MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 38800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_010483	AGA	2	6	1691007	1691012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289447
35003	NC_010483	CAT	2	6	1691038	1691043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289447
35004	NC_010483	TCT	2	6	1691071	1691076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289447
35005	NC_010483	GAA	2	6	1691123	1691128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289447
35006	NC_010483	GA	3	6	1691135	1691140	50 %	0 %	50 %	0 %	170289447
35007	NC_010483	TGA	2	6	1691304	1691309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289447
35008	NC_010483	TGG	2	6	1691350	1691355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170289447
35009	NC_010483	AAC	2	6	1691522	1691527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289447
35010	NC_010483	GGC	2	6	1691560	1691565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170289447
35011	NC_010483	GAT	2	6	1691641	1691646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289447
35012	NC_010483	CCTGG	2	10	1691703	1691712	0 %	20 %	40 %	40 %	170289447
35013	NC_010483	TGA	2	6	1691730	1691735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289447
35014	NC_010483	TTC	2	6	1691780	1691785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289447
35015	NC_010483	GTG	3	9	1691795	1691803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170289447
35016	NC_010483	TCG	2	6	1691814	1691819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289447
35017	NC_010483	TTC	3	9	1691900	1691908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289448
35018	NC_010483	GGT	2	6	1691951	1691956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170289448
35019	NC_010483	CA	3	6	1692039	1692044	50 %	0 %	0 %	50 %	170289448
35020	NC_010483	TCG	2	6	1692117	1692122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289448
35021	NC_010483	GTA	2	6	1692148	1692153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289448
35022	NC_010483	TCT	2	6	1692157	1692162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289448
35023	NC_010483	CCGTG	2	10	1692165	1692174	0 %	20 %	40 %	40 %	170289448
35024	NC_010483	GA	3	6	1692204	1692209	50 %	0 %	50 %	0 %	170289448
35025	NC_010483	ATG	2	6	1692266	1692271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289448
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35029	NC_010483	ACA	2	6	1692557	1692562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289448
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35031	NC_010483	TGTTT	2	10	1692592	1692601	0 %	80 %	20 %	0 %	170289448
35032	NC_010483	CAC	2	6	1692613	1692618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289448
35033	NC_010483	CTG	2	6	1692630	1692635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289448
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35037	NC_010483	ATG	2	6	1692743	1692748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289448
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35041	NC_010483	TGATC	2	10	1692912	1692921	20 %	40 %	20 %	20 %	170289448
35042	NC_010483	TC	3	6	1692932	1692937	0 %	50 %	0 %	50 %	170289448
35043	NC_010483	ATC	2	6	1693004	1693009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289448
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35047	NC_010483	T	6	6	1693372	1693377	0 %	100 %	0 %	0 %	170289449
35048	NC_010483	TCT	2	6	1693394	1693399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289449
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35051	NC_010483	AGGT	2	8	1693451	1693458	25 %	25 %	50 %	0 %	170289449
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35100	NC_010483	TCCT	2	8	1695766	1695773	0 %	50 %	0 %	50 %	170289452
35101	NC_010483	TTGT	2	8	1695819	1695826	0 %	75 %	25 %	0 %	170289452
35102	NC_010483	GAT	2	6	1695845	1695850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289452
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35104	NC_010483	GTA	2	6	1695989	1695994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289452
35105	NC_010483	GA	3	6	1696001	1696006	50 %	0 %	50 %	0 %	170289452
35106	NC_010483	TTCC	2	8	1696097	1696104	0 %	50 %	0 %	50 %	170289453
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35112	NC_010483	CCAGAA	2	12	1696461	1696472	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	170289453
35113	NC_010483	TCTG	2	8	1696515	1696522	0 %	50 %	25 %	25 %	170289453
35114	NC_010483	GA	3	6	1696534	1696539	50 %	0 %	50 %	0 %	170289453
35115	NC_010483	GTG	2	6	1696542	1696547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170289453
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35469	NC_010483	AGA	2	6	1713597	1713602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289471
35470	NC_010483	GAA	2	6	1713609	1713614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289471
35471	NC_010483	ACG	2	6	1713662	1713667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289471
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