MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 22109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_010741	GCA	2	6	1106202	1106207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026237
21502	NC_010741	ACC	2	6	1106234	1106239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026237
21503	NC_010741	A	6	6	1106285	1106290	100 %	0 %	0 %	0 %	189026237
21504	NC_010741	TG	3	6	1106316	1106321	0 %	50 %	50 %	0 %	189026237
21505	NC_010741	GC	3	6	1106353	1106358	0 %	0 %	50 %	50 %	189026237
21506	NC_010741	GCCC	2	8	1106430	1106437	0 %	0 %	25 %	75 %	189026237
21507	NC_010741	C	6	6	1106536	1106541	0 %	0 %	0 %	100 %	189026237
21508	NC_010741	AG	3	6	1106546	1106551	50 %	0 %	50 %	0 %	189026237
21509	NC_010741	CTGT	2	8	1106573	1106580	0 %	50 %	25 %	25 %	189026237
21510	NC_010741	TGC	2	6	1106582	1106587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026237
21511	NC_010741	CT	3	6	1106601	1106606	0 %	50 %	0 %	50 %	189026237
21512	NC_010741	AC	3	6	1106652	1106657	50 %	0 %	0 %	50 %	189026237
21513	NC_010741	GAG	2	6	1106689	1106694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189026237
21514	NC_010741	AGTG	2	8	1106696	1106703	25 %	25 %	50 %	0 %	189026237
21515	NC_010741	TG	3	6	1106721	1106726	0 %	50 %	50 %	0 %	189026237
21516	NC_010741	GCGT	2	8	1106832	1106839	0 %	25 %	50 %	25 %	189026237
21517	NC_010741	GGC	2	6	1106843	1106848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189026237
21518	NC_010741	GTAC	2	8	1106852	1106859	25 %	25 %	25 %	25 %	189026237
21519	NC_010741	GCA	2	6	1107000	1107005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026237
21520	NC_010741	GCAT	2	8	1107054	1107061	25 %	25 %	25 %	25 %	189026237
21521	NC_010741	GGC	2	6	1107138	1107143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189026237
21522	NC_010741	C	6	6	1107213	1107218	0 %	0 %	0 %	100 %	189026237
21523	NC_010741	CTC	2	6	1107242	1107247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026237
21524	NC_010741	CT	3	6	1107262	1107267	0 %	50 %	0 %	50 %	189026237
21525	NC_010741	CCT	2	6	1107300	1107305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026237
21526	NC_010741	AGC	2	6	1107323	1107328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026237
21527	NC_010741	CAC	2	6	1107371	1107376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026237
21528	NC_010741	GCA	2	6	1107441	1107446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026237
21529	NC_010741	CAT	2	6	1107454	1107459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026237
21530	NC_010741	CTT	2	6	1107465	1107470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189026237
21531	NC_010741	CGA	2	6	1107551	1107556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026237
21532	NC_010741	CG	3	6	1107561	1107566	0 %	0 %	50 %	50 %	189026237
21533	NC_010741	CCA	2	6	1107571	1107576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026237
21534	NC_010741	TC	3	6	1107644	1107649	0 %	50 %	0 %	50 %	189026237
21535	NC_010741	ACCC	2	8	1107701	1107708	25 %	0 %	0 %	75 %	189026237
21536	NC_010741	ACT	2	6	1107711	1107716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026237
21537	NC_010741	AG	3	6	1107725	1107730	50 %	0 %	50 %	0 %	189026237
21538	NC_010741	TAC	2	6	1107742	1107747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026237
21539	NC_010741	GTC	2	6	1107795	1107800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026237
21540	NC_010741	ACG	3	9	1107841	1107849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026238
21541	NC_010741	G	6	6	1107849	1107854	0 %	0 %	100 %	0 %	189026238
21542	NC_010741	CA	3	6	1107954	1107959	50 %	0 %	0 %	50 %	189026238
21543	NC_010741	AGG	2	6	1108032	1108037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189026238
21544	NC_010741	CGC	2	6	1108089	1108094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189026238
21545	NC_010741	AG	3	6	1108106	1108111	50 %	0 %	50 %	0 %	189026238
21546	NC_010741	GC	3	6	1108132	1108137	0 %	0 %	50 %	50 %	189026238
21547	NC_010741	CTC	2	6	1108138	1108143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026238
21548	NC_010741	TCAC	2	8	1108162	1108169	25 %	25 %	0 %	50 %	189026238
