MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga lettingae TMO chromosome

Total Repeats: 42311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009828	ATA	2	6	149	154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157362871
2	NC_009828	CCG	2	6	178	183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157362871
3	NC_009828	GAAA	2	8	217	224	75 %	0 %	25 %	0 %	157362871
4	NC_009828	TCA	2	6	264	269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362871
5	NC_009828	A	6	6	284	289	100 %	0 %	0 %	0 %	157362871
6	NC_009828	GTT	2	6	322	327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157362871
7	NC_009828	A	6	6	413	418	100 %	0 %	0 %	0 %	157362871
8	NC_009828	TGG	2	6	556	561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157362871
9	NC_009828	ATT	2	6	603	608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157362871
10	NC_009828	TGAA	2	8	663	670	50 %	25 %	25 %	0 %	157362871
11	NC_009828	A	6	6	685	690	100 %	0 %	0 %	0 %	157362871
12	NC_009828	TTA	2	6	740	745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157362871
13	NC_009828	CA	3	6	800	805	50 %	0 %	0 %	50 %	157362871
14	NC_009828	TG	3	6	841	846	0 %	50 %	50 %	0 %	157362871
15	NC_009828	TGA	2	6	937	942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157362871
16	NC_009828	A	6	6	966	971	100 %	0 %	0 %	0 %	157362871
17	NC_009828	GCT	2	6	1129	1134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157362871
18	NC_009828	CAA	2	6	1156	1161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157362871
19	NC_009828	TGA	2	6	1182	1187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157362871
20	NC_009828	TC	3	6	1212	1217	0 %	50 %	0 %	50 %	157362871
21	NC_009828	GAA	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157362871
22	NC_009828	A	6	6	1243	1248	100 %	0 %	0 %	0 %	157362871
23	NC_009828	ATGT	2	8	1277	1284	25 %	50 %	25 %	0 %	157362871
24	NC_009828	CA	4	8	1356	1363	50 %	0 %	0 %	50 %	157362871
25	NC_009828	GGA	2	6	1375	1380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157362871
26	NC_009828	AGAT	2	8	1416	1423	50 %	25 %	25 %	0 %	157362871
27	NC_009828	TCA	2	6	1499	1504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362872
28	NC_009828	T	7	7	1530	1536	0 %	100 %	0 %	0 %	157362872
29	NC_009828	CCTG	2	8	1556	1563	0 %	25 %	25 %	50 %	157362872
30	NC_009828	AATCA	2	10	1734	1743	60 %	20 %	0 %	20 %	157362872
31	NC_009828	CTG	2	6	1880	1885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157362872
32	NC_009828	CAT	3	9	1934	1942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362872
33	NC_009828	AAT	2	6	1958	1963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157362872
34	NC_009828	AAC	2	6	2016	2021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157362872
35	NC_009828	TGG	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157362872
36	NC_009828	AGAA	2	8	2067	2074	75 %	0 %	25 %	0 %	157362872
37	NC_009828	AAT	2	6	2078	2083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157362872
38	NC_009828	TC	3	6	2089	2094	0 %	50 %	0 %	50 %	157362872
39	NC_009828	TCG	2	6	2134	2139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157362872
40	NC_009828	GA	3	6	2149	2154	50 %	0 %	50 %	0 %	157362872
41	NC_009828	TC	3	6	2175	2180	0 %	50 %	0 %	50 %	157362872
42	NC_009828	TCA	2	6	2197	2202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362872
43	NC_009828	TTGG	2	8	2209	2216	0 %	50 %	50 %	0 %	157362872
44	NC_009828	TCG	2	6	2311	2316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157362872
45	NC_009828	TTC	2	6	2349	2354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157362872
46	NC_009828	TCT	2	6	2355	2360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157362872
47	NC_009828	CTG	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157362873
48	NC_009828	CCT	2	6	2586	2591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157362873
49	NC_009828	T	6	6	2698	2703	0 %	100 %	0 %	0 %	157362873
50	NC_009828	TC	3	6	2759	2764	0 %	50 %	0 %	50 %	157362873
51	NC_009828	TGAT	2	8	2775	2782	25 %	50 %	25 %	0 %	157362873
52	NC_009828	T	7	7	2829	2835	0 %	100 %	0 %	0 %	157362873
53	NC_009828	TGA	2	6	3027	3032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157362873
54	NC_009828	CTT	2	6	3035	3040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157362873
55	NC_009828	TGT	2	6	3082	3087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157362873
56	NC_009828	A	7	7	3091	3097	100 %	0 %	0 %	0 %	157362873
57	NC_009828	TC	3	6	3099	3104	0 %	50 %	0 %	50 %	157362873
58	NC_009828	T	7	7	3165	3171	0 %	100 %	0 %	0 %	157362873
59	NC_009828	CTCTT	2	10	3225	3234	0 %	60 %	0 %	40 %	157362873
60	NC_009828	TTG	2	6	3294	3299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157362873
61	NC_009828	TGC	2	6	3326	3331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157362873
62	NC_009828	TAA	2	6	3444	3449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157362874
63	NC_009828	ACT	2	6	3496	3501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362874
64	NC_009828	CAT	2	6	3522	3527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362874
65	NC_009828	AT	3	6	3535	3540	50 %	50 %	0 %	0 %	157362874
66	NC_009828	ATA	2	6	3595	3600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157362874
67	NC_009828	TAT	2	6	3715	3720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157362874
68	NC_009828	TTC	2	6	3721	3726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157362874
69	NC_009828	CTT	2	6	3756	3761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157362874
