MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga lettingae TMO chromosome

Total Repeats: 42311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_009828	GAA	2	6	249165	249170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363106
5003	NC_009828	CAA	2	6	249189	249194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363106
5004	NC_009828	TCT	2	6	249215	249220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363106
5005	NC_009828	AATT	2	8	249256	249263	50 %	50 %	0 %	0 %	157363106
5006	NC_009828	CAC	2	6	249264	249269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363106
5007	NC_009828	TAG	2	6	249289	249294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363106
5008	NC_009828	T	6	6	249386	249391	0 %	100 %	0 %	0 %	157363106
5009	NC_009828	CTT	2	6	249396	249401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363106
5010	NC_009828	TG	3	6	249421	249426	0 %	50 %	50 %	0 %	157363106
5011	NC_009828	CTTT	2	8	249497	249504	0 %	75 %	0 %	25 %	157363106
5012	NC_009828	GTG	2	6	249565	249570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157363106
5013	NC_009828	T	7	7	249637	249643	0 %	100 %	0 %	0 %	157363106
5014	NC_009828	GT	3	6	249654	249659	0 %	50 %	50 %	0 %	157363106
5015	NC_009828	T	6	6	249693	249698	0 %	100 %	0 %	0 %	157363106
5016	NC_009828	CTA	2	6	249744	249749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363106
5017	NC_009828	GAA	2	6	249783	249788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363106
5018	NC_009828	CTT	2	6	249789	249794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363106
5019	NC_009828	AGCA	2	8	249811	249818	50 %	0 %	25 %	25 %	157363106
5020	NC_009828	ATT	2	6	249938	249943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363106
5021	NC_009828	TGT	2	6	249967	249972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363106
5022	NC_009828	T	7	7	250093	250099	0 %	100 %	0 %	0 %	157363106
5023	NC_009828	ACC	2	6	250133	250138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363106
5024	NC_009828	AAG	2	6	250173	250178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363106
5025	NC_009828	TG	3	6	250236	250241	0 %	50 %	50 %	0 %	157363106
5026	NC_009828	CT	3	6	250254	250259	0 %	50 %	0 %	50 %	157363106
5027	NC_009828	T	7	7	250259	250265	0 %	100 %	0 %	0 %	157363106
5028	NC_009828	T	7	7	250296	250302	0 %	100 %	0 %	0 %	157363106
5029	NC_009828	TCG	2	6	250337	250342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363106
5030	NC_009828	GAAGA	2	10	250383	250392	60 %	0 %	40 %	0 %	157363106
5031	NC_009828	GA	3	6	250391	250396	50 %	0 %	50 %	0 %	157363106
5032	NC_009828	TAA	2	6	250404	250409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363106
5033	NC_009828	T	6	6	250441	250446	0 %	100 %	0 %	0 %	157363106
5034	NC_009828	TTC	2	6	250476	250481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363106
5035	NC_009828	TCA	2	6	250526	250531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363106
5036	NC_009828	T	6	6	250569	250574	0 %	100 %	0 %	0 %	157363106
5037	NC_009828	GATCA	2	10	250627	250636	40 %	20 %	20 %	20 %	157363106
5038	NC_009828	CAA	2	6	250662	250667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363106
5039	NC_009828	GTT	2	6	250698	250703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363106
5040	NC_009828	TTA	2	6	250707	250712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363106
5041	NC_009828	CATCTA	2	12	250848	250859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363106
5042	NC_009828	A	6	6	250909	250914	100 %	0 %	0 %	0 %	157363106
5043	NC_009828	TCGT	2	8	250937	250944	0 %	50 %	25 %	25 %	157363106
5044	NC_009828	T	6	6	250946	250951	0 %	100 %	0 %	0 %	157363106
5045	NC_009828	TCTG	2	8	250957	250964	0 %	50 %	25 %	25 %	157363106
5046	NC_009828	A	8	8	250996	251003	100 %	0 %	0 %	0 %	157363106
5047	NC_009828	CT	3	6	251006	251011	0 %	50 %	0 %	50 %	157363106
5048	NC_009828	TCT	2	6	251021	251026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363106
5049	NC_009828	CAG	2	6	251199	251204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363107
5050	NC_009828	ATC	2	6	251212	251217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363107
5051	NC_009828	TCTT	2	8	251227	251234	0 %	75 %	0 %	25 %	157363107
5052	NC_009828	T	6	6	251262	251267	0 %	100 %	0 %	0 %	157363107
5053	NC_009828	CTG	2	6	251472	251477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363107
5054	NC_009828	ACTG	2	8	251526	251533	25 %	25 %	25 %	25 %	157363107
5055	NC_009828	TTC	2	6	251708	251713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363108
5056	NC_009828	CTT	2	6	251740	251745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363108
