MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 22109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010741	TTTG	2	8	237	244	0 %	75 %	25 %	0 %	189025237
2	NC_010741	A	6	6	250	255	100 %	0 %	0 %	0 %	189025237
3	NC_010741	C	6	6	280	285	0 %	0 %	0 %	100 %	189025237
4	NC_010741	TACC	2	8	297	304	25 %	25 %	0 %	50 %	189025237
5	NC_010741	TTCC	2	8	329	336	0 %	50 %	0 %	50 %	189025237
6	NC_010741	GAA	2	6	397	402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025237
7	NC_010741	GCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025237
8	NC_010741	A	6	6	438	443	100 %	0 %	0 %	0 %	189025237
9	NC_010741	ACA	2	6	538	543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189025237
10	NC_010741	A	9	9	628	636	100 %	0 %	0 %	0 %	189025237
11	NC_010741	CTT	2	6	658	663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025237
12	NC_010741	CATT	2	8	672	679	25 %	50 %	0 %	25 %	189025237
13	NC_010741	T	7	7	678	684	0 %	100 %	0 %	0 %	189025237
14	NC_010741	AAG	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025237
15	NC_010741	A	9	9	742	750	100 %	0 %	0 %	0 %	189025237
16	NC_010741	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	189025237
17	NC_010741	A	7	7	886	892	100 %	0 %	0 %	0 %	189025237
18	NC_010741	TGT	2	6	945	950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025237
19	NC_010741	TTC	2	6	972	977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025237
20	NC_010741	GATA	2	8	1047	1054	50 %	25 %	25 %	0 %	189025237
21	NC_010741	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	189025237
22	NC_010741	TTC	2	6	1078	1083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025237
23	NC_010741	CT	3	6	1084	1089	0 %	50 %	0 %	50 %	189025237
24	NC_010741	TTC	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025237
25	NC_010741	GTT	2	6	1192	1197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025237
26	NC_010741	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	189025237
27	NC_010741	ACT	2	6	1249	1254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025237
28	NC_010741	TGG	2	6	1272	1277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025237
29	NC_010741	A	6	6	1310	1315	100 %	0 %	0 %	0 %	189025237
30	NC_010741	AAAGT	2	10	1370	1379	60 %	20 %	20 %	0 %	189025237
31	NC_010741	AAG	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025238
32	NC_010741	AGCAC	2	10	1683	1692	40 %	0 %	20 %	40 %	189025238
33	NC_010741	A	8	8	1710	1717	100 %	0 %	0 %	0 %	189025238
34	NC_010741	T	6	6	1726	1731	0 %	100 %	0 %	0 %	189025238
35	NC_010741	GCT	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025238
36	NC_010741	T	6	6	1846	1851	0 %	100 %	0 %	0 %	189025238
37	NC_010741	TGT	2	6	1868	1873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025238
38	NC_010741	CAA	2	6	1885	1890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189025238
39	NC_010741	GAA	2	6	1914	1919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025238
40	NC_010741	CAAA	2	8	1939	1946	75 %	0 %	0 %	25 %	189025238
41	NC_010741	AGG	2	6	2009	2014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025238
42	NC_010741	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	189025238
43	NC_010741	AGA	2	6	2081	2086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025238
44	NC_010741	ATT	2	6	2139	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025238
45	NC_010741	TA	3	6	2175	2180	50 %	50 %	0 %	0 %	189025238
46	NC_010741	A	7	7	2182	2188	100 %	0 %	0 %	0 %	189025238
47	NC_010741	GCA	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025238
48	NC_010741	T	8	8	2313	2320	0 %	100 %	0 %	0 %	189025238
49	NC_010741	TCT	2	6	2337	2342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025238
50	NC_010741	ATC	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025238
51	NC_010741	GTT	2	6	2453	2458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025238
52	NC_010741	TTA	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025238
53	NC_010741	CAG	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025238
54	NC_010741	TTG	2	6	2505	2510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025238
55	NC_010741	GAA	2	6	2562	2567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025238
56	NC_010741	CTAT	2	8	2612	2619	25 %	50 %	0 %	25 %	189025238
57	NC_010741	GAA	2	6	2625	2630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025238
58	NC_010741	AGG	2	6	2653	2658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025238
59	NC_010741	CAT	2	6	2729	2734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025238
60	NC_010741	AT	3	6	2819	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	189025239
61	NC_010741	T	8	8	2837	2844	0 %	100 %	0 %	0 %	189025239
62	NC_010741	TGC	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025239
63	NC_010741	CG	3	6	2952	2957	0 %	0 %	50 %	50 %	189025239
64	NC_010741	CA	3	6	3004	3009	50 %	0 %	0 %	50 %	189025239
65	NC_010741	A	6	6	3033	3038	100 %	0 %	0 %	0 %	189025239
66	NC_010741	A	7	7	3058	3064	100 %	0 %	0 %	0 %	189025239
67	NC_010741	A	7	7	3072	3078	100 %	0 %	0 %	0 %	189025239
68	NC_010741	CAG	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025239
