MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 38800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_010483	CAT	2	6	449047	449052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288259
9503	NC_010483	ACA	2	6	449061	449066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288259
9504	NC_010483	A	7	7	449096	449102	100 %	0 %	0 %	0 %	170288259
9505	NC_010483	CTC	2	6	449177	449182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288259
9506	NC_010483	AGA	2	6	449244	449249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288259
9507	NC_010483	CGT	2	6	449295	449300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288259
9508	NC_010483	GAA	2	6	449306	449311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288259
9509	NC_010483	GATC	2	8	449347	449354	25 %	25 %	25 %	25 %	170288259
9510	NC_010483	ACA	2	6	449400	449405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288259
9511	NC_010483	GAA	2	6	449516	449521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288260
9512	NC_010483	CAG	3	9	449560	449568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288260
9513	NC_010483	CAT	2	6	449624	449629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288260
9514	NC_010483	CGA	2	6	449630	449635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288260
9515	NC_010483	CA	3	6	449651	449656	50 %	0 %	0 %	50 %	170288260
9516	NC_010483	ACAGTG	2	12	449712	449723	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170288260
9517	NC_010483	CTG	2	6	449761	449766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288260
9518	NC_010483	TAT	2	6	449822	449827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288260
9519	NC_010483	TCT	2	6	449842	449847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288260
9520	NC_010483	TCCA	2	8	449855	449862	25 %	25 %	0 %	50 %	170288260
9521	NC_010483	ATT	2	6	449875	449880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288260
9522	NC_010483	CTA	2	6	449939	449944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288260
9523	NC_010483	CCA	2	6	449980	449985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288260
9524	NC_010483	CAA	2	6	449986	449991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288260
9525	NC_010483	CGA	2	6	450005	450010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288260
9526	NC_010483	CAAGCA	2	12	450097	450108	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	170288260
9527	NC_010483	CAA	2	6	450196	450201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288260
9528	NC_010483	TTCGAC	2	12	450237	450248	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	170288260
9529	NC_010483	ACT	2	6	450280	450285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288260
9530	NC_010483	AAC	2	6	450312	450317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288260
9531	NC_010483	GCA	2	6	450460	450465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288260
9532	NC_010483	CTT	2	6	450498	450503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288260
9533	NC_010483	CTC	2	6	450606	450611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288260
9534	NC_010483	TTC	2	6	450654	450659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288260
9535	NC_010483	ACA	2	6	450699	450704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288260
9536	NC_010483	TGA	2	6	450707	450712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288260
9537	NC_010483	TCA	2	6	450730	450735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288260
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9539	NC_010483	GTG	2	6	450964	450969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288261
9540	NC_010483	GATC	2	8	451032	451039	25 %	25 %	25 %	25 %	170288261
9541	NC_010483	CAT	2	6	451083	451088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288261
9542	NC_010483	CAC	2	6	451089	451094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288261
9543	NC_010483	A	8	8	451228	451235	100 %	0 %	0 %	0 %	170288261
9544	NC_010483	ACA	2	6	451253	451258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288261
9545	NC_010483	AC	3	6	451321	451326	50 %	0 %	0 %	50 %	170288261
9546	NC_010483	TG	3	6	451330	451335	0 %	50 %	50 %	0 %	170288261
9547	NC_010483	AAT	2	6	451380	451385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288261
9548	NC_010483	CTT	2	6	451400	451405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288261
9549	NC_010483	GAAA	2	8	451443	451450	75 %	0 %	25 %	0 %	170288261
9550	NC_010483	TAC	2	6	451541	451546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288262
9551	NC_010483	TAC	2	6	451691	451696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288262
9552	NC_010483	GCT	2	6	451760	451765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288262
9553	NC_010483	AGA	2	6	451785	451790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288262
9554	NC_010483	CTCA	2	8	451799	451806	25 %	25 %	0 %	50 %	170288262
9555	NC_010483	ACG	2	6	451884	451889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288262
9556	NC_010483	AAG	2	6	451902	451907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288262
9557	NC_010483	CCA	2	6	451989	451994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288262
9558	NC_010483	GTG	2	6	452018	452023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288262
9559	NC_010483	ACT	2	6	452073	452078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288262
9560	NC_010483	ACGG	2	8	452090	452097	25 %	0 %	50 %	25 %	170288262
9561	NC_010483	ACT	2	6	452151	452156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288262
9562	NC_010483	TGC	2	6	452224	452229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288262
9563	NC_010483	GACA	2	8	452240	452247	50 %	0 %	25 %	25 %	170288262
9564	NC_010483	GAA	2	6	452252	452257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288262
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9568	NC_010483	TCC	2	6	452477	452482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288262
9569	NC_010483	GT	3	6	452489	452494	0 %	50 %	50 %	0 %	170288262
9570	NC_010483	GTC	2	6	452558	452563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288262
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9602	NC_010483	ACC	2	6	453822	453827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288264
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9612	NC_010483	T	6	6	454312	454317	0 %	100 %	0 %	0 %	170288265
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9617	NC_010483	GATC	2	8	454432	454439	25 %	25 %	25 %	25 %	170288265
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9990	NC_010483	CATTC	2	10	472931	472940	20 %	40 %	0 %	40 %	170288278
9991	NC_010483	GCCT	2	8	472982	472989	0 %	25 %	25 %	50 %	170288278
9992	NC_010483	CGT	3	9	473022	473030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288278
9993	NC_010483	TCG	2	6	473076	473081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288278
9994	NC_010483	CTT	3	9	473100	473108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288278
9995	NC_010483	ACT	2	6	473144	473149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288278
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9997	NC_010483	TAT	2	6	473158	473163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288278
9998	NC_010483	GTG	2	6	473186	473191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288278
9999	NC_010483	CTT	2	6	473211	473216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288278
10000	NC_010483	TA	3	6	473315	473320	50 %	50 %	0 %	0 %	170288278

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