21549	NC_010741	CCG	2	6	1108237	1108242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189026239
21550	NC_010741	TTG	2	6	1108274	1108279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189026239
21551	NC_010741	AAG	2	6	1108292	1108297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189026239
21552	NC_010741	CCA	2	6	1108339	1108344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026239
21553	NC_010741	TTC	2	6	1108377	1108382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189026239
21554	NC_010741	TTCA	2	8	1108415	1108422	25 %	50 %	0 %	25 %	189026239
21555	NC_010741	GCA	3	9	1108635	1108643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026239
21556	NC_010741	AAC	2	6	1108674	1108679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189026239
21557	NC_010741	TTA	2	6	1108710	1108715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189026239
21558	NC_010741	GTA	2	6	1108721	1108726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189026239
21559	NC_010741	CTT	2	6	1108778	1108783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189026239
21560	NC_010741	TGC	2	6	1108857	1108862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026239
21561	NC_010741	CGAG	2	8	1108876	1108883	25 %	0 %	50 %	25 %	189026239
21562	NC_010741	CAG	2	6	1109068	1109073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026239
21563	NC_010741	CTT	2	6	1109081	1109086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189026239
21564	NC_010741	AAC	2	6	1109265	1109270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189026239
21565	NC_010741	CA	3	6	1109288	1109293	50 %	0 %	0 %	50 %	189026239
21566	NC_010741	CA	3	6	1109446	1109451	50 %	0 %	0 %	50 %	189026240
21567	NC_010741	AAC	2	6	1109511	1109516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189026240
21568	NC_010741	TGC	2	6	1109694	1109699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026240
21569	NC_010741	GCA	2	6	1109734	1109739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026240
21570	NC_010741	ACCC	2	8	1109788	1109795	25 %	0 %	0 %	75 %	189026240
21571	NC_010741	CGTAT	2	10	1109927	1109936	20 %	40 %	20 %	20 %	189026240
21572	NC_010741	ATC	2	6	1109994	1109999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026240
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21574	NC_010741	GC	3	6	1110131	1110136	0 %	0 %	50 %	50 %	189026240
21575	NC_010741	GAGG	2	8	1110137	1110144	25 %	0 %	75 %	0 %	189026240
21576	NC_010741	CTTC	2	8	1110170	1110177	0 %	50 %	0 %	50 %	189026240
21577	NC_010741	CGT	2	6	1110310	1110315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026240
21578	NC_010741	CA	3	6	1110452	1110457	50 %	0 %	0 %	50 %	189026240
21579	NC_010741	GAC	2	6	1110556	1110561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026240
21580	NC_010741	AGG	2	6	1110575	1110580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189026240
21581	NC_010741	CCA	2	6	1110644	1110649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026240
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21583	NC_010741	GC	3	6	1110683	1110688	0 %	0 %	50 %	50 %	189026240
21584	NC_010741	TCA	2	6	1110723	1110728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026240
21585	NC_010741	CCT	3	9	1110832	1110840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026240
21586	NC_010741	ATGC	2	8	1111001	1111008	25 %	25 %	25 %	25 %	189026240
21587	NC_010741	CAG	2	6	1111009	1111014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026240
21588	NC_010741	AAG	2	6	1111089	1111094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189026240
21589	NC_010741	TAT	2	6	1111148	1111153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189026240
21590	NC_010741	CTG	2	6	1111164	1111169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026240
21591	NC_010741	TCC	2	6	1111434	1111439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026241
21592	NC_010741	AGG	2	6	1111440	1111445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189026241
21593	NC_010741	AAG	2	6	1111452	1111457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189026241
