MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011529	CTC	2	6	334201	334206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223505
6002	NC_011529	ATA	2	6	334356	334361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223505
6003	NC_011529	GCA	2	6	334417	334422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223505
6004	NC_011529	TCG	2	6	334429	334434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223505
6005	NC_011529	GTT	2	6	334443	334448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223505
6006	NC_011529	GGT	2	6	334499	334504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223505
6007	NC_011529	GAT	2	6	334513	334518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223505
6008	NC_011529	TAT	2	6	334528	334533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223506
6009	NC_011529	CTTT	2	8	334546	334553	0 %	75 %	0 %	25 %	212223506
6010	NC_011529	T	6	6	334568	334573	0 %	100 %	0 %	0 %	212223506
6011	NC_011529	GCC	2	6	334628	334633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223506
6012	NC_011529	CTT	2	6	334732	334737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223506
6013	NC_011529	GAC	2	6	334783	334788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223506
6014	NC_011529	TC	3	6	334810	334815	0 %	50 %	0 %	50 %	212223506
6015	NC_011529	GTAT	2	8	334834	334841	25 %	50 %	25 %	0 %	212223506
6016	NC_011529	TA	3	6	334927	334932	50 %	50 %	0 %	0 %	212223506
6017	NC_011529	CTC	2	6	335006	335011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223506
6018	NC_011529	GTTC	2	8	335056	335063	0 %	50 %	25 %	25 %	212223506
6019	NC_011529	CTTT	2	8	335185	335192	0 %	75 %	0 %	25 %	212223506
6020	NC_011529	AAGG	2	8	335333	335340	50 %	0 %	50 %	0 %	212223506
6021	NC_011529	AGAT	2	8	335385	335392	50 %	25 %	25 %	0 %	212223506
6022	NC_011529	AAG	2	6	335424	335429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223506
6023	NC_011529	ATC	2	6	335438	335443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223506
6024	NC_011529	TA	3	6	335444	335449	50 %	50 %	0 %	0 %	212223506
6025	NC_011529	TCC	2	6	335502	335507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223506
6026	NC_011529	G	6	6	335537	335542	0 %	0 %	100 %	0 %	212223506
6027	NC_011529	GTA	2	6	335665	335670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223507
6028	NC_011529	GGA	2	6	335700	335705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223507
6029	NC_011529	TC	3	6	335710	335715	0 %	50 %	0 %	50 %	212223507
6030	NC_011529	ACT	2	6	335795	335800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223507
6031	NC_011529	TAT	2	6	335866	335871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223507
6032	NC_011529	TC	4	8	335932	335939	0 %	50 %	0 %	50 %	212223507
6033	NC_011529	GGC	2	6	335959	335964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223507
6034	NC_011529	TCC	2	6	335968	335973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223507
6035	NC_011529	CCT	2	6	335994	335999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223507
6036	NC_011529	TGT	3	9	336093	336101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223507
6037	NC_011529	CTT	2	6	336120	336125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223507
6038	NC_011529	TGG	2	6	336193	336198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223507
6039	NC_011529	TCT	2	6	336201	336206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223507
6040	NC_011529	CGA	2	6	336210	336215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223507
6041	NC_011529	CGC	2	6	336343	336348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223507
6042	NC_011529	GTC	2	6	336367	336372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223507
6043	NC_011529	TGA	2	6	336384	336389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223507
6044	NC_011529	CTC	2	6	336406	336411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223507
6045	NC_011529	ATT	2	6	336479	336484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223507
6046	NC_011529	GGC	2	6	336541	336546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223507
6047	NC_011529	TGG	2	6	336612	336617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223507
6048	NC_011529	TAA	2	6	336642	336647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223507
6049	NC_011529	CTTC	2	8	336708	336715	0 %	50 %	0 %	50 %	212223507
6050	NC_011529	TCT	2	6	336759	336764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223507
6051	NC_011529	GGT	2	6	337132	337137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223508
6052	NC_011529	CCT	2	6	337149	337154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223508
6053	NC_011529	CCG	2	6	337193	337198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223508
6054	NC_011529	GGGCTA	2	12	337251	337262	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212223508
6055	NC_011529	GAAGG	2	10	337309	337318	40 %	0 %	60 %	0 %	212223508
6056	NC_011529	CTT	2	6	337352	337357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223508
6057	NC_011529	CCT	2	6	337473	337478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223508
6058	NC_011529	CT	3	6	337544	337549	0 %	50 %	0 %	50 %	212223508
6059	NC_011529	TCT	2	6	337604	337609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223508
6060	NC_011529	CT	3	6	337675	337680	0 %	50 %	0 %	50 %	212223508
6061	NC_011529	GTC	2	6	337696	337701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223508
6062	NC_011529	TA	3	6	337741	337746	50 %	50 %	0 %	0 %	212223508
6063	NC_011529	CCT	2	6	337788	337793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223508
6064	NC_011529	TCG	2	6	337805	337810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223508
6065	NC_011529	AGGC	2	8	337866	337873	25 %	0 %	50 %	25 %	212223508
6066	NC_011529	CCG	2	6	337877	337882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223508
6067	NC_011529	ATT	2	6	337889	337894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223508
6068	NC_011529	TC	3	6	337897	337902	0 %	50 %	0 %	50 %	212223508
6069	NC_011529	TTA	2	6	337941	337946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223508
6070	NC_011529	CTT	2	6	337956	337961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223508
6071	NC_011529	AT	3	6	338140	338145	50 %	50 %	0 %	0 %	212223509
