MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 38800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_010483	TTC	2	6	644176	644181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288432
13502	NC_010483	CGC	2	6	644212	644217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288432
13503	NC_010483	TCC	2	6	644254	644259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288432
13504	NC_010483	CTTT	2	8	644278	644285	0 %	75 %	0 %	25 %	170288432
13505	NC_010483	AGAA	2	8	644509	644516	75 %	0 %	25 %	0 %	170288433
13506	NC_010483	AGA	2	6	644554	644559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288433
13507	NC_010483	GGA	2	6	644593	644598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288433
13508	NC_010483	TGA	2	6	644627	644632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288433
13509	NC_010483	A	6	6	644632	644637	100 %	0 %	0 %	0 %	170288433
13510	NC_010483	ACACA	2	10	644648	644657	60 %	0 %	0 %	40 %	170288433
13511	NC_010483	CAT	2	6	644658	644663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288433
13512	NC_010483	TTC	2	6	644670	644675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288433
13513	NC_010483	TCT	2	6	644732	644737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288433
13514	NC_010483	GAA	2	6	644773	644778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288433
13515	NC_010483	TTTC	2	8	644801	644808	0 %	75 %	0 %	25 %	170288433
13516	NC_010483	GAA	2	6	644884	644889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288433
13517	NC_010483	AGA	2	6	644934	644939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288433
13518	NC_010483	TCT	2	6	645145	645150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288433
13519	NC_010483	CGC	2	6	645282	645287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288433
13520	NC_010483	GATGC	2	10	645316	645325	20 %	20 %	40 %	20 %	170288433
13521	NC_010483	AGA	2	6	645500	645505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288434
13522	NC_010483	A	6	6	645510	645515	100 %	0 %	0 %	0 %	170288434
13523	NC_010483	TGGA	2	8	645535	645542	25 %	25 %	50 %	0 %	170288434
13524	NC_010483	ACG	2	6	645546	645551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288434
13525	NC_010483	AGGA	2	8	645571	645578	50 %	0 %	50 %	0 %	170288434
13526	NC_010483	AG	3	6	645592	645597	50 %	0 %	50 %	0 %	170288434
13527	NC_010483	TC	3	6	645648	645653	0 %	50 %	0 %	50 %	170288434
13528	NC_010483	GA	3	6	645671	645676	50 %	0 %	50 %	0 %	170288434
13529	NC_010483	GA	3	6	645680	645685	50 %	0 %	50 %	0 %	170288434
13530	NC_010483	GCTC	2	8	645686	645693	0 %	25 %	25 %	50 %	170288434
13531	NC_010483	GTG	2	6	645708	645713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288434
13532	NC_010483	CT	3	6	645757	645762	0 %	50 %	0 %	50 %	170288434
13533	NC_010483	CAGCC	2	10	645800	645809	20 %	0 %	20 %	60 %	170288434
13534	NC_010483	ACG	2	6	645883	645888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288434
13535	NC_010483	TCG	2	6	645910	645915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288434
13536	NC_010483	ACA	2	6	645922	645927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288434
13537	NC_010483	ATC	2	6	645948	645953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288434
13538	NC_010483	TGT	2	6	645980	645985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288434
13539	NC_010483	GGC	2	6	645989	645994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288434
13540	NC_010483	GA	3	6	646038	646043	50 %	0 %	50 %	0 %	170288434
13541	NC_010483	GAA	2	6	646118	646123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288434
13542	NC_010483	TGA	2	6	646168	646173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288435
13543	NC_010483	GAA	2	6	646195	646200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288435
13544	NC_010483	CTTT	2	8	646201	646208	0 %	75 %	0 %	25 %	170288435
13545	NC_010483	T	6	6	646206	646211	0 %	100 %	0 %	0 %	170288435
13546	NC_010483	ACTCA	2	10	646238	646247	40 %	20 %	0 %	40 %	170288435
13547	NC_010483	TAATT	2	10	646256	646265	40 %	60 %	0 %	0 %	170288435
13548	NC_010483	CAC	2	6	646300	646305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288435
13549	NC_010483	AC	4	8	646304	646311	50 %	0 %	0 %	50 %	170288435
13550	NC_010483	TGA	2	6	646354	646359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288435
13551	NC_010483	GAA	2	6	646463	646468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288435
13552	NC_010483	CTT	2	6	646474	646479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288435
13553	NC_010483	AGC	2	6	646502	646507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288435
13554	NC_010483	ATT	2	6	646524	646529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288435
13555	NC_010483	TTCC	2	8	646558	646565	0 %	50 %	0 %	50 %	170288435