5057	NC_009828	TACT	2	8	251752	251759	25 %	50 %	0 %	25 %	157363108
5058	NC_009828	T	6	6	251777	251782	0 %	100 %	0 %	0 %	157363108
5059	NC_009828	CTT	2	6	251788	251793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363108
5060	NC_009828	TGA	2	6	251931	251936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363108
5061	NC_009828	T	7	7	251969	251975	0 %	100 %	0 %	0 %	157363108
5062	NC_009828	TAG	2	6	252007	252012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363108
5063	NC_009828	TTC	2	6	252068	252073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363108
5064	NC_009828	GAA	2	6	252134	252139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363108
5065	NC_009828	TTA	2	6	252145	252150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363108
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5067	NC_009828	ATG	2	6	252279	252284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363108
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5069	NC_009828	ATA	2	6	252584	252589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363108
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5072	NC_009828	TAT	2	6	252728	252733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363108
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5074	NC_009828	TCA	2	6	252840	252845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363108
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5076	NC_009828	TACA	2	8	252875	252882	50 %	25 %	0 %	25 %	157363108
5077	NC_009828	T	6	6	252938	252943	0 %	100 %	0 %	0 %	157363108
5078	NC_009828	TAT	2	6	252974	252979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363108
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5080	NC_009828	ATT	2	6	253062	253067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363108
5081	NC_009828	CTG	2	6	253117	253122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363108
5082	NC_009828	TG	3	6	253157	253162	0 %	50 %	50 %	0 %	157363108
5083	NC_009828	TGC	2	6	253231	253236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363108
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5087	NC_009828	AAT	2	6	253472	253477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363108
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5090	NC_009828	A	7	7	253645	253651	100 %	0 %	0 %	0 %	157363109
5091	NC_009828	TTG	2	6	253800	253805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363109
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5095	NC_009828	T	6	6	253945	253950	0 %	100 %	0 %	0 %	157363109
5096	NC_009828	TGA	2	6	253960	253965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363109
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5099	NC_009828	GCC	2	6	254303	254308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157363109
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5104	NC_009828	CAAGC	2	10	254467	254476	40 %	0 %	20 %	40 %	157363109
5105	NC_009828	AG	4	8	254599	254606	50 %	0 %	50 %	0 %	157363110
5106	NC_009828	AAAG	2	8	254697	254704	75 %	0 %	25 %	0 %	157363110
5107	NC_009828	A	8	8	254745	254752	100 %	0 %	0 %	0 %	157363110
5108	NC_009828	GTA	2	6	254894	254899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363110
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5111	NC_009828	GAA	2	6	254941	254946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363110
5112	NC_009828	TGC	2	6	254949	254954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363110
5113	NC_009828	AG	3	6	254962	254967	50 %	0 %	50 %	0 %	157363110
5114	NC_009828	T	6	6	254992	254997	0 %	100 %	0 %	0 %	157363111
5115	NC_009828	GTTT	2	8	255002	255009	0 %	75 %	25 %	0 %	157363111
5116	NC_009828	TTG	2	6	255022	255027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363111
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5118	NC_009828	A	6	6	255051	255056	100 %	0 %	0 %	0 %	157363111
5119	NC_009828	ATCTC	2	10	255072	255081	20 %	40 %	0 %	40 %	157363111
5120	NC_009828	GATT	2	8	255089	255096	25 %	50 %	25 %	0 %	157363111
5121	NC_009828	ATG	2	6	255107	255112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363111
5122	NC_009828	GTT	2	6	255134	255139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363111
5123	NC_009828	TAAT	2	8	255173	255180	50 %	50 %	0 %	0 %	157363111
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5498	NC_009828	GCT	2	6	273466	273471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363124
5499	NC_009828	CA	3	6	273529	273534	50 %	0 %	0 %	50 %	157363124
5500	NC_009828	AGC	2	6	273552	273557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363124

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