MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga lettingae TMO chromosome

Total Repeats: 42311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_009828	TGG	2	6	653425	653430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157363503
13003	NC_009828	CAG	2	6	653458	653463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363503
13004	NC_009828	AT	3	6	653493	653498	50 %	50 %	0 %	0 %	157363503
13005	NC_009828	AACA	2	8	653508	653515	75 %	0 %	0 %	25 %	157363503
13006	NC_009828	TAA	2	6	653563	653568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363503
13007	NC_009828	GTT	2	6	653588	653593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363503
13008	NC_009828	ATA	2	6	653627	653632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363503
13009	NC_009828	ACA	4	12	653738	653749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363503
13010	NC_009828	GGT	2	6	653804	653809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157363503
13011	NC_009828	TGA	2	6	653872	653877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363503
13012	NC_009828	ATC	2	6	653940	653945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363503
13013	NC_009828	AGT	2	6	653995	654000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363503
13014	NC_009828	GATA	2	8	654103	654110	50 %	25 %	25 %	0 %	157363503
13015	NC_009828	ATT	2	6	654226	654231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363503
13016	NC_009828	AGA	2	6	654296	654301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363503
13017	NC_009828	GAT	2	6	654347	654352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363503
13018	NC_009828	ACA	2	6	654392	654397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363503
13019	NC_009828	AGT	2	6	654424	654429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363503
13020	NC_009828	CA	3	6	654441	654446	50 %	0 %	0 %	50 %	157363503
13021	NC_009828	TGA	2	6	654459	654464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363503
13022	NC_009828	GA	3	6	654463	654468	50 %	0 %	50 %	0 %	157363503
13023	NC_009828	AT	4	8	654509	654516	50 %	50 %	0 %	0 %	157363503
13024	NC_009828	A	6	6	654599	654604	100 %	0 %	0 %	0 %	157363503
13025	NC_009828	TTA	2	6	654629	654634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363503
13026	NC_009828	ATCT	2	8	654665	654672	25 %	50 %	0 %	25 %	157363503
13027	NC_009828	TC	3	6	654702	654707	0 %	50 %	0 %	50 %	157363503
13028	NC_009828	ATGC	2	8	654722	654729	25 %	25 %	25 %	25 %	157363503
13029	NC_009828	A	6	6	654731	654736	100 %	0 %	0 %	0 %	157363503
13030	NC_009828	CAA	2	6	654804	654809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363504
13031	NC_009828	CTTGAG	2	12	654888	654899	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157363504
13032	NC_009828	CT	3	6	654928	654933	0 %	50 %	0 %	50 %	157363504
13033	NC_009828	TCCCAA	2	12	654937	654948	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	157363504
13034	NC_009828	CTATAG	2	12	655068	655079	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157363504
13035	NC_009828	CT	3	6	655093	655098	0 %	50 %	0 %	50 %	157363504
13036	NC_009828	ATGA	2	8	655154	655161	50 %	25 %	25 %	0 %	157363504
13037	NC_009828	ATC	2	6	655232	655237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363504
13038	NC_009828	ATT	2	6	655262	655267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363504
13039	NC_009828	TCA	2	6	655278	655283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363504
13040	NC_009828	TCA	2	6	655289	655294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363504
13041	NC_009828	ACC	2	6	655300	655305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363504
13042	NC_009828	ATA	2	6	655306	655311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363504
13043	NC_009828	A	6	6	655327	655332	100 %	0 %	0 %	0 %	157363504
13044	NC_009828	TA	3	6	655444	655449	50 %	50 %	0 %	0 %	157363504
13045	NC_009828	ATTG	2	8	655461	655468	25 %	50 %	25 %	0 %	157363504
13046	NC_009828	CTTTC	2	10	655525	655534	0 %	60 %	0 %	40 %	157363504
13047	NC_009828	TAATCA	2	12	655571	655582	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	157363504
13048	NC_009828	T	6	6	655619	655624	0 %	100 %	0 %	0 %	157363504
13049	NC_009828	ACA	2	6	655625	655630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363504
13050	NC_009828	TCA	2	6	655676	655681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363504
13051	NC_009828	TGA	2	6	655735	655740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363504
13052	NC_009828	TTC	2	6	655774	655779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363504
13053	NC_009828	T	7	7	655818	655824	0 %	100 %	0 %	0 %	157363504
13054	NC_009828	CAT	2	6	655827	655832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363504
13055	NC_009828	CAT	2	6	655896	655901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363504