13556	NC_010483	TTC	2	6	646574	646579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288435
13557	NC_010483	TCT	2	6	646758	646763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288435
13558	NC_010483	TAT	2	6	646790	646795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288435
13559	NC_010483	TTA	2	6	646822	646827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288435
13560	NC_010483	CTT	2	6	646882	646887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288435
13561	NC_010483	TGG	2	6	646892	646897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288435
13562	NC_010483	CTC	2	6	646976	646981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288435
13563	NC_010483	TTC	2	6	647011	647016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288435
13564	NC_010483	GAA	2	6	647044	647049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288435
13565	NC_010483	TC	3	6	647052	647057	0 %	50 %	0 %	50 %	170288435
13566	NC_010483	TAT	2	6	647084	647089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288435
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13570	NC_010483	AAT	2	6	647237	647242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288435
13571	NC_010483	ATA	2	6	647392	647397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288435
13572	NC_010483	TGA	2	6	647401	647406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288435
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13574	NC_010483	A	6	6	647483	647488	100 %	0 %	0 %	0 %	170288435
13575	NC_010483	ATCT	2	8	647531	647538	25 %	50 %	0 %	25 %	170288435
13576	NC_010483	TC	3	6	647540	647545	0 %	50 %	0 %	50 %	170288435
13577	NC_010483	ATC	2	6	647567	647572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288435
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13580	NC_010483	CTT	3	9	647743	647751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288435
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13583	NC_010483	CTT	2	6	647978	647983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288436
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13588	NC_010483	CCG	2	6	648330	648335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288437
13589	NC_010483	GAA	2	6	648379	648384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288437
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13592	NC_010483	AGG	2	6	648460	648465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288437
13593	NC_010483	GCC	2	6	648476	648481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288437
13594	NC_010483	CTG	2	6	648486	648491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288437
13595	NC_010483	AGA	2	6	648514	648519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288437
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13598	NC_010483	CAT	2	6	648580	648585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288437
13599	NC_010483	TCAT	2	8	648623	648630	25 %	50 %	0 %	25 %	170288437
13600	NC_010483	AGC	2	6	648664	648669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288437
13601	NC_010483	ACA	2	6	648683	648688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288437
13602	NC_010483	GA	3	6	648719	648724	50 %	0 %	50 %	0 %	170288437
13603	NC_010483	GA	3	6	648757	648762	50 %	0 %	50 %	0 %	170288437
13604	NC_010483	T	6	6	648782	648787	0 %	100 %	0 %	0 %	170288437
13605	NC_010483	GCT	2	6	648821	648826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288437
13606	NC_010483	CCA	2	6	648830	648835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288437
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13608	NC_010483	TCC	2	6	648868	648873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288437
13609	NC_010483	GCA	2	6	648956	648961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288437
13610	NC_010483	CCT	2	6	648965	648970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288437
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13612	NC_010483	GAAA	2	8	649030	649037	75 %	0 %	25 %	0 %	170288437
13613	NC_010483	CCT	2	6	649052	649057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288437
13614	NC_010483	CAA	2	6	649062	649067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288437
13615	NC_010483	TG	3	6	649077	649082	0 %	50 %	50 %	0 %	170288437
13616	NC_010483	TCA	2	6	649092	649097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288437
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13618	NC_010483	TCA	2	6	649154	649159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288437
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13620	NC_010483	T	6	6	649211	649216	0 %	100 %	0 %	0 %	170288437
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13622	NC_010483	TTA	2	6	649329	649334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288437
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