MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 38800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010483	TTTC	2	8	307108	307115	0 %	75 %	0 %	25 %	170288123
6502	NC_010483	TTC	2	6	307190	307195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288123
6503	NC_010483	AAC	2	6	307248	307253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288123
6504	NC_010483	GTC	2	6	307260	307265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288123
6505	NC_010483	TGG	2	6	307316	307321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288123
6506	NC_010483	TC	3	6	307349	307354	0 %	50 %	0 %	50 %	170288123
6507	NC_010483	TTTC	2	8	307360	307367	0 %	75 %	0 %	25 %	170288123
6508	NC_010483	GAA	3	9	307434	307442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288123
6509	NC_010483	AAGG	2	8	307494	307501	50 %	0 %	50 %	0 %	170288123
6510	NC_010483	TA	3	6	307537	307542	50 %	50 %	0 %	0 %	170288123
6511	NC_010483	GAA	2	6	307569	307574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288123
6512	NC_010483	T	6	6	307601	307606	0 %	100 %	0 %	0 %	170288123
6513	NC_010483	TCT	2	6	307639	307644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288123
6514	NC_010483	CCA	2	6	307653	307658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288123
6515	NC_010483	TGG	2	6	307988	307993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288124
6516	NC_010483	TCA	2	6	308073	308078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288124
6517	NC_010483	TTG	2	6	308090	308095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288124
6518	NC_010483	GA	3	6	308105	308110	50 %	0 %	50 %	0 %	170288124
6519	NC_010483	ACG	2	6	308125	308130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288124
6520	NC_010483	GGAG	2	8	308253	308260	25 %	0 %	75 %	0 %	170288124
6521	NC_010483	AC	3	6	308362	308367	50 %	0 %	0 %	50 %	170288124
6522	NC_010483	CTT	2	6	308394	308399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288124
6523	NC_010483	GAA	2	6	308490	308495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288124
6524	NC_010483	TCA	3	9	308534	308542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288124
6525	NC_010483	GGA	2	6	308544	308549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288124
6526	NC_010483	GTC	2	6	308554	308559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288124
6527	NC_010483	TTG	2	6	308660	308665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288124
6528	NC_010483	GAA	2	6	308673	308678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288124
6529	NC_010483	ATC	2	6	308698	308703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288124
6530	NC_010483	ACA	2	6	308819	308824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288124
6531	NC_010483	AAC	2	6	309006	309011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288124
6532	NC_010483	TTG	2	6	309056	309061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288124
6533	NC_010483	AAGG	2	8	309064	309071	50 %	0 %	50 %	0 %	170288124
6534	NC_010483	AAC	2	6	309181	309186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288125
6535	NC_010483	ATC	2	6	309200	309205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288125
6536	NC_010483	AG	3	6	309242	309247	50 %	0 %	50 %	0 %	170288125
6537	NC_010483	TCT	2	6	309305	309310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288125
6538	NC_010483	ATC	2	6	309319	309324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288125
6539	NC_010483	TTC	2	6	309413	309418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288125
6540	NC_010483	TGA	2	6	309441	309446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288125
6541	NC_010483	AGA	2	6	309480	309485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288125
6542	NC_010483	GAT	2	6	309500	309505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288125
6543	NC_010483	GGAA	2	8	309569	309576	50 %	0 %	50 %	0 %	170288126
6544	NC_010483	TGG	2	6	309592	309597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288126
6545	NC_010483	TTC	2	6	309638	309643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288126
6546	NC_010483	CTG	2	6	309745	309750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288126
6547	NC_010483	CTG	2	6	309752	309757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288126
6548	NC_010483	GAA	2	6	309759	309764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288126
6549	NC_010483	ATC	2	6	309818	309823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288126
6550	NC_010483	TC	3	6	309851	309856	0 %	50 %	0 %	50 %	170288126
6551	NC_010483	ACC	2	6	309866	309871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288126
6552	NC_010483	GCG	2	6	310341	310346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288127