13056	NC_009828	CTG	2	6	655917	655922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363504
13057	NC_009828	TC	3	6	655981	655986	0 %	50 %	0 %	50 %	157363504
13058	NC_009828	GGA	2	6	656019	656024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157363504
13059	NC_009828	TGG	2	6	656071	656076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157363504
13060	NC_009828	GA	3	6	656118	656123	50 %	0 %	50 %	0 %	157363504
13061	NC_009828	AT	3	6	656231	656236	50 %	50 %	0 %	0 %	157363504
13062	NC_009828	TTC	2	6	656239	656244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363504
13063	NC_009828	TCT	2	6	656253	656258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363504
13064	NC_009828	GTT	2	6	656260	656265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363504
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13066	NC_009828	GCAA	2	8	656327	656334	50 %	0 %	25 %	25 %	157363505
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13069	NC_009828	TTG	2	6	656410	656415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363505
13070	NC_009828	TA	3	6	656429	656434	50 %	50 %	0 %	0 %	157363505
13071	NC_009828	CCAA	2	8	656452	656459	50 %	0 %	0 %	50 %	157363505
13072	NC_009828	ATC	2	6	656522	656527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363505
13073	NC_009828	TAC	2	6	656563	656568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363505
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13075	NC_009828	AT	3	6	656642	656647	50 %	50 %	0 %	0 %	157363505
13076	NC_009828	TCA	2	6	656649	656654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363505
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13084	NC_009828	GCGA	2	8	656939	656946	25 %	0 %	50 %	25 %	157363505
13085	NC_009828	AG	3	6	656953	656958	50 %	0 %	50 %	0 %	157363505
13086	NC_009828	GCA	2	6	656969	656974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363505
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13088	NC_009828	TTC	3	9	657097	657105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363505
13089	NC_009828	GCA	2	6	657173	657178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363505
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13092	NC_009828	TCT	2	6	657238	657243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363505
13093	NC_009828	T	6	6	657307	657312	0 %	100 %	0 %	0 %	157363506
13094	NC_009828	TTC	2	6	657332	657337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363506
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13099	NC_009828	AG	3	6	657767	657772	50 %	0 %	50 %	0 %	157363506
13100	NC_009828	TACA	2	8	657790	657797	50 %	25 %	0 %	25 %	157363506
13101	NC_009828	GTG	2	6	657807	657812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157363506
13102	NC_009828	TTG	2	6	657846	657851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363506
13103	NC_009828	GCC	2	6	657893	657898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157363506
13104	NC_009828	CAT	2	6	657908	657913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363506
13105	NC_009828	GTA	2	6	657962	657967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363506
13106	NC_009828	TATC	2	8	658027	658034	25 %	50 %	0 %	25 %	157363506
13107	NC_009828	CTTTT	2	10	658181	658190	0 %	80 %	0 %	20 %	157363506
13108	NC_009828	T	6	6	658340	658345	0 %	100 %	0 %	0 %	157363506
13109	NC_009828	ATA	2	6	658349	658354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363506
13110	NC_009828	TTTC	2	8	658359	658366	0 %	75 %	0 %	25 %	157363506
13111	NC_009828	TA	3	6	658403	658408	50 %	50 %	0 %	0 %	157363506
13112	NC_009828	TC	3	6	658428	658433	0 %	50 %	0 %	50 %	157363506
13113	NC_009828	ATTG	2	8	658436	658443	25 %	50 %	25 %	0 %	157363506
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13119	NC_009828	ATC	2	6	658691	658696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363506
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13122	NC_009828	T	6	6	658791	658796	0 %	100 %	0 %	0 %	157363506
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13488	NC_009828	GT	3	6	676847	676852	0 %	50 %	50 %	0 %	157363524
13489	NC_009828	ATC	2	6	676942	676947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363524
13490	NC_009828	A	6	6	677033	677038	100 %	0 %	0 %	0 %	157363525
13491	NC_009828	CCT	2	6	677039	677044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363525
13492	NC_009828	CTG	2	6	677091	677096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363525
13493	NC_009828	TAT	2	6	677129	677134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363525
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13495	NC_009828	AT	3	6	677212	677217	50 %	50 %	0 %	0 %	157363525
13496	NC_009828	GTA	2	6	677243	677248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363525
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