MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 22109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010741	GGA	2	6	137415	137420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025352
2502	NC_010741	TAA	2	6	137486	137491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189025352
2503	NC_010741	AAC	2	6	137532	137537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189025352
2504	NC_010741	CCG	2	6	137645	137650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025352
2505	NC_010741	TTC	2	6	137796	137801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025352
2506	NC_010741	GCA	2	6	137923	137928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025352
2507	NC_010741	CCG	2	6	137929	137934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025352
2508	NC_010741	CAA	2	6	137959	137964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189025352
2509	NC_010741	CTG	2	6	137979	137984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025352
2510	NC_010741	GC	3	6	138139	138144	0 %	0 %	50 %	50 %	189025353
2511	NC_010741	TCA	2	6	138222	138227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025353
2512	NC_010741	CCT	2	6	138278	138283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189025353
2513	NC_010741	ATTA	2	8	138322	138329	50 %	50 %	0 %	0 %	189025353
2514	NC_010741	AGC	2	6	138361	138366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025353
2515	NC_010741	GCA	2	6	138372	138377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025353
2516	NC_010741	CCG	2	6	138420	138425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025353
2517	NC_010741	CAG	2	6	138451	138456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025353
2518	NC_010741	GCC	3	9	138515	138523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025353
2519	NC_010741	ACC	2	6	138569	138574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189025353
2520	NC_010741	GC	3	6	138596	138601	0 %	0 %	50 %	50 %	189025353
2521	NC_010741	AC	3	6	138624	138629	50 %	0 %	0 %	50 %	189025353
2522	NC_010741	GCT	2	6	138701	138706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025353
2523	NC_010741	CA	3	6	138726	138731	50 %	0 %	0 %	50 %	189025353
2524	NC_010741	TGTC	2	8	138742	138749	0 %	50 %	25 %	25 %	189025353
2525	NC_010741	CTA	2	6	138762	138767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025353
2526	NC_010741	ACA	2	6	138890	138895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189025354
2527	NC_010741	CTG	2	6	138897	138902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025354
2528	NC_010741	TG	3	6	138901	138906	0 %	50 %	50 %	0 %	189025354
2529	NC_010741	GCC	2	6	138911	138916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025354
2530	NC_010741	GCA	2	6	138922	138927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025354
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2532	NC_010741	CGG	2	6	138977	138982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025354
2533	NC_010741	ACC	2	6	139003	139008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189025354
2534	NC_010741	GT	3	6	139017	139022	0 %	50 %	50 %	0 %	189025354
2535	NC_010741	TGT	2	6	139086	139091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025354
2536	NC_010741	TTG	2	6	139109	139114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025354
2537	NC_010741	TCG	2	6	139117	139122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025354
2538	NC_010741	AGA	2	6	139124	139129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025354
2539	NC_010741	GC	4	8	139153	139160	0 %	0 %	50 %	50 %	189025354
2540	NC_010741	GCT	2	6	139172	139177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025354
2541	NC_010741	ACCA	2	8	139227	139234	50 %	0 %	0 %	50 %	189025354
2542	NC_010741	CG	4	8	139253	139260	0 %	0 %	50 %	50 %	189025354
2543	NC_010741	GAA	2	6	139327	139332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025354
2544	NC_010741	TTG	2	6	139344	139349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025354
2545	NC_010741	GCA	2	6	139387	139392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025354
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2547	NC_010741	A	6	6	139424	139429	100 %	0 %	0 %	0 %	189025354
2548	NC_010741	ATG	2	6	139462	139467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025354
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2550	NC_010741	GAT	2	6	139503	139508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025354
2551	NC_010741	TCT	2	6	139574	139579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025354
2552	NC_010741	TGA	2	6	139787	139792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025355
2553	NC_010741	GTG	2	6	139941	139946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025355
