MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga lettingae TMO chromosome

Total Repeats: 42311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009828	CCA	2	6	198239	198244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363063
4002	NC_009828	ACA	2	6	198272	198277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363063
4003	NC_009828	CAG	2	6	198363	198368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363063
4004	NC_009828	AAT	2	6	198411	198416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363063
4005	NC_009828	GCTT	2	8	198454	198461	0 %	50 %	25 %	25 %	157363063
4006	NC_009828	AAC	2	6	198652	198657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363063
4007	NC_009828	GTTGGA	2	12	198662	198673	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	157363063
4008	NC_009828	CAA	2	6	198720	198725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363063
4009	NC_009828	GCC	2	6	198781	198786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157363063
4010	NC_009828	TTC	2	6	198791	198796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363063
4011	NC_009828	ATA	2	6	198857	198862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363063
4012	NC_009828	CCAG	2	8	198868	198875	25 %	0 %	25 %	50 %	157363063
4013	NC_009828	GAAT	2	8	199032	199039	50 %	25 %	25 %	0 %	157363064
4014	NC_009828	ATG	2	6	199094	199099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363064
4015	NC_009828	AGAA	2	8	199100	199107	75 %	0 %	25 %	0 %	157363064
4016	NC_009828	ATC	2	6	199275	199280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363064
4017	NC_009828	AGA	2	6	199293	199298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363064
4018	NC_009828	GT	3	6	199362	199367	0 %	50 %	50 %	0 %	157363064
4019	NC_009828	TCC	2	6	199376	199381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363064
4020	NC_009828	ATG	2	6	199391	199396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363064
4021	NC_009828	AACA	2	8	199421	199428	75 %	0 %	0 %	25 %	157363064
4022	NC_009828	T	6	6	199593	199598	0 %	100 %	0 %	0 %	157363064
4023	NC_009828	CAG	2	6	199606	199611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363064
4024	NC_009828	TAC	2	6	199735	199740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363064
4025	NC_009828	GAG	2	6	199763	199768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157363064
4026	NC_009828	TGC	2	6	199846	199851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363064
4027	NC_009828	TATCT	2	10	200032	200041	20 %	60 %	0 %	20 %	157363065
4028	NC_009828	A	6	6	200061	200066	100 %	0 %	0 %	0 %	157363065
4029	NC_009828	CTT	2	6	200092	200097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363065
4030	NC_009828	A	7	7	200150	200156	100 %	0 %	0 %	0 %	157363065
4031	NC_009828	CAG	2	6	200164	200169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363065
4032	NC_009828	AGG	2	6	200182	200187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157363065
4033	NC_009828	T	8	8	200218	200225	0 %	100 %	0 %	0 %	157363065
4034	NC_009828	ATGG	2	8	200269	200276	25 %	25 %	50 %	0 %	157363065
4035	NC_009828	TAA	2	6	200362	200367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363065
4036	NC_009828	AT	3	6	200391	200396	50 %	50 %	0 %	0 %	157363065
4037	NC_009828	T	6	6	200411	200416	0 %	100 %	0 %	0 %	157363065
4038	NC_009828	T	6	6	200420	200425	0 %	100 %	0 %	0 %	157363065
4039	NC_009828	AGA	2	6	200427	200432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363065
4040	NC_009828	TGA	2	6	200434	200439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363065
4041	NC_009828	ACC	2	6	200543	200548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363065
4042	NC_009828	T	7	7	200582	200588	0 %	100 %	0 %	0 %	157363065
4043	NC_009828	T	7	7	200620	200626	0 %	100 %	0 %	0 %	157363065
4044	NC_009828	CTC	2	6	200627	200632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363065
4045	NC_009828	CGA	2	6	200705	200710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363065
4046	NC_009828	A	8	8	200795	200802	100 %	0 %	0 %	0 %	157363065
4047	NC_009828	ACC	2	6	200807	200812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363065
4048	NC_009828	TTC	2	6	200839	200844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363065
4049	NC_009828	CGT	2	6	200849	200854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363065
4050	NC_009828	TCA	2	6	200919	200924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363065
4051	NC_009828	A	6	6	200951	200956	100 %	0 %	0 %	0 %	157363065
4052	NC_009828	T	6	6	200960	200965	0 %	100 %	0 %	0 %	157363065
4053	NC_009828	TCA	2	6	201014	201019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363066
4054	NC_009828	CCA	2	6	201020	201025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363066
4055	NC_009828	AAGC	2	8	201038	201045	50 %	0 %	25 %	25 %	157363066
4056	NC_009828	TCA	2	6	201083	201088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363066
4057	NC_009828	CA	3	6	201087	201092	50 %	0 %	0 %	50 %	157363066
4058	NC_009828	TGG	2	6	201139	201144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157363066
4059	NC_009828	CAA	2	6	201330	201335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363066
4060	NC_009828	TG	4	8	201345	201352	0 %	50 %	50 %	0 %	157363066
4061	NC_009828	TCT	2	6	201387	201392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363066
4062	NC_009828	AGC	2	6	201395	201400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363066
4063	NC_009828	AGT	2	6	201436	201441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363066
4064	NC_009828	AC	3	6	201472	201477	50 %	0 %	0 %	50 %	157363066
4065	NC_009828	TCC	2	6	201511	201516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363066
4066	NC_009828	CTT	2	6	201606	201611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363066
4067	NC_009828	ATT	2	6	201632	201637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363066
