MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 37720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_009486	CTT	2	6	1233386	1233391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270344
25503	NC_009486	TCC	2	6	1233402	1233407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270344
25504	NC_009486	TTC	2	6	1233437	1233442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270344
25505	NC_009486	AGA	2	6	1233443	1233448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270344
25506	NC_009486	GAA	2	6	1233488	1233493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270344
25507	NC_009486	CTC	2	6	1233545	1233550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270344
25508	NC_009486	ACA	2	6	1233564	1233569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270344
25509	NC_009486	TCG	2	6	1233594	1233599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270344
25510	NC_009486	CTT	2	6	1233645	1233650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270344
25511	NC_009486	CAT	2	6	1233664	1233669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270344
25512	NC_009486	CTT	2	6	1233716	1233721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270344
25513	NC_009486	TCCT	2	8	1233770	1233777	0 %	50 %	0 %	50 %	148270344
25514	NC_009486	TCA	2	6	1233793	1233798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270344
25515	NC_009486	AGA	2	6	1233831	1233836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270344
25516	NC_009486	GA	4	8	1233845	1233852	50 %	0 %	50 %	0 %	148270344
25517	NC_009486	GAA	2	6	1233854	1233859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270344
25518	NC_009486	TTC	2	6	1233916	1233921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270344
25519	NC_009486	ATG	2	6	1233945	1233950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270344
25520	NC_009486	TCC	2	6	1233956	1233961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270344
25521	NC_009486	TGG	2	6	1234015	1234020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270344
25522	NC_009486	CGA	2	6	1234054	1234059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270344
25523	NC_009486	CTT	2	6	1234066	1234071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270344
25524	NC_009486	CTTT	2	8	1234111	1234118	0 %	75 %	0 %	25 %	148270344
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25528	NC_009486	TTTC	2	8	1234228	1234235	0 %	75 %	0 %	25 %	148270344
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25532	NC_009486	TTC	2	6	1234424	1234429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270344
25533	NC_009486	CTT	2	6	1234444	1234449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270344
25534	NC_009486	TGG	2	6	1234464	1234469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270344
25535	NC_009486	GCA	2	6	1234495	1234500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270344
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25537	NC_009486	GAC	2	6	1234544	1234549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270344
25538	NC_009486	CTT	2	6	1234562	1234567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270344
25539	NC_009486	AGAGA	2	10	1234606	1234615	60 %	0 %	40 %	0 %	148270344
25540	NC_009486	GAT	2	6	1234649	1234654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270344
25541	NC_009486	ATG	2	6	1234689	1234694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270344
25542	NC_009486	CTT	2	6	1234739	1234744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270344
25543	NC_009486	CT	3	6	1234779	1234784	0 %	50 %	0 %	50 %	148270344
25544	NC_009486	GAT	2	6	1234799	1234804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270344
25545	NC_009486	CT	3	6	1234870	1234875	0 %	50 %	0 %	50 %	148270344
25546	NC_009486	GTT	2	6	1234934	1234939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270344
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25548	NC_009486	CTTC	2	8	1234969	1234976	0 %	50 %	0 %	50 %	148270344
25549	NC_009486	CTT	2	6	1235017	1235022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270344
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25552	NC_009486	TGG	2	6	1235284	1235289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270344
25553	NC_009486	ACC	2	6	1235351	1235356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270344
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25556	NC_009486	TTC	2	6	1235508	1235513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270344
25557	NC_009486	T	6	6	1235564	1235569	0 %	100 %	0 %	0 %	148270344
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25603	NC_009486	T	7	7	1237700	1237706	0 %	100 %	0 %	0 %	148270347
25604	NC_009486	AG	3	6	1237743	1237748	50 %	0 %	50 %	0 %	148270347
25605	NC_009486	TGA	2	6	1237764	1237769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270347
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25607	NC_009486	ATC	2	6	1237843	1237848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270347
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