70	NC_009828	GA	3	6	3883	3888	50 %	0 %	50 %	0 %	157362874
71	NC_009828	GT	3	6	3907	3912	0 %	50 %	50 %	0 %	157362874
72	NC_009828	CAA	2	6	3936	3941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157362874
73	NC_009828	GA	3	6	3985	3990	50 %	0 %	50 %	0 %	157362874
74	NC_009828	T	7	7	4096	4102	0 %	100 %	0 %	0 %	157362874
75	NC_009828	CTC	2	6	4145	4150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157362874
76	NC_009828	ATAGCC	2	12	4217	4228	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157362874
77	NC_009828	TTG	2	6	4244	4249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157362874
78	NC_009828	AAT	2	6	4281	4286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157362874
79	NC_009828	TCTTT	2	10	4334	4343	0 %	80 %	0 %	20 %	157362874
80	NC_009828	AGC	2	6	4393	4398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157362874
81	NC_009828	CAA	2	6	4411	4416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157362874
82	NC_009828	AAAC	2	8	4435	4442	75 %	0 %	0 %	25 %	157362874
83	NC_009828	ACC	2	6	4493	4498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157362874
84	NC_009828	TCACAC	2	12	4515	4526	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	157362874
85	NC_009828	CTC	2	6	4527	4532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157362875
86	NC_009828	AGC	2	6	4662	4667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157362875
87	NC_009828	AG	3	6	4717	4722	50 %	0 %	50 %	0 %	157362875
88	NC_009828	A	6	6	4741	4746	100 %	0 %	0 %	0 %	157362875
89	NC_009828	TTA	2	6	4763	4768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157362875
90	NC_009828	ACC	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157362875
91	NC_009828	T	6	6	4806	4811	0 %	100 %	0 %	0 %	157362875
92	NC_009828	T	6	6	4919	4924	0 %	100 %	0 %	0 %	157362875
93	NC_009828	CAT	2	6	5027	5032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362875
94	NC_009828	ACT	2	6	5056	5061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362875
95	NC_009828	ATT	2	6	5070	5075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157362875
96	NC_009828	T	6	6	5118	5123	0 %	100 %	0 %	0 %	157362875
97	NC_009828	CCA	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157362875
98	NC_009828	CT	4	8	5151	5158	0 %	50 %	0 %	50 %	157362875
99	NC_009828	AGA	2	6	5191	5196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157362875
100	NC_009828	CAAC	2	8	5209	5216	50 %	0 %	0 %	50 %	157362875
101	NC_009828	CAG	2	6	5261	5266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157362875
102	NC_009828	TC	3	6	5319	5324	0 %	50 %	0 %	50 %	157362875
103	NC_009828	GCT	2	6	5345	5350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157362875
104	NC_009828	TTA	2	6	5354	5359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157362875
105	NC_009828	AATCC	2	10	5534	5543	40 %	20 %	0 %	40 %	157362875
106	NC_009828	AAG	2	6	5643	5648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157362875
107	NC_009828	ATCA	2	8	5652	5659	50 %	25 %	0 %	25 %	157362875
108	NC_009828	CAT	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362875
109	NC_009828	CCA	2	6	5731	5736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157362875
110	NC_009828	GACA	2	8	5772	5779	50 %	0 %	25 %	25 %	157362875
111	NC_009828	T	6	6	5781	5786	0 %	100 %	0 %	0 %	157362875
112	NC_009828	TCA	2	6	5788	5793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362875
113	NC_009828	TGC	2	6	5841	5846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157362875
114	NC_009828	ATT	2	6	5865	5870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157362875
115	NC_009828	GCTC	2	8	5953	5960	0 %	25 %	25 %	50 %	157362875
116	NC_009828	AGA	2	6	5970	5975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157362875
117	NC_009828	A	6	6	5982	5987	100 %	0 %	0 %	0 %	157362875
118	NC_009828	CAG	2	6	5993	5998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157362875
119	NC_009828	CTG	2	6	6021	6026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157362875
120	NC_009828	A	6	6	6043	6048	100 %	0 %	0 %	0 %	157362875
121	NC_009828	TCA	2	6	6188	6193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362876
122	NC_009828	GAT	2	6	6249	6254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157362876
123	NC_009828	ATCA	2	8	6265	6272	50 %	25 %	0 %	25 %	157362876
124	NC_009828	ATT	2	6	6389	6394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157362876
125	NC_009828	TC	3	6	6420	6425	0 %	50 %	0 %	50 %	157362876
126	NC_009828	AAT	2	6	6435	6440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157362876
127	NC_009828	AAT	2	6	6472	6477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157362876
128	NC_009828	TA	3	6	6605	6610	50 %	50 %	0 %	0 %	157362877
129	NC_009828	T	6	6	6648	6653	0 %	100 %	0 %	0 %	157362877
130	NC_009828	TTA	2	6	6676	6681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157362877
131	NC_009828	AT	3	6	6686	6691	50 %	50 %	0 %	0 %	157362877
132	NC_009828	AAT	2	6	6858	6863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157362877
133	NC_009828	TAA	2	6	6908	6913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157362877
134	NC_009828	ATT	2	6	6981	6986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157362877
135	NC_009828	AAAAT	2	10	7020	7029	80 %	20 %	0 %	0 %	157362877
136	NC_009828	TTA	2	6	7129	7134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157362877
137	NC_009828	TGT	2	6	7141	7146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157362877
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