MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacter sp. X514 chromosome

Total Repeats: 50400

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010320	ATC	2	6	205	210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038676
2	NC_010320	CCA	2	6	259	264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167038676
3	NC_010320	ACA	2	6	268	273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167038676
4	NC_010320	ATT	2	6	303	308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038676
5	NC_010320	GAT	2	6	309	314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038676
6	NC_010320	A	6	6	347	352	100 %	0 %	0 %	0 %	167038676
7	NC_010320	TAA	2	6	355	360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038676
8	NC_010320	AT	3	6	368	373	50 %	50 %	0 %	0 %	167038676
9	NC_010320	ACG	2	6	385	390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167038676
10	NC_010320	AAAT	2	8	407	414	75 %	25 %	0 %	0 %	167038676
11	NC_010320	AGA	2	6	437	442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038676
12	NC_010320	GAA	3	9	444	452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038676
13	NC_010320	ACT	2	6	501	506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038676
14	NC_010320	TTTA	2	8	623	630	25 %	75 %	0 %	0 %	167038676
15	NC_010320	GGA	2	6	636	641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167038676
16	NC_010320	ATGC	2	8	666	673	25 %	25 %	25 %	25 %	167038676
17	NC_010320	TACGT	2	10	720	729	20 %	40 %	20 %	20 %	167038676
18	NC_010320	AGTT	2	8	748	755	25 %	50 %	25 %	0 %	167038676
19	NC_010320	GAC	2	6	768	773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167038676
20	NC_010320	GAA	2	6	780	785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038676
21	NC_010320	TTC	2	6	814	819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038676
22	NC_010320	GAT	2	6	825	830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038676
23	NC_010320	A	6	6	846	851	100 %	0 %	0 %	0 %	167038676
24	NC_010320	GAAC	2	8	852	859	50 %	0 %	25 %	25 %	167038676
25	NC_010320	AAG	2	6	862	867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038676
26	NC_010320	CAA	2	6	902	907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167038676
27	NC_010320	ACC	2	6	932	937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167038676
28	NC_010320	AGA	2	6	956	961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038676
29	NC_010320	CCA	2	6	1008	1013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167038676
30	NC_010320	CGA	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167038676
31	NC_010320	A	6	6	1102	1107	100 %	0 %	0 %	0 %	167038676
32	NC_010320	TCAA	2	8	1109	1116	50 %	25 %	0 %	25 %	167038676
33	NC_010320	AG	3	6	1122	1127	50 %	0 %	50 %	0 %	167038676
34	NC_010320	TAA	2	6	1141	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038676
35	NC_010320	TAA	2	6	1226	1231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038676
36	NC_010320	GA	3	6	1235	1240	50 %	0 %	50 %	0 %	167038676
37	NC_010320	GAA	2	6	1263	1268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038676
38	NC_010320	AGA	2	6	1295	1300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038676
39	NC_010320	A	6	6	1322	1327	100 %	0 %	0 %	0 %	167038676
40	NC_010320	GAA	2	6	1401	1406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038676
41	NC_010320	TAC	2	6	1421	1426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038676
42	NC_010320	A	6	6	1444	1449	100 %	0 %	0 %	0 %	167038676
43	NC_010320	TC	3	6	1478	1483	0 %	50 %	0 %	50 %	167038676
44	NC_010320	A	7	7	1756	1762	100 %	0 %	0 %	0 %	167038677
45	NC_010320	TG	4	8	1770	1777	0 %	50 %	50 %	0 %	167038677
46	NC_010320	ATT	2	6	1788	1793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038677
47	NC_010320	G	6	6	1817	1822	0 %	0 %	100 %	0 %	167038677
48	NC_010320	ACT	2	6	1834	1839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038677
49	NC_010320	TTC	2	6	1847	1852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038677
50	NC_010320	GTCAA	2	10	1880	1889	40 %	20 %	20 %	20 %	167038677
51	NC_010320	AGA	3	9	1944	1952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038677
52	NC_010320	TAG	2	6	1961	1966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038677
53	NC_010320	TAA	2	6	2171	2176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038677
54	NC_010320	TA	3	6	2292	2297	50 %	50 %	0 %	0 %	167038677
55	NC_010320	AGA	2	6	2373	2378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038677
56	NC_010320	GAAG	2	8	2485	2492	50 %	0 %	50 %	0 %	167038677
57	NC_010320	AAT	2	6	2605	2610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038677
58	NC_010320	TTA	2	6	2639	2644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038677
59	NC_010320	TCT	2	6	2650	2655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038677
60	NC_010320	GAT	2	6	2673	2678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038677
61	NC_010320	A	6	6	2681	2686	100 %	0 %	0 %	0 %	167038677
62	NC_010320	TTA	2	6	2740	2745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038677
63	NC_010320	GAA	3	9	2767	2775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038677
64	NC_010320	TAA	3	9	2810	2818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038677
65	NC_010320	AT	3	6	2921	2926	50 %	50 %	0 %	0 %	167038678
66	NC_010320	GGA	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167038678
