MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosipho melanesiensis BI429 chromosome

Total Repeats: 44672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009616	CTT	2	6	181	186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150019914
2	NC_009616	AGAA	2	8	191	198	75 %	0 %	25 %	0 %	150019914
3	NC_009616	GCC	2	6	202	207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150019914
4	NC_009616	AG	3	6	243	248	50 %	0 %	50 %	0 %	150019914
5	NC_009616	AAAG	2	8	294	301	75 %	0 %	25 %	0 %	150019914
6	NC_009616	A	8	8	307	314	100 %	0 %	0 %	0 %	150019914
7	NC_009616	TAA	2	6	317	322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019914
8	NC_009616	A	7	7	429	435	100 %	0 %	0 %	0 %	150019914
9	NC_009616	ACT	2	6	440	445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150019914
10	NC_009616	TAG	2	6	484	489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150019914
11	NC_009616	GAA	2	6	669	674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150019914
12	NC_009616	A	6	6	701	706	100 %	0 %	0 %	0 %	150019914
13	NC_009616	A	7	7	740	746	100 %	0 %	0 %	0 %	150019914
14	NC_009616	TAA	2	6	757	762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019914
15	NC_009616	ATT	2	6	852	857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150019914
16	NC_009616	TTCA	2	8	895	902	25 %	50 %	0 %	25 %	150019914
17	NC_009616	TAG	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150019914
18	NC_009616	A	7	7	981	987	100 %	0 %	0 %	0 %	150019914
19	NC_009616	TGAAA	2	10	992	1001	60 %	20 %	20 %	0 %	150019914
20	NC_009616	TGA	3	9	1013	1021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150019914
21	NC_009616	ATT	2	6	1023	1028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150019914
22	NC_009616	ACC	2	6	1160	1165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150019914
23	NC_009616	GAA	2	6	1176	1181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150019914
24	NC_009616	ACT	2	6	1184	1189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150019914
25	NC_009616	TGA	2	6	1223	1228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150019914
26	NC_009616	CTT	2	6	1234	1239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150019914
27	NC_009616	A	6	6	1250	1255	100 %	0 %	0 %	0 %	150019914
28	NC_009616	A	6	6	1296	1301	100 %	0 %	0 %	0 %	150019914
29	NC_009616	TC	3	6	1307	1312	0 %	50 %	0 %	50 %	150019914
30	NC_009616	ATT	2	6	1385	1390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150019914
31	NC_009616	AAG	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150019914
32	NC_009616	A	6	6	1412	1417	100 %	0 %	0 %	0 %	150019914
33	NC_009616	CAAA	2	8	1424	1431	75 %	0 %	0 %	25 %	150019914
34	NC_009616	GAT	2	6	1598	1603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150019915
35	NC_009616	GCA	2	6	1655	1660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150019915
36	NC_009616	ATT	3	9	1682	1690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150019915
37	NC_009616	GAA	2	6	1691	1696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150019915
38	NC_009616	TAA	2	6	1697	1702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019915
39	NC_009616	GAAT	2	8	5342	5349	50 %	25 %	25 %	0 %	150019916
40	NC_009616	ATT	2	6	5362	5367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150019916
41	NC_009616	ATT	2	6	5386	5391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150019916
42	NC_009616	AAGGAA	2	12	5397	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150019916
43	NC_009616	AAT	2	6	5413	5418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019916
44	NC_009616	TTC	2	6	5421	5426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150019916
45	NC_009616	ATA	2	6	5445	5450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019916
46	NC_009616	A	7	7	5452	5458	100 %	0 %	0 %	0 %	150019916
47	NC_009616	TA	3	6	5571	5576	50 %	50 %	0 %	0 %	150019916
48	NC_009616	TACC	2	8	5645	5652	25 %	25 %	0 %	50 %	150019916
49	NC_009616	A	6	6	5653	5658	100 %	0 %	0 %	0 %	150019916
50	NC_009616	A	6	6	5671	5676	100 %	0 %	0 %	0 %	150019916
51	NC_009616	TTTC	2	8	6154	6161	0 %	75 %	0 %	25 %	150019917
52	NC_009616	A	7	7	6168	6174	100 %	0 %	0 %	0 %	150019917
53	NC_009616	AAAG	2	8	6198	6205	75 %	0 %	25 %	0 %	150019917
54	NC_009616	AAAT	2	8	6274	6281	75 %	25 %	0 %	0 %	150019917
55	NC_009616	AAAT	2	8	6322	6329	75 %	25 %	0 %	0 %	150019917
56	NC_009616	AT	3	6	6328	6333	50 %	50 %	0 %	0 %	150019917
57	NC_009616	ACAAA	2	10	6334	6343	80 %	0 %	0 %	20 %	150019917
58	NC_009616	ACCA	2	8	6394	6401	50 %	0 %	0 %	50 %	150019917
59	NC_009616	AAAT	2	8	6413	6420	75 %	25 %	0 %	0 %	150019917
60	NC_009616	CA	3	6	6431	6436	50 %	0 %	0 %	50 %	150019917
61	NC_009616	A	7	7	6457	6463	100 %	0 %	0 %	0 %	150019917
62	NC_009616	CAT	2	6	6532	6537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150019917
63	NC_009616	TG	3	6	6615	6620	0 %	50 %	50 %	0 %	150019917