6072	NC_011529	TCC	2	6	338185	338190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223509
6073	NC_011529	TCC	2	6	338293	338298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223509
6074	NC_011529	CAG	2	6	338365	338370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223509
6075	NC_011529	CGT	2	6	338402	338407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223509
6076	NC_011529	GGA	2	6	338424	338429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223509
6077	NC_011529	TCGT	2	8	338433	338440	0 %	50 %	25 %	25 %	212223509
6078	NC_011529	GGACTG	2	12	338470	338481	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212223509
6079	NC_011529	ATG	2	6	338490	338495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223509
6080	NC_011529	TCT	2	6	338527	338532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223509
6081	NC_011529	G	6	6	338555	338560	0 %	0 %	100 %	0 %	212223509
6082	NC_011529	CGG	2	6	338611	338616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223509
6083	NC_011529	GA	3	6	338646	338651	50 %	0 %	50 %	0 %	212223509
6084	NC_011529	TGG	2	6	338713	338718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223509
6085	NC_011529	CTA	2	6	338729	338734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223509
6086	NC_011529	GGT	2	6	338793	338798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223509
6087	NC_011529	AGG	2	6	339155	339160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223509
6088	NC_011529	TA	3	6	339288	339293	50 %	50 %	0 %	0 %	212223509
6089	NC_011529	CGA	2	6	339299	339304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223509
6090	NC_011529	AGG	2	6	339313	339318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223509
6091	NC_011529	CTT	2	6	339407	339412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223509
6092	NC_011529	TCC	2	6	339499	339504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223509
6093	NC_011529	AGGC	2	8	339515	339522	25 %	0 %	50 %	25 %	212223509
6094	NC_011529	ATA	2	6	339549	339554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223509
6095	NC_011529	TCT	2	6	339559	339564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223509
6096	NC_011529	GTG	2	6	339579	339584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223509
6097	NC_011529	AAT	2	6	339697	339702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223510
6098	NC_011529	GAGCGG	2	12	339709	339720	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	212223510
6099	NC_011529	GAG	2	6	339818	339823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223510
6100	NC_011529	GAG	3	9	339917	339925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223510
6101	NC_011529	C	7	7	340030	340036	0 %	0 %	0 %	100 %	212223510
6102	NC_011529	AGC	2	6	340056	340061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223510
6103	NC_011529	AGC	2	6	340072	340077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223510
6104	NC_011529	CTC	2	6	340172	340177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223510
6105	NC_011529	AGGA	2	8	340178	340185	50 %	0 %	50 %	0 %	212223510
6106	NC_011529	GTC	2	6	340199	340204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223510
6107	NC_011529	TGG	2	6	340206	340211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223510
6108	NC_011529	CAT	2	6	340214	340219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223510
6109	NC_011529	ATA	2	6	340250	340255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223510
6110	NC_011529	GGA	2	6	340306	340311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223510
6111	NC_011529	TAA	2	6	340389	340394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223510
6112	NC_011529	GGCT	2	8	340398	340405	0 %	25 %	50 %	25 %	212223510
6113	NC_011529	GAG	2	6	340412	340417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223510
6114	NC_011529	TC	3	6	340423	340428	0 %	50 %	0 %	50 %	212223510
6115	NC_011529	TC	3	6	340439	340444	0 %	50 %	0 %	50 %	212223510
6116	NC_011529	GAGT	2	8	340467	340474	25 %	25 %	50 %	0 %	212223511
6117	NC_011529	TCC	2	6	340531	340536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223511
6118	NC_011529	CT	3	6	340575	340580	0 %	50 %	0 %	50 %	212223511
6119	NC_011529	GTA	2	6	340608	340613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223511
6120	NC_011529	ACA	2	6	340717	340722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223511
6121	NC_011529	GCCT	2	8	340761	340768	0 %	25 %	25 %	50 %	212223511
6122	NC_011529	AGG	2	6	340774	340779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223511
6123	NC_011529	TCA	2	6	340796	340801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223511
6124	NC_011529	ATC	2	6	340818	340823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223511
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6128	NC_011529	CTG	2	6	340990	340995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223511
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6147	NC_011529	TCG	2	6	341738	341743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223512
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6154	NC_011529	TCC	2	6	342119	342124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223513
6155	NC_011529	CCT	2	6	342168	342173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223513
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6487	NC_011529	CGA	2	6	361366	361371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223536
6488	NC_011529	ATA	2	6	361439	361444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223536
6489	NC_011529	CTC	2	6	361457	361462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223536
6490	NC_011529	TCG	2	6	361470	361475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223536
6491	NC_011529	CAC	2	6	361638	361643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223537
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6494	NC_011529	ACG	2	6	361727	361732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223537
6495	NC_011529	TCG	2	6	361742	361747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223537
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6499	NC_011529	TCA	2	6	361976	361981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223537
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