MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 22109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_010741	TACG	2	8	1080521	1080528	25 %	25 %	25 %	25 %	189026217
21002	NC_010741	GAC	2	6	1080533	1080538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026217
21003	NC_010741	CG	4	8	1080551	1080558	0 %	0 %	50 %	50 %	189026217
21004	NC_010741	AC	3	6	1080642	1080647	50 %	0 %	0 %	50 %	189026217
21005	NC_010741	AGCAC	2	10	1080719	1080728	40 %	0 %	20 %	40 %	189026217
21006	NC_010741	CTG	2	6	1080740	1080745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026217
21007	NC_010741	GAT	2	6	1080854	1080859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189026217
21008	NC_010741	CT	3	6	1080993	1080998	0 %	50 %	0 %	50 %	189026218
21009	NC_010741	ATT	2	6	1081050	1081055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189026218
21010	NC_010741	GAT	2	6	1081107	1081112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189026218
21011	NC_010741	TGG	2	6	1081127	1081132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189026218
21012	NC_010741	GAA	2	6	1081158	1081163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189026218
21013	NC_010741	A	6	6	1081162	1081167	100 %	0 %	0 %	0 %	189026218
21014	NC_010741	CTTT	2	8	1081274	1081281	0 %	75 %	0 %	25 %	189026218
21015	NC_010741	ATG	2	6	1081443	1081448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189026218
21016	NC_010741	ACG	2	6	1081495	1081500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026218
21017	NC_010741	A	6	6	1081501	1081506	100 %	0 %	0 %	0 %	189026218
21018	NC_010741	TTTGA	2	10	1081536	1081545	20 %	60 %	20 %	0 %	189026218
21019	NC_010741	A	7	7	1081581	1081587	100 %	0 %	0 %	0 %	189026218
21020	NC_010741	ACG	2	6	1081750	1081755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026218
21021	NC_010741	GGT	2	6	1081859	1081864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189026218
21022	NC_010741	GAA	2	6	1081878	1081883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189026218
21023	NC_010741	TCG	2	6	1081905	1081910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026218
21024	NC_010741	CAA	2	6	1081997	1082002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189026218
21025	NC_010741	ATC	2	6	1082086	1082091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026218
21026	NC_010741	CG	3	6	1082146	1082151	0 %	0 %	50 %	50 %	189026218
21027	NC_010741	T	6	6	1082346	1082351	0 %	100 %	0 %	0 %	189026219
21028	NC_010741	ATA	2	6	1082500	1082505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189026219
21029	NC_010741	TCCA	2	8	1082525	1082532	25 %	25 %	0 %	50 %	189026219
21030	NC_010741	CCG	2	6	1082574	1082579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189026219
21031	NC_010741	TAA	2	6	1082586	1082591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189026219
21032	NC_010741	CATA	2	8	1082613	1082620	50 %	25 %	0 %	25 %	189026219
21033	NC_010741	CAA	2	6	1082675	1082680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189026219
21034	NC_010741	AAG	2	6	1082697	1082702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189026219
21035	NC_010741	CAC	2	6	1082710	1082715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026219
21036	NC_010741	CTG	2	6	1082737	1082742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026219
21037	NC_010741	CT	3	6	1082848	1082853	0 %	50 %	0 %	50 %	189026219
21038	NC_010741	CTG	2	6	1082934	1082939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026219
21039	NC_010741	TC	3	6	1082970	1082975	0 %	50 %	0 %	50 %	189026219
21040	NC_010741	CAA	2	6	1083046	1083051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189026219
21041	NC_010741	T	6	6	1083053	1083058	0 %	100 %	0 %	0 %	189026219
21042	NC_010741	CTG	2	6	1083108	1083113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026219
21043	NC_010741	TTC	2	6	1083167	1083172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189026219
21044	NC_010741	CCT	2	6	1083174	1083179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026219
21045	NC_010741	CCG	2	6	1083198	1083203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189026219
21046	NC_010741	TCG	2	6	1083305	1083310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026219
21047	NC_010741	ATA	2	6	1083364	1083369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189026219
21048	NC_010741	GCT	2	6	1083375	1083380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026219
21049	NC_010741	AAT	2	6	1083397	1083402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189026219
21050	NC_010741	CG	3	6	1083404	1083409	0 %	0 %	50 %	50 %	189026219
21051	NC_010741	CAA	2	6	1083433	1083438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189026219
21052	NC_010741	CCG	2	6	1083497	1083502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189026219
