MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 22109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_010741	CCG	2	6	647647	647652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025820
12503	NC_010741	CTC	2	6	647817	647822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189025821
12504	NC_010741	AATT	2	8	647839	647846	50 %	50 %	0 %	0 %	189025821
12505	NC_010741	CCA	2	6	647889	647894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189025821
12506	NC_010741	ACCA	2	8	647942	647949	50 %	0 %	0 %	50 %	189025821
12507	NC_010741	CTT	2	6	647972	647977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025821
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12509	NC_010741	TCA	2	6	648114	648119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025821
12510	NC_010741	CA	4	8	648212	648219	50 %	0 %	0 %	50 %	189025821
12511	NC_010741	GCCC	2	8	648258	648265	0 %	0 %	25 %	75 %	189025821
12512	NC_010741	CAAC	2	8	648285	648292	50 %	0 %	0 %	50 %	189025821
12513	NC_010741	A	6	6	648312	648317	100 %	0 %	0 %	0 %	189025821
12514	NC_010741	ACG	2	6	648329	648334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025821
12515	NC_010741	C	6	6	648337	648342	0 %	0 %	0 %	100 %	189025821
12516	NC_010741	ACAT	2	8	648343	648350	50 %	25 %	0 %	25 %	189025821
12517	NC_010741	CGG	2	6	648407	648412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025822
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12520	NC_010741	CTC	2	6	648541	648546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189025822
12521	NC_010741	CA	3	6	648558	648563	50 %	0 %	0 %	50 %	189025822
12522	NC_010741	CT	4	8	648566	648573	0 %	50 %	0 %	50 %	189025822
12523	NC_010741	AC	3	6	648617	648622	50 %	0 %	0 %	50 %	189025822
12524	NC_010741	CAA	2	6	648643	648648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189025822
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12527	NC_010741	GCC	2	6	648821	648826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025822
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12530	NC_010741	TGC	2	6	648878	648883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025822
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12534	NC_010741	AAAC	2	8	648993	649000	75 %	0 %	0 %	25 %	189025822
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12565	NC_010741	GCA	2	6	650681	650686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025824
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12588	NC_010741	TTTC	2	8	651752	651759	0 %	75 %	0 %	25 %	189025824
12589	NC_010741	CA	3	6	651772	651777	50 %	0 %	0 %	50 %	189025824
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12604	NC_010741	GC	3	6	652218	652223	0 %	0 %	50 %	50 %	189025824
12605	NC_010741	GC	3	6	652249	652254	0 %	0 %	50 %	50 %	189025824
12606	NC_010741	ACA	2	6	652287	652292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189025824
12607	NC_010741	TGC	2	6	652316	652321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025824
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12609	NC_010741	CTCGCT	2	12	652411	652422	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	189025825
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12612	NC_010741	A	7	7	652535	652541	100 %	0 %	0 %	0 %	189025825
12613	NC_010741	CT	3	6	652549	652554	0 %	50 %	0 %	50 %	189025825
12614	NC_010741	A	6	6	652586	652591	100 %	0 %	0 %	0 %	189025825
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12618	NC_010741	CAC	2	6	652852	652857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189025825
12619	NC_010741	A	6	6	652878	652883	100 %	0 %	0 %	0 %	189025825
12620	NC_010741	CTG	2	6	652889	652894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025825
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12746	NC_010741	CCT	2	6	658557	658562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189025831
12747	NC_010741	CTCATC	2	12	658663	658674	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189025832
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12851	NC_010741	AGA	2	6	663291	663296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025836
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12854	NC_010741	CTTT	2	8	663516	663523	0 %	75 %	0 %	25 %	189025836
12855	NC_010741	CTGCTC	2	12	663560	663571	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	189025836
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12863	NC_010741	AGTT	2	8	664065	664072	25 %	50 %	25 %	0 %	189025836
12864	NC_010741	CTTG	2	8	664080	664087	0 %	50 %	25 %	25 %	189025836
12865	NC_010741	CAA	2	6	664111	664116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189025836
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12990	NC_010741	CG	3	6	670548	670553	0 %	0 %	50 %	50 %	189025842
12991	NC_010741	GTG	2	6	670571	670576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025842
12992	NC_010741	A	7	7	670651	670657	100 %	0 %	0 %	0 %	189025842
12993	NC_010741	TGAC	2	8	670668	670675	25 %	25 %	25 %	25 %	189025842
12994	NC_010741	ATTTT	2	10	670683	670692	20 %	80 %	0 %	0 %	189025842
12995	NC_010741	CG	3	6	670696	670701	0 %	0 %	50 %	50 %	189025842
12996	NC_010741	CG	3	6	670742	670747	0 %	0 %	50 %	50 %	189025842
12997	NC_010741	TTG	2	6	670809	670814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025842
12998	NC_010741	CGCA	2	8	670815	670822	25 %	0 %	25 %	50 %	189025842
12999	NC_010741	CCT	2	6	670848	670853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189025842
13000	NC_010741	GC	3	6	670873	670878	0 %	0 %	50 %	50 %	189025842

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