64	NC_009616	TAAT	2	8	6733	6740	50 %	50 %	0 %	0 %	150019917
65	NC_009616	ATT	2	6	6747	6752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150019917
66	NC_009616	AAT	2	6	6831	6836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019918
67	NC_009616	TAA	2	6	6847	6852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019918
68	NC_009616	AAT	2	6	6861	6866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019918
69	NC_009616	ATA	2	6	6883	6888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019918
70	NC_009616	A	6	6	6892	6897	100 %	0 %	0 %	0 %	150019918
71	NC_009616	CAA	2	6	6950	6955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150019918
72	NC_009616	A	6	6	7009	7014	100 %	0 %	0 %	0 %	150019918
73	NC_009616	TAA	2	6	7073	7078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019918
74	NC_009616	TAA	2	6	7095	7100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019918
75	NC_009616	A	6	6	7102	7107	100 %	0 %	0 %	0 %	150019918
76	NC_009616	TAA	2	6	7113	7118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019918
77	NC_009616	AATT	2	8	7136	7143	50 %	50 %	0 %	0 %	150019918
78	NC_009616	A	8	8	7165	7172	100 %	0 %	0 %	0 %	150019918
79	NC_009616	A	7	7	7174	7180	100 %	0 %	0 %	0 %	150019918
80	NC_009616	A	6	6	7198	7203	100 %	0 %	0 %	0 %	150019918
81	NC_009616	TA	3	6	7209	7214	50 %	50 %	0 %	0 %	150019918
82	NC_009616	C	6	6	7226	7231	0 %	0 %	0 %	100 %	150019918
83	NC_009616	AAT	2	6	7240	7245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019918
84	NC_009616	TAAC	2	8	7306	7313	50 %	25 %	0 %	25 %	150019918
85	NC_009616	AATTG	2	10	7314	7323	40 %	40 %	20 %	0 %	150019918
86	NC_009616	AACAAA	2	12	7341	7352	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	150019918
87	NC_009616	TGT	2	6	7384	7389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150019918
88	NC_009616	AAT	2	6	7394	7399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019918
89	NC_009616	T	6	6	7453	7458	0 %	100 %	0 %	0 %	150019918
90	NC_009616	CAT	2	6	7493	7498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150019918
91	NC_009616	ATA	2	6	7504	7509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019918
92	NC_009616	TTC	2	6	7524	7529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150019918
93	NC_009616	TAA	2	6	7539	7544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019918
94	NC_009616	T	7	7	7598	7604	0 %	100 %	0 %	0 %	150019918
95	NC_009616	AAAATC	2	12	7651	7662	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150019918
96	NC_009616	GTT	2	6	7700	7705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150019918
97	NC_009616	CAAA	2	8	7748	7755	75 %	0 %	0 %	25 %	150019918
98	NC_009616	ATT	2	6	7791	7796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150019918
99	NC_009616	AGA	2	6	7804	7809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150019918
100	NC_009616	T	7	7	7880	7886	0 %	100 %	0 %	0 %	150019918
101	NC_009616	AT	4	8	7927	7934	50 %	50 %	0 %	0 %	150019918
102	NC_009616	CAA	2	6	7953	7958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150019918
103	NC_009616	GTT	2	6	7981	7986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150019918
104	NC_009616	CAA	2	6	8006	8011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150019918
105	NC_009616	TCT	2	6	8050	8055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150019918
106	NC_009616	AT	3	6	8076	8081	50 %	50 %	0 %	0 %	150019918
107	NC_009616	T	6	6	8092	8097	0 %	100 %	0 %	0 %	150019918
108	NC_009616	TTC	2	6	8804	8809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150019919
109	NC_009616	TGC	2	6	8858	8863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150019919
110	NC_009616	TAAA	2	8	8873	8880	75 %	25 %	0 %	0 %	150019919
111	NC_009616	TTC	2	6	8903	8908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150019919
112	NC_009616	TTTG	2	8	8988	8995	0 %	75 %	25 %	0 %	150019919
113	NC_009616	T	6	6	9141	9146	0 %	100 %	0 %	0 %	150019919
114	NC_009616	CCA	2	6	9192	9197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150019919
115	NC_009616	T	6	6	9224	9229	0 %	100 %	0 %	0 %	150019919
116	NC_009616	ATT	3	9	9312	9320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150019919
117	NC_009616	T	6	6	9383	9388	0 %	100 %	0 %	0 %	150019919
118	NC_009616	T	6	6	9393	9398	0 %	100 %	0 %	0 %	150019919
119	NC_009616	ACC	2	6	9464	9469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150019919
120	NC_009616	T	7	7	9480	9486	0 %	100 %	0 %	0 %	150019919
121	NC_009616	CAT	2	6	9499	9504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150019919
122	NC_009616	TCT	2	6	9511	9516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150019919
123	NC_009616	CCA	3	9	9549	9557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150019919
124	NC_009616	CTT	2	6	9569	9574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150019919
125	NC_009616	CTA	2	6	9603	9608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150019919
