MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 37720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009486	CCT	2	6	188097	188102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269339
4002	NC_009486	ACA	2	6	188105	188110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269339
4003	NC_009486	TTC	2	6	188131	188136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269339
4004	NC_009486	TTC	2	6	188171	188176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269339
4005	NC_009486	GTT	2	6	188206	188211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269339
4006	NC_009486	CTT	2	6	188215	188220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269339
4007	NC_009486	CTT	2	6	188229	188234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269339
4008	NC_009486	TC	3	6	188313	188318	0 %	50 %	0 %	50 %	148269339
4009	NC_009486	GA	4	8	188323	188330	50 %	0 %	50 %	0 %	148269339
4010	NC_009486	A	6	6	188417	188422	100 %	0 %	0 %	0 %	148269339
4011	NC_009486	TCC	2	6	188470	188475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269339
4012	NC_009486	CTT	2	6	188541	188546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269339
4013	NC_009486	T	7	7	188589	188595	0 %	100 %	0 %	0 %	148269339
4014	NC_009486	TCC	2	6	188629	188634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269339
4015	NC_009486	GAAA	2	8	188653	188660	75 %	0 %	25 %	0 %	148269339
4016	NC_009486	GTTT	2	8	188830	188837	0 %	75 %	25 %	0 %	148269339
4017	NC_009486	GAT	2	6	188866	188871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269339
4018	NC_009486	CTT	2	6	188964	188969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269339
4019	NC_009486	TC	3	6	189003	189008	0 %	50 %	0 %	50 %	148269339
4020	NC_009486	CT	3	6	189024	189029	0 %	50 %	0 %	50 %	148269339
4021	NC_009486	TC	3	6	189044	189049	0 %	50 %	0 %	50 %	148269339
4022	NC_009486	TCCA	2	8	189118	189125	25 %	25 %	0 %	50 %	148269339
4023	NC_009486	GT	3	6	189156	189161	0 %	50 %	50 %	0 %	148269339
4024	NC_009486	TCT	2	6	189185	189190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269339
4025	NC_009486	TTC	2	6	189196	189201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269339
4026	NC_009486	TC	3	6	189277	189282	0 %	50 %	0 %	50 %	148269339
4027	NC_009486	T	7	7	189415	189421	0 %	100 %	0 %	0 %	148269340
4028	NC_009486	GGA	2	6	189458	189463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269340
4029	NC_009486	TAT	2	6	189514	189519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148269340
4030	NC_009486	CAT	2	6	189538	189543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269340
4031	NC_009486	GA	3	6	189567	189572	50 %	0 %	50 %	0 %	148269340
4032	NC_009486	CGG	2	6	189621	189626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148269340
4033	NC_009486	GAA	2	6	189664	189669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269340
4034	NC_009486	GCT	2	6	189678	189683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269340
4035	NC_009486	CT	3	6	189798	189803	0 %	50 %	0 %	50 %	148269340
4036	NC_009486	TCC	2	6	189866	189871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269340
4037	NC_009486	AAC	2	6	189883	189888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269340
4038	NC_009486	CCA	2	6	189918	189923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269340
4039	NC_009486	TCT	2	6	189980	189985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269340
4040	NC_009486	TCGA	2	8	190015	190022	25 %	25 %	25 %	25 %	148269340
4041	NC_009486	TCC	2	6	190025	190030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269340
4042	NC_009486	TTC	2	6	190069	190074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269340
4043	NC_009486	TTCCC	2	10	190113	190122	0 %	40 %	0 %	60 %	148269340
4044	NC_009486	GA	3	6	190179	190184	50 %	0 %	50 %	0 %	148269340
4045	NC_009486	GAA	3	9	190192	190200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269340
4046	NC_009486	ATC	2	6	190207	190212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269340
4047	NC_009486	GAG	2	6	190216	190221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269340
4048	NC_009486	A	6	6	190229	190234	100 %	0 %	0 %	0 %	148269340
4049	NC_009486	CTT	2	6	190284	190289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269340
4050	NC_009486	CTT	2	6	190308	190313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269340
4051	NC_009486	TGA	2	6	190317	190322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269340
4052	NC_009486	CTTC	2	8	190359	190366	0 %	50 %	0 %	50 %	148269340
4053	NC_009486	CGTT	2	8	190482	190489	0 %	50 %	25 %	25 %	148269340
4054	NC_009486	GA	3	6	190504	190509	50 %	0 %	50 %	0 %	148269340
4055	NC_009486	TGC	2	6	190512	190517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269340
4056	NC_009486	TCT	2	6	190560	190565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269340
4057	NC_009486	ATC	2	6	190661	190666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269340
4058	NC_009486	TCG	2	6	190731	190736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269341
4059	NC_009486	ACCC	2	8	190765	190772	25 %	0 %	0 %	75 %	148269341
4060	NC_009486	GGC	2	6	190794	190799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148269341
4061	NC_009486	TTG	2	6	190812	190817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269341
4062	NC_009486	AGG	2	6	190826	190831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269341
4063	NC_009486	TC	3	6	190839	190844	0 %	50 %	0 %	50 %	148269341
