MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 22109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_010741	TC	3	6	326916	326921	0 %	50 %	0 %	50 %	189025543
6003	NC_010741	CTT	2	6	326925	326930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025543
6004	NC_010741	GTT	2	6	326933	326938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025543
6005	NC_010741	CCT	3	9	326939	326947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189025543
6006	NC_010741	AGG	2	6	326970	326975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025543
6007	NC_010741	CG	3	6	326976	326981	0 %	0 %	50 %	50 %	189025543
6008	NC_010741	CGT	2	6	327014	327019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025543
6009	NC_010741	GC	3	6	327067	327072	0 %	0 %	50 %	50 %	189025543
6010	NC_010741	CG	3	6	327130	327135	0 %	0 %	50 %	50 %	189025543
6011	NC_010741	CGTA	2	8	327156	327163	25 %	25 %	25 %	25 %	189025543
6012	NC_010741	GAA	2	6	327263	327268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025543
6013	NC_010741	ATG	2	6	327270	327275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025543
6014	NC_010741	GTT	2	6	327286	327291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025543
6015	NC_010741	CACT	2	8	327327	327334	25 %	25 %	0 %	50 %	189025543
6016	NC_010741	TGG	2	6	327360	327365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025543
6017	NC_010741	CGC	2	6	327396	327401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025543
6018	NC_010741	GCG	2	6	327406	327411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025543
6019	NC_010741	GGT	2	6	327555	327560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025543
6020	NC_010741	CAT	2	6	327577	327582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025543
6021	NC_010741	CG	5	10	327668	327677	0 %	0 %	50 %	50 %	189025544
6022	NC_010741	GGC	2	6	327683	327688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025544
6023	NC_010741	GT	3	6	327690	327695	0 %	50 %	50 %	0 %	189025544
6024	NC_010741	AGGGG	2	10	327728	327737	20 %	0 %	80 %	0 %	189025544
6025	NC_010741	CA	3	6	327744	327749	50 %	0 %	0 %	50 %	189025544
6026	NC_010741	GC	3	6	327789	327794	0 %	0 %	50 %	50 %	189025544
6027	NC_010741	GT	3	6	327795	327800	0 %	50 %	50 %	0 %	189025544
6028	NC_010741	GGT	2	6	327833	327838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025544
6029	NC_010741	GCA	2	6	327863	327868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025544
6030	NC_010741	GGA	2	6	327869	327874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025544
6031	NC_010741	GT	3	6	327947	327952	0 %	50 %	50 %	0 %	189025544
6032	NC_010741	GA	3	6	327980	327985	50 %	0 %	50 %	0 %	189025545
6033	NC_010741	T	6	6	328012	328017	0 %	100 %	0 %	0 %	189025545
6034	NC_010741	AGAA	2	8	328021	328028	75 %	0 %	25 %	0 %	189025545
6035	NC_010741	CAG	2	6	328032	328037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025545
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6037	NC_010741	GCT	2	6	328136	328141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025546
6038	NC_010741	GCA	2	6	328167	328172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025546
6039	NC_010741	GCTT	2	8	328213	328220	0 %	50 %	25 %	25 %	189025546
6040	NC_010741	G	6	6	328229	328234	0 %	0 %	100 %	0 %	189025546
6041	NC_010741	GTG	2	6	328239	328244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025546
6042	NC_010741	TGCG	2	8	328270	328277	0 %	25 %	50 %	25 %	189025546
6043	NC_010741	GTGC	2	8	328359	328366	0 %	25 %	50 %	25 %	189025546
6044	NC_010741	GC	3	6	328410	328415	0 %	0 %	50 %	50 %	189025546
6045	NC_010741	CGC	2	6	328437	328442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025546
6046	NC_010741	GTGTG	2	10	328443	328452	0 %	40 %	60 %	0 %	189025546
6047	NC_010741	ATT	2	6	328461	328466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025546
6048	NC_010741	TGC	2	6	328474	328479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025546
6049	NC_010741	GT	3	6	328494	328499	0 %	50 %	50 %	0 %	189025546
6050	NC_010741	GCA	2	6	328514	328519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025546
6051	NC_010741	CG	3	6	328520	328525	0 %	0 %	50 %	50 %	189025546
6052	NC_010741	CGG	2	6	328567	328572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025546
6053	NC_010741	TAC	2	6	328577	328582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025546
6054	NC_010741	CA	3	6	328585	328590	50 %	0 %	0 %	50 %	189025546
6055	NC_010741	CG	3	6	328591	328596	0 %	0 %	50 %	50 %	189025546
6056	NC_010741	GCG	3	9	328629	328637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025546
6057	NC_010741	TGC	2	6	328675	328680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025546
6058	NC_010741	GC	3	6	328721	328726	0 %	0 %	50 %	50 %	189025546
6059	NC_010741	G	6	6	328736	328741	0 %	0 %	100 %	0 %	189025546
6060	NC_010741	TAA	2	6	328762	328767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189025546
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6062	NC_010741	GCG	2	6	328842	328847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025546
6063	NC_010741	GT	5	10	328895	328904	0 %	50 %	50 %	0 %	189025546
6064	NC_010741	GTT	2	6	328931	328936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025546
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6066	NC_010741	GT	3	6	329000	329005	0 %	50 %	50 %	0 %	189025546
6067	NC_010741	GC	3	6	329043	329048	0 %	0 %	50 %	50 %	189025546
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6070	NC_010741	GTG	3	9	329187	329195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025547
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6072	NC_010741	TAC	2	6	329363	329368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025547
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6075	NC_010741	ACACT	2	10	329532	329541	40 %	20 %	0 %	40 %	189025547
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6097	NC_010741	TCT	2	6	330861	330866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025547
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6119	NC_010741	CGC	2	6	332148	332153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189025549
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6495	NC_010741	GC	3	6	352941	352946	0 %	0 %	50 %	50 %	189025562
6496	NC_010741	CGA	2	6	352984	352989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025562
6497	NC_010741	CAC	2	6	353052	353057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189025562
6498	NC_010741	CG	3	6	353065	353070	0 %	0 %	50 %	50 %	189025562
6499	NC_010741	TCT	2	6	353114	353119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025562
6500	NC_010741	GAG	2	6	353170	353175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025562

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