MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 38800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_010483	GAT	2	6	619498	619503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288412
13002	NC_010483	TCT	2	6	619607	619612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288412
13003	NC_010483	ACC	2	6	619660	619665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288412
13004	NC_010483	TC	3	6	619682	619687	0 %	50 %	0 %	50 %	170288412
13005	NC_010483	CAT	2	6	619825	619830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288412
13006	NC_010483	TGA	2	6	619848	619853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288412
13007	NC_010483	CTT	2	6	619860	619865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288412
13008	NC_010483	CACCG	2	10	620032	620041	20 %	0 %	20 %	60 %	170288412
13009	NC_010483	AAG	2	6	620042	620047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288412
13010	NC_010483	GT	3	6	620052	620057	0 %	50 %	50 %	0 %	170288412
13011	NC_010483	TG	3	6	620075	620080	0 %	50 %	50 %	0 %	170288412
13012	NC_010483	AACG	2	8	620128	620135	50 %	0 %	25 %	25 %	170288412
13013	NC_010483	AAAC	2	8	620178	620185	75 %	0 %	0 %	25 %	170288412
13014	NC_010483	AGG	2	6	620201	620206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288412
13015	NC_010483	TTC	2	6	620254	620259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288412
13016	NC_010483	CTTT	2	8	620266	620273	0 %	75 %	0 %	25 %	170288412
13017	NC_010483	ACCT	2	8	620308	620315	25 %	25 %	0 %	50 %	170288412
13018	NC_010483	T	6	6	620326	620331	0 %	100 %	0 %	0 %	170288412
13019	NC_010483	CT	3	6	620350	620355	0 %	50 %	0 %	50 %	170288412
13020	NC_010483	TCT	2	6	620484	620489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288412
13021	NC_010483	TTC	2	6	620501	620506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288412
13022	NC_010483	TCC	2	6	620516	620521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288412
13023	NC_010483	CCTC	2	8	620551	620558	0 %	25 %	0 %	75 %	170288413
13024	NC_010483	ATA	2	6	620654	620659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288413
13025	NC_010483	CAC	2	6	620776	620781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288413
13026	NC_010483	TCC	2	6	620831	620836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288414
13027	NC_010483	CTT	2	6	620855	620860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288414
13028	NC_010483	TTC	2	6	620921	620926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288414
13029	NC_010483	TCC	2	6	620949	620954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288414
13030	NC_010483	ACC	2	6	620983	620988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288414
13031	NC_010483	ATC	2	6	621007	621012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288414
13032	NC_010483	CTC	2	6	621020	621025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288414
13033	NC_010483	CAAAAA	2	12	621055	621066	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	170288414
13034	NC_010483	TAC	2	6	621250	621255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288415
13035	NC_010483	TCA	2	6	621309	621314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288415
13036	NC_010483	GTT	2	6	621329	621334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288415
13037	NC_010483	ATTC	2	8	621367	621374	25 %	50 %	0 %	25 %	170288416
13038	NC_010483	CTG	2	6	621483	621488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288416
13039	NC_010483	GTTTTT	2	12	621491	621502	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	170288416
13040	NC_010483	GCTC	2	8	621533	621540	0 %	25 %	25 %	50 %	170288416
13041	NC_010483	T	6	6	621586	621591	0 %	100 %	0 %	0 %	170288416
13042	NC_010483	CCTC	2	8	621603	621610	0 %	25 %	0 %	75 %	170288416
13043	NC_010483	GTT	2	6	621668	621673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288416
13044	NC_010483	AGAA	2	8	621683	621690	75 %	0 %	25 %	0 %	170288416
13045	NC_010483	AGT	2	6	621713	621718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288416
13046	NC_010483	AG	3	6	621742	621747	50 %	0 %	50 %	0 %	170288416
13047	NC_010483	TC	3	6	621771	621776	0 %	50 %	0 %	50 %	170288416
13048	NC_010483	TGT	2	6	621784	621789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288416
13049	NC_010483	CACTC	2	10	621865	621874	20 %	20 %	0 %	60 %	170288416
13050	NC_010483	TC	3	6	621903	621908	0 %	50 %	0 %	50 %	170288416
13051	NC_010483	CTT	2	6	621934	621939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288416
13052	NC_010483	CTT	2	6	622037	622042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288416
13053	NC_010483	AGA	2	6	622078	622083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288416
13054	NC_010483	ACG	2	6	622095	622100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288416
13055	NC_010483	CT	3	6	622106	622111	0 %	50 %	0 %	50 %	170288416
13056	NC_010483	GAA	2	6	622181	622186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288416
13057	NC_010483	CAC	2	6	622214	622219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288416
13058	NC_010483	AG	4	8	622272	622279	50 %	0 %	50 %	0 %	170288416
13059	NC_010483	CCT	2	6	622333	622338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288417
13060	NC_010483	C	6	6	622369	622374	0 %	0 %	0 %	100 %	170288417
13061	NC_010483	CA	3	6	622380	622385	50 %	0 %	0 %	50 %	170288417
13062	NC_010483	TTC	2	6	622556	622561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288417
13063	NC_010483	AG	3	6	622600	622605	50 %	0 %	50 %	0 %	170288417
13064	NC_010483	GAAA	2	8	622657	622664	75 %	0 %	25 %	0 %	170288417
13065	NC_010483	CGG	2	6	622703	622708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288417
13066	NC_010483	CGC	3	9	622743	622751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288417