4064	NC_009486	GAT	2	6	190886	190891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269341
4065	NC_009486	GT	3	6	190917	190922	0 %	50 %	50 %	0 %	148269341
4066	NC_009486	TC	3	6	190942	190947	0 %	50 %	0 %	50 %	148269341
4067	NC_009486	GAA	2	6	190999	191004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269341
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4069	NC_009486	TTTC	2	8	191139	191146	0 %	75 %	0 %	25 %	148269342
4070	NC_009486	AAC	2	6	191170	191175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269342
4071	NC_009486	AGAA	2	8	191295	191302	75 %	0 %	25 %	0 %	148269342
4072	NC_009486	GTTC	2	8	191307	191314	0 %	50 %	25 %	25 %	148269342
4073	NC_009486	CTT	2	6	191349	191354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269342
4074	NC_009486	AG	3	6	191380	191385	50 %	0 %	50 %	0 %	148269342
4075	NC_009486	CTT	2	6	191583	191588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269342
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4079	NC_009486	AGT	2	6	191890	191895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269343
4080	NC_009486	TCTG	2	8	191896	191903	0 %	50 %	25 %	25 %	148269343
4081	NC_009486	CTC	2	6	191947	191952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269343
4082	NC_009486	GAA	3	9	191969	191977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269343
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4084	NC_009486	CAT	2	6	192020	192025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269343
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4087	NC_009486	CTT	2	6	192091	192096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269343
4088	NC_009486	TC	3	6	192104	192109	0 %	50 %	0 %	50 %	148269343
4089	NC_009486	AAG	2	6	192110	192115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269343
4090	NC_009486	TCT	2	6	192198	192203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269343
4091	NC_009486	ATG	2	6	192239	192244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269343
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4093	NC_009486	AGG	2	6	192287	192292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269343
4094	NC_009486	AGA	2	6	192313	192318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269343
4095	NC_009486	AGA	2	6	192398	192403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269344
4096	NC_009486	AAG	2	6	192569	192574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269344
4097	NC_009486	ACA	2	6	192619	192624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269344
4098	NC_009486	GCCA	2	8	192709	192716	25 %	0 %	25 %	50 %	148269344
4099	NC_009486	ATC	2	6	192735	192740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269344
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4102	NC_009486	T	6	6	192791	192796	0 %	100 %	0 %	0 %	148269344
4103	NC_009486	CAC	2	6	192848	192853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269345
4104	NC_009486	GGT	2	6	192914	192919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148269345
4105	NC_009486	GGT	2	6	192951	192956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148269345
4106	NC_009486	TCT	2	6	192957	192962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269345
4107	NC_009486	T	7	7	193032	193038	0 %	100 %	0 %	0 %	148269345
4108	NC_009486	ACC	2	6	193050	193055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269345
4109	NC_009486	TG	3	6	193060	193065	0 %	50 %	50 %	0 %	148269345
4110	NC_009486	TTC	2	6	193128	193133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269345
4111	NC_009486	ACA	2	6	193214	193219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269345
4112	NC_009486	T	6	6	193317	193322	0 %	100 %	0 %	0 %	148269345
4113	NC_009486	TG	3	6	193347	193352	0 %	50 %	50 %	0 %	148269345
4114	NC_009486	TAC	2	6	193357	193362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269345
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4117	NC_009486	CTT	2	6	193438	193443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269345
4118	NC_009486	CTT	2	6	193483	193488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269345
4119	NC_009486	CG	3	6	193548	193553	0 %	0 %	50 %	50 %	148269345
4120	NC_009486	TTG	2	6	193605	193610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269345
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4122	NC_009486	CAA	2	6	193621	193626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269345
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4124	NC_009486	GAT	2	6	193757	193762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269345
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4281	NC_009486	TCG	2	6	201329	201334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269352
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4493	NC_009486	GAG	2	6	210618	210623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269360
4494	NC_009486	T	6	6	210678	210683	0 %	100 %	0 %	0 %	148269360
4495	NC_009486	CTT	2	6	210718	210723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269360
4496	NC_009486	CCA	2	6	210782	210787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269360
4497	NC_009486	TC	3	6	210793	210798	0 %	50 %	0 %	50 %	148269360
4498	NC_009486	CCA	3	9	210827	210835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269360
4499	NC_009486	TCG	2	6	210839	210844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269360
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