6553	NC_010483	TCT	2	6	310386	310391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288127
6554	NC_010483	TC	3	6	310455	310460	0 %	50 %	0 %	50 %	170288127
6555	NC_010483	CTT	2	6	310510	310515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288127
6556	NC_010483	ACC	2	6	310523	310528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288127
6557	NC_010483	CTGT	2	8	310530	310537	0 %	50 %	25 %	25 %	170288127
6558	NC_010483	CAC	2	6	310538	310543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288127
6559	NC_010483	AGG	2	6	310614	310619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288127
6560	NC_010483	GATG	2	8	310660	310667	25 %	25 %	50 %	0 %	170288127
6561	NC_010483	ACT	2	6	310674	310679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288127
6562	NC_010483	TTC	2	6	310680	310685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288127
6563	NC_010483	TC	3	6	310684	310689	0 %	50 %	0 %	50 %	170288127
6564	NC_010483	GAAT	2	8	310771	310778	50 %	25 %	25 %	0 %	170288127
6565	NC_010483	TCC	2	6	310827	310832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288127
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6570	NC_010483	GC	3	6	311053	311058	0 %	0 %	50 %	50 %	170288127
6571	NC_010483	GAG	2	6	311114	311119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288127
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6579	NC_010483	CGAAA	2	10	311551	311560	60 %	0 %	20 %	20 %	170288128
6580	NC_010483	TTC	2	6	311564	311569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288128
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6584	NC_010483	ATGA	2	8	311827	311834	50 %	25 %	25 %	0 %	170288128
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6588	NC_010483	TCC	2	6	312030	312035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288128
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6591	NC_010483	CT	3	6	312212	312217	0 %	50 %	0 %	50 %	170288128
6592	NC_010483	T	6	6	312231	312236	0 %	100 %	0 %	0 %	170288128
6593	NC_010483	TTTC	2	8	312248	312255	0 %	75 %	0 %	25 %	170288128
6594	NC_010483	CTT	2	6	312336	312341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288128
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6598	NC_010483	AG	3	6	312800	312805	50 %	0 %	50 %	0 %	170288129
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6601	NC_010483	CT	3	6	312921	312926	0 %	50 %	0 %	50 %	170288129
6602	NC_010483	AAAG	2	8	312966	312973	75 %	0 %	25 %	0 %	170288129
6603	NC_010483	GAA	2	6	313092	313097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288129
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6605	NC_010483	CA	3	6	313182	313187	50 %	0 %	0 %	50 %	170288130
6606	NC_010483	CT	3	6	313209	313214	0 %	50 %	0 %	50 %	170288130
6607	NC_010483	AGA	2	6	313230	313235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288130
6608	NC_010483	TG	3	6	313278	313283	0 %	50 %	50 %	0 %	170288130
6609	NC_010483	TCA	2	6	313324	313329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288130
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6611	NC_010483	AGC	2	6	313456	313461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288130
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6618	NC_010483	CT	4	8	314017	314024	0 %	50 %	0 %	50 %	170288130
6619	NC_010483	CATGAA	2	12	314177	314188	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	170288131
6620	NC_010483	AC	3	6	314194	314199	50 %	0 %	0 %	50 %	170288131
6621	NC_010483	GATC	2	8	314218	314225	25 %	25 %	25 %	25 %	170288131
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6989	NC_010483	ATG	2	6	330596	330601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288149
6990	NC_010483	T	6	6	330624	330629	0 %	100 %	0 %	0 %	170288149
6991	NC_010483	ACC	2	6	330662	330667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288149
6992	NC_010483	CTC	2	6	330693	330698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288149
6993	NC_010483	CGT	2	6	330751	330756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288149
6994	NC_010483	CTATCT	2	12	330795	330806	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	170288149
6995	NC_010483	CGT	2	6	330949	330954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288149
6996	NC_010483	TCC	2	6	330955	330960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288149
6997	NC_010483	CCA	3	9	330969	330977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288149
6998	NC_010483	AGC	2	6	331018	331023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288149
6999	NC_010483	ATTC	2	8	331150	331157	25 %	50 %	0 %	25 %	170288149
7000	NC_010483	GACC	2	8	331290	331297	25 %	0 %	25 %	50 %	170288149

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