126	NC_009616	AAC	2	6	9676	9681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150019919
127	NC_009616	ATC	2	6	9698	9703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150019919
128	NC_009616	ATA	2	6	9712	9717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019919
129	NC_009616	ATC	2	6	9782	9787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150019919
130	NC_009616	T	6	6	9794	9799	0 %	100 %	0 %	0 %	150019919
131	NC_009616	ATC	2	6	9875	9880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150019919
132	NC_009616	CAAC	2	8	9945	9952	50 %	0 %	0 %	50 %	150019919
133	NC_009616	TTC	2	6	10004	10009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150019919
134	NC_009616	TCC	2	6	10019	10024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150019919
135	NC_009616	CAA	2	6	10027	10032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150019919
136	NC_009616	AAC	2	6	10056	10061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150019919
137	NC_009616	TCTTT	2	10	10134	10143	0 %	80 %	0 %	20 %	150019919
138	NC_009616	AAT	2	6	10256	10261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019919
139	NC_009616	GCT	2	6	10362	10367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150019919
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141	NC_009616	CTA	2	6	10423	10428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150019919
142	NC_009616	ATT	2	6	10521	10526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150019919
143	NC_009616	ATA	2	6	10556	10561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019919
144	NC_009616	TCA	2	6	10572	10577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150019919
145	NC_009616	CCATT	2	10	10737	10746	20 %	40 %	0 %	40 %	150019920
146	NC_009616	ATG	2	6	10767	10772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150019920
147	NC_009616	ATT	2	6	10846	10851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150019920
148	NC_009616	CTTC	2	8	10869	10876	0 %	50 %	0 %	50 %	150019920
149	NC_009616	ATA	2	6	10877	10882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019920
150	NC_009616	CT	4	8	10937	10944	0 %	50 %	0 %	50 %	150019920
151	NC_009616	TCA	2	6	11067	11072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150019921
152	NC_009616	TGCA	2	8	11146	11153	25 %	25 %	25 %	25 %	150019921
153	NC_009616	T	6	6	11174	11179	0 %	100 %	0 %	0 %	150019921
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156	NC_009616	TTC	2	6	11251	11256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150019921
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159	NC_009616	T	7	7	11379	11385	0 %	100 %	0 %	0 %	150019922
160	NC_009616	CTG	2	6	11409	11414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150019922
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162	NC_009616	CAT	2	6	11517	11522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150019922
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170	NC_009616	AGATT	2	10	11763	11772	40 %	40 %	20 %	0 %	150019923
171	NC_009616	CAT	2	6	11782	11787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150019923
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173	NC_009616	AAT	2	6	11830	11835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019923
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182	NC_009616	TAT	2	6	12143	12148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150019923
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246	NC_009616	T	7	7	14649	14655	0 %	100 %	0 %	0 %	150019925
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249	NC_009616	TAT	2	6	14809	14814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150019925
250	NC_009616	CCA	2	6	15015	15020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150019925
251	NC_009616	TTTC	2	8	15070	15077	0 %	75 %	0 %	25 %	150019925
252	NC_009616	ATA	2	6	15143	15148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150019925
253	NC_009616	TAC	2	6	15365	15370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150019926
254	NC_009616	T	6	6	15374	15379	0 %	100 %	0 %	0 %	150019926
255	NC_009616	TGA	3	9	15468	15476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150019926
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258	NC_009616	TAG	2	6	15545	15550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150019926
259	NC_009616	A	6	6	15560	15565	100 %	0 %	0 %	0 %	150019926
260	NC_009616	TTAT	2	8	15602	15609	25 %	75 %	0 %	0 %	150019926
261	NC_009616	AAC	2	6	15638	15643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150019926
262	NC_009616	TGC	2	6	15651	15656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150019926
263	NC_009616	AGAA	2	8	15684	15691	75 %	0 %	25 %	0 %	150019926
264	NC_009616	TCAA	2	8	15731	15738	50 %	25 %	0 %	25 %	150019926
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