21053	NC_010741	TAA	2	6	1083543	1083548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189026219
21054	NC_010741	GCT	2	6	1083549	1083554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026219
21055	NC_010741	CA	3	6	1083560	1083565	50 %	0 %	0 %	50 %	189026219
21056	NC_010741	GTG	2	6	1083584	1083589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189026219
21057	NC_010741	GC	3	6	1083598	1083603	0 %	0 %	50 %	50 %	189026219
21058	NC_010741	CTG	2	6	1083666	1083671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026219
21059	NC_010741	A	6	6	1083676	1083681	100 %	0 %	0 %	0 %	189026219
21060	NC_010741	AGA	2	6	1083796	1083801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189026219
21061	NC_010741	GCG	2	6	1083822	1083827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189026219
21062	NC_010741	GCA	2	6	1083834	1083839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026219
21063	NC_010741	AC	3	6	1083873	1083878	50 %	0 %	0 %	50 %	189026219
21064	NC_010741	CA	3	6	1083888	1083893	50 %	0 %	0 %	50 %	189026219
21065	NC_010741	TTC	2	6	1084171	1084176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189026220
21066	NC_010741	CTGC	2	8	1084216	1084223	0 %	25 %	25 %	50 %	189026220
21067	NC_010741	TCC	2	6	1084301	1084306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026220
21068	NC_010741	CCG	2	6	1084332	1084337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189026220
21069	NC_010741	GAAA	2	8	1084379	1084386	75 %	0 %	25 %	0 %	189026220
21070	NC_010741	CATCA	2	10	1084402	1084411	40 %	20 %	0 %	40 %	189026220
21071	NC_010741	GC	3	6	1084420	1084425	0 %	0 %	50 %	50 %	189026220
21072	NC_010741	AAG	2	6	1084455	1084460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189026220
21073	NC_010741	GTA	2	6	1084536	1084541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189026220
21074	NC_010741	GCA	2	6	1084628	1084633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026220
21075	NC_010741	CTT	2	6	1084660	1084665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189026220
21076	NC_010741	GC	3	6	1084689	1084694	0 %	0 %	50 %	50 %	189026220
21077	NC_010741	ACT	2	6	1084748	1084753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026220
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21082	NC_010741	AAT	2	6	1084864	1084869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189026220
21083	NC_010741	T	6	6	1084934	1084939	0 %	100 %	0 %	0 %	189026220
21084	NC_010741	GTC	2	6	1084951	1084956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026220
21085	NC_010741	CG	3	6	1085004	1085009	0 %	0 %	50 %	50 %	189026220
21086	NC_010741	GC	3	6	1085035	1085040	0 %	0 %	50 %	50 %	189026220
21087	NC_010741	CGA	2	6	1085075	1085080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026220
21088	NC_010741	TGC	2	6	1085099	1085104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026220
21089	NC_010741	CTG	2	6	1085143	1085148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026220
21090	NC_010741	TCCT	2	8	1085201	1085208	0 %	50 %	0 %	50 %	189026220
21091	NC_010741	TCC	2	6	1085275	1085280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026220
21092	NC_010741	AG	3	6	1085293	1085298	50 %	0 %	50 %	0 %	189026220
21093	NC_010741	TCA	2	6	1085352	1085357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026220
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21096	NC_010741	CAGA	2	8	1085437	1085444	50 %	0 %	25 %	25 %	189026220
21097	NC_010741	A	7	7	1085502	1085508	100 %	0 %	0 %	0 %	189026220
21098	NC_010741	AGAA	2	8	1085561	1085568	75 %	0 %	25 %	0 %	189026220
21099	NC_010741	AAC	2	6	1085633	1085638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189026220
21100	NC_010741	TCA	2	6	1085650	1085655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026220
21101	NC_010741	ACC	2	6	1085676	1085681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026220
21102	NC_010741	AAC	2	6	1085733	1085738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189026220
21103	NC_010741	AGAA	2	8	1085742	1085749	75 %	0 %	25 %	0 %	189026220
21104	NC_010741	AGC	2	6	1085793	1085798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026220
21105	NC_010741	TG	3	6	1085844	1085849	0 %	50 %	50 %	0 %	189026220
21106	NC_010741	TTGC	2	8	1085936	1085943	0 %	50 %	25 %	25 %	189026221
21107	NC_010741	TGA	2	6	1086001	1086006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189026221
21108	NC_010741	CAAA	2	8	1086042	1086049	75 %	0 %	0 %	25 %	189026221
21109	NC_010741	ACGT	2	8	1086137	1086144	25 %	25 %	25 %	25 %	189026221
21110	NC_010741	GTA	2	6	1086155	1086160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189026221
21111	NC_010741	CTTG	2	8	1086235	1086242	0 %	50 %	25 %	25 %	189026221
21112	NC_010741	TGC	2	6	1086252	1086257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026221
21113	NC_010741	AG	3	6	1086299	1086304	50 %	0 %	50 %	0 %	189026221
