MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 22109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_010741	CG	3	6	1002952	1002957	0 %	0 %	50 %	50 %	189026145
19503	NC_010741	CGG	2	6	1002998	1003003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189026145
19504	NC_010741	CG	3	6	1003012	1003017	0 %	0 %	50 %	50 %	189026145
19505	NC_010741	GCA	2	6	1003021	1003026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026145
19506	NC_010741	GTT	2	6	1003137	1003142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189026146
19507	NC_010741	GCAG	2	8	1003165	1003172	25 %	0 %	50 %	25 %	189026146
19508	NC_010741	AC	3	6	1003185	1003190	50 %	0 %	0 %	50 %	189026146
19509	NC_010741	GTG	2	6	1003226	1003231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189026146
19510	NC_010741	TTTTG	2	10	1003266	1003275	0 %	80 %	20 %	0 %	189026146
19511	NC_010741	T	6	6	1003316	1003321	0 %	100 %	0 %	0 %	189026146
19512	NC_010741	GGT	2	6	1003393	1003398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189026146
19513	NC_010741	GCT	2	6	1003441	1003446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026146
19514	NC_010741	GTT	2	6	1003450	1003455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189026146
19515	NC_010741	GCTAAC	2	12	1003546	1003557	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189026146
19516	NC_010741	TTA	2	6	1003571	1003576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189026146
19517	NC_010741	C	6	6	1003592	1003597	0 %	0 %	0 %	100 %	189026146
19518	NC_010741	AACT	2	8	1003615	1003622	50 %	25 %	0 %	25 %	189026146
19519	NC_010741	CTC	2	6	1003630	1003635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026146
19520	NC_010741	CA	3	6	1003637	1003642	50 %	0 %	0 %	50 %	189026146
19521	NC_010741	TACCGT	2	12	1003661	1003672	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189026146
19522	NC_010741	CCG	2	6	1003723	1003728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189026146
19523	NC_010741	CCA	2	6	1003804	1003809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026146
19524	NC_010741	CCT	2	6	1003987	1003992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026146
19525	NC_010741	AC	3	6	1004013	1004018	50 %	0 %	0 %	50 %	189026146
19526	NC_010741	GCA	2	6	1004027	1004032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026146
19527	NC_010741	GC	4	8	1004035	1004042	0 %	0 %	50 %	50 %	189026146
19528	NC_010741	ACA	2	6	1004075	1004080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189026146
19529	NC_010741	C	6	6	1004081	1004086	0 %	0 %	0 %	100 %	189026146
19530	NC_010741	CGC	2	6	1004110	1004115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189026146
19531	NC_010741	GC	3	6	1004452	1004457	0 %	0 %	50 %	50 %	189026147
19532	NC_010741	CTC	2	6	1004500	1004505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026147
19533	NC_010741	AAG	2	6	1004507	1004512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189026147
19534	NC_010741	GC	3	6	1004533	1004538	0 %	0 %	50 %	50 %	189026147
19535	NC_010741	GGAA	2	8	1004543	1004550	50 %	0 %	50 %	0 %	189026147
19536	NC_010741	CACC	2	8	1004604	1004611	25 %	0 %	0 %	75 %	189026147
19537	NC_010741	AAG	2	6	1004657	1004662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189026147
19538	NC_010741	GCA	2	6	1004713	1004718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026147
19539	NC_010741	A	8	8	1004743	1004750	100 %	0 %	0 %	0 %	189026147
19540	NC_010741	GCAG	2	8	1004829	1004836	25 %	0 %	50 %	25 %	189026147
19541	NC_010741	GC	3	6	1004844	1004849	0 %	0 %	50 %	50 %	189026147
19542	NC_010741	TCG	2	6	1004861	1004866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026147
19543	NC_010741	CTG	2	6	1004870	1004875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026147
19544	NC_010741	CGT	2	6	1005003	1005008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026147
19545	NC_010741	CGTC	2	8	1005047	1005054	0 %	25 %	25 %	50 %	189026147
19546	NC_010741	G	6	6	1005125	1005130	0 %	0 %	100 %	0 %	189026147
19547	NC_010741	CGC	2	6	1005174	1005179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189026147
19548	NC_010741	CAA	2	6	1005210	1005215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189026147
19549	NC_010741	ATC	2	6	1005221	1005226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026147
19550	NC_010741	GTG	2	6	1005247	1005252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189026147
19551	NC_010741	CG	3	6	1005380	1005385	0 %	0 %	50 %	50 %	189026147
19552	NC_010741	AT	3	6	1005469	1005474	50 %	50 %	0 %	0 %	189026147
