MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 37720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_009486	A	6	6	165527	165532	100 %	0 %	0 %	0 %	148269316
3503	NC_009486	AGAAA	2	10	165614	165623	80 %	0 %	20 %	0 %	148269316
3504	NC_009486	CTA	2	6	165628	165633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269316
3505	NC_009486	AAAG	2	8	165674	165681	75 %	0 %	25 %	0 %	148269316
3506	NC_009486	AGA	2	6	165721	165726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269316
3507	NC_009486	AGA	2	6	165832	165837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269316
3508	NC_009486	CCT	2	6	165847	165852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269316
3509	NC_009486	TGT	2	6	165853	165858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269316
3510	NC_009486	TTC	2	6	165915	165920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269316
3511	NC_009486	TCT	2	6	165924	165929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269316
3512	NC_009486	GA	3	6	165943	165948	50 %	0 %	50 %	0 %	148269316
3513	NC_009486	TAT	2	6	165968	165973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148269316
3514	NC_009486	ACC	2	6	165995	166000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269316
3515	NC_009486	GAA	2	6	166009	166014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269316
3516	NC_009486	GTT	2	6	166040	166045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269316
3517	NC_009486	AGG	2	6	166091	166096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269316
3518	NC_009486	A	6	6	166128	166133	100 %	0 %	0 %	0 %	148269317
3519	NC_009486	A	6	6	166175	166180	100 %	0 %	0 %	0 %	148269317
3520	NC_009486	AGA	2	6	166182	166187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269317
3521	NC_009486	ACT	2	6	166223	166228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269317
3522	NC_009486	A	6	6	166264	166269	100 %	0 %	0 %	0 %	148269317
3523	NC_009486	GAT	2	6	166294	166299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269317
3524	NC_009486	ACT	2	6	166310	166315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269317
3525	NC_009486	CAA	3	9	166374	166382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269317
3526	NC_009486	AC	3	6	166412	166417	50 %	0 %	0 %	50 %	148269317
3527	NC_009486	TAT	2	6	166450	166455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148269317
3528	NC_009486	GCA	2	6	166465	166470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269317
3529	NC_009486	GAAA	2	8	166494	166501	75 %	0 %	25 %	0 %	148269317
3530	NC_009486	A	6	6	166528	166533	100 %	0 %	0 %	0 %	148269317
3531	NC_009486	TTG	2	6	166625	166630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269317
3532	NC_009486	ACA	2	6	166633	166638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269317
3533	NC_009486	CAGA	2	8	166644	166651	50 %	0 %	25 %	25 %	148269317
3534	NC_009486	CGAA	2	8	166697	166704	50 %	0 %	25 %	25 %	148269317
3535	NC_009486	A	7	7	166744	166750	100 %	0 %	0 %	0 %	148269317
3536	NC_009486	A	6	6	166796	166801	100 %	0 %	0 %	0 %	148269317
3537	NC_009486	TTG	2	6	166832	166837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269317
3538	NC_009486	CAAG	2	8	166884	166891	50 %	0 %	25 %	25 %	148269317
3539	NC_009486	ATCA	2	8	166990	166997	50 %	25 %	0 %	25 %	148269317
3540	NC_009486	A	6	6	166999	167004	100 %	0 %	0 %	0 %	148269317
3541	NC_009486	TGA	2	6	167049	167054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269317
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3543	NC_009486	ACA	2	6	167240	167245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269317
3544	NC_009486	TAT	2	6	167277	167282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148269317
3545	NC_009486	GAT	2	6	167317	167322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269317
3546	NC_009486	CGA	2	6	167340	167345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269317
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3551	NC_009486	AATC	2	8	167486	167493	50 %	25 %	0 %	25 %	148269317
3552	NC_009486	CACAGA	2	12	167508	167519	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148269317
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3554	NC_009486	T	6	6	167632	167637	0 %	100 %	0 %	0 %	148269317
3555	NC_009486	GAC	2	6	167896	167901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269317
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3557	NC_009486	GTTT	2	8	167973	167980	0 %	75 %	25 %	0 %	148269317
3558	NC_009486	T	6	6	168042	168047	0 %	100 %	0 %	0 %	148269317
3559	NC_009486	GAA	2	6	168094	168099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269317
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3561	NC_009486	GAT	2	6	168271	168276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269317
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3563	NC_009486	TTA	2	6	168313	168318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148269317
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3566	NC_009486	GA	3	6	168506	168511	50 %	0 %	50 %	0 %	148269317
3567	NC_009486	TTTC	2	8	168597	168604	0 %	75 %	0 %	25 %	148269317
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3570	NC_009486	GAT	2	6	168652	168657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269317
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3573	NC_009486	GTA	2	6	168743	168748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269317
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3581	NC_009486	A	6	6	169023	169028	100 %	0 %	0 %	0 %	148269317
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3595	NC_009486	TCG	2	6	170146	170151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269319
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3598	NC_009486	CGA	2	6	170222	170227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269319
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3601	NC_009486	ATA	2	6	170346	170351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148269319
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3603	NC_009486	TC	3	6	170459	170464	0 %	50 %	0 %	50 %	148269319
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3606	NC_009486	A	6	6	170529	170534	100 %	0 %	0 %	0 %	148269319
3607	NC_009486	TGA	2	6	170544	170549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269319
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3611	NC_009486	CTA	2	6	170654	170659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269320
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3613	NC_009486	A	6	6	170704	170709	100 %	0 %	0 %	0 %	148269320
3614	NC_009486	A	7	7	170740	170746	100 %	0 %	0 %	0 %	148269320
3615	NC_009486	CTT	2	6	170760	170765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269320
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3622	NC_009486	CAT	2	6	170969	170974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269320
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3994	NC_009486	CAG	2	6	187753	187758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269338
3995	NC_009486	GAG	2	6	187772	187777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269338
3996	NC_009486	TTTC	2	8	187793	187800	0 %	75 %	0 %	25 %	148269338
3997	NC_009486	TC	3	6	187895	187900	0 %	50 %	0 %	50 %	148269338
3998	NC_009486	CCT	2	6	187988	187993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269339
3999	NC_009486	GTA	2	6	188014	188019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269339
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