MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 22109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_010741	TTCGC	2	10	850426	850435	0 %	40 %	20 %	40 %	189026007
16503	NC_010741	GTAC	2	8	850564	850571	25 %	25 %	25 %	25 %	189026007
16504	NC_010741	CTG	2	6	850620	850625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026007
16505	NC_010741	CA	3	6	850697	850702	50 %	0 %	0 %	50 %	189026007
16506	NC_010741	ACGC	2	8	850752	850759	25 %	0 %	25 %	50 %	189026007
16507	NC_010741	AGAA	2	8	850835	850842	75 %	0 %	25 %	0 %	189026008
16508	NC_010741	T	8	8	850843	850850	0 %	100 %	0 %	0 %	189026008
16509	NC_010741	CG	3	6	850909	850914	0 %	0 %	50 %	50 %	189026008
16510	NC_010741	GCT	2	6	850938	850943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026008
16511	NC_010741	CAA	2	6	850995	851000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189026008
16512	NC_010741	CAAT	2	8	851042	851049	50 %	25 %	0 %	25 %	189026008
16513	NC_010741	ACCCCT	2	12	851051	851062	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	189026008
16514	NC_010741	TCA	2	6	851106	851111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026008
16515	NC_010741	TGCAC	2	10	851160	851169	20 %	20 %	20 %	40 %	189026008
16516	NC_010741	CA	3	6	851211	851216	50 %	0 %	0 %	50 %	189026008
16517	NC_010741	CGCA	2	8	851217	851224	25 %	0 %	25 %	50 %	189026008
16518	NC_010741	AG	4	8	851242	851249	50 %	0 %	50 %	0 %	189026008
16519	NC_010741	CCCG	2	8	851278	851285	0 %	0 %	25 %	75 %	189026008
16520	NC_010741	GCA	2	6	851363	851368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026008
16521	NC_010741	AC	3	6	851403	851408	50 %	0 %	0 %	50 %	189026008
16522	NC_010741	CG	4	8	851424	851431	0 %	0 %	50 %	50 %	189026008
16523	NC_010741	AGG	2	6	851436	851441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189026008
16524	NC_010741	A	6	6	851470	851475	100 %	0 %	0 %	0 %	189026008
16525	NC_010741	CAG	2	6	851532	851537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026008
16526	NC_010741	GT	3	6	851587	851592	0 %	50 %	50 %	0 %	189026008
16527	NC_010741	CCA	2	6	851669	851674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189026008
16528	NC_010741	CG	3	6	851718	851723	0 %	0 %	50 %	50 %	189026008
16529	NC_010741	GCT	2	6	851805	851810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026008
16530	NC_010741	T	6	6	851861	851866	0 %	100 %	0 %	0 %	189026008
16531	NC_010741	GC	3	6	851900	851905	0 %	0 %	50 %	50 %	189026008
16532	NC_010741	GTTC	2	8	851918	851925	0 %	50 %	25 %	25 %	189026008
16533	NC_010741	CTT	2	6	851929	851934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189026008
16534	NC_010741	TGT	2	6	851943	851948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189026008
16535	NC_010741	TGC	2	6	852131	852136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026009
16536	NC_010741	CAG	2	6	852142	852147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026009
16537	NC_010741	AC	3	6	852186	852191	50 %	0 %	0 %	50 %	189026009
16538	NC_010741	ACA	2	6	852228	852233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189026009
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16540	NC_010741	ACG	2	6	852327	852332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026009
16541	NC_010741	ACTG	2	8	852377	852384	25 %	25 %	25 %	25 %	189026009
16542	NC_010741	CTT	2	6	852424	852429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189026009
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16544	NC_010741	GGTT	2	8	852553	852560	0 %	50 %	50 %	0 %	189026009
16545	NC_010741	GCAC	2	8	852572	852579	25 %	0 %	25 %	50 %	189026009
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16549	NC_010741	CTT	2	6	852720	852725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189026009
16550	NC_010741	CG	3	6	852783	852788	0 %	0 %	50 %	50 %	189026010
16551	NC_010741	T	6	6	852802	852807	0 %	100 %	0 %	0 %	189026010
16552	NC_010741	CG	3	6	852867	852872	0 %	0 %	50 %	50 %	189026010
16553	NC_010741	CGA	2	6	852924	852929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026010
16554	NC_010741	ATC	2	6	852932	852937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026010
16555	NC_010741	A	9	9	852968	852976	100 %	0 %	0 %	0 %	189026010
16556	NC_010741	TAC	2	6	853029	853034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026010
16557	NC_010741	ACT	2	6	853038	853043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026010
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16559	NC_010741	A	7	7	853112	853118	100 %	0 %	0 %	0 %	189026010
16560	NC_010741	TACC	2	8	853152	853159	25 %	25 %	0 %	50 %	189026010
16561	NC_010741	GTAT	2	8	853187	853194	25 %	50 %	25 %	0 %	189026010
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16567	NC_010741	GC	3	6	853781	853786	0 %	0 %	50 %	50 %	189026011
16568	NC_010741	GCT	2	6	853844	853849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189026011
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16573	NC_010741	GTA	2	6	854154	854159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189026011
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16602	NC_010741	T	6	6	855514	855519	0 %	100 %	0 %	0 %	189026013
16603	NC_010741	AAG	2	6	855592	855597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189026013
16604	NC_010741	GCCA	2	8	855607	855614	25 %	0 %	25 %	50 %	189026013
16605	NC_010741	GAA	2	6	855631	855636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189026013
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16608	NC_010741	T	6	6	855853	855858	0 %	100 %	0 %	0 %	189026014
16609	NC_010741	TG	3	6	855939	855944	0 %	50 %	50 %	0 %	189026014
16610	NC_010741	GCAC	2	8	855960	855967	25 %	0 %	25 %	50 %	189026014
16611	NC_010741	TCA	2	6	856007	856012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026014
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16614	NC_010741	AAG	2	6	856169	856174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189026014
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16990	NC_010741	TCA	2	6	874486	874491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189026029
16991	NC_010741	ACA	2	6	874508	874513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189026029
16992	NC_010741	TCTCC	2	10	874521	874530	0 %	40 %	0 %	60 %	189026029
16993	NC_010741	CGTT	2	8	874555	874562	0 %	50 %	25 %	25 %	189026029
16994	NC_010741	TCC	2	6	874580	874585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189026029
16995	NC_010741	TTC	2	6	874654	874659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189026029
16996	NC_010741	A	6	6	874688	874693	100 %	0 %	0 %	0 %	189026029
16997	NC_010741	CA	3	6	874703	874708	50 %	0 %	0 %	50 %	189026029
16998	NC_010741	CGC	2	6	874741	874746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189026029
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17000	NC_010741	CG	3	6	874763	874768	0 %	0 %	50 %	50 %	189026029

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