MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 22109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_010741	TGC	2	6	447800	447805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025651
8502	NC_010741	AGT	2	6	447815	447820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025651
8503	NC_010741	TTGG	2	8	447878	447885	0 %	50 %	50 %	0 %	189025651
8504	NC_010741	TGG	2	6	447959	447964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025651
8505	NC_010741	CGA	2	6	448019	448024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025651
8506	NC_010741	AGC	2	6	448049	448054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025651
8507	NC_010741	TAC	2	6	448101	448106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025651
8508	NC_010741	GAT	2	6	448115	448120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025652
8509	NC_010741	GCA	2	6	448130	448135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025652
8510	NC_010741	CG	3	6	448142	448147	0 %	0 %	50 %	50 %	189025652
8511	NC_010741	GCG	2	6	448154	448159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025652
8512	NC_010741	AGC	2	6	448165	448170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025652
8513	NC_010741	TAC	2	6	448237	448242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025652
8514	NC_010741	TG	3	6	448310	448315	0 %	50 %	50 %	0 %	189025652
8515	NC_010741	CG	3	6	448319	448324	0 %	0 %	50 %	50 %	189025652
8516	NC_010741	CCG	2	6	448349	448354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025652
8517	NC_010741	TGG	2	6	448359	448364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025652
8518	NC_010741	GCA	2	6	448427	448432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025652
8519	NC_010741	TCC	2	6	448565	448570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189025652
8520	NC_010741	CG	3	6	448594	448599	0 %	0 %	50 %	50 %	189025652
8521	NC_010741	CG	4	8	448630	448637	0 %	0 %	50 %	50 %	189025652
8522	NC_010741	CGT	2	6	448641	448646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025652
8523	NC_010741	AT	3	6	448650	448655	50 %	50 %	0 %	0 %	189025652
8524	NC_010741	GCG	2	6	448716	448721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025653
8525	NC_010741	GTG	2	6	448765	448770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025653
8526	NC_010741	CCT	2	6	448812	448817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189025653
8527	NC_010741	GTTGCC	2	12	448820	448831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025653
8528	NC_010741	TTG	2	6	448850	448855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025653
8529	NC_010741	GTG	2	6	448875	448880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025653
8530	NC_010741	GC	3	6	449045	449050	0 %	0 %	50 %	50 %	189025654
8531	NC_010741	GCA	2	6	449116	449121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025654
8532	NC_010741	CGC	2	6	449131	449136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025654
8533	NC_010741	ATG	2	6	449168	449173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025654
8534	NC_010741	CTG	2	6	449201	449206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025654
8535	NC_010741	TAC	2	6	449248	449253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025654
8536	NC_010741	GCGCG	2	10	449291	449300	0 %	0 %	60 %	40 %	189025654
8537	NC_010741	CGG	2	6	449313	449318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025654
8538	NC_010741	CAG	2	6	449350	449355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025654
8539	NC_010741	CAG	2	6	449378	449383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025654
8540	NC_010741	TG	3	6	449462	449467	0 %	50 %	50 %	0 %	189025654
8541	NC_010741	GCT	2	6	449514	449519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025654
8542	NC_010741	GTC	2	6	449651	449656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025654
8543	NC_010741	GAAG	2	8	449661	449668	50 %	0 %	50 %	0 %	189025654
8544	NC_010741	CTC	2	6	449813	449818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189025654
8545	NC_010741	GC	3	6	449842	449847	0 %	0 %	50 %	50 %	189025654
8546	NC_010741	GGC	2	6	449869	449874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025654
8547	NC_010741	TTG	2	6	450022	450027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025654
8548	NC_010741	TC	3	6	450031	450036	0 %	50 %	0 %	50 %	189025654
8549	NC_010741	TGG	3	9	450050	450058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025654
8550	NC_010741	CGG	2	6	450119	450124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025654
8551	NC_010741	CGG	2	6	450210	450215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025654
