MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 22109

< Previous12...33343536373839404142434445Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_010741	CTC	2	6	875050	875055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026029
17003	NC_010741	GCT	2	6	875063	875068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026029
17004	NC_010741	CGC	2	6	875096	875101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189026030
17005	NC_010741	CAGA	2	8	875116	875123	50 %	0 %	25 %	25 %	189026030
17006	NC_010741	CACG	2	8	875153	875160	25 %	0 %	25 %	50 %	189026030
17007	NC_010741	CGTT	2	8	875176	875183	0 %	50 %	25 %	25 %	189026030
17008	NC_010741	CAG	2	6	875228	875233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026030
17009	NC_010741	GT	3	6	875289	875294	0 %	50 %	50 %	0 %	189026030
17010	NC_010741	GAC	2	6	875326	875331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026030
17011	NC_010741	TG	3	6	875349	875354	0 %	50 %	50 %	0 %	189026030
17012	NC_010741	GC	3	6	875360	875365	0 %	0 %	50 %	50 %	189026030
17013	NC_010741	CTGC	2	8	875374	875381	0 %	25 %	25 %	50 %	189026030
17014	NC_010741	CAG	2	6	875425	875430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026030
17015	NC_010741	TTG	2	6	875468	875473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189026030
17016	NC_010741	GCAA	2	8	875478	875485	50 %	0 %	25 %	25 %	189026030
17017	NC_010741	TGC	2	6	875540	875545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026030
17018	NC_010741	CGG	2	6	875554	875559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189026030
17019	NC_010741	CGA	2	6	875571	875576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026030
17020	NC_010741	CG	3	6	875585	875590	0 %	0 %	50 %	50 %	189026030
17021	NC_010741	TGC	2	6	875696	875701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026030
17022	NC_010741	CTG	2	6	875756	875761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026030
17023	NC_010741	TTTCC	2	10	875821	875830	0 %	60 %	0 %	40 %	189026030
17024	NC_010741	GCGCC	2	10	875898	875907	0 %	0 %	40 %	60 %	189026030
17025	NC_010741	TGT	2	6	875923	875928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189026030
17026	NC_010741	GC	3	6	875930	875935	0 %	0 %	50 %	50 %	189026030
17027	NC_010741	CA	3	6	876032	876037	50 %	0 %	0 %	50 %	189026030
17028	NC_010741	TCA	2	6	876054	876059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026030
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17030	NC_010741	ACC	2	6	876120	876125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026030
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17032	NC_010741	TGCG	2	8	876197	876204	0 %	25 %	50 %	25 %	189026030
17033	NC_010741	GAA	2	6	876211	876216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189026030
17034	NC_010741	CG	3	6	876286	876291	0 %	0 %	50 %	50 %	189026030
17035	NC_010741	AC	3	6	876351	876356	50 %	0 %	0 %	50 %	189026030
17036	NC_010741	TG	4	8	876360	876367	0 %	50 %	50 %	0 %	189026030
17037	NC_010741	TGC	2	6	876375	876380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026030
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17039	NC_010741	T	7	7	876732	876738	0 %	100 %	0 %	0 %	189026030
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17042	NC_010741	C	6	6	876868	876873	0 %	0 %	0 %	100 %	189026030
17043	NC_010741	A	6	6	876893	876898	100 %	0 %	0 %	0 %	189026030
17044	NC_010741	CG	4	8	876925	876932	0 %	0 %	50 %	50 %	189026030
17045	NC_010741	GAA	2	6	876993	876998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189026030
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17047	NC_010741	CTCG	2	8	877087	877094	0 %	25 %	25 %	50 %	189026030
17048	NC_010741	AC	3	6	877104	877109	50 %	0 %	0 %	50 %	189026030
17049	NC_010741	ACC	2	6	877254	877259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026031
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17052	NC_010741	CTT	2	6	877455	877460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189026031
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17054	NC_010741	TCA	2	6	877583	877588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026031
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17057	NC_010741	TGC	2	6	877678	877683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026031
17058	NC_010741	TGC	2	6	877723	877728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026031
17059	NC_010741	ATA	2	6	877750	877755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189026031
17060	NC_010741	CGC	2	6	877786	877791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189026031
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17064	NC_010741	CCT	2	6	877851	877856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026031
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17067	NC_010741	AGC	2	6	878005	878010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026031
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17073	NC_010741	GC	4	8	878216	878223	0 %	0 %	50 %	50 %	189026031
17074	NC_010741	ACGT	2	8	878381	878388	25 %	25 %	25 %	25 %	189026031
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17099	NC_010741	GTA	2	6	879846	879851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189026034
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17101	NC_010741	A	7	7	879959	879965	100 %	0 %	0 %	0 %	189026034
17102	NC_010741	TGC	2	6	880034	880039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026034
17103	NC_010741	CCGC	2	8	880074	880081	0 %	0 %	25 %	75 %	189026034
17104	NC_010741	GC	3	6	880108	880113	0 %	0 %	50 %	50 %	189026035
17105	NC_010741	ATCT	3	12	880235	880246	25 %	50 %	0 %	25 %	189026035
17106	NC_010741	CTG	2	6	880262	880267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026035
17107	NC_010741	TG	3	6	880266	880271	0 %	50 %	50 %	0 %	189026035
17108	NC_010741	AGA	2	6	880297	880302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189026035
17109	NC_010741	CCTA	2	8	880343	880350	25 %	25 %	0 %	50 %	189026035
17110	NC_010741	GCG	2	6	880363	880368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189026035
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17112	NC_010741	TCAAT	2	10	880468	880477	40 %	40 %	0 %	20 %	189026035
17113	NC_010741	ACC	2	6	880520	880525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026035
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17117	NC_010741	GAG	2	6	880671	880676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189026035
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17120	NC_010741	TGCA	2	8	880772	880779	25 %	25 %	25 %	25 %	189026035
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17490	NC_010741	AAC	2	6	902134	902139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189026057
17491	NC_010741	GC	3	6	902143	902148	0 %	0 %	50 %	50 %	189026057
17492	NC_010741	TCG	2	6	902202	902207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026057
17493	NC_010741	ACA	2	6	902237	902242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189026057
17494	NC_010741	GACAC	2	10	902253	902262	40 %	0 %	20 %	40 %	189026057
17495	NC_010741	CG	3	6	902375	902380	0 %	0 %	50 %	50 %	189026058
17496	NC_010741	CCGTC	2	10	902389	902398	0 %	20 %	20 %	60 %	189026058
17497	NC_010741	CTC	2	6	902464	902469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026058
17498	NC_010741	GTA	2	6	902502	902507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189026058
17499	NC_010741	ACAA	2	8	902523	902530	75 %	0 %	0 %	25 %	189026058
17500	NC_010741	CCG	2	6	902607	902612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189026058

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