MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga lettingae TMO chromosome

Total Repeats: 42311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009828	T	6	6	225697	225702	0 %	100 %	0 %	0 %	157363084
4502	NC_009828	T	6	6	225704	225709	0 %	100 %	0 %	0 %	157363084
4503	NC_009828	T	6	6	225757	225762	0 %	100 %	0 %	0 %	157363084
4504	NC_009828	CAA	2	6	225786	225791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363084
4505	NC_009828	TTC	2	6	225793	225798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363084
4506	NC_009828	ATC	2	6	225851	225856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363084
4507	NC_009828	CGC	2	6	225892	225897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157363084
4508	NC_009828	CCT	2	6	225954	225959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363084
4509	NC_009828	CTG	2	6	225977	225982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363084
4510	NC_009828	ATC	2	6	225985	225990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363084
4511	NC_009828	GTT	2	6	226006	226011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363084
4512	NC_009828	CTG	2	6	226044	226049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363084
4513	NC_009828	CTT	2	6	226173	226178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363084
4514	NC_009828	CAA	2	6	226180	226185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363084
4515	NC_009828	T	6	6	226186	226191	0 %	100 %	0 %	0 %	157363084
4516	NC_009828	AG	3	6	226356	226361	50 %	0 %	50 %	0 %	157363084
4517	NC_009828	TTC	2	6	226483	226488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363084
4518	NC_009828	ATG	2	6	226514	226519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363084
4519	NC_009828	TTTTTG	2	12	226581	226592	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	157363084
4520	NC_009828	CAA	2	6	226689	226694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363085
4521	NC_009828	AAC	2	6	226695	226700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363085
4522	NC_009828	TGAT	2	8	226730	226737	25 %	50 %	25 %	0 %	157363085
4523	NC_009828	TGC	2	6	226745	226750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363085
4524	NC_009828	ATT	2	6	226815	226820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363085
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4527	NC_009828	TCT	2	6	226921	226926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363085
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4529	NC_009828	T	6	6	227018	227023	0 %	100 %	0 %	0 %	157363085
4530	NC_009828	ACCA	2	8	227046	227053	50 %	0 %	0 %	50 %	157363085
4531	NC_009828	A	6	6	227106	227111	100 %	0 %	0 %	0 %	157363085
4532	NC_009828	TGT	2	6	227127	227132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363085
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4534	NC_009828	TCT	2	6	227281	227286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363085
4535	NC_009828	CATC	2	8	227289	227296	25 %	25 %	0 %	50 %	157363085
4536	NC_009828	ACT	2	6	227317	227322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363085
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4539	NC_009828	AT	3	6	227435	227440	50 %	50 %	0 %	0 %	157363085
4540	NC_009828	CAT	2	6	227469	227474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363085
4541	NC_009828	GCTTTT	2	12	227590	227601	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	157363085
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4543	NC_009828	TTG	3	9	227659	227667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363085
4544	NC_009828	CAT	2	6	227675	227680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363085
4545	NC_009828	CAT	2	6	227756	227761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363085
4546	NC_009828	TCA	2	6	227800	227805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363085
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4549	NC_009828	AT	3	6	227981	227986	50 %	50 %	0 %	0 %	157363085
4550	NC_009828	GTC	2	6	228009	228014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363085
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4552	NC_009828	T	7	7	228095	228101	0 %	100 %	0 %	0 %	157363085
4553	NC_009828	AGA	2	6	228118	228123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363085
4554	NC_009828	TTGAA	2	10	228147	228156	40 %	40 %	20 %	0 %	157363085
4555	NC_009828	AAG	2	6	228164	228169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363085
4556	NC_009828	TTC	2	6	228212	228217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363085
4557	NC_009828	T	6	6	228300	228305	0 %	100 %	0 %	0 %	157363085
4558	NC_009828	TAC	2	6	228416	228421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363085
4559	NC_009828	TCA	2	6	228612	228617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363085
4560	NC_009828	TTC	2	6	228632	228637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363085
4561	NC_009828	TGA	2	6	228641	228646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363085
4562	NC_009828	CAG	2	6	228673	228678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363085
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4564	NC_009828	CAGA	2	8	228807	228814	50 %	0 %	25 %	25 %	157363085
4565	NC_009828	GAA	2	6	228821	228826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363085
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4571	NC_009828	GCA	2	6	229040	229045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363086
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4573	NC_009828	TCT	2	6	229082	229087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363086
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4593	NC_009828	AATG	2	8	229714	229721	50 %	25 %	25 %	0 %	157363087
4594	NC_009828	T	6	6	229732	229737	0 %	100 %	0 %	0 %	157363087
4595	NC_009828	CTT	3	9	229752	229760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363087
4596	NC_009828	GA	3	6	229793	229798	50 %	0 %	50 %	0 %	157363087
4597	NC_009828	TAT	2	6	229801	229806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363087
4598	NC_009828	TTG	2	6	229830	229835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363087
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4602	NC_009828	CTT	2	6	230136	230141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363087
4603	NC_009828	TAT	2	6	230200	230205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363087
4604	NC_009828	A	6	6	230319	230324	100 %	0 %	0 %	0 %	157363087
4605	NC_009828	T	6	6	230355	230360	0 %	100 %	0 %	0 %	157363087
4606	NC_009828	T	6	6	230399	230404	0 %	100 %	0 %	0 %	157363087
4607	NC_009828	AT	3	6	230428	230433	50 %	50 %	0 %	0 %	157363087
4608	NC_009828	CTGTAC	2	12	230520	230531	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157363088
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4610	NC_009828	ATT	2	6	230551	230556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363088
4611	NC_009828	TAT	2	6	230579	230584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363088
4612	NC_009828	AGT	2	6	230641	230646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363088
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4614	NC_009828	ATA	2	6	230845	230850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363088
4615	NC_009828	TCT	2	6	230959	230964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363088
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4620	NC_009828	T	6	6	231169	231174	0 %	100 %	0 %	0 %	157363088
4621	NC_009828	ATCT	2	8	231222	231229	25 %	50 %	0 %	25 %	157363088
4622	NC_009828	ATC	2	6	231235	231240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363088
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4998	NC_009828	GCT	2	6	248979	248984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363106
4999	NC_009828	AT	3	6	248988	248993	50 %	50 %	0 %	0 %	157363106
5000	NC_009828	TCT	2	6	249035	249040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363106

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