MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga lettingae TMO chromosome

Total Repeats: 42311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_009828	TAT	2	6	53650	53655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157362918
1003	NC_009828	TC	3	6	53715	53720	0 %	50 %	0 %	50 %	157362918
1004	NC_009828	ATT	2	6	53879	53884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157362918
1005	NC_009828	CT	3	6	53949	53954	0 %	50 %	0 %	50 %	157362918
1006	NC_009828	TCA	2	6	53966	53971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362918
1007	NC_009828	T	7	7	54002	54008	0 %	100 %	0 %	0 %	157362918
1008	NC_009828	TTC	2	6	54025	54030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157362918
1009	NC_009828	CAA	2	6	54057	54062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157362918
1010	NC_009828	CAGC	2	8	54118	54125	25 %	0 %	25 %	50 %	157362919
1011	NC_009828	TTA	2	6	54132	54137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157362919
1012	NC_009828	CT	3	6	54141	54146	0 %	50 %	0 %	50 %	157362919
1013	NC_009828	CAGTAA	2	12	54307	54318	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157362919
1014	NC_009828	T	7	7	54344	54350	0 %	100 %	0 %	0 %	157362919
1015	NC_009828	TC	3	6	54373	54378	0 %	50 %	0 %	50 %	157362919
1016	NC_009828	GCAA	2	8	54423	54430	50 %	0 %	25 %	25 %	157362919
1017	NC_009828	TCG	2	6	54447	54452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157362919
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1019	NC_009828	T	6	6	54468	54473	0 %	100 %	0 %	0 %	157362919
1020	NC_009828	AGC	2	6	54521	54526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157362919
1021	NC_009828	A	6	6	54533	54538	100 %	0 %	0 %	0 %	157362919
1022	NC_009828	CTT	2	6	54553	54558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157362919
1023	NC_009828	GT	3	6	54607	54612	0 %	50 %	50 %	0 %	157362919
1024	NC_009828	GTC	2	6	54665	54670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157362919
1025	NC_009828	CTG	2	6	54743	54748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157362919
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1031	NC_009828	TCC	2	6	55044	55049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157362920
1032	NC_009828	TCA	2	6	55087	55092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362920
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1034	NC_009828	TCT	2	6	55180	55185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157362920
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1037	NC_009828	TTC	2	6	55491	55496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157362920
1038	NC_009828	T	6	6	55565	55570	0 %	100 %	0 %	0 %	157362920
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1042	NC_009828	CAT	2	6	55713	55718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362920
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1048	NC_009828	CAA	2	6	55874	55879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157362921
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1053	NC_009828	TCA	2	6	56063	56068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362921
1054	NC_009828	ATC	2	6	56122	56127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362921
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1056	NC_009828	TGACA	2	10	56223	56232	40 %	20 %	20 %	20 %	157362921
1057	NC_009828	TC	4	8	56479	56486	0 %	50 %	0 %	50 %	157362921
1058	NC_009828	AAC	2	6	56535	56540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157362921
1059	NC_009828	CGC	2	6	56568	56573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157362921
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1061	NC_009828	GA	3	6	56652	56657	50 %	0 %	50 %	0 %	157362921
1062	NC_009828	CA	3	6	56662	56667	50 %	0 %	0 %	50 %	157362921
1063	NC_009828	ACTGCA	2	12	56671	56682	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157362921
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1065	NC_009828	ACC	2	6	56769	56774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157362921
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1068	NC_009828	TCA	2	6	56849	56854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362921
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1107	NC_009828	TCA	2	6	59070	59075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362924
1108	NC_009828	T	6	6	59115	59120	0 %	100 %	0 %	0 %	157362924
1109	NC_009828	ATTC	2	8	59149	59156	25 %	50 %	0 %	25 %	157362924
1110	NC_009828	T	6	6	59172	59177	0 %	100 %	0 %	0 %	157362924
1111	NC_009828	CTC	2	6	59183	59188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157362924
1112	NC_009828	TTC	2	6	59250	59255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157362924
1113	NC_009828	CCA	2	6	59295	59300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157362924
1114	NC_009828	ATA	2	6	59313	59318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157362924
1115	NC_009828	TCC	2	6	59359	59364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157362924
1116	NC_009828	A	7	7	59483	59489	100 %	0 %	0 %	0 %	157362924
1117	NC_009828	CAA	2	6	59528	59533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157362924
1118	NC_009828	ATTTCC	2	12	59543	59554	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	157362924
1119	NC_009828	T	7	7	59588	59594	0 %	100 %	0 %	0 %	157362924
1120	NC_009828	TTGA	2	8	59623	59630	25 %	50 %	25 %	0 %	157362924
1121	NC_009828	T	6	6	59794	59799	0 %	100 %	0 %	0 %	157362925
1122	NC_009828	CTT	2	6	59815	59820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157362925
1123	NC_009828	ACA	2	6	59853	59858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157362925
1124	NC_009828	TA	3	6	59904	59909	50 %	50 %	0 %	0 %	157362925
1125	NC_009828	TCAC	2	8	59910	59917	25 %	25 %	0 %	50 %	157362925
1126	NC_009828	TGAGA	2	10	59950	59959	40 %	20 %	40 %	0 %	157362925
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1128	NC_009828	GA	3	6	60030	60035	50 %	0 %	50 %	0 %	157362925
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