 %	50 %	212223562
6989	NC_011529	TCA	2	6	388672	388677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223562
6990	NC_011529	GAA	3	9	388725	388733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223562
6991	NC_011529	T	7	7	388745	388751	0 %	100 %	0 %	0 %	212223562
6992	NC_011529	CGG	2	6	388815	388820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223562
6993	NC_011529	GCT	2	6	388862	388867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223563
6994	NC_011529	CCT	2	6	388868	388873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223563
6995	NC_011529	CAG	2	6	388886	388891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223563
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6997	NC_011529	TCGT	2	8	389028	389035	0 %	50 %	25 %	25 %	212223563
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6999	NC_011529	GCC	2	6	389220	389225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223563
7000	NC_011529	TC	3	6	389245	389250	0 %	50 %	0 %	50 %	212223563

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