21114	NC_010741	ACC	3	9	1086474	1086482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026221
21115	NC_010741	ACC	2	6	1086494	1086499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026221
21116	NC_010741	A	6	6	1086539	1086544	100 %	0 %	0 %	0 %	189026221
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21118	NC_010741	GC	3	6	1086647	1086652	0 %	0 %	50 %	50 %	189026221
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21232	NC_010741	CAC	2	6	1092176	1092181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026225
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21234	NC_010741	TGT	2	6	1092248	1092253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189026225
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21350	NC_010741	A	6	6	1097417	1097422	100 %	0 %	0 %	0 %	189026229
21351	NC_010741	C	6	6	1097471	1097476	0 %	0 %	0 %	100 %	189026229
21352	NC_010741	GCAAC	2	10	1097538	1097547	40 %	0 %	20 %	40 %	189026229
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21354	NC_010741	TCA	2	6	1097690	1097695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026229
21355	NC_010741	A	6	6	1097723	1097728	100 %	0 %	0 %	0 %	189026229
21356	NC_010741	ATGG	2	8	1097789	1097796	25 %	25 %	50 %	0 %	189026229
21357	NC_010741	ATA	2	6	1097813	1097818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189026229
21358	NC_010741	ATA	2	6	1097887	1097892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189026229
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21384	NC_010741	CA	3	6	1099277	1099282	50 %	0 %	0 %	50 %	189026230
21385	NC_010741	AAAG	2	8	1099336	1099343	75 %	0 %	25 %	0 %	189026230
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21459	NC_010741	TTCT	2	8	1103709	1103716	0 %	75 %	0 %	25 %	189026233
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21464	NC_010741	CAC	2	6	1104081	1104086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026234
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21470	NC_010741	GATG	2	8	1104288	1104295	25 %	25 %	50 %	0 %	189026234
21471	NC_010741	GCA	2	6	1104322	1104327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026234
21472	NC_010741	TTC	2	6	1104339	1104344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189026234
21473	NC_010741	T	7	7	1104488	1104494	0 %	100 %	0 %	0 %	189026235
21474	NC_010741	CTC	2	6	1104667	1104672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026235
21475	NC_010741	CAC	2	6	1104738	1104743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026235
21476	NC_010741	GCG	2	6	1104780	1104785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189026235
21477	NC_010741	CTT	2	6	1104801	1104806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189026235
21478	NC_010741	AGG	2	6	1104901	1104906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189026235
21479	NC_010741	GCA	2	6	1104929	1104934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026235
21480	NC_010741	GAT	2	6	1104958	1104963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189026235
21481	NC_010741	GCAC	2	8	1105163	1105170	25 %	0 %	25 %	50 %	189026235
21482	NC_010741	GCA	2	6	1105205	1105210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026235
21483	NC_010741	CATGCA	2	12	1105211	1105222	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189026235
21484	NC_010741	TTC	2	6	1105225	1105230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189026235
21485	NC_010741	GTAC	2	8	1105341	1105348	25 %	25 %	25 %	25 %	189026235
21486	NC_010741	ATC	3	9	1105639	1105647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026236
21487	NC_010741	GAG	2	6	1105783	1105788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189026236
21488	NC_010741	CTG	2	6	1105792	1105797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026236
21489	NC_010741	AGT	2	6	1105829	1105834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189026236
21490	NC_010741	GC	4	8	1105855	1105862	0 %	0 %	50 %	50 %	189026236
21491	NC_010741	CG	3	6	1105875	1105880	0 %	0 %	50 %	50 %	189026236
21492	NC_010741	TGC	2	6	1105899	1105904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026237
21493	NC_010741	TC	3	6	1105932	1105937	0 %	50 %	0 %	50 %	189026237
21494	NC_010741	CGC	2	6	1105955	1105960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189026237
21495	NC_010741	GC	3	6	1105964	1105969	0 %	0 %	50 %	50 %	189026237
21496	NC_010741	TTC	2	6	1105979	1105984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189026237
21497	NC_010741	CCT	2	6	1106002	1106007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026237
21498	NC_010741	CG	3	6	1106029	1106034	0 %	0 %	50 %	50 %	189026237
21499	NC_010741	CGCTG	2	10	1106120	1106129	0 %	20 %	40 %	40 %	189026237
21500	NC_010741	CCA	2	6	1106155	1106160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026237

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