8552	NC_010741	AC	3	6	450282	450287	50 %	0 %	0 %	50 %	189025654
8553	NC_010741	T	6	6	450328	450333	0 %	100 %	0 %	0 %	189025654
8554	NC_010741	GAA	2	6	450340	450345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025654
8555	NC_010741	CCGG	2	8	450348	450355	0 %	0 %	50 %	50 %	189025654
8556	NC_010741	TGG	2	6	450416	450421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025654
8557	NC_010741	GCG	2	6	450559	450564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025654
8558	NC_010741	TTC	2	6	450603	450608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025654
8559	NC_010741	GGCA	2	8	450642	450649	25 %	0 %	50 %	25 %	189025654
8560	NC_010741	GC	3	6	450672	450677	0 %	0 %	50 %	50 %	189025654
8561	NC_010741	AAT	2	6	450760	450765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189025654
8562	NC_010741	AAG	2	6	450869	450874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025654
8563	NC_010741	ATCG	2	8	450935	450942	25 %	25 %	25 %	25 %	189025654
8564	NC_010741	AT	3	6	450969	450974	50 %	50 %	0 %	0 %	189025654
8565	NC_010741	CTG	2	6	451200	451205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025655
8566	NC_010741	ATGCG	2	10	451206	451215	20 %	20 %	40 %	20 %	189025655
8567	NC_010741	TAT	2	6	451244	451249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025655
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8569	NC_010741	GCG	2	6	451328	451333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025655
8570	NC_010741	TCTTG	2	10	451354	451363	0 %	60 %	20 %	20 %	189025655
8571	NC_010741	GCGTGT	2	12	451375	451386	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	189025655
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8573	NC_010741	T	7	7	451432	451438	0 %	100 %	0 %	0 %	189025655
8574	NC_010741	CTG	2	6	451539	451544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025655
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8576	NC_010741	TTC	2	6	451595	451600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025655
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8579	NC_010741	TGA	2	6	451681	451686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025655
8580	NC_010741	GTAC	2	8	451711	451718	25 %	25 %	25 %	25 %	189025655
8581	NC_010741	GTG	2	6	451722	451727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025655
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8587	NC_010741	T	6	6	451957	451962	0 %	100 %	0 %	0 %	189025655
8588	NC_010741	GC	3	6	452012	452017	0 %	0 %	50 %	50 %	189025655
8589	NC_010741	GAA	2	6	452202	452207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025656
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8594	NC_010741	GT	3	6	452400	452405	0 %	50 %	50 %	0 %	189025656
8595	NC_010741	TG	3	6	452418	452423	0 %	50 %	50 %	0 %	189025656
8596	NC_010741	AG	3	6	452461	452466	50 %	0 %	50 %	0 %	189025656
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8600	NC_010741	GCAC	2	8	452586	452593	25 %	0 %	25 %	50 %	189025656
8601	NC_010741	TGC	2	6	452664	452669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025656
8602	NC_010741	AG	3	6	452672	452677	50 %	0 %	50 %	0 %	189025656
8603	NC_010741	GCGT	2	8	452734	452741	0 %	25 %	50 %	25 %	189025656
8604	NC_010741	GCG	2	6	452745	452750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025656
8605	NC_010741	GTG	2	6	452810	452815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025656
8606	NC_010741	GCG	2	6	452816	452821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025656
8607	NC_010741	CA	3	6	452830	452835	50 %	0 %	0 %	50 %	189025656
8608	NC_010741	TGT	2	6	452848	452853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025656
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8612	NC_010741	GAG	2	6	453111	453116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025657
8613	NC_010741	GAG	2	6	453144	453149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025657
8614	NC_010741	GAG	2	6	453177	453182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025657
8615	NC_010741	GTC	3	9	453197	453205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025657
8616	NC_010741	GCG	2	6	453210	453215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025657
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8618	NC_010741	CT	3	6	453269	453274	0 %	50 %	0 %	50 %	189025657
8619	NC_010741	TAT	2	6	453281	453286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025657
8620	NC_010741	CT	3	6	453393	453398	0 %	50 %	0 %	50 %	189025657
8621	NC_010741	CTG	2	6	453400	453405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025657
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