MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 38800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_010483	CTCTT	2	10	740707	740716	0 %	60 %	0 %	40 %	170288524
15503	NC_010483	CCG	2	6	740721	740726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288524
15504	NC_010483	TTC	2	6	740790	740795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288524
15505	NC_010483	GAA	2	6	740870	740875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288524
15506	NC_010483	CTT	2	6	740913	740918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288524
15507	NC_010483	CTTT	3	12	740929	740940	0 %	75 %	0 %	25 %	170288524
15508	NC_010483	CGT	2	6	740944	740949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288524
15509	NC_010483	GAA	2	6	740995	741000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288524
15510	NC_010483	CAA	2	6	741031	741036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288524
15511	NC_010483	T	6	6	741083	741088	0 %	100 %	0 %	0 %	170288524
15512	NC_010483	GA	3	6	741118	741123	50 %	0 %	50 %	0 %	170288524
15513	NC_010483	TTG	2	6	741202	741207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288525
15514	NC_010483	GA	3	6	741215	741220	50 %	0 %	50 %	0 %	170288525
15515	NC_010483	TAG	2	6	741235	741240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288525
15516	NC_010483	GGAAA	2	10	741263	741272	60 %	0 %	40 %	0 %	170288525
15517	NC_010483	GGA	2	6	741282	741287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288525
15518	NC_010483	TAA	2	6	741304	741309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288525
15519	NC_010483	TGGC	2	8	741361	741368	0 %	25 %	50 %	25 %	170288525
15520	NC_010483	ATC	2	6	741393	741398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288525
15521	NC_010483	GAG	2	6	741408	741413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288525
15522	NC_010483	AT	3	6	741448	741453	50 %	50 %	0 %	0 %	170288525
15523	NC_010483	AGG	2	6	741607	741612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288525
15524	NC_010483	CAT	2	6	741626	741631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288525
15525	NC_010483	GTG	2	6	741697	741702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288525
15526	NC_010483	ACT	2	6	741844	741849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288525
15527	NC_010483	TAC	2	6	741936	741941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288525
15528	NC_010483	AAAG	2	8	741953	741960	75 %	0 %	25 %	0 %	170288525
15529	NC_010483	AGA	2	6	742065	742070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288525
15530	NC_010483	GAG	2	6	742082	742087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288525
15531	NC_010483	GGA	2	6	742131	742136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288525
15532	NC_010483	ACGA	2	8	742207	742214	50 %	0 %	25 %	25 %	170288525
15533	NC_010483	AGA	2	6	742255	742260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288525
15534	NC_010483	CTT	2	6	742321	742326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288525
15535	NC_010483	TTC	2	6	742330	742335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288525
15536	NC_010483	ACA	2	6	742339	742344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288525
15537	NC_010483	TAA	2	6	742360	742365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288525
15538	NC_010483	CT	3	6	742409	742414	0 %	50 %	0 %	50 %	170288525
15539	NC_010483	GAA	2	6	742495	742500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288525
15540	NC_010483	ATCT	2	8	742557	742564	25 %	50 %	0 %	25 %	170288525
15541	NC_010483	AAG	2	6	742580	742585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288525
15542	NC_010483	AAG	2	6	742595	742600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288525
15543	NC_010483	AGA	2	6	742607	742612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288525
15544	NC_010483	GAA	2	6	742618	742623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288525
15545	NC_010483	GAA	2	6	742629	742634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288525
15546	NC_010483	GAAA	2	8	742640	742647	75 %	0 %	25 %	0 %	170288525
15547	NC_010483	TCC	2	6	742648	742653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288525
15548	NC_010483	GAA	2	6	742656	742661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288525
15549	NC_010483	AGG	2	6	742666	742671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288525
15550	NC_010483	AGA	2	6	742685	742690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288525
15551	NC_010483	AGA	2	6	742712	742717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288525
15552	NC_010483	AAAG	2	8	742823	742830	75 %	0 %	25 %	0 %	170288526
15553	NC_010483	TGG	2	6	742844	742849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288526
15554	NC_010483	AGC	2	6	742866	742871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288526
15555	NC_010483	TGA	2	6	742877	742882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288526
15556	NC_010483	TGA	2	6	742890	742895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288526
15557	NC_010483	TGG	3	9	742913	742921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288526
15558	NC_010483	A	7	7	742955	742961	100 %	0 %	0 %	0 %	170288526
15559	NC_010483	GAA	2	6	742972	742977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288526
15560	NC_010483	GGT	2	6	743017	743022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288526
15561	NC_010483	A	7	7	743034	743040	100 %	0 %	0 %	0 %	170288526
15562	NC_010483	GTT	2	6	743194	743199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288526
15563	NC_010483	CAGA	2	8	743260	743267	50 %	0 %	25 %	25 %	170288526
15564	NC_010483	GTT	2	6	743311	743316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288526
15565	NC_010483	AGGT	2	8	743378	743385	25 %	25 %	50 %	0 %	170288526
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15569	NC_010483	CGA	2	6	743604	743609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288526
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15572	NC_010483	GGA	2	6	743706	743711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288526
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15591	NC_010483	CGAT	2	8	744913	744920	25 %	25 %	25 %	25 %	170288527
15592	NC_010483	CTT	2	6	744994	744999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288527
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15595	NC_010483	AG	3	6	745083	745088	50 %	0 %	50 %	0 %	170288527
15596	NC_010483	TGG	2	6	745124	745129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288527
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15601	NC_010483	CT	3	6	745239	745244	0 %	50 %	0 %	50 %	170288527
15602	NC_010483	AG	3	6	745265	745270	50 %	0 %	50 %	0 %	170288527
15603	NC_010483	CAC	2	6	745299	745304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288527
15604	NC_010483	CCA	2	6	745315	745320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288527
15605	NC_010483	GCA	2	6	745376	745381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288527
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15607	NC_010483	CGAAT	2	10	745491	745500	40 %	20 %	20 %	20 %	170288527
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15611	NC_010483	AG	3	6	745570	745575	50 %	0 %	50 %	0 %	170288527
15612	NC_010483	GCG	2	6	745576	745581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288527
15613	NC_010483	TAAG	2	8	745792	745799	50 %	25 %	25 %	0 %	170288527
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15985	NC_010483	ACG	2	6	762928	762933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288544
15986	NC_010483	TCTTT	2	10	762938	762947	0 %	80 %	0 %	20 %	170288544
15987	NC_010483	TTC	2	6	762957	762962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288544
15988	NC_010483	AAC	2	6	762966	762971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288544
15989	NC_010483	CCG	2	6	762977	762982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288544
15990	NC_010483	GCA	2	6	763015	763020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288544
15991	NC_010483	CCA	2	6	763100	763105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288544
15992	NC_010483	CTT	2	6	763217	763222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288544
15993	NC_010483	AGATC	2	10	763262	763271	40 %	20 %	20 %	20 %	170288544
15994	NC_010483	AG	3	6	763326	763331	50 %	0 %	50 %	0 %	170288544
15995	NC_010483	AAG	2	6	763332	763337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288544
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15997	NC_010483	ACCAT	2	10	763390	763399	40 %	20 %	0 %	40 %	170288544
15998	NC_010483	CA	3	6	763413	763418	50 %	0 %	0 %	50 %	170288544
15999	NC_010483	GTG	2	6	763497	763502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288544
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