MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 38800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_010483	TCGAAG	2	12	1158189	1158200	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170288906
24003	NC_010483	CG	3	6	1158223	1158228	0 %	0 %	50 %	50 %	170288906
24004	NC_010483	AAC	2	6	1158276	1158281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288906
24005	NC_010483	GTT	2	6	1158291	1158296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288906
24006	NC_010483	AGA	2	6	1158299	1158304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288906
24007	NC_010483	GAAGG	2	10	1158305	1158314	40 %	0 %	60 %	0 %	170288906
24008	NC_010483	CTG	2	6	1158393	1158398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288906
24009	NC_010483	TCT	2	6	1158444	1158449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288906
24010	NC_010483	GAA	2	6	1158513	1158518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288906
24011	NC_010483	TCA	2	6	1158548	1158553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288906
24012	NC_010483	GCA	2	6	1158588	1158593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288906
24013	NC_010483	GAT	2	6	1158617	1158622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288906
24014	NC_010483	ATCTGA	2	12	1158631	1158642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	170288906
24015	NC_010483	AG	3	6	1158664	1158669	50 %	0 %	50 %	0 %	170288906
24016	NC_010483	TCTT	2	8	1158704	1158711	0 %	75 %	0 %	25 %	170288906
24017	NC_010483	AAC	2	6	1158753	1158758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288906
24018	NC_010483	GAA	2	6	1158831	1158836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288906
24019	NC_010483	GGA	2	6	1158881	1158886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288906
24020	NC_010483	CTTT	2	8	1158896	1158903	0 %	75 %	0 %	25 %	170288906
24021	NC_010483	ACA	2	6	1158946	1158951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288906
24022	NC_010483	AG	3	6	1158981	1158986	50 %	0 %	50 %	0 %	170288906
24023	NC_010483	GT	3	6	1159033	1159038	0 %	50 %	50 %	0 %	170288906
24024	NC_010483	GAA	2	6	1159059	1159064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288906
24025	NC_010483	GAT	2	6	1159095	1159100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288906
24026	NC_010483	AG	3	6	1159135	1159140	50 %	0 %	50 %	0 %	170288906
24027	NC_010483	TCT	2	6	1159172	1159177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288906
24028	NC_010483	AG	3	6	1159190	1159195	50 %	0 %	50 %	0 %	170288906
24029	NC_010483	GA	4	8	1159218	1159225	50 %	0 %	50 %	0 %	170288906
24030	NC_010483	TAC	2	6	1159275	1159280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288906
24031	NC_010483	GAT	2	6	1159317	1159322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288906
24032	NC_010483	GAAA	2	8	1159326	1159333	75 %	0 %	25 %	0 %	170288906
24033	NC_010483	TCA	2	6	1159360	1159365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288906
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24035	NC_010483	AGA	2	6	1159418	1159423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288906
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24042	NC_010483	TTG	2	6	1159639	1159644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288906
24043	NC_010483	TAA	2	6	1159684	1159689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288906
24044	NC_010483	TCA	2	6	1159720	1159725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288906
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24049	NC_010483	CACT	2	8	1160027	1160034	25 %	25 %	0 %	50 %	170288906
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24052	NC_010483	CAGA	2	8	1160149	1160156	50 %	0 %	25 %	25 %	170288906
24053	NC_010483	GAA	2	6	1160252	1160257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288906
24054	NC_010483	TCAG	2	8	1160278	1160285	25 %	25 %	25 %	25 %	170288906
24055	NC_010483	CT	3	6	1160293	1160298	0 %	50 %	0 %	50 %	170288906
24056	NC_010483	TCG	2	6	1160370	1160375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288907
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24116	NC_010483	CTTCT	2	10	1163029	1163038	0 %	60 %	0 %	40 %	170288910
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24233	NC_010483	AGAT	2	8	1167867	1167874	50 %	25 %	25 %	0 %	170288917
24234	NC_010483	GAAA	2	8	1167887	1167894	75 %	0 %	25 %	0 %	170288917
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24354	NC_010483	TAC	2	6	1174361	1174366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288922
24355	NC_010483	GGAA	2	8	1174393	1174400	50 %	0 %	50 %	0 %	170288922
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24471	NC_010483	CTG	3	9	1179821	1179829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288927
24472	NC_010483	TC	3	6	1179852	1179857	0 %	50 %	0 %	50 %	170288927
24473	NC_010483	CGA	2	6	1179888	1179893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288927
24474	NC_010483	CTC	2	6	1179909	1179914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288927
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24477	NC_010483	TTC	2	6	1180114	1180119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288927
24478	NC_010483	CTT	2	6	1180134	1180139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288927
24479	NC_010483	TC	3	6	1180140	1180145	0 %	50 %	0 %	50 %	170288927
24480	NC_010483	CGT	2	6	1180330	1180335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288927
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24490	NC_010483	TGG	2	6	1180783	1180788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288928
24491	NC_010483	GAG	2	6	1180789	1180794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288928
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24496	NC_010483	TCCA	2	8	1181130	1181137	25 %	25 %	0 %	50 %	170288928
24497	NC_010483	AGA	2	6	1181159	1181164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288928
24498	NC_010483	TGT	2	6	1181184	1181189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288928
24499	NC_010483	GAAT	2	8	1181224	1181231	50 %	25 %	25 %	0 %	170288928
24500	NC_010483	GAG	2	6	1181232	1181237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288928

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