MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 38800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_010483	CTG	2	6	838687	838692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288611
17503	NC_010483	TCC	2	6	838727	838732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288612
17504	NC_010483	TCC	2	6	838814	838819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288612
17505	NC_010483	TCA	2	6	838884	838889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288612
17506	NC_010483	CTC	2	6	838930	838935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288612
17507	NC_010483	CGT	2	6	838959	838964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288612
17508	NC_010483	AGA	2	6	838982	838987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288612
17509	NC_010483	A	6	6	838995	839000	100 %	0 %	0 %	0 %	170288612
17510	NC_010483	CAC	2	6	839036	839041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288612
17511	NC_010483	TTC	2	6	839042	839047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288612
17512	NC_010483	ATC	2	6	839048	839053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288612
17513	NC_010483	GAT	2	6	839200	839205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288612
17514	NC_010483	TCTTT	2	10	839233	839242	0 %	80 %	0 %	20 %	170288612
17515	NC_010483	TAC	2	6	839265	839270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288612
17516	NC_010483	GTCT	2	8	839331	839338	0 %	50 %	25 %	25 %	170288613
17517	NC_010483	CTTC	2	8	839347	839354	0 %	50 %	0 %	50 %	170288613
17518	NC_010483	GAG	2	6	839363	839368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288613
17519	NC_010483	GTTCG	2	10	839381	839390	0 %	40 %	40 %	20 %	170288613
17520	NC_010483	TCA	2	6	839428	839433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288613
17521	NC_010483	GA	3	6	839491	839496	50 %	0 %	50 %	0 %	170288613
17522	NC_010483	GA	3	6	839577	839582	50 %	0 %	50 %	0 %	170288613
17523	NC_010483	CTG	2	6	839696	839701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288613
17524	NC_010483	ATT	2	6	839724	839729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288613
17525	NC_010483	TTCT	2	8	839738	839745	0 %	75 %	0 %	25 %	170288613
17526	NC_010483	AGA	2	6	839859	839864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288613
17527	NC_010483	CTG	2	6	839927	839932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288613
17528	NC_010483	TTTC	2	8	839985	839992	0 %	75 %	0 %	25 %	170288613
17529	NC_010483	AAG	2	6	840284	840289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288614
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17531	NC_010483	AAAG	2	8	840546	840553	75 %	0 %	25 %	0 %	170288614
17532	NC_010483	GAAA	2	8	840559	840566	75 %	0 %	25 %	0 %	170288614
17533	NC_010483	AG	3	6	840569	840574	50 %	0 %	50 %	0 %	170288614
17534	NC_010483	AAG	2	6	840575	840580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288614
17535	NC_010483	GAGT	2	8	840662	840669	25 %	25 %	50 %	0 %	170288614
17536	NC_010483	GAA	2	6	840683	840688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288614
17537	NC_010483	GAT	2	6	840725	840730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288614
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17539	NC_010483	TCT	2	6	840826	840831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288614
17540	NC_010483	GAG	2	6	840841	840846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288614
17541	NC_010483	GAG	2	6	840869	840874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288614
17542	NC_010483	GATCT	2	10	840983	840992	20 %	40 %	20 %	20 %	170288614
17543	NC_010483	CTT	2	6	841030	841035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288614
17544	NC_010483	AG	3	6	841046	841051	50 %	0 %	50 %	0 %	170288614
17545	NC_010483	GAT	2	6	841100	841105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288614
17546	NC_010483	AATC	2	8	841229	841236	50 %	25 %	0 %	25 %	170288614
17547	NC_010483	GCG	3	9	841284	841292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288614
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17550	NC_010483	T	6	6	841401	841406	0 %	100 %	0 %	0 %	170288614
17551	NC_010483	A	6	6	841496	841501	100 %	0 %	0 %	0 %	170288615
17552	NC_010483	CGT	2	6	841557	841562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288615
17553	NC_010483	A	6	6	841602	841607	100 %	0 %	0 %	0 %	170288615
17554	NC_010483	GAAGA	2	10	841696	841705	60 %	0 %	40 %	0 %	170288615
17555	NC_010483	TCC	2	6	841797	841802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288615
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17557	NC_010483	GAA	2	6	841844	841849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288615
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17559	NC_010483	TCC	2	6	841949	841954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288615
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17563	NC_010483	TCACT	2	10	842067	842076	20 %	40 %	0 %	40 %	170288615
17564	NC_010483	GTG	2	6	842124	842129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288615
17565	NC_010483	TAC	2	6	842180	842185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288615
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17581	NC_010483	GAAA	2	8	842892	842899	75 %	0 %	25 %	0 %	170288616
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17593	NC_010483	CTG	2	6	843718	843723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288616
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17600	NC_010483	GCAC	2	8	844059	844066	25 %	0 %	25 %	50 %	170288617
17601	NC_010483	T	6	6	844112	844117	0 %	100 %	0 %	0 %	170288617
17602	NC_010483	ACG	2	6	844215	844220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288617
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17604	NC_010483	CGT	2	6	844264	844269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288617
17605	NC_010483	CGA	2	6	844279	844284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288617
17606	NC_010483	TTC	2	6	844346	844351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288617
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17608	NC_010483	AAAG	2	8	844622	844629	75 %	0 %	25 %	0 %	170288617
17609	NC_010483	AGA	2	6	844669	844674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288617
17610	NC_010483	ATC	2	6	844728	844733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288617
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17612	NC_010483	GTC	2	6	844798	844803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288618
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17616	NC_010483	ATCT	2	8	844999	845006	25 %	50 %	0 %	25 %	170288618
17617	NC_010483	CTT	2	6	845032	845037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288618
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17619	NC_010483	GTC	2	6	845104	845109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288618
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