67	NC_010320	AAGCA	2	10	2977	2986	60 %	0 %	20 %	20 %	167038678
68	NC_010320	ATTT	2	8	2987	2994	25 %	75 %	0 %	0 %	167038678
69	NC_010320	A	6	6	3042	3047	100 %	0 %	0 %	0 %	167038678
70	NC_010320	A	6	6	3161	3166	100 %	0 %	0 %	0 %	167038679
71	NC_010320	AATA	2	8	3183	3190	75 %	25 %	0 %	0 %	167038679
72	NC_010320	TTA	2	6	3226	3231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038679
73	NC_010320	TAA	2	6	3290	3295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038679
74	NC_010320	ATT	2	6	3308	3313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038679
75	NC_010320	A	7	7	3352	3358	100 %	0 %	0 %	0 %	167038679
76	NC_010320	AATAA	2	10	3409	3418	80 %	20 %	0 %	0 %	167038679
77	NC_010320	T	6	6	3458	3463	0 %	100 %	0 %	0 %	167038679
78	NC_010320	ATA	2	6	3481	3486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038679
79	NC_010320	AAG	2	6	3488	3493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038679
80	NC_010320	TGT	2	6	3534	3539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167038679
81	NC_010320	AAAAGT	2	12	3625	3636	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167038679
82	NC_010320	TGA	2	6	3651	3656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038679
83	NC_010320	TAG	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038679
84	NC_010320	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038679
85	NC_010320	ATT	2	6	3701	3706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038679
86	NC_010320	A	6	6	3708	3713	100 %	0 %	0 %	0 %	167038679
87	NC_010320	A	7	7	3729	3735	100 %	0 %	0 %	0 %	167038679
88	NC_010320	CAG	2	6	3761	3766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167038679
89	NC_010320	GAA	2	6	3811	3816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038679
90	NC_010320	A	7	7	3823	3829	100 %	0 %	0 %	0 %	167038679
91	NC_010320	ACA	2	6	3880	3885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167038679
92	NC_010320	ATT	2	6	3916	3921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038679
93	NC_010320	TTC	2	6	3948	3953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038679
94	NC_010320	A	6	6	4011	4016	100 %	0 %	0 %	0 %	167038679
95	NC_010320	A	7	7	4080	4086	100 %	0 %	0 %	0 %	167038679
96	NC_010320	TAC	2	6	4131	4136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038679
97	NC_010320	GTT	2	6	4183	4188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167038679
98	NC_010320	A	6	6	4207	4212	100 %	0 %	0 %	0 %	167038680
99	NC_010320	GGC	2	6	4227	4232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167038680
100	NC_010320	ACT	2	6	4287	4292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038680
101	NC_010320	GAA	3	9	4326	4334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038680
102	NC_010320	TAT	2	6	4403	4408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038680
103	NC_010320	TTAT	3	12	4405	4416	25 %	75 %	0 %	0 %	167038680
104	NC_010320	AAG	2	6	4442	4447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038680
105	NC_010320	A	6	6	4453	4458	100 %	0 %	0 %	0 %	167038680
106	NC_010320	A	6	6	4489	4494	100 %	0 %	0 %	0 %	167038681
107	NC_010320	TTG	2	6	4507	4512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167038681
108	NC_010320	AAG	2	6	4527	4532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038681
109	NC_010320	ATT	2	6	4560	4565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038681
110	NC_010320	A	6	6	4591	4596	100 %	0 %	0 %	0 %	167038681
111	NC_010320	GAAAG	2	10	4617	4626	60 %	0 %	40 %	0 %	167038681
112	NC_010320	AAGAA	2	10	4652	4661	80 %	0 %	20 %	0 %	167038681
113	NC_010320	ATAA	2	8	4704	4711	75 %	25 %	0 %	0 %	167038681
114	NC_010320	TAAT	2	8	4753	4760	50 %	50 %	0 %	0 %	167038681
115	NC_010320	GGA	2	6	4773	4778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167038681
116	NC_010320	AGA	2	6	4823	4828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038681
117	NC_010320	A	6	6	4869	4874	100 %	0 %	0 %	0 %	167038681
118	NC_010320	T	6	6	4955	4960	0 %	100 %	0 %	0 %	167038681
119	NC_010320	T	7	7	5018	5024	0 %	100 %	0 %	0 %	167038681
120	NC_010320	TAT	2	6	5052	5057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038681
121	NC_010320	ATT	2	6	5083	5088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038681
122	NC_010320	TTTA	2	8	5091	5098	25 %	75 %	0 %	0 %	167038681
123	NC_010320	CAG	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167038681
124	NC_010320	AG	4	8	5213	5220	50 %	0 %	50 %	0 %	167038681
125	NC_010320	AT	3	6	5271	5276	50 %	50 %	0 %	0 %	167038681
126	NC_010320	AGC	2	6	5356	5361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167038681
127	NC_010320	AGT	2	6	5381	5386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038681
128	NC_010320	GAG	2	6	5448	5453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167038681
129	NC_010320	ATT	2	6	5455	5460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038681
130	NC_010320	AAG	3	9	5536	5544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038681
131	NC_010320	TGG	2	6	5553	5558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167038681
132	NC_010320	G	6	6	5557	5562	0 %	0 %	100 %	0 %	167038681
133	NC_010320	ATGA	2	8	5613	5620	50 %	25 %	25 %	0 %	167038681
134	NC_010320	CTA	2	6	5641	5646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038681
135	NC_010320	ATA	2	6	5662	5667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038681
