MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 38800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_010483	TGG	2	6	545813	545818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288342
11502	NC_010483	CGC	2	6	545859	545864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288342
11503	NC_010483	TGGA	2	8	545873	545880	25 %	25 %	50 %	0 %	170288342
11504	NC_010483	GGT	2	6	545884	545889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288342
11505	NC_010483	AGC	2	6	545904	545909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288342
11506	NC_010483	TA	3	6	545925	545930	50 %	50 %	0 %	0 %	170288342
11507	NC_010483	T	6	6	545953	545958	0 %	100 %	0 %	0 %	170288342
11508	NC_010483	AGA	2	6	545969	545974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288342
11509	NC_010483	CAG	2	6	546030	546035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288342
11510	NC_010483	TGA	2	6	546137	546142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288342
11511	NC_010483	ACC	2	6	546213	546218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288342
11512	NC_010483	GA	3	6	546231	546236	50 %	0 %	50 %	0 %	170288342
11513	NC_010483	GAA	2	6	546245	546250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288342
11514	NC_010483	ATT	2	6	546279	546284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288342
11515	NC_010483	TGT	2	6	546398	546403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288343
11516	NC_010483	GTT	2	6	546405	546410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288343
11517	NC_010483	GGC	2	6	546434	546439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288343
11518	NC_010483	CAC	2	6	546443	546448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288343
11519	NC_010483	A	7	7	546468	546474	100 %	0 %	0 %	0 %	170288343
11520	NC_010483	AAG	2	6	546486	546491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288343
11521	NC_010483	GAAA	2	8	546497	546504	75 %	0 %	25 %	0 %	170288343
11522	NC_010483	TCT	2	6	546602	546607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288343
11523	NC_010483	AAG	2	6	546642	546647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288343
11524	NC_010483	TCA	2	6	546688	546693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288343
11525	NC_010483	AC	3	6	546715	546720	50 %	0 %	0 %	50 %	170288343
11526	NC_010483	ACT	2	6	546785	546790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288343
11527	NC_010483	TCA	2	6	546823	546828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288343
11528	NC_010483	GAA	2	6	546881	546886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288343
11529	NC_010483	AAT	2	6	546902	546907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288343
11530	NC_010483	CCT	2	6	546914	546919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288343
11531	NC_010483	GAA	2	6	546997	547002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288343
11532	NC_010483	CGGAA	2	10	547019	547028	40 %	0 %	40 %	20 %	170288343
11533	NC_010483	GGAG	2	8	547034	547041	25 %	0 %	75 %	0 %	170288343
11534	NC_010483	GCT	2	6	547272	547277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288343
11535	NC_010483	GAAC	2	8	547330	547337	50 %	0 %	25 %	25 %	170288343
11536	NC_010483	GA	3	6	547404	547409	50 %	0 %	50 %	0 %	170288343
11537	NC_010483	GAAG	2	8	547415	547422	50 %	0 %	50 %	0 %	170288343
11538	NC_010483	CAGA	2	8	547459	547466	50 %	0 %	25 %	25 %	170288343
11539	NC_010483	GTG	2	6	547500	547505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288343
11540	NC_010483	TCT	2	6	547513	547518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288343
11541	NC_010483	TAA	2	6	547588	547593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288343
11542	NC_010483	AC	3	6	547650	547655	50 %	0 %	0 %	50 %	170288343
11543	NC_010483	TAT	2	6	547711	547716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288343
11544	NC_010483	GAAA	2	8	547751	547758	75 %	0 %	25 %	0 %	170288344
11545	NC_010483	AGC	2	6	547777	547782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288344
11546	NC_010483	ATC	2	6	547791	547796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288344
11547	NC_010483	AGA	3	9	547967	547975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288344
11548	NC_010483	GGT	2	6	548013	548018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288344
11549	NC_010483	AGG	3	9	548144	548152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288345
11550	NC_010483	AAG	2	6	548196	548201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288345
11551	NC_010483	TC	3	6	548281	548286	0 %	50 %	0 %	50 %	170288345
11552	NC_010483	ATGAA	2	10	548296	548305	60 %	20 %	20 %	0 %	170288345
11553	NC_010483	ACG	2	6	548350	548355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288345