2554	NC_010741	GT	3	6	140026	140031	0 %	50 %	50 %	0 %	189025355
2555	NC_010741	CGC	2	6	140079	140084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025355
2556	NC_010741	ATT	2	6	140136	140141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025355
2557	NC_010741	GGT	2	6	140187	140192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025355
2558	NC_010741	CACT	2	8	140197	140204	25 %	25 %	0 %	50 %	189025355
2559	NC_010741	ATT	2	6	140265	140270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025355
2560	NC_010741	GC	3	6	140402	140407	0 %	0 %	50 %	50 %	189025355
2561	NC_010741	GGA	2	6	140682	140687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025355
2562	NC_010741	GCA	2	6	140714	140719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025355
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2564	NC_010741	CG	3	6	141109	141114	0 %	0 %	50 %	50 %	189025356
2565	NC_010741	TC	3	6	141134	141139	0 %	50 %	0 %	50 %	189025356
2566	NC_010741	CTGC	2	8	141197	141204	0 %	25 %	25 %	50 %	189025356
2567	NC_010741	AGT	2	6	141446	141451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025356
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2569	NC_010741	CTG	2	6	141527	141532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025356
2570	NC_010741	GAT	2	6	141549	141554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025356
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2573	NC_010741	CAAT	2	8	141790	141797	50 %	25 %	0 %	25 %	189025356
2574	NC_010741	CAC	2	6	141832	141837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189025356
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2578	NC_010741	ATC	2	6	142051	142056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025356
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2582	NC_010741	GA	3	6	142280	142285	50 %	0 %	50 %	0 %	189025356
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2584	NC_010741	ACG	2	6	142447	142452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025356
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2588	NC_010741	CG	3	6	142661	142666	0 %	0 %	50 %	50 %	189025356
2589	NC_010741	T	7	7	142710	142716	0 %	100 %	0 %	0 %	189025356
2590	NC_010741	AGCCA	2	10	142725	142734	40 %	0 %	20 %	40 %	189025356
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2593	NC_010741	TCT	2	6	142825	142830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025356
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2596	NC_010741	GTT	2	6	143059	143064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025357
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2599	NC_010741	TGC	2	6	143231	143236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025357
2600	NC_010741	CA	3	6	143278	143283	50 %	0 %	0 %	50 %	189025357
2601	NC_010741	CGC	2	6	143300	143305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025357
2602	NC_010741	TGCG	3	12	143313	143324	0 %	25 %	50 %	25 %	189025357
2603	NC_010741	GTT	2	6	143385	143390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025357
2604	NC_010741	AGA	2	6	143417	143422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025357
2605	NC_010741	T	7	7	143465	143471	0 %	100 %	0 %	0 %	189025357
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2607	NC_010741	T	9	9	143718	143726	0 %	100 %	0 %	0 %	189025357
2608	NC_010741	GC	3	6	143732	143737	0 %	0 %	50 %	50 %	189025357
2609	NC_010741	T	7	7	143747	143753	0 %	100 %	0 %	0 %	189025357
2610	NC_010741	CGG	2	6	143760	143765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025357
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2617	NC_010741	T	6	6	144066	144071	0 %	100 %	0 %	0 %	189025357
2618	NC_010741	A	6	6	144081	144086	100 %	0 %	0 %	0 %	189025357
2619	NC_010741	TCG	2	6	144097	144102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025357
2620	NC_010741	ATTT	2	8	144106	144113	25 %	75 %	0 %	0 %	189025357
2621	NC_010741	CTTC	2	8	144238	144245	0 %	50 %	0 %	50 %	189025357
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2623	NC_010741	AGGA	2	8	144262	144269	50 %	0 %	50 %	0 %	189025357
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2994	NC_010741	GCGA	2	8	164134	164141	25 %	0 %	50 %	25 %	189025376
2995	NC_010741	TGCCT	2	10	164144	164153	0 %	40 %	20 %	40 %	189025376
2996	NC_010741	T	6	6	164177	164182	0 %	100 %	0 %	0 %	189025376
2997	NC_010741	TAC	3	9	164208	164216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025376
2998	NC_010741	TAT	2	6	164225	164230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025376
2999	NC_010741	GCT	2	6	164275	164280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025377
3000	NC_010741	GA	3	6	164336	164341	50 %	0 %	50 %	0 %	189025377

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