136	NC_010320	AAG	2	6	5701	5706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038681
137	NC_010320	TATGGC	2	12	5729	5740	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167038681
138	NC_010320	GCT	2	6	5799	5804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167038681
139	NC_010320	ACA	2	6	5845	5850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167038681
140	NC_010320	CTT	2	6	5868	5873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038681
141	NC_010320	ATG	3	9	5874	5882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038681
142	NC_010320	GAA	2	6	5961	5966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038681
143	NC_010320	AT	3	6	6076	6081	50 %	50 %	0 %	0 %	167038681
144	NC_010320	CTTA	2	8	6118	6125	25 %	50 %	0 %	25 %	167038681
145	NC_010320	AAG	2	6	6193	6198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038681
146	NC_010320	TA	3	6	6260	6265	50 %	50 %	0 %	0 %	167038681
147	NC_010320	A	6	6	6280	6285	100 %	0 %	0 %	0 %	167038681
148	NC_010320	ACTGG	2	10	6322	6331	20 %	20 %	40 %	20 %	167038681
149	NC_010320	TAT	2	6	6354	6359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038681
150	NC_010320	ATA	2	6	6381	6386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038681
151	NC_010320	AGG	2	6	6404	6409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167038681
152	NC_010320	ATT	2	6	6413	6418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038681
153	NC_010320	AGA	2	6	6443	6448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038681
154	NC_010320	ATA	2	6	6465	6470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038681
155	NC_010320	GAA	2	6	6489	6494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038681
156	NC_010320	GAAG	2	8	6585	6592	50 %	0 %	50 %	0 %	167038681
157	NC_010320	GGAA	2	8	6712	6719	50 %	0 %	50 %	0 %	167038681
158	NC_010320	T	7	7	6761	6767	0 %	100 %	0 %	0 %	167038682
159	NC_010320	TTG	2	6	6797	6802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167038682
160	NC_010320	TCT	2	6	6960	6965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038682
161	NC_010320	ATT	2	6	6984	6989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038682
162	NC_010320	CCA	2	6	7048	7053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167038682
163	NC_010320	T	7	7	7062	7068	0 %	100 %	0 %	0 %	167038682
164	NC_010320	TAC	2	6	7088	7093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038682
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167	NC_010320	CCA	2	6	7203	7208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167038682
168	NC_010320	GTC	2	6	7277	7282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167038682
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172	NC_010320	TATATC	2	12	7328	7339	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167038682
173	NC_010320	CTT	3	9	7404	7412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038682
174	NC_010320	TAA	2	6	7451	7456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038682
175	NC_010320	TCC	2	6	7496	7501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167038683
176	NC_010320	TATT	2	8	7514	7521	25 %	75 %	0 %	0 %	167038683
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179	NC_010320	TTAG	2	8	7571	7578	25 %	50 %	25 %	0 %	167038683
180	NC_010320	TTA	2	6	7628	7633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038683
181	NC_010320	TTA	2	6	7692	7697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038683
182	NC_010320	TA	3	6	7696	7701	50 %	50 %	0 %	0 %	167038683
183	NC_010320	TCT	2	6	7727	7732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038683
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192	NC_010320	AT	3	6	8100	8105	50 %	50 %	0 %	0 %	167038683
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243	NC_010320	AGC	2	6	10343	10348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167038684
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251	NC_010320	TA	3	6	10792	10797	50 %	50 %	0 %	0 %	167038684
252	NC_010320	TAT	2	6	10821	10826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038684
253	NC_010320	AATG	2	8	10913	10920	50 %	25 %	25 %	0 %	167038684
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257	NC_010320	ATGAA	2	10	11154	11163	60 %	20 %	20 %	0 %	167038685
258	NC_010320	A	6	6	11162	11167	100 %	0 %	0 %	0 %	167038685
259	NC_010320	TA	3	6	11171	11176	50 %	50 %	0 %	0 %	167038685
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262	NC_010320	ATGA	2	8	11264	11271	50 %	25 %	25 %	0 %	167038685
263	NC_010320	A	7	7	11300	11306	100 %	0 %	0 %	0 %	167038685
264	NC_010320	GTT	2	6	11315	11320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167038685
265	NC_010320	ATC	2	6	11340	11345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038685
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267	NC_010320	C	6	6	11455	11460	0 %	0 %	0 %	100 %	167038685
268	NC_010320	ATAA	2	8	11522	11529	75 %	25 %	0 %	0 %	167038685
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270	NC_010320	TCC	2	6	11656	11661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167038685
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400	NC_010320	GTAGAT	2	12	17906	17917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038690
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