13067	NC_010483	GTG	2	6	622752	622757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288417
13068	NC_010483	ACC	2	6	622761	622766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288417
13069	NC_010483	GA	3	6	622771	622776	50 %	0 %	50 %	0 %	170288417
13070	NC_010483	TCC	2	6	622802	622807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288417
13071	NC_010483	TGT	2	6	622826	622831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288417
13072	NC_010483	CCCA	2	8	622843	622850	25 %	0 %	0 %	75 %	170288417
13073	NC_010483	T	6	6	622958	622963	0 %	100 %	0 %	0 %	170288417
13074	NC_010483	T	6	6	622969	622974	0 %	100 %	0 %	0 %	170288417
13075	NC_010483	CTTT	2	8	622988	622995	0 %	75 %	0 %	25 %	170288417
13076	NC_010483	TTCAA	2	10	623077	623086	40 %	40 %	0 %	20 %	170288417
13077	NC_010483	CAA	2	6	623111	623116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288417
13078	NC_010483	TATC	2	8	623140	623147	25 %	50 %	0 %	25 %	170288417
13079	NC_010483	ACA	2	6	623152	623157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288417
13080	NC_010483	TTC	2	6	623242	623247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288417
13081	NC_010483	GCG	2	6	623272	623277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288417
13082	NC_010483	TTTCA	2	10	623368	623377	20 %	60 %	0 %	20 %	170288418
13083	NC_010483	AGA	2	6	623428	623433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288418
13084	NC_010483	GAT	2	6	623441	623446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288418
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13086	NC_010483	TTTC	2	8	623490	623497	0 %	75 %	0 %	25 %	170288418
13087	NC_010483	TC	3	6	623504	623509	0 %	50 %	0 %	50 %	170288418
13088	NC_010483	GCA	2	6	623529	623534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288418
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13090	NC_010483	T	6	6	623678	623683	0 %	100 %	0 %	0 %	170288418
13091	NC_010483	GAA	2	6	623690	623695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288418
13092	NC_010483	GAT	2	6	623702	623707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288418
13093	NC_010483	AGAC	2	8	623752	623759	50 %	0 %	25 %	25 %	170288418
13094	NC_010483	GAA	2	6	623818	623823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288418
13095	NC_010483	CAT	2	6	623861	623866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288418
13096	NC_010483	T	7	7	624007	624013	0 %	100 %	0 %	0 %	170288419
13097	NC_010483	TTCC	2	8	624047	624054	0 %	50 %	0 %	50 %	170288419
13098	NC_010483	TCT	2	6	624107	624112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288419
13099	NC_010483	CTTT	2	8	624122	624129	0 %	75 %	0 %	25 %	170288419
13100	NC_010483	TC	4	8	624178	624185	0 %	50 %	0 %	50 %	170288419
13101	NC_010483	GAA	2	6	624226	624231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288419
13102	NC_010483	GTA	2	6	624237	624242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288419
13103	NC_010483	CCA	2	6	624250	624255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288419
13104	NC_010483	GTTC	2	8	624281	624288	0 %	50 %	25 %	25 %	170288419
13105	NC_010483	TGG	2	6	624329	624334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288419
13106	NC_010483	TTC	2	6	624423	624428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288419
13107	NC_010483	C	6	6	624436	624441	0 %	0 %	0 %	100 %	170288419
13108	NC_010483	AAC	2	6	624477	624482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288419
13109	NC_010483	TTG	2	6	624512	624517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288419
13110	NC_010483	TCC	2	6	624531	624536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288419
13111	NC_010483	TTC	2	6	624570	624575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288419
13112	NC_010483	CCA	2	6	624578	624583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288419
13113	NC_010483	GAT	2	6	624603	624608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288419
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13118	NC_010483	CTT	2	6	624842	624847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288419
13119	NC_010483	CTC	2	6	624908	624913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288419
13120	NC_010483	TC	3	6	624989	624994	0 %	50 %	0 %	50 %	170288419
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13478	NC_010483	A	6	6	642582	642587	100 %	0 %	0 %	0 %	170288431
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13482	NC_010483	CTGAA	2	10	642809	642818	40 %	20 %	20 %	20 %	170288431
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13484	NC_010483	TAC	2	6	643035	643040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288431
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13486	NC_010483	TCC	2	6	643198	643203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288431
13487	NC_010483	AGT	2	6	643263	643268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288431
13488	NC_010483	GATC	2	8	643293	643300	25 %	25 %	25 %	25 %	170288431
13489	NC_010483	ACG	2	6	643340	643345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288431
13490	NC_010483	CGA	2	6	643347	643352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288431
13491	NC_010483	AAC	2	6	643366	643371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288431
13492	NC_010483	CCT	2	6	643391	643396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288431
13493	NC_010483	CCT	2	6	643538	643543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288432
13494	NC_010483	AGC	2	6	643621	643626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288432
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13497	NC_010483	GAAA	2	8	643937	643944	75 %	0 %	25 %	0 %	170288432
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