MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 22109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_010741	CTGC	2	8	824653	824660	0 %	25 %	25 %	50 %	189025985
16002	NC_010741	ATC	2	6	824690	824695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025985
16003	NC_010741	GC	3	6	824767	824772	0 %	0 %	50 %	50 %	189025985
16004	NC_010741	TCTCT	2	10	824824	824833	0 %	60 %	0 %	40 %	189025985
16005	NC_010741	GCA	2	6	824856	824861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025985
16006	NC_010741	CTCC	2	8	824959	824966	0 %	25 %	0 %	75 %	189025985
16007	NC_010741	CCG	2	6	824982	824987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025985
16008	NC_010741	GTG	2	6	824996	825001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025985
16009	NC_010741	CCG	2	6	825078	825083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025985
16010	NC_010741	CAT	2	6	825256	825261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025985
16011	NC_010741	TC	3	6	825309	825314	0 %	50 %	0 %	50 %	189025985
16012	NC_010741	AGC	2	6	825528	825533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025985
16013	NC_010741	AACTCA	2	12	825576	825587	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	189025985
16014	NC_010741	CG	3	6	825605	825610	0 %	0 %	50 %	50 %	189025985
16015	NC_010741	CCGG	2	8	825615	825622	0 %	0 %	50 %	50 %	189025985
16016	NC_010741	AGA	2	6	825669	825674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025986
16017	NC_010741	T	6	6	825693	825698	0 %	100 %	0 %	0 %	189025986
16018	NC_010741	AGC	2	6	825766	825771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025986
16019	NC_010741	CCT	2	6	825786	825791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189025986
16020	NC_010741	CCT	2	6	825797	825802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189025986
16021	NC_010741	T	7	7	825905	825911	0 %	100 %	0 %	0 %	189025986
16022	NC_010741	ACGC	2	8	825912	825919	25 %	0 %	25 %	50 %	189025986
16023	NC_010741	GGC	2	6	825930	825935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025986
16024	NC_010741	GCA	3	9	825983	825991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025986
16025	NC_010741	AT	3	6	826024	826029	50 %	50 %	0 %	0 %	189025986
16026	NC_010741	T	7	7	826042	826048	0 %	100 %	0 %	0 %	189025986
16027	NC_010741	CTC	2	6	826071	826076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189025986
16028	NC_010741	CTGC	2	8	826098	826105	0 %	25 %	25 %	50 %	189025986
16029	NC_010741	GC	3	6	826136	826141	0 %	0 %	50 %	50 %	189025986
16030	NC_010741	TC	3	6	826155	826160	0 %	50 %	0 %	50 %	189025986
16031	NC_010741	A	6	6	826307	826312	100 %	0 %	0 %	0 %	189025986
16032	NC_010741	TG	4	8	826324	826331	0 %	50 %	50 %	0 %	189025986
16033	NC_010741	TGCGC	2	10	826346	826355	0 %	20 %	40 %	40 %	189025986
16034	NC_010741	TCA	2	6	826381	826386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025986
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16036	NC_010741	A	10	10	826436	826445	100 %	0 %	0 %	0 %	189025986
16037	NC_010741	ATT	2	6	826451	826456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025986
16038	NC_010741	GC	3	6	826474	826479	0 %	0 %	50 %	50 %	189025986
16039	NC_010741	GC	4	8	826487	826494	0 %	0 %	50 %	50 %	189025986
16040	NC_010741	ATG	2	6	826682	826687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025987
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16042	NC_010741	TCT	2	6	826737	826742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025987
16043	NC_010741	GC	3	6	826843	826848	0 %	0 %	50 %	50 %	189025987
16044	NC_010741	GAG	2	6	826873	826878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025987
16045	NC_010741	CCT	2	6	826922	826927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189025987
16046	NC_010741	TGCAC	2	10	826932	826941	20 %	20 %	20 %	40 %	189025987
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16048	NC_010741	AGGA	2	8	827130	827137	50 %	0 %	50 %	0 %	189025987
16049	NC_010741	GCC	2	6	827228	827233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025987
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16051	NC_010741	GAA	2	6	827349	827354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025987
16052	NC_010741	GCAC	2	8	827439	827446	25 %	0 %	25 %	50 %	189025987
16053	NC_010741	GA	3	6	827449	827454	50 %	0 %	50 %	0 %	189025987
16054	NC_010741	TTCC	2	8	827460	827467	0 %	50 %	0 %	50 %	189025987
16055	NC_010741	AAAAC	2	10	827501	827510	80 %	0 %	0 %	20 %	189025987
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16057	NC_010741	CCGA	2	8	827545	827552	25 %	0 %	25 %	50 %	189025987
16058	NC_010741	CCTA	2	8	827554	827561	25 %	25 %	0 %	50 %	189025987
16059	NC_010741	GCACAC	2	12	827572	827583	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	189025987
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16061	NC_010741	GCC	2	6	827620	827625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025987
16062	NC_010741	GAG	3	9	827632	827640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025987
16063	NC_010741	GT	3	6	827683	827688	0 %	50 %	50 %	0 %	189025987
16064	NC_010741	GCAGGG	2	12	827694	827705	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	189025987
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16066	NC_010741	GCG	2	6	827816	827821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025988
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16073	NC_010741	CG	3	6	828097	828102	0 %	0 %	50 %	50 %	189025988
16074	NC_010741	GC	3	6	828163	828168	0 %	0 %	50 %	50 %	189025988
16075	NC_010741	GA	3	6	828263	828268	50 %	0 %	50 %	0 %	189025988
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16083	NC_010741	TGA	2	6	828685	828690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025988
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16091	NC_010741	A	6	6	829024	829029	100 %	0 %	0 %	0 %	189025989
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16095	NC_010741	TAT	2	6	829285	829290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025989
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16105	NC_010741	T	6	6	829844	829849	0 %	100 %	0 %	0 %	189025990
16106	NC_010741	TCG	2	6	829892	829897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025990
16107	NC_010741	T	6	6	829951	829956	0 %	100 %	0 %	0 %	189025990
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16109	NC_010741	CG	3	6	830001	830006	0 %	0 %	50 %	50 %	189025990
16110	NC_010741	TCA	2	6	830015	830020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025990
16111	NC_010741	CTG	2	6	830026	830031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025990
16112	NC_010741	TG	3	6	830030	830035	0 %	50 %	50 %	0 %	189025990
16113	NC_010741	CG	3	6	830049	830054	0 %	0 %	50 %	50 %	189025990
16114	NC_010741	ATC	2	6	830138	830143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025990
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16121	NC_010741	T	7	7	830448	830454	0 %	100 %	0 %	0 %	189025990
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16488	NC_010741	AGC	2	6	849559	849564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026005
16489	NC_010741	ACG	2	6	849651	849656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026005
16490	NC_010741	GCAAGC	2	12	849718	849729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026005
16491	NC_010741	CCACA	2	10	849752	849761	40 %	0 %	0 %	60 %	189026005
16492	NC_010741	CA	3	6	849768	849773	50 %	0 %	0 %	50 %	189026005
16493	NC_010741	A	6	6	849790	849795	100 %	0 %	0 %	0 %	189026005
16494	NC_010741	CG	3	6	849859	849864	0 %	0 %	50 %	50 %	189026006
16495	NC_010741	GACA	2	8	849964	849971	50 %	0 %	25 %	25 %	189026006
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16500	NC_010741	AGC	2	6	850272	850277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189026006

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