MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 38800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_010483	TGT	2	6	212329	212334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288022
4503	NC_010483	TCC	2	6	212369	212374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288022
4504	NC_010483	CTG	2	6	212387	212392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288022
4505	NC_010483	CAC	2	6	212434	212439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288022
4506	NC_010483	GAG	2	6	212444	212449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288022
4507	NC_010483	TTC	2	6	212502	212507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288022
4508	NC_010483	CTGAG	3	15	212568	212582	20 %	20 %	40 %	20 %	170288022
4509	NC_010483	AG	3	6	212597	212602	50 %	0 %	50 %	0 %	170288022
4510	NC_010483	AGA	2	6	212639	212644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288022
4511	NC_010483	TGT	2	6	212663	212668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288022
4512	NC_010483	CT	3	6	212672	212677	0 %	50 %	0 %	50 %	170288022
4513	NC_010483	CTT	2	6	212683	212688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288022
4514	NC_010483	T	7	7	212693	212699	0 %	100 %	0 %	0 %	170288022
4515	NC_010483	TTG	2	6	212780	212785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288022
4516	NC_010483	CTT	2	6	212790	212795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288022
4517	NC_010483	CAG	2	6	212859	212864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288022
4518	NC_010483	GTTC	2	8	212912	212919	0 %	50 %	25 %	25 %	170288022
4519	NC_010483	GCT	2	6	212936	212941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288022
4520	NC_010483	AGC	2	6	212963	212968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288022
4521	NC_010483	CGT	2	6	213033	213038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288022
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4523	NC_010483	ATG	2	6	213089	213094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288022
4524	NC_010483	CAC	2	6	213103	213108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288022
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4526	NC_010483	TCT	2	6	213372	213377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288023
4527	NC_010483	TTCG	2	8	213393	213400	0 %	50 %	25 %	25 %	170288023
4528	NC_010483	CCT	2	6	213417	213422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288023
4529	NC_010483	CAG	2	6	213544	213549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288023
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4533	NC_010483	TC	3	6	213675	213680	0 %	50 %	0 %	50 %	170288023
4534	NC_010483	CAC	2	6	213731	213736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288024
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4537	NC_010483	TGA	2	6	213810	213815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288024
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4539	NC_010483	TCTT	2	8	213930	213937	0 %	75 %	0 %	25 %	170288024
4540	NC_010483	GAG	2	6	213947	213952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288024
4541	NC_010483	TCT	3	9	213953	213961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288024
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4544	NC_010483	A	6	6	213978	213983	100 %	0 %	0 %	0 %	170288024
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4548	NC_010483	GAAA	2	8	214217	214224	75 %	0 %	25 %	0 %	170288024
4549	NC_010483	T	7	7	214232	214238	0 %	100 %	0 %	0 %	170288024
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4552	NC_010483	TCC	2	6	214278	214283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288024
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4554	NC_010483	CTT	2	6	214424	214429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288025
4555	NC_010483	CTG	2	6	214438	214443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288025
4556	NC_010483	TTCT	2	8	214496	214503	0 %	75 %	0 %	25 %	170288025
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4561	NC_010483	T	7	7	214838	214844	0 %	100 %	0 %	0 %	170288025
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4592	NC_010483	AAGA	2	8	216666	216673	75 %	0 %	25 %	0 %	170288027
4593	NC_010483	GT	3	6	216737	216742	0 %	50 %	50 %	0 %	170288027
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4597	NC_010483	GA	3	6	216918	216923	50 %	0 %	50 %	0 %	170288027
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4600	NC_010483	TTCTT	2	10	217016	217025	0 %	80 %	0 %	20 %	170288027
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4618	NC_010483	AG	3	6	217878	217883	50 %	0 %	50 %	0 %	170288027
4619	NC_010483	CTTT	2	8	217931	217938	0 %	75 %	0 %	25 %	170288027
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4622	NC_010483	CCT	2	6	218027	218032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288027
4623	NC_010483	CCGTG	2	10	218094	218103	0 %	20 %	40 %	40 %	170288027
4624	NC_010483	CTT	2	6	218129	218134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288027
4625	NC_010483	TTC	2	6	218152	218157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288027
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4628	NC_010483	CTC	2	6	218284	218289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288027
4629	NC_010483	ATG	2	6	218335	218340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288027
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4632	NC_010483	GGAA	2	8	218410	218417	50 %	0 %	50 %	0 %	170288028
4633	NC_010483	TGT	2	6	218483	218488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288028
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4645	NC_010483	TC	3	6	219309	219314	0 %	50 %	0 %	50 %	170288029
4646	NC_010483	T	8	8	219411	219418	0 %	100 %	0 %	0 %	170288029
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4650	NC_010483	GTA	2	6	219572	219577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288029
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4654	NC_010483	TTC	2	6	219821	219826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288029
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4657	NC_010483	CTC	2	6	219896	219901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288029
4658	NC_010483	TC	3	6	219975	219980	0 %	50 %	0 %	50 %	170288029
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4992	NC_010483	CGT	2	6	233929	233934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288047
4993	NC_010483	A	6	6	233968	233973	100 %	0 %	0 %	0 %	170288047
4994	NC_010483	AAC	2	6	233993	233998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288047
4995	NC_010483	ATCT	2	8	234041	234048	25 %	50 %	0 %	25 %	170288047
4996	NC_010483	TTCC	2	8	234049	234056	0 %	50 %	0 %	50 %	170288047
4997	NC_010483	TC	3	6	234093	234098	0 %	50 %	0 %	50 %	170288047
4998	NC_010483	TCC	2	6	234101	234106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288047
4999	NC_010483	TCG	2	6	234198	234203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288047
5000	NC_010483	GAT	2	6	234239	234244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288047

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