69	NC_010741	T	6	6	3109	3114	0 %	100 %	0 %	0 %	189025239
70	NC_010741	CTT	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025239
71	NC_010741	AACAAA	2	12	3231	3242	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	189025239
72	NC_010741	AG	3	6	3247	3252	50 %	0 %	50 %	0 %	189025239
73	NC_010741	TAT	2	6	3373	3378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025239
74	NC_010741	CTC	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189025239
75	NC_010741	GAG	2	6	3445	3450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025239
76	NC_010741	GGTT	2	8	3587	3594	0 %	50 %	50 %	0 %	189025239
77	NC_010741	GAT	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025239
78	NC_010741	ATG	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025239
79	NC_010741	A	6	6	3788	3793	100 %	0 %	0 %	0 %	189025239
80	NC_010741	AAT	2	6	3830	3835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189025239
81	NC_010741	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	189025240
82	NC_010741	GT	3	6	3929	3934	0 %	50 %	50 %	0 %	189025240
83	NC_010741	AAAG	2	8	4039	4046	75 %	0 %	25 %	0 %	189025240
84	NC_010741	CGT	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025240
85	NC_010741	GTAC	2	8	4104	4111	25 %	25 %	25 %	25 %	189025240
86	NC_010741	GAA	2	6	4141	4146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025240
87	NC_010741	GAA	2	6	4247	4252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025240
88	NC_010741	GAA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025241
89	NC_010741	GGA	2	6	4558	4563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025241
90	NC_010741	CGTC	2	8	4650	4657	0 %	25 %	25 %	50 %	189025241
91	NC_010741	TCAT	2	8	4707	4714	25 %	50 %	0 %	25 %	189025241
92	NC_010741	CGAAG	2	10	4771	4780	40 %	0 %	40 %	20 %	189025241
93	NC_010741	A	6	6	4816	4821	100 %	0 %	0 %	0 %	189025241
94	NC_010741	TTC	2	6	4875	4880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025241
95	NC_010741	TCT	2	6	4897	4902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025241
96	NC_010741	TTG	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025241
97	NC_010741	ATT	2	6	5174	5179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025241
98	NC_010741	TAC	2	6	5206	5211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025241
99	NC_010741	ACG	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025241
100	NC_010741	GTA	2	6	5345	5350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025241
101	NC_010741	GTGC	2	8	5540	5547	0 %	25 %	50 %	25 %	189025241
102	NC_010741	ATC	2	6	5579	5584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025241
103	NC_010741	TTTGAC	2	12	5642	5653	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189025241
104	NC_010741	GCAGGC	2	12	5659	5670	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	189025241
105	NC_010741	TCT	2	6	5756	5761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025241
106	NC_010741	GGA	2	6	5764	5769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025241
107	NC_010741	TTAC	2	8	5771	5778	25 %	50 %	0 %	25 %	189025241
108	NC_010741	GTT	2	6	5801	5806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025241
109	NC_010741	AAGA	2	8	5807	5814	75 %	0 %	25 %	0 %	189025241
110	NC_010741	GAT	2	6	5843	5848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025241
111	NC_010741	AGA	2	6	5893	5898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025241
112	NC_010741	GGA	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025241
113	NC_010741	GGC	2	6	6019	6024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025241
114	NC_010741	TTA	2	6	6033	6038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025241
115	NC_010741	GGGC	2	8	6092	6099	0 %	0 %	75 %	25 %	189025241
116	NC_010741	GACG	2	8	6181	6188	25 %	0 %	50 %	25 %	189025241
117	NC_010741	GA	3	6	6214	6219	50 %	0 %	50 %	0 %	189025241
118	NC_010741	TAA	2	6	6226	6231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189025241
119	NC_010741	ACT	2	6	6278	6283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025241
120	NC_010741	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	189025241
121	NC_010741	TAT	2	6	6313	6318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025241
122	NC_010741	TTA	2	6	6390	6395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025241
123	NC_010741	GAGG	2	8	6427	6434	25 %	0 %	75 %	0 %	189025241
124	NC_010741	AAC	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189025241
125	NC_010741	AGA	2	6	6615	6620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025241
126	NC_010741	AC	3	6	6624	6629	50 %	0 %	0 %	50 %	189025241
127	NC_010741	GTGTAT	2	12	6685	6696	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	189025241
128	NC_010741	GT	3	6	6728	6733	0 %	50 %	50 %	0 %	189025241
129	NC_010741	GTG	2	6	6753	6758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025241
130	NC_010741	GCGT	2	8	6765	6772	0 %	25 %	50 %	25 %	189025241
131	NC_010741	GT	3	6	6771	6776	0 %	50 %	50 %	0 %	189025241
132	NC_010741	TAG	3	9	6798	6806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025241
133	NC_010741	T	6	6	7076	7081	0 %	100 %	0 %	0 %	189025242