21594	NC_010741	AAAAG	2	10	1111467	1111476	80 %	0 %	20 %	0 %	189026241
21595	NC_010741	GAAA	2	8	1111511	1111518	75 %	0 %	25 %	0 %	189026241
21596	NC_010741	CAG	2	6	1111520	1111525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026241
21597	NC_010741	GAC	2	6	1111532	1111537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026241
21598	NC_010741	AGCTG	2	10	1111549	1111558	20 %	20 %	40 %	20 %	189026241
21599	NC_010741	CTT	2	6	1111577	1111582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189026241
21600	NC_010741	CT	3	6	1111598	1111603	0 %	50 %	0 %	50 %	189026241
21601	NC_010741	CG	4	8	1111605	1111612	0 %	0 %	50 %	50 %	189026241
21602	NC_010741	AAG	2	6	1111668	1111673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189026241
21603	NC_010741	CTCA	2	8	1111712	1111719	25 %	25 %	0 %	50 %	189026241
21604	NC_010741	TCA	3	9	1111737	1111745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026241
21605	NC_010741	ACG	2	6	1111770	1111775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026241
21606	NC_010741	TCA	2	6	1111785	1111790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026241
21607	NC_010741	AGG	2	6	1111800	1111805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189026241
21608	NC_010741	CG	5	10	1111829	1111838	0 %	0 %	50 %	50 %	189026241
21609	NC_010741	TAC	2	6	1111849	1111854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026241
21610	NC_010741	CTG	2	6	1111869	1111874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026241
21611	NC_010741	GAA	2	6	1111919	1111924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189026241
21612	NC_010741	CAT	2	6	1111936	1111941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026241
21613	NC_010741	CG	3	6	1111964	1111969	0 %	0 %	50 %	50 %	189026241
21614	NC_010741	AC	3	6	1112007	1112012	50 %	0 %	0 %	50 %	189026241
21615	NC_010741	GTC	2	6	1112021	1112026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026241
21616	NC_010741	GC	3	6	1112060	1112065	0 %	0 %	50 %	50 %	189026241
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21618	NC_010741	ATCC	2	8	1112099	1112106	25 %	25 %	0 %	50 %	189026241
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21855	NC_010741	A	6	6	1125817	1125822	100 %	0 %	0 %	0 %	189026254
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21977	NC_010741	CG	3	6	1131154	1131159	0 %	0 %	50 %	50 %	189026258
21978	NC_010741	CAC	2	6	1131350	1131355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026258
21979	NC_010741	AC	3	6	1131541	1131546	50 %	0 %	0 %	50 %	189026258
21980	NC_010741	CTC	2	6	1131568	1131573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026258
21981	NC_010741	GCA	2	6	1131650	1131655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026258
21982	NC_010741	GAGC	2	8	1131670	1131677	25 %	0 %	50 %	25 %	189026258
21983	NC_010741	AAT	2	6	1131805	1131810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189026258
21984	NC_010741	GC	3	6	1131868	1131873	0 %	0 %	50 %	50 %	189026258
21985	NC_010741	ATC	2	6	1131874	1131879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026258
21986	NC_010741	GTA	2	6	1131926	1131931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189026258
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21989	NC_010741	ATA	2	6	1132027	1132032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189026258
21990	NC_010741	GC	3	6	1132035	1132040	0 %	0 %	50 %	50 %	189026258
21991	NC_010741	TGA	2	6	1132052	1132057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189026258
21992	NC_010741	AACG	2	8	1132150	1132157	50 %	0 %	25 %	25 %	189026258
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21995	NC_010741	CCTT	2	8	1132328	1132335	0 %	50 %	0 %	50 %	189026258
21996	NC_010741	TGC	2	6	1132358	1132363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026258
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21998	NC_010741	CG	3	6	1132587	1132592	0 %	0 %	50 %	50 %	189026258
21999	NC_010741	TGCC	2	8	1132606	1132613	0 %	25 %	25 %	50 %	189026258
22000	NC_010741	GCT	2	6	1132614	1132619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026258

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