4068	NC_009828	T	7	7	201711	201717	0 %	100 %	0 %	0 %	157363066
4069	NC_009828	CTT	2	6	201738	201743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363066
4070	NC_009828	T	6	6	201759	201764	0 %	100 %	0 %	0 %	157363066
4071	NC_009828	AGG	2	6	201802	201807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157363066
4072	NC_009828	CTA	2	6	201867	201872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363066
4073	NC_009828	CAA	2	6	201876	201881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363066
4074	NC_009828	TCT	2	6	201911	201916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363066
4075	NC_009828	ACA	2	6	201926	201931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363066
4076	NC_009828	CTT	2	6	201933	201938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363066
4077	NC_009828	ATTC	2	8	201978	201985	25 %	50 %	0 %	25 %	157363066
4078	NC_009828	ATT	3	9	202240	202248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363067
4079	NC_009828	ATT	2	6	202282	202287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363067
4080	NC_009828	TGC	2	6	202314	202319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363067
4081	NC_009828	AATA	2	8	202388	202395	75 %	25 %	0 %	0 %	157363067
4082	NC_009828	ATA	2	6	202405	202410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363067
4083	NC_009828	AGATT	2	10	202411	202420	40 %	40 %	20 %	0 %	157363067
4084	NC_009828	TGC	2	6	202434	202439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363067
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4086	NC_009828	TCA	2	6	202496	202501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363067
4087	NC_009828	TCA	2	6	202507	202512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363067
4088	NC_009828	TCC	2	6	202518	202523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363067
4089	NC_009828	CAG	2	6	202544	202549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363067
4090	NC_009828	A	7	7	202581	202587	100 %	0 %	0 %	0 %	157363067
4091	NC_009828	AAG	2	6	202673	202678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363067
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4093	NC_009828	T	8	8	202832	202839	0 %	100 %	0 %	0 %	157363067
4094	NC_009828	CAA	2	6	202891	202896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363068
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4097	NC_009828	AT	3	6	202983	202988	50 %	50 %	0 %	0 %	157363068
4098	NC_009828	AC	3	6	203011	203016	50 %	0 %	0 %	50 %	157363068
4099	NC_009828	AAG	2	6	203039	203044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363068
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4101	NC_009828	TTGA	2	8	203162	203169	25 %	50 %	25 %	0 %	157363068
4102	NC_009828	AAT	2	6	203246	203251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363068
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4104	NC_009828	TCC	2	6	203270	203275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363068
4105	NC_009828	GAAG	2	8	203277	203284	50 %	0 %	50 %	0 %	157363068
4106	NC_009828	A	6	6	203302	203307	100 %	0 %	0 %	0 %	157363068
4107	NC_009828	TTA	2	6	203308	203313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363068
4108	NC_009828	CAG	2	6	203404	203409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363068
4109	NC_009828	ATT	2	6	203412	203417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363068
4110	NC_009828	AAGA	2	8	203420	203427	75 %	0 %	25 %	0 %	157363068
4111	NC_009828	TCT	2	6	203625	203630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363068
4112	NC_009828	TAT	2	6	203651	203656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363068
4113	NC_009828	TTTCT	2	10	203882	203891	0 %	80 %	0 %	20 %	157363069
4114	NC_009828	ATT	2	6	203947	203952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363069
4115	NC_009828	T	6	6	203951	203956	0 %	100 %	0 %	0 %	157363069
4116	NC_009828	ATA	2	6	203967	203972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363069
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4119	NC_009828	ATT	2	6	204051	204056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363069
4120	NC_009828	CGG	2	6	204281	204286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157363069
4121	NC_009828	CCTT	2	8	204306	204313	0 %	50 %	0 %	50 %	157363069
4122	NC_009828	CTT	2	6	204353	204358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363069
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4124	NC_009828	AAT	2	6	204841	204846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363069
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4230	NC_009828	A	6	6	212883	212888	100 %	0 %	0 %	0 %	157363073
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4239	NC_009828	TTG	2	6	213362	213367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363073
4240	NC_009828	GA	3	6	213368	213373	50 %	0 %	50 %	0 %	157363073
4241	NC_009828	AAAG	2	8	213425	213432	75 %	0 %	25 %	0 %	157363073
4242	NC_009828	TTC	2	6	213453	213458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363073
4243	NC_009828	T	6	6	213507	213512	0 %	100 %	0 %	0 %	157363073
4244	NC_009828	AAT	2	6	213570	213575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363073
4245	NC_009828	AG	3	6	213590	213595	50 %	0 %	50 %	0 %	157363073
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4495	NC_009828	TGA	2	6	225512	225517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363084
4496	NC_009828	TA	3	6	225549	225554	50 %	50 %	0 %	0 %	157363084
4497	NC_009828	GAAA	2	8	225573	225580	75 %	0 %	25 %	0 %	157363084
4498	NC_009828	TTG	2	6	225593	225598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363084
4499	NC_009828	G	6	6	225598	225603	0 %	0 %	100 %	0 %	157363084
4500	NC_009828	CCA	2	6	225650	225655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363084

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