11554	NC_010483	TGA	2	6	548389	548394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288345
11555	NC_010483	CGT	2	6	548459	548464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288345
11556	NC_010483	AAAACA	2	12	548467	548478	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	170288345
11557	NC_010483	GTC	2	6	548484	548489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288345
11558	NC_010483	GA	3	6	548500	548505	50 %	0 %	50 %	0 %	170288345
11559	NC_010483	T	6	6	548554	548559	0 %	100 %	0 %	0 %	170288345
11560	NC_010483	TGA	2	6	548591	548596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288345
11561	NC_010483	ATA	2	6	548634	548639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288345
11562	NC_010483	GGT	2	6	548643	548648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288345
11563	NC_010483	TTC	2	6	548673	548678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288345
11564	NC_010483	TCC	2	6	548725	548730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288345
11565	NC_010483	AGA	2	6	548753	548758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288345
11566	NC_010483	AAAGG	2	10	548776	548785	60 %	0 %	40 %	0 %	170288345
11567	NC_010483	A	6	6	548800	548805	100 %	0 %	0 %	0 %	170288345
11568	NC_010483	TCC	2	6	548814	548819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288345
11569	NC_010483	CGC	2	6	548894	548899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288345
11570	NC_010483	GAA	2	6	548902	548907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288345
11571	NC_010483	GGA	2	6	548921	548926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288345
11572	NC_010483	GTC	2	6	548961	548966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288345
11573	NC_010483	GAAC	2	8	548983	548990	50 %	0 %	25 %	25 %	170288345
11574	NC_010483	GCTC	2	8	549035	549042	0 %	25 %	25 %	50 %	170288345
11575	NC_010483	GAA	2	6	549096	549101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288345
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11578	NC_010483	GA	3	6	549164	549169	50 %	0 %	50 %	0 %	170288345
11579	NC_010483	GAA	2	6	549186	549191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288345
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11583	NC_010483	TCT	2	6	549586	549591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288346
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11587	NC_010483	CGG	2	6	549728	549733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288346
11588	NC_010483	GAG	2	6	549759	549764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288346
11589	NC_010483	TC	3	6	549793	549798	0 %	50 %	0 %	50 %	170288346
11590	NC_010483	GAA	2	6	549870	549875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288346
11591	NC_010483	CAG	2	6	549933	549938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288346
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11593	NC_010483	TTC	2	6	549988	549993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288346
11594	NC_010483	TTA	2	6	550022	550027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288346
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11598	NC_010483	GA	3	6	550210	550215	50 %	0 %	50 %	0 %	170288347
11599	NC_010483	GCC	2	6	550224	550229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288347
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11601	NC_010483	GTT	2	6	550272	550277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288347
11602	NC_010483	GAA	2	6	550287	550292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288347
11603	NC_010483	A	6	6	550295	550300	100 %	0 %	0 %	0 %	170288347
11604	NC_010483	GCC	2	6	550419	550424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288347
11605	NC_010483	CTT	2	6	550434	550439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288347
11606	NC_010483	GTGTG	2	10	550470	550479	0 %	40 %	60 %	0 %	170288347
11607	NC_010483	AG	3	6	550491	550496	50 %	0 %	50 %	0 %	170288347
11608	NC_010483	AG	3	6	550515	550520	50 %	0 %	50 %	0 %	170288347
11609	NC_010483	CTT	2	6	550521	550526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288347
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11616	NC_010483	GA	3	6	551246	551251	50 %	0 %	50 %	0 %	170288348
11617	NC_010483	GAG	2	6	551269	551274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288348
11618	NC_010483	TTCG	2	8	551297	551304	0 %	50 %	25 %	25 %	170288348
11619	NC_010483	GAA	2	6	551316	551321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288348
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11621	NC_010483	TCT	2	6	551333	551338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288349
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11988	NC_010483	T	6	6	570993	570998	0 %	100 %	0 %	0 %	170288363
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