134	NC_010741	AGTT	2	8	7082	7089	25 %	50 %	25 %	0 %	189025242
135	NC_010741	GGA	2	6	7135	7140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025242
136	NC_010741	CTT	2	6	7141	7146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025242
137	NC_010741	ATCGG	2	10	7147	7156	20 %	20 %	40 %	20 %	189025242
138	NC_010741	GAT	2	6	7188	7193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025242
139	NC_010741	TTAC	2	8	7267	7274	25 %	50 %	0 %	25 %	189025242
140	NC_010741	TTGC	2	8	7317	7324	0 %	50 %	25 %	25 %	189025242
141	NC_010741	TGC	2	6	7462	7467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025242
142	NC_010741	GTCA	2	8	7488	7495	25 %	25 %	25 %	25 %	189025242
143	NC_010741	ACT	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025242
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145	NC_010741	TGA	2	6	7618	7623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025242
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147	NC_010741	T	6	6	7712	7717	0 %	100 %	0 %	0 %	189025242
148	NC_010741	A	6	6	7743	7748	100 %	0 %	0 %	0 %	189025242
149	NC_010741	TCA	2	6	7801	7806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189025242
150	NC_010741	TTG	2	6	7812	7817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025242
151	NC_010741	GA	3	6	7912	7917	50 %	0 %	50 %	0 %	189025242
152	NC_010741	TTAAAT	2	12	7964	7975	50 %	50 %	0 %	0 %	189025242
153	NC_010741	GC	3	6	8015	8020	0 %	0 %	50 %	50 %	189025243
154	NC_010741	GAT	2	6	8048	8053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025243
155	NC_010741	GTGG	2	8	10237	10244	0 %	25 %	75 %	0 %	189025244
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157	NC_010741	GTG	2	6	10289	10294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189025244
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159	NC_010741	A	7	7	10330	10336	100 %	0 %	0 %	0 %	189025244
160	NC_010741	A	6	6	10351	10356	100 %	0 %	0 %	0 %	189025244
161	NC_010741	TCC	2	6	10495	10500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189025245
162	NC_010741	CTG	2	6	10517	10522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025245
163	NC_010741	GTC	2	6	10537	10542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025245
164	NC_010741	AGC	2	6	10609	10614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025245
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166	NC_010741	TTG	2	6	10633	10638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189025245
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173	NC_010741	GAAAG	2	10	11079	11088	60 %	0 %	40 %	0 %	189025245
174	NC_010741	GCA	2	6	11197	11202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189025245
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181	NC_010741	CTG	2	6	11462	11467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025245
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217	NC_010741	TGA	2	6	13003	13008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025247
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257	NC_010741	AGAT	2	8	14975	14982	50 %	25 %	25 %	0 %	189025249
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259	NC_010741	GAA	2	6	15127	15132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025249
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261	NC_010741	GAT	2	6	15325	15330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025249
262	NC_010741	TCT	2	6	15396	15401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025249
263	NC_010741	CAA	2	6	15505	15510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189025249
264	NC_010741	AGG	2	6	15536	15541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025249
265	NC_010741	GCTC	2	8	15777	15784	0 %	25 %	25 %	50 %	189025249
266	NC_010741	AAG	2	6	15804	15809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189025250
267	NC_010741	CTGCG	2	10	15895	15904	0 %	20 %	40 %	40 %	189025250
268	NC_010741	TG	3	6	15947	15952	0 %	50 %	50 %	0 %	189025250
269	NC_010741	TGC	2	6	16080	16085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189025250
270	NC_010741	CGG	2	6	16092	16097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025250
271	NC_010741	GAG	2	6	16126	16131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189025250
272	NC_010741	CTT	2	6	16183	16188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189025250
273	NC_010741	GCG	2	6	16195	16200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189025250
274	NC_010741	GCTG	2	8	16207	16214	0 %	25 %	50 %	25 %	189025250
275	NC_010741	GTAC	2	8	16305	16312	25 %	25 %	25 %	25 %	189025250
276	NC_010741	CG	3	6	16382	16387	0 %	0 %	50 %	50 %	189025250
277	NC_010741	GTA	2	6	16403	16408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189025250
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384	NC_010741	ATT	2	6	22273	22278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189025254
385	NC_010741	GCCAC	2	10	22288	22297	20 %	0 %	20 %	60 %	189025254
386	NC_010741	CG	3	6	22413	22418	0 %	0 %	50 %	50 %	189025254
387	NC_010741	AC	3	6	22420	22425	50 %	0 %	0 %	50 %	189025254
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