19553	NC_010741	CGC	2	6	1005498	1005503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189026147
19554	NC_010741	TGCAG	2	10	1005570	1005579	20 %	20 %	40 %	20 %	189026147
19555	NC_010741	AC	3	6	1005607	1005612	50 %	0 %	0 %	50 %	189026147
19556	NC_010741	CAG	2	6	1005662	1005667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026147
19557	NC_010741	GAG	2	6	1005682	1005687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189026147
19558	NC_010741	GTG	2	6	1005713	1005718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189026147
19559	NC_010741	A	7	7	1005818	1005824	100 %	0 %	0 %	0 %	189026147
19560	NC_010741	GAG	2	6	1005832	1005837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189026147
19561	NC_010741	GTA	2	6	1005847	1005852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189026147
19562	NC_010741	TC	3	6	1005901	1005906	0 %	50 %	0 %	50 %	189026147
19563	NC_010741	AAC	2	6	1005992	1005997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189026147
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19567	NC_010741	GCT	2	6	1007252	1007257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026148
19568	NC_010741	GAG	2	6	1007272	1007277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189026148
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19571	NC_010741	GGC	2	6	1007383	1007388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189026148
19572	NC_010741	ATGG	2	8	1007391	1007398	25 %	25 %	50 %	0 %	189026148
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19582	NC_010741	TG	3	6	1008346	1008351	0 %	50 %	50 %	0 %	189026149
19583	NC_010741	CGC	2	6	1008394	1008399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189026149
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19585	NC_010741	GC	3	6	1008431	1008436	0 %	0 %	50 %	50 %	189026149
19586	NC_010741	GC	3	6	1008470	1008475	0 %	0 %	50 %	50 %	189026149
19587	NC_010741	GATG	2	8	1008489	1008496	25 %	25 %	50 %	0 %	189026149
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19589	NC_010741	CTC	2	6	1008505	1008510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026149
19590	NC_010741	CGTA	2	8	1008579	1008586	25 %	25 %	25 %	25 %	189026149
19591	NC_010741	CAT	2	6	1008615	1008620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026149
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19594	NC_010741	CGA	2	6	1008834	1008839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026149
19595	NC_010741	AAACG	2	10	1008872	1008881	60 %	0 %	20 %	20 %	189026149
19596	NC_010741	GAG	2	6	1008922	1008927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189026149
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19598	NC_010741	AC	3	6	1009095	1009100	50 %	0 %	0 %	50 %	189026149
19599	NC_010741	A	6	6	1009150	1009155	100 %	0 %	0 %	0 %	189026149
19600	NC_010741	GTAC	2	8	1009161	1009168	25 %	25 %	25 %	25 %	189026149
19601	NC_010741	TCC	2	6	1009170	1009175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026149
19602	NC_010741	ACA	2	6	1009185	1009190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189026149
19603	NC_010741	AC	3	6	1009199	1009204	50 %	0 %	0 %	50 %	189026149
19604	NC_010741	CG	3	6	1009272	1009277	0 %	0 %	50 %	50 %	189026149
19605	NC_010741	GCACA	2	10	1009386	1009395	40 %	0 %	20 %	40 %	189026150
19606	NC_010741	AGC	2	6	1009419	1009424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026150
19607	NC_010741	AGC	2	6	1009426	1009431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026150
19608	NC_010741	A	6	6	1009469	1009474	100 %	0 %	0 %	0 %	189026150
19609	NC_010741	GCA	2	6	1009499	1009504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026150
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19611	NC_010741	AC	3	6	1009623	1009628	50 %	0 %	0 %	50 %	189026150
19612	NC_010741	GCA	2	6	1009690	1009695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026150
19613	NC_010741	GA	3	6	1009719	1009724	50 %	0 %	50 %	0 %	189026150
19614	NC_010741	ATC	2	6	1009766	1009771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026150
19615	NC_010741	A	6	6	1009799	1009804	100 %	0 %	0 %	0 %	189026150
19616	NC_010741	GTG	2	6	1010046	1010051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189026151
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19618	NC_010741	T	6	6	1010167	1010172	0 %	100 %	0 %	0 %	189026151
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19648	NC_010741	GC	3	6	1011706	1011711	0 %	0 %	50 %	50 %	189026153
19649	NC_010741	GC	3	6	1011746	1011751	0 %	0